Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3460
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3460, 1354 aa
1>>>pF1KE3460 1354 - 1354 aa - 1354 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.6978+/-0.0018; mu= -34.4792+/- 0.105
mean_var=899.5629+/-196.451, 0's: 0 Z-trim(107.2): 558 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.042762
statistics sampled from 8931 (9442) to 8931 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 4.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 8819 561.7 4.7e-159
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 4178 275.4 7.4e-73
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 1528 112.0 1.4e-23
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 1508 110.8 3.4e-23
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 1497 110.1 5.2e-23
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 1407 104.5 2.3e-21
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1394 103.8 5e-21
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1372 102.5 1.3e-20
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 1260 95.1 5.6e-19
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 1260 95.1 6.3e-19
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 1260 95.1 6.3e-19
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 1181 90.3 1.9e-17
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 1130 87.1 1.7e-16
>>CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354 aa)
initn: 8819 init1: 8819 opt: 8819 Z-score: 2969.0 bits: 561.7 E(32554): 4.7e-159
Smith-Waterman score: 8819; 100.0% identity (100.0% similar) in 1354 aa overlap (1-1354:1-1354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNRTSSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNRTSSNA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQRRNLEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQRRNLEST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNSQLANEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNSQLANEKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSKSQTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSKSQTD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 KDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 HSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLEQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLEQES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 NKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 ELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 SEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 ELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 KANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 ASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 QYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILY
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 ANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 CRRCHVKCHRDHLDKKEDLICPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CRRCHVKCHRDHLDKKEDLICPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350
pF1KE3 PSGFVRASPRTLSTRSTANQSFRKVVKNTSGKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSGFVRASPRTLSTRSTANQSFRKVVKNTSGKTS
1330 1340 1350
>>CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388 aa)
initn: 5013 init1: 2349 opt: 4178 Z-score: 1421.5 bits: 275.4 E(32554): 7.4e-73
Smith-Waterman score: 5874; 65.8% identity (86.4% similar) in 1360 aa overlap (9-1344:25-1377)
10 20 30 40
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFP
.: .:.. :.:::.: .: . :::::..:: :::::
CCDS42 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAM
::::::::::::.::. ..::: :.::::::.:::::::::::::::::::...:::::
CCDS42 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 MSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMN
:::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS42 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 KEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
. :::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GTYSKIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWA
:::::::.::::: ::.: .:::.::::::::::::::::::::::::..: :::::::
CCDS42 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 WETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR
:...:.:.:::::.::::::.:::::.:.:::. ::::::::::::::::.::::: .
CCDS42 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 YLSSANPNDNRTSSNADKSLQES--LQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDK
::.. :. .:.: ... .:: .:: .: :::.: :::: :.:.::::.. : .:.:
CCDS42 LLSDS-PSCRETDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEK
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 IMKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQ
:::.:: . :...::.. :.:.:: ::::. ::::::..: .:.::.::.:..::::
CCDS42 TAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 LEDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLN
:::::: .::::...::..:::.::.:.: :::::::::.::::...: ::.:.:::: :
CCDS42 LEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNN
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 RELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLK
:.::..: .::..: . .:.. .::. ::.::::: : ::.:.:::.:: .:.:..:. :
CCDS42 RDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGK
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 HNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDK-
: ::: :... :. .. ::::.:.:::..:.:: .:: :::: :::.:::::.::
CCDS42 ILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKN
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750
pF1KE3 --HQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLT
..::::::: :: :::::: ::: ..:.:: ... ::.::.:: ::::::::...:
CCDS42 KIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELL
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 GNKERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKR
.:. ....:.::::..:::..:: : ::.:: :. ....:: :::.::: : :.: :
CCDS42 KQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKM
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 LLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNR---ENLK
:: . :.: :. . .:::.::::::::::::::::::::.::::: :::.. : .
CCDS42 NLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQ
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920
pF1KE3 KIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQES-------KKAASRNRQ
: ::::.:...::.::... :::.::::::.. :::: .: .:. :. .:..:
CCDS42 KKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQ
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KE3 EITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISN--LKAA
:.:.:: :.. :::.: ::.:. : :.:::..:.: ..:. . :.:::: .::
CCDS42 ELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQ
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE3 FEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREK
:::.. ::::::::::::::::::::. :..: :.:.::::::::..::..::::
CCDS42 FEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKE---PVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE3 FNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLS---DSTSVA
..:...:.:::::.::::..:: : :::: : ::.:::::::..: : ::.:..
CCDS42 LTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE3 SFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNP
: :. :.: ..::::.:::::.: :.: :..:: :.::.:::::::::..:::::::::
CCDS42 SGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNP
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 SMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVE--MEPVQQAEKTN
:::::::::::::::: :::::...:::.::::::::::: .:. : .::: .::.:
CCDS42 YMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPV--GEKSN
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE3 FQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLICP
. ::::::::::::::.::.:: :::::.:::::::::::::.:::.::.::::..: :
CCDS42 YICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE3 CKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSG--FVRASPRTLSTRSTANQ
::: ::...:...:::: : .::.:::..:::::::.::. :.:.:::: : . ::
CCDS42 CKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRT-SMKIQQNQ
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350
pF1KE3 SFRKVVKNTSGKTS
:.:.
CCDS42 SIRRPSRQLAPNKPS
1380
>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719 aa)
initn: 1375 init1: 449 opt: 1528 Z-score: 536.6 bits: 112.0 E(32554): 1.4e-23
Smith-Waterman score: 1667; 30.9% identity (62.4% similar) in 1262 aa overlap (6-1206:2-1164)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDC-----LLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNF
: :.:........ : ...:..: ::: : : . . ::..::: ..
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKR
: : .:....:.. ::.:..::::::::::: .:. :.. ::.:::.:.:.::.::
CCDS15 LEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 SDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEK
...: : ::::... ... :.. : :::::: ::.::.:. ::::..:.:... .::
CCDS15 AETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPED
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 WARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDT
:::: ::.:.:.:..:.. ..:::.::::.:.: .::..:::::.:.:. ..: :. ..
CCDS15 MARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AVGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMN
:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.::::
CCDS15 AVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 HKNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDT
::. . :: . .:.:..::.:: .. .:: :::.::.:..:.: ::.. . :...:.
CCDS15 HKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGID--WDNIRNC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE3 VAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTY-----YSNRR
:: .:..:: :::::: .. . ::.: : :: :..:::::::: :.:
CCDS15 EAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 YLS-SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI
: .:.:.. . :....:...: : : ..: ..::. ::
CCDS15 CLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAY--------ERRIK-RLEQE------KL---
420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL
::. :.:. ... .. ::. . : .. : ...::...
CCDS15 --ELS------RKLQESTQTVQA----LQYSTVDGPLTASKDLE--------IKNLKEEI
460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLN
: :.: .: :.:..:::::: . : : : : : :.. .. :...: :.::
CCDS15 EKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLN
500 510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE3 REL-QERNRILENSKSQTD---KDYYQLQAILEA-ERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEE
.:: : .:. ..:: : . .: ..: :: . : ... : .. . .::
CCDS15 KELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQ--KLARHVRDKEEE
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 VKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLN-YKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKA
: . ..:::. :.: : ..:. :..::. . .. ..: .: .:: .
CCDS15 VDLV---MQKVESLRQE----LRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEH--YSK
610 620 630 640 650
700 710 720 730 740
pF1KE3 RLTDKHQSIEEAK---SVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLD----VDLK
.: .. ..... . : ..: .:.. .: . . :.. . :.. : . ..:
CCDS15 QLENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQ-QEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIK
660 670 680 690 700 710
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 QSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQ
. ...:. :.. .. :. . :. . :...: ... . . ::.. ...:...
CCDS15 NLKKELHDSEGQQLALNKEI--MILKDKLEKTRR---ESQSEREEFESE----FKQQYER
720 730 740 750 760
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 EINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLE--AEQYFSTLY-KTQVKELKEE
: : : .. : :: .:: :.. . ..:..... :.. :. . ..:. :. .
CCDS15 EKVLLTEENKKLTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQW
770 780 790 800 810 820
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 I-EEKN-RENLKKI-QELQNEKETL-ATQLDLAETKA--ESEQLARGLLEEQYFELTQES
. .::. : :. . ... .: :.: ..: : . ...:. : .:: : .
CCDS15 VSDEKDARGYLQALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAK-LDMSARLEL-QSA
830 840 850 860 870 880
930 940 950 960 970
pF1KE3 KKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELT---EKMKKAEEEYKLEK
: : .: : .. ..... .: . .. ...: :: :.. : :: . ::
CCDS15 LDAEIRAKQAIQEE---LNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEK
890 900 910 920 930 940
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 EEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKL
: .. . .: .:: :.:.... : .. ... .: :::: .
CCDS15 GIEHQDSQHSFLAFLNTP----TDALDQF-ETVDSTPLSV-----HTPTLRKKGCPG---
950 960 970 980
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE3 QLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASK--ESDIEQLRAKLL
. . .: : .:. :: . .: . . :.. : . .. . ..
CCDS15 STGFPPKR-KTHQFFVK--------SFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHIT
990 1000 1010 1020 1030 1040
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 DLSDSTSVASFPSADETDGNL---PESRI----EGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSK
.. . .. : ..: : : :.. : :: . .:. ...:. ::.. ..: .
CCDS15 CVNKAPTTCPVPP-EQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDF
1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 KILFYNDEQDKEQSNPSMVL----DI-DKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQI----L
:...: : . . :.::.:. :. :. : : : .:: .: ..:: ::.. :
CCDS15 KLFLY-DIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 YANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPAL
:....:
CCDS15 SASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTT
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711 aa)
initn: 1269 init1: 454 opt: 1508 Z-score: 530.0 bits: 110.8 E(32554): 3.4e-23
Smith-Waterman score: 1676; 30.4% identity (62.7% similar) in 1264 aa overlap (6-1198:2-1178)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRD-P---KSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFL
: ..:..:...:: : : .: .. . ::: : : . . :::..: . .::
CCDS99 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRS
: . ....... ::.:..::::::::::: .:. :.:...::::.:.:.::.::.
CCDS99 EWAKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 DSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKW
..: : ::::... .. :.. : :::::. .::.::.:. ::::..:.:... .::
CCDS99 ETACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 ARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTA
:::: .:.:::.:.::.. ..:::.::::.::: .::..:::::.:.::: .: :. ..:
CCDS99 ARFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNH
::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.:::::
CCDS99 VGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 KNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTV
.. . ::. .:.:.:::.:: .. .:: :::.::.:..:.: ::.. ::..:.
CCDS99 EERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEG--LNWENIRNLE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE3 APVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKA---FVGNQLPFVGFTY-----YSNRR
:: .::.:: :::::: .. . : .: : . : : .:::.:::. .:.:
CCDS99 APYIPDVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILP-PGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 YLSSANPNDNRTSS-NADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI
:.: ... :.. .....:..::: : :.... : : :. .: . :. ....
CCDS99 SLKSIMQSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAY--ERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL
.:..: . :. .:: :...:.. . : . :. .:..:. :. :...
CCDS99 ------HGSSR---ALSNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVA-LRQER
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KE3 ED----LKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLE
:: :. . .. ... .. .:.::: ::.. :... : .:. .: . . .....
CCDS99 EDSTQRLRGLEKQHRVVRQEKEELHKQLVEASERLKSQ---AKELKDAHQQRKLALQEFS
530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 SLNRELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVK
::... : ..: .: :: ::. .. :. ..:
CCDS99 ELNERMAEL-------RAQKQKVSRQL--------RDKEEEMEVA----------TQKVD
580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 HLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTK----
........: ::: . .:. . : .. : : . ... ...:.:.. :: .
CCDS99 AMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASK-ERKLREHSENFCKQMESELEALKVKQGGRG
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740
pF1KE3 ARLTDKHQS-IEEAKSVAMCEMEKKL---KEE---REAREKAENRVVQIEKQCS-----M
: : .::. : . :: :.:::. .:: ::: . : . :. : . :
CCDS99 AGATLEHQQEISKIKS----ELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEVHDSESHQLA
680 690 700 710 720
750 760 770 780 790
pF1KE3 LDVDLKQSQQKLEHLTGNKER---MEDEVKNLTLQLEQES------NKRLLLQNELKTQA
:. .. . ..:::. ...:: ::. : .. . :.: ::.: .:: : .
CCDS99 LQKEILMLKDKLEK--SKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLTAENE-KLCS
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 FEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFST
: .:.: . ..:...:.. : :. . ::... .. ..:. .:. :...
CCDS99 F-VDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEI-------IQWVSDEKDARGYLQA
790 800 810 820 830
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 LYKTQVKELKE----EIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLE
: . ...::. . .. . : :... : : ....:.: .. :.: :. :..
CCDS99 LASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQ--KLDMSARLEL-QSALEAEIRAKQLVQ
840 850 860 870 880 890
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 EQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAE
:. .. : : .... :. : : : ...:::. :: :
CCDS99 EEL----RKVKDANLTLESKLKDS-------EAKNRELLEEMEILK----------KKME
900 910 920 930
980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 EEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINT-----ERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQ
:... . .. ... .. . .:: . :..:..... . . . . . : ..
CCDS99 EKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNTAPLAHDLTFRTSSASEQETQAPKPEASPSMSVAASE
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ---DLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLAS
:. . .. . : .: . :: ...... .:.: . :.. :
CCDS99 QQEDMARPPQRPSAVPLPTTQALALAGPKPKAHQFSIKSFSSPT--QCSHCTSLMVGLIR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 K--ESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSAD-ETDGNLPESR-----IEGWLSVPNRGNIK
. .. .. .. . . .: .: . . .. .: .: ..::. ..:
CCDS99 QGYACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPIPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 RYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNP----SMVLDI-DKLFHVRPVTQGDVYRAET
. ::.. :.:: . :...: : . ....: :.:::. : : : : .:: .:
CCDS99 K-GWQRAYAVVCDCKLFLY-DLPEGKSTQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATR
1120 1130 1140 1150 1160
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE3 EEIPKIFQILYANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPL
..:: ::..
CCDS99 RDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTENENEKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVP
1170 1180 1190 1200 1210 1220
>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638 aa)
initn: 1254 init1: 449 opt: 1497 Z-score: 526.6 bits: 110.1 E(32554): 5.2e-23
Smith-Waterman score: 1557; 30.8% identity (60.0% similar) in 1243 aa overlap (6-1206:2-1083)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDC-----LLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNF
: :.:........ : ...:..: ::: : : . . ::..::: ..
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKR
: : .:....:.. ::.:..::::::::::: .:. :.. ::.:::.:.:.::.::
CCDS15 LEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 SDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEK
...: : ::::... ... :.. : :::::: ::.::.:. ::::..:.:... .::
CCDS15 AETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPED
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 WARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDT
:::: ::.:.:.:..:.. ..:::.::::.:.: .::..:::::.:.:. ..: :. ..
CCDS15 MARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AVGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMN
:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.::::
CCDS15 AVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 HKNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDT
::. . :: . .:.:..::.:: .. .:: :::.::.:..:.: ::.. .: ...:.
CCDS15 HKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDW--DNIRNC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE3 VAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTY-----YSNRR
:: .:..:: :::::: .. . ::.: : :: :..:::::::: :.:
CCDS15 EAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 YLS-SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI
: .:.:.. . :....:...: : : ..: ..::. ::
CCDS15 CLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAY--------ERRIK-RLEQE------KL---
420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL
::. :.:. ... .. ::. . : .. : ...::...
CCDS15 --ELS------RKLQESTQTVQA----LQYSTVDGPLTASKDLE--------IKNLKEEI
460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLN
: :.: .: :.:..:::::: . : : : : : :.. .. :...: :.::
CCDS15 EKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLN
500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 R-ELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHL
. :.. . : ::.. .. ..:. .. ..:. : :. . : . : .
CCDS15 KLEVHTEALAAEASKDRKLRE--------QSEHYSKQLENELEG-LKQKQISYSPGVCSI
550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 KHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDK
.:. : . : :..:: . . :..: ..:: : : .: :.
CCDS15 EHQQEIT---------------KLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKKELHDS
600 610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 HQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGN
:... : :. ..: : . :. ..::.. :.. ..
CCDS15 -----------------------EGQQLALNKEIMILK--DKLEKTRRESQSEREEFESE
650 660 670
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 -KERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRL
:...: : :: : ::.: .:: . .::. ..:...:.. : . :.
CCDS15 FKQQYEREKVLLT-----EENKKL--TSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKES
680 690 700 710 720 730
830 840 850 860 870
pF1KE3 LEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENL-KKIQ
. ::.:. .. ..:. .:. :...: .... ::.: .: .
CCDS15 VAHWEAQITEI-------IQWVSDEKDARGYLQAL----ASKMTEELEALRNSSLGTRAT
740 750 760 770 780
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 ELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVS
.. . . .: .::.. :: .:: : . : : .: : .. ..
CCDS15 DMPWKMRRFA-KLDMS---------AR-------LEL-QSALDAEIRAKQAIQEE---LN
790 800 810 820
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 RLEEANSMLTKDIEILRRENEELT---EKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTER
... .: . .. ...: :: :.. : :: . :: : .. . .: .::
CCDS15 KVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNT--
830 840 850 860 870
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 TLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQ
:.:.... : .. ... .: :::: . . . .: : .:. ::
CCDS15 --PTDALDQF-ETVDSTPLSV-----HTPTLRKKGCPG---STGFPPKR-KTHQFFVK--
880 890 900 910 920
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 KELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASK--ESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDG
. .: . . :.. : . .. . .. .. . .. : ..: :
CCDS15 ------SFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPP-EQTKG
930 940 950 960 970
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE3 NL---PESRI----EGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMV
: :.. : :: . .:. ...:. ::.. ..: . :...: : . . :.::.:
CCDS15 PLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDFKLFLY-DIAEGKASQPSVV
980 990 1000 1010 1020 1030
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE3 L----DI-DKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQI----LYANEGECRKDVEMEPVQQA
. :. :. : : : .:: .: ..:: ::.. : :....:
CCDS15 ISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE3 EKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKED
CCDS15 NKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551 aa)
initn: 1170 init1: 480 opt: 1407 Z-score: 496.9 bits: 104.5 E(32554): 2.3e-21
Smith-Waterman score: 1497; 30.5% identity (58.6% similar) in 1210 aa overlap (8-1198:2-1030)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNS-DCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRY
: :.. ...: : . . : ::: : :: ..:. ::..... .:::
CCDS31 MERRLRALEQLARGEAGGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 KDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSA
. ..:...::.. .:.:..::::::::::: .::...: ...:::.: :.::.::...:
CCDS31 SPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 FFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARF
: ::::... ..: ::. : :::::..:::.::.:. ::::..:.: .. .: . :.:
CCDS31 CFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGT
: ::.:::. ..:..:..::::::::.::: .::..:::::.:...: .::: ..::::
CCDS31 YLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 PDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNS
:::::::.:.. . : :.:: .:::::.:: ::.: :.:::::.::: ::.:::::..
CCDS31 PDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPV
: :: : :. :..:: .: .: ::::.:..... : ::.. .: : : ...::
CCDS31 LQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDW--ERLASSTAPY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPND
.:.: . .:::::: .. .. :.: :. :: :..:::::::: :. : .:.
CCDS31 IPELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSG-----SHSPE-
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 NRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQ
.::.: .:...:: .::. ...:.. .: . ..
CCDS31 --SSSEAWAALERKLQC------------------LEQE----KVELSRKHQEALHAPTD
410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 RRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNS
.:.:: :..:: . :. :. :. : ...: . . . .:.:
CCDS31 HRELE----QLRKEVQTLRDRLPEMLR-------------DKASLSQTDGPPAGSPGQDS
450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 QLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILE
.: .: :..:...: :. . :. .. :. .. .: : : ..::: ..
CCDS31 DLRQE-LDRLHRELAEGR----------AGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREA
490 500 510 520 530
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 NSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERK
. ::: ::. :.: .:.:...::...: .:. . :. : .
CCDS31 ATASQTRALSSQLEEARAAQR-----------ELEAQVSSLSRQVTQLQGQWEQRLEESS
540 550 560 570 580
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 EAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAM
.:. . :. .: :.. . . .:..:: . . .: . :. .: :.
CCDS31 QAKTI--HTASETNGMGPP---EGGPQEAQLRKEVA---ALREQLEQAHSHRPSGKEEAL
590 600 610 620 630
720 730 740 750 760
pF1KE3 CEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMED----EV
:.... ::: .. :.. :...: : :.. ..: :.... :. ..
CCDS31 CQLQE------------ENRRLSREQE--RLEAELAQEQESKQRLEGERRETESNWEAQL
640 650 660 670 680
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 KNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQM--KQEINTLLEAKRLLEFEL-A
.. ...:. .: :: .: : ..:... : . .. .:.:: ..: :
CCDS31 ADILSWVNDEKVSRGYLQALATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASA
690 700 710 720 730 740
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 QLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKE
.: :::. :::: : ..: ...: . . ...:: ::.
CCDS31 RL------------ELQSALEAEIR----AKQGLQERLTQVQEAQLQAERRLQE--AEKQ
750 760 770 780
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 TLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANS
. : : .:: . : . ::: .. :. :.. . ..:: .
CCDS31 SQALQQELAMLREELR--ARGPVD------TKPSNSLIPFLSFRSSEKDSA---------
790 800 810 820
950 960 970 980 990 1000
pF1KE3 MLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKL
:: : . : :.. .: . . : . :.:. ::
CCDS31 ---KDPGI----SGEATRH--GGEPDLRPEGR-----------------RSLRMGAVFPR
830 840 850 860
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE3 AEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQL
: : . . : ... :: :.. . : .. . .: : . .
CCDS31 APTANTASTEGLPAKPGSHTLRP-----RSFPSPTKCLRCTSLMLGLGRQGLGCDACGYF
870 880 890 900 910
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE3 VEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLS
: : :. :: :... : :: . . ::.::
CCDS31 ---CHTTCAPQAPPCPVPPDL--LR---------TALGVHP---ETGTG---TAYEGFLS
920 930 940 950
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 VPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPS----MVLDI-DKLFHVRPVTQ
:: ....: ::.. ....:....:.. : : . : :: .:::. : : . ::
CCDS31 VPRPSGVRR-GWQRVFAALSDSRLLLF-DAPDLRLSPPSGALLQVLDLRDPQFSATPVLA
960 970 980 990 1000 1010
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE3 GDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPAN
.:: .:.....:.::..
CCDS31 SDVIHAQSRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGERERWLQVLGELQRLLLDARP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027 aa)
initn: 1097 init1: 444 opt: 1394 Z-score: 491.0 bits: 103.8 E(32554): 5e-21
Smith-Waterman score: 1500; 29.1% identity (62.6% similar) in 1222 aa overlap (23-1159:44-1232)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNI
: .. . .::.: .: . . ::: : :..
CCDS91 AGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEECSQPALMKIKHV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 DNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEM
.::. .:.::: ....:. .:.:.:: ...: : :.:::.::.:.: .::::...: .
CCDS91 SNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDIYAMKVMKKKAL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--V
. . . .:: :::.:.. ..:::. :: ::::: .::.::::.:::::..:.. :. .
CCDS91 LAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVR
:. .:: ::..::. ..: ::..:::.::.:.:.:..::.::.:::. :::.. ::
CCDS91 DENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNKMVN
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280
pF1KE3 CDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGY--YGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYS
.:::::..:::: ..::: :: .::::::::. :::. : .:: . . :..
CCDS91 AKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRSPFAEGTSARTFN
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 KIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFF-KNDQWAWET
.::: . : :::: .:.. .:: ..: .. :: .: . : :: : : :..
CCDS91 NIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEG---LCCHPFFSKID---WNN
320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPI---PKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR
.:.. : :: :.:: ::::::. :... . : :..: :..::::::.: .
CCDS91 IRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSWVSSS-PCQLSPSGFSGEELPFVGFSYSKALG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440
pF1KE3 YLS------SANPNDNRTSSNA------DKSLQESLQKTIYKLEEQ---LH---NEMQL-
:. :. . .::: .: ::.: : .:.:.. :: .:..
CCDS91 ILGRSESVVSGLDSPAKTSSMEKKLLIKSKELQDS-QDKCHKMEQEMTRLHRRVSEVEAV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490
pF1KE3 --KDEMEQKCRTSNIKL--DKIMKELDEEGNQRRNLEST---VSQIEKEKMLLQHRINEY
. :.: : .. .: . . . : .. .:.::.. ::: . . . : : : :
CCDS91 LSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQ
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540
pF1KE3 QRKAEQ--ENEKRRNVENEVSTLKDQLE-DL---KKVS-------QNSQLANE----KLS
.:: .. :.: . .:: :. . .::: :: .. : ..:.:: : : .
CCDS91 SRKLQEIKEQEYQAQVE-EMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLYESELRESRLAAEEFKRKAT
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590
pF1KE3 QLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLNRELQ---ERNRILENSKS
. :..: .:.: . : ..:.: ..:.. .:..: :.:.. .. : ...:.: ..
CCDS91 ECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKASTEATELLQNIRQ
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 QTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIG--DLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEA
.. .:. . . : ..: .... .:. . : ..::. .:.. : . .:
CCDS91 AKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLVEAEELEEKHREAQVSAQHLEVHLKQKEQHYEEK
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 QDMLNHSEKEKNNLEIDLNYK--LKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAM
.:. :... :: : :....:: :.:..: :... ...... .: . .
CCDS91 IKVLD------NQIKKDLADKETLENMMQRHEEEAHE----KGKILSEQKAMINAMDSKI
730 740 750 760 770
720 730 740 750 760
pF1KE3 CEMEKKLKEEREAREKAENRVV----QIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKE----RM
.:... : :: . : : . ... : :.. .:.:.. :: .:. : ..
CCDS91 RSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMIS-ELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKL
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 EDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFEL
:....... : ....:. : :...:. ..: .. : :: .:.... : . . : .:
CCDS91 EEQLEKISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQK-LE--LKRQLTELQLSLQERESQL
840 850 860 870 880 890
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 AQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEK
. : . :.:.:. . .:: . . ..::..: . :.. . ..
CCDS91 TALQAARAALESQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRK-FDALRNSCTVITDL
900 910 920 930 940
890 900 910 920 930
pF1KE3 ETLATQL--DLAETKAESEQLARGLLE-----EQYFELTQES---KKAASRNRQEITDKD
: .:: : :: . .. :.. : : .. .: .: .. .. ....:..
CCDS91 EEQLNQLTEDNAELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITEREMQLTSQK
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 HTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKA---AFEKNI
.:. :. . .:: ... :. :.:: :: .. : .. .:. :... ... .
CCDS91 QTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEK-SQFECRVRELQRML
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 NTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMV
.::. ...: ....: . .. . ..::. :.. :: .::. : . .:.:..
CCDS91 DTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKE-QKLKAE--SLSDKLNDLE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE3 VKHQK-ELN--DMQAQLVEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSA
:: :.: ..: .: : ...: . :. ..... . ... :... . : . :
CCDS91 KKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLLEEQAKLQQQMDLQKNHIFRLTQGLQEA-LDRA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE3 D--ETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMV
: .:. . : ..:. . .. ..: : .: ..: : : . ..:.
CCDS91 DLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQ----QTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 LDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHK
CCDS91 FSRRKEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAAHRKATD
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069 aa)
initn: 1097 init1: 444 opt: 1372 Z-score: 483.5 bits: 102.5 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 1491; 28.2% identity (61.5% similar) in 1275 aa overlap (23-1227:44-1271)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNI
: .. . .::.: .: . . ::: : :..
CCDS55 AGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEECSQPALMKIKHV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 DNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEM
.::. .:.::: ....:. .:.:.:: ...: : :.:::.::.:.: .::::...: .
CCDS55 SNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDIYAMKVMKKKAL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--V
. . . .:: :::.:.. ..:::. :: ::::: .::.::::.:::::..:.. :. .
CCDS55 LAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVR
:. .:: ::..::. ..: ::..:::.::.:.:.:..::.::.:::. :::.. ::
CCDS55 DENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNKMVN
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280
pF1KE3 CDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGY--YGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYS
.:::::..:::: ..::: :: .::::::::. :::. : .:: . . :..
CCDS55 AKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRSPFAEGTSARTFN
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 KIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFF-KNDQWAWET
.::: . : :::: .:.. .:: ..: .. :: .: . : :: : : :..
CCDS55 NIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEG---LCCHPFFSKID---WNN
320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPI---PKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR
.:.. : :: :.:: ::::::. :... . : :..: :..::::::.: .
CCDS55 IRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSWVSSS-PCQLSPSGFSGEELPFVGFSYSKALG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440
pF1KE3 YLS------SANPNDNRTSSNA------DKSLQESLQKTIYKLEEQ---LH---NEMQL-
:. :. . .::: .: ::.: : .:.:.. :: .:..
CCDS55 ILGRSESVVSGLDSPAKTSSMEKKLLIKSKELQDS-QDKCHKMEQEMTRLHRRVSEVEAV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490
pF1KE3 --KDEMEQKCRTSNIKL--DKIMKELDEEGNQRRNLEST---VSQIEKEKMLLQHRINEY
. :.: : .. .: . . . : .. .:.::.. ::: . . . : : : :
CCDS55 LSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQ
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540
pF1KE3 QRKAEQ--ENEKRRNVENEVSTLKDQLE-DL---KKVS-------QNSQLANE----KLS
.:: .. :.: . .:: :. . .::: :: .. : ..:.:: : : .
CCDS55 SRKLQEIKEQEYQAQVE-EMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLYESELRESRLAAEEFKRKAT
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590
pF1KE3 QLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLNRELQ---ERNRILENSKS
. :..: .:.: . : ..:.: ..:.. .:..: :.:.. .. : ...:.: ..
CCDS55 ECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKASTEATELLQNIRQ
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 QTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQD
.. .:. . . : ..: .... . . : ::...::.:. ..:. :.. :. :
CCDS55 AKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLV-EAEERRHSLENKVKRLE-TMERRENRLKD--D
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 MLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEME
. ..:.. .. . :. . : .: : .: ...: .:.: :: .: ..
CCDS55 IQTKSQQIQQMADKILELEEK---HREAQVSAQH--LEVHLKQKEQHYEEKIKV----LD
730 740 750 760 770
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 KKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLE
...:.. .: :: . . :.. :.... .. . .. . .:... .:. .
CCDS55 NQIKKDLADKETLENMMQRHEEEAHEKGKILSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVELSEANK
780 790 800 810 820 830
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 QESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEG
.:. :. : ..:.: ..:. . .. . . : .: :: .: ....: .....
CCDS55 LAANSSLFTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKISHQDHSDKN
840 850 860 870 880 890
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 QMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAET
.. ::. .:. . : ..:. :.. . .: ... :: . .: .:: :.:
CCDS55 RLLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQLRQAKT
900 910 920 930 940 950
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 KAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRR
. : : :.. ::. :: . . .:. . . .. ... ::: ..::.: :
CCDS55 ELE-ETTAEA--EEEIQALTAH-RDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNN
960 970 980 990 1000
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 ENEELTEKMKKAE--EEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDF
.: :.... .: .. .. . :...:. . . . . : . :... : . .
CCDS55 QNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITER-EMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 KIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNE
.. .: ...: .::.. . . :..:. .:. : . :. : : . : . .:
CCDS55 QVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQFECRVRELQRML-DTEKQSRARADQRIT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 LQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKR
. :.. : ... .:..: :... . .. . . .: . .. : . :. ..
CCDS55 ESRQVV--ELAVKEHKAEILALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQK
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 YGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQG--------DVYRA
... ....: .:: : :.. .:..: :. .::: :. ..
CCDS55 LETEREL----KQRLL---EEQAKLQQQ----MDLQKN-HIFRLTQGLQEALDRADLLKT
1190 1200 1210 1220 1230
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE3 ETEEIP---KIFQILYANEGECRKDVEMEPV--QQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANC
: .. . .:.::..: :.:: . ::.. .: . :
CCDS55 ERSDLEYQLENIQVLYSHE-----KVKMEGTISQQTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGLFSRR
1240 1250 1260 1270 1280
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE3 DACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLICPCKVSYDVTSARDMLLLACSQ
CCDS55 KEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAAHRKATDHPHP
1290 1300 1310 1320 1330 1340
>>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (530 aa)
initn: 958 init1: 418 opt: 1260 Z-score: 454.2 bits: 95.1 E(32554): 5.6e-19
Smith-Waterman score: 1264; 38.4% identity (69.8% similar) in 536 aa overlap (6-527:2-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK
: :.:......:. :: . .. . ::: : .. .: : ..: . .::. .
CCDS74 MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF
. .....:.. .:.:..::::::::.:: .:. :.: .:::::...:..:.::.. .
CCDS74 PIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARFY
: ::::... .. :..:: .::::. :::.::::. ::::..:.:.. .: . ::::
CCDS74 FREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 TAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTP
::.:.:.:..: .:..:::.::::.:::. ::..:::::.:.:. .: :: .:::::
CCDS74 LAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DYISPEVLKSQGGD---GYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKN
::.:::.:.. :: : :: :::::..::: :::. :.::::::: . ::.::...:.
CCDS74 DYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SLTFPD-DNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRH-LFFKNDQWAWETLRDTVA
:..: :. . .::...: .: :.::::.:. ... : .:: : :. :::.:
CCDS74 HLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLD---WDGLRDSVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 PVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANP
: .::. . :: ::: .:. ::. . : .: .:::::..: : .: :
CCDS74 PFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY-SCMALRDSEVP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE3 NDNRTSSNADKSLQE-----SLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKE
. . .:.. :. ::. .. .: :. . . ... : ....
CCDS74 GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDET--AEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEA
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 LDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDL
:.:: :..: . :. ... . .. :.:: .: :..: .: :....: :
CCDS74 LEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQL----REAEARN---RDLEAHVRQLQERMELL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 KKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQ
.
CCDS74 QAEGATGP
530
>>CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (624 aa)
initn: 958 init1: 418 opt: 1260 Z-score: 453.3 bits: 95.1 E(32554): 6.3e-19
Smith-Waterman score: 1264; 38.4% identity (69.8% similar) in 536 aa overlap (6-527:2-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK
: :.:......:. :: . .. . ::: : .. .: : ..: . .::. .
CCDS46 MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF
. .....:.. .:.:..::::::::.:: .:. :.: .:::::...:..:.::.. .
CCDS46 PIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARFY
: ::::... .. :..:: .::::. :::.::::. ::::..:.:.. .: . ::::
CCDS46 FREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 TAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTP
::.:.:.:..: .:..:::.::::.:::. ::..:::::.:.:. .: :: .:::::
CCDS46 LAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DYISPEVLKSQGGD---GYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKN
::.:::.:.. :: : :: :::::..::: :::. :.::::::: . ::.::...:.
CCDS46 DYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SLTFPD-DNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRH-LFFKNDQWAWETLRDTVA
:..: :. . .::...: .: :.::::.:. ... : .:: : :. :::.:
CCDS46 HLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLD---WDGLRDSVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 PVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANP
: .::. . :: ::: .:. ::. . : .: .:::::..: : .: :
CCDS46 PFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY-SCMALRDSEVP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE3 NDNRTSSNADKSLQE-----SLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKE
. . .:.. :. ::. .. .: :. . . ... : ....
CCDS46 GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDET--AEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEA
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 LDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDL
:.:: :..: . :. ... . .. :.:: .: :..: .: :....: :
CCDS46 LEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQL----REAEARN---RDLEAHVRQLQERMELL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 KKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQ
.
CCDS46 QAEGATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPARVPRPGLSE
530 540 550 560 570 580
1354 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:26:09 2016 done: Sun Nov 6 00:26:10 2016
Total Scan time: 4.760 Total Display time: 0.570
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]