Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3446
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3446, 387 aa
1>>>pF1KE3446 387 - 387 aa - 387 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9523+/-0.000986; mu= 13.2799+/- 0.059
mean_var=114.5810+/-31.121, 0's: 0 Z-trim(106.0): 251 B-trim: 1121 in 2/49
Lambda= 0.119817
statistics sampled from 8377 (8732) to 8377 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 2645 468.7 3.9e-132
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 2385 423.7 1.3e-118
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 1187 216.6 2.7e-56
CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 ( 423) 776 145.7 7.5e-35
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 669 127.1 2.3e-29
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 544 105.5 8.1e-23
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 518 101.0 1.8e-21
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 499 97.7 1.7e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 490 96.2 5.2e-20
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 461 91.1 1.6e-18
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 459 90.8 2e-18
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 459 90.9 2.2e-18
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 455 90.1 3.4e-18
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 448 88.9 7.6e-18
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 446 88.6 1e-17
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 439 87.4 2.4e-17
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 436 86.8 3.3e-17
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 436 86.9 3.7e-17
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 422 84.4 1.8e-16
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 422 84.4 1.8e-16
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 416 83.4 3.6e-16
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 416 83.4 3.7e-16
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 415 83.2 3.9e-16
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 415 83.2 4e-16
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 415 83.2 4.2e-16
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 413 82.9 5.3e-16
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 409 82.2 8.4e-16
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 409 82.2 8.4e-16
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 408 82.0 8.9e-16
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 407 81.9 1.1e-15
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 404 81.3 1.6e-15
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 403 81.2 1.9e-15
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 402 81.0 2e-15
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 402 81.0 2.1e-15
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 402 81.0 2.1e-15
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 402 81.0 2.1e-15
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 402 81.0 2.1e-15
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 402 81.0 2.2e-15
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 402 81.0 2.3e-15
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 402 81.1 2.4e-15
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 398 80.3 3.1e-15
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 397 80.1 3.3e-15
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 394 79.6 4.9e-15
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 387 78.4 1.2e-14
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 386 78.2 1.3e-14
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 386 78.2 1.4e-14
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 386 78.2 1.4e-14
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 385 78.0 1.5e-14
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 385 78.0 1.5e-14
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 385 78.0 1.5e-14
>>CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 (387 aa)
initn: 2645 init1: 2645 opt: 2645 Z-score: 2485.7 bits: 468.7 E(32554): 3.9e-132
Smith-Waterman score: 2645; 98.7% identity (99.7% similar) in 387 aa overlap (1-387:1-387)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGPANVCISF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS53 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGTANVCISF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SICHTFRWHEAMFLLEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SICHTFRWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VICFLPSVVVRIHIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGP
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS53 FPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALIANSGEPWSPSYLGP
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE3 TSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
370 380
>>CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 (363 aa)
initn: 2385 init1: 2385 opt: 2385 Z-score: 2243.2 bits: 423.7 E(32554): 1.3e-118
Smith-Waterman score: 2385; 95.9% identity (98.3% similar) in 362 aa overlap (1-362:1-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
::::::::::::::::::::::.:: :::: :::::::::::.:::.:::::::::::::
CCDS92 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGPANVCISF
::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::::::::::. :::: ::.: ::
CCDS92 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SICHTFRWHEAMFLLEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGP
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE3 TSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
::
CCDS92 TSP
>>CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 (346 aa)
initn: 1137 init1: 850 opt: 1187 Z-score: 1124.2 bits: 216.6 E(32554): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 1187; 52.2% identity (76.0% similar) in 341 aa overlap (17-355:5-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
.:: .. : :..:.::.: . :..: ::::.:: ::::.:.::
CCDS92 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
: ..:::::::::::.::::: :::.:: : :::::::. :: .:::: :::.::::
CCDS92 PSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGPANVCISF
::.::::.:::::::.: ::. .:: : : ::.... ::.:: .. : . : : ::
CCDS92 VAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE3 SICHTFRWHEAMFLLEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQ-MDRHAKIKRAITFIMVVAIV
. . ::. :: :::..::::::::: .:.::::.:: . :.:..:.: ::::::::
CCDS92 IMESANGWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVAIV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 FVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSP
:. :.:::: .:. ..: . .:. :. :: :. ::::::::::::::.:::::::
CCDS92 FITCYLPSVSARLYFLWTVPSSA---CDP--SVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTR-GAPEALMANSGEPWSPSYL
:::.:.. : :. :. :. ..: . ... .. .. ......: :.:
CCDS92 SFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIV
290 300 310 320 330 340
360 370 380
pF1KE3 GPTSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
CCDS92 EWH
>>CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 (423 aa)
initn: 752 init1: 460 opt: 776 Z-score: 739.2 bits: 145.7 E(32554): 7.5e-35
Smith-Waterman score: 776; 42.0% identity (71.2% similar) in 295 aa overlap (18-301:83-362)
10 20 30 40
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
: ..... : :.:.:::..::.::.:
CCDS18 SSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSL
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMF
::.:::.: . : :. .:: .:..:::::: ::. .:::. . :.:: :.. :::.
CCDS18 ALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFML
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLW-GITVGLTVHLLKKK
. :: .:..:::..:..::..::.:::.:.. : .:: .. :: :: . :. ::: .
CCDS18 STNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILL-LNGHLLLST
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LLIQNGPANVCISFSI----CHTFRWHEAMFLLEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDR
. .::. :.:. . ..:::.:..::::.:::..::: . : ..:.: .
CCDS18 F---SGPS--CLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGG
240 250 260 270 280
230 240 250 260 270
pF1KE3 HAKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVV---VRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLA---F
.: .::. . .:. :..::::::.. . . ::: . : ::.:: :
CCDS18 QAGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWL------SAC---RSLDLCTQLF
290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 FITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPN
.:.:::.::.::::.: ::::.:
CCDS18 HGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREA
340 350 360 370 380 390
>>CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 (319 aa)
initn: 646 init1: 381 opt: 669 Z-score: 640.8 bits: 127.1 E(32554): 2.3e-29
Smith-Waterman score: 669; 35.6% identity (67.9% similar) in 312 aa overlap (19-323:6-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
: . .: .. .:::: .:::::..::: : :... ::
CCDS52 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
..:.:::.::.:: ::::. .:. . :..: . : . :.. ..:. .. ::..
CCDS52 PYAVYLLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALHFLLDLSRSVGMAFLAA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGPANVCISF
::.:::.:::::. .: .: .: .: :.: . :.:: : . :: .. : ::
CCDS52 VALDRYLRVVHPRLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISEAAQN--STRCHSF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE3 ----SICHTFRWHEAMFLLEFLLPLGIILFCSARIIWSL--RQRQMDRHAKIKRAITFIM
. .. :.::. :.:.::.:.:.::.: :: .: : :. ... :..:: ...
CCDS52 YSRADGSFSIIWQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VVAIVFVICFLPSVVVRIRIFWLLHT-SGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVV
.:...:..:::: ..:. :.: .. .:.. .: . .: :.::..:.:.:::
CCDS52 LVVVLFALCFLPCFLARV----LMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYLHSVLNPVV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 YYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPW
: ::::.: . . ... . ...:: .
CCDS52 YCFSSPTFRSSYRRVFHTLRGKGQAAEPPDFNPRDSYS
290 300 310
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 477 init1: 413 opt: 544 Z-score: 523.1 bits: 105.5 E(32554): 8.1e-23
Smith-Waterman score: 544; 29.6% identity (61.8% similar) in 304 aa overlap (18-315:42-345)
10 20 30 40
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
: . . : :: : : ::.:.:::..
CCDS31 GTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSV
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMF
:.:.: ::.: :.. ...::::.:::: .. :: .. :: ..:: ::: :.: :.:
CCDS31 AIWMFVFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIF
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITV-GLTVHLLKKK
.: :::.::: ... :: ::.: ..:..... .: :: :.: :.: ... :. .
CCDS31 HVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSG
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LLIQNGPANVCISFSICHTFR----WHEAMFLLEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDR
.... . .: . . . .: . . : .:: .:: : . :. .: ...:
CCDS31 TGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDN
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 HAKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVR-IRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLS
...: ....: ::.. ..: :.. . . : . : : .. .: .
CCDS31 SPLRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 FTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGA
.. .:: .::..:.... .: .: . .:
CCDS31 LASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDT
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380
pF1KE3 PEALMANSGEPWSPSYLGPTSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
CCDS31 SL
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 484 init1: 398 opt: 518 Z-score: 498.9 bits: 101.0 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 518; 33.8% identity (62.4% similar) in 290 aa overlap (36-321:68-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 LQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIF
:.::..:.:: ::::.: :: . .:
CCDS21 GLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTPANVF
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTVVAVDR
:..:::::. .. :: . :. . : ::.: :::. :.: .: .:: ::: ...::
CCDS21 LMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYFLTCISADR
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 YFRVVHPHHALNKISNWTAAIISC-LLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGPANVCISFSICH
.. .::: ..: :. : ..: .:: ... . :: . .:.. . ::... .
CCDS21 FLAIVHPVKSL-KLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQTNHTVVCLQLYREK
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TFRWHEAMFLLE--FLLPLGIILFCSARIIWSLRQR-QMDRHAKIKRAITFIMVVAIVFV
. :.:. : : .:. . : :: :::: ..... : : :. .: .: .:.
CCDS21 AS--HHALVSLAVAFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRVEKRLKTK-AVRMIAIVLAIFL
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSF
.::.: : : .. : . : .: . : . :: :: .: .:. :::..:.: . .:
CCDS21 VCFVPYHVNR-SVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKF
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGPT
. . .:. : .: . : :
CCDS21 RHALCNLL--CGKR-LKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
340 350 360
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
initn: 404 init1: 339 opt: 499 Z-score: 481.5 bits: 97.7 E(32554): 1.7e-20
Smith-Waterman score: 499; 28.5% identity (62.0% similar) in 326 aa overlap (10-329:23-333)
10 20 30 40
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
: . ...:: . ..: . .: : . :..:.:::::
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTI--ENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMF
....: :. : .:..:::..:.:.: ::: :::.: :.: :::. ::.. . .
CCDS94 SIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKL
.: .:: ::::..: :.. .::: . :. : .: :. ..: . .. .. :: .
CCDS94 YVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSIMLLDSGS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LIQNGPANVCISFSICHTFRWHEAMFL---LEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHA
::: .. :. ... . . . .. . :::. . .: :: : . .. . .
CCDS94 E-QNGSVTSCLELNLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVPESG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 -KI--KRAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLS
.. ..:.: :... :.: .:::: ..: .: . . . :. :::.
CCDS94 LRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRT-----VHLTTWKVGLCKDRLHKALVITLA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 FTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGA
.. :. ..:..:::.. .: . ... . :: :.:.. .. :
CCDS94 LAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSAL-----RK--GHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETR
300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KE3 PEALMANSGEPWSPSYLGPTSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
CCDS94 V
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 316 init1: 160 opt: 490 Z-score: 472.7 bits: 96.2 E(32554): 5.2e-20
Smith-Waterman score: 490; 29.9% identity (63.8% similar) in 298 aa overlap (17-305:29-322)
10 20 30 40
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLA
: :. :.: .. : .. ::.::. :...
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFA
:..:::..: . . ::. ::::.:.:.. ::: . : : : ::: :.. :
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRH-WPFGDTLCKISGTAFL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 MNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITV--GLTVHLLKKK
: ::..::: ..:::.. .:.: .. . . ..::. .: ... :... :..
CCDS14 TNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LLIQNGPANVCI-SFS--ICHTFRWHEAMFL--LEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMD
. :. ...:. .:: . .:. . ..:. . :..:: . . ::. .. .::.
CCDS14 NV--NNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE3 RH--AKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFIT
. .. :... .: : :::.::.: : . .. :..... :: . : . . . ::
CCDS14 SQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSV-LFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPIT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 LSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTR
: .. .: .:: .:::. :: . :
CCDS14 LCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQ
300 310 320 330 340 350
>>CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 384 init1: 303 opt: 461 Z-score: 446.2 bits: 91.1 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 461; 27.7% identity (59.5% similar) in 321 aa overlap (17-328:23-332)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCF
:: . . :: . :. :. :. ::.... . :
CCDS94 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGS
... :::: :...::: .:.: . :::.. ::. .: :::. :... : : .: .:
CCDS94 KMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFNLYSS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISC-LLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGP
:.::: .. :: ..:: .. : . :...: ..: :.. .. . .
CCDS94 ILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFS-IHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTNRTN
130 140 150 160 170
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pF1KE3 ANVCISFSIC---HTFRWHEAMFL-LEFLLPLGIILFCSARIIWSLRQR-QMDRHAKIK-
..:.... .:..:.. .. : ::: :. .: . :: .: . : : : :
CCDS94 RSACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHGLQTDSCLKQKA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 RAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVR-IRIF-WLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYM
: .:.....: : .:::: ..: ::: :: : : . .. :.... .. .
CCDS94 RRLTILLLLA--FYVCFLPFHILRVIRIESRLLSIS----CSIENQIHEAYIVSRPLAAL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 NSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEAL
:.. . ..: : .: . . . :: :..:. .. .. :
CCDS94 NTFGNLLLYVVVSDNFQQAVCSTV-RC---KVSGNLEQAKKISYSNNP
300 310 320 330
350 360 370 380
pF1KE3 MANSGEPWSPSYLGPTSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
387 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]