Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3427
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3427, 602 aa
1>>>pF1KE3427 602 - 602 aa - 602 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7285+/-0.000952; mu= 3.2918+/- 0.057
mean_var=158.1530+/-33.006, 0's: 0 Z-trim(111.1): 39 B-trim: 590 in 1/50
Lambda= 0.101985
statistics sampled from 12059 (12096) to 12059 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 4072 611.1 1.3e-174
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 3387 510.3 2.3e-144
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 1557 241.1 3.1e-63
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 1265 198.1 2.3e-50
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 931 149.0 1.3e-35
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 840 135.5 1.2e-31
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 832 134.4 3.4e-31
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 824 133.2 6.3e-31
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 803 130.1 5.8e-30
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 790 128.2 2.5e-29
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 787 127.7 2.6e-29
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 783 127.2 4.7e-29
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 775 126.0 1.2e-28
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 772 125.6 1.7e-28
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 720 118.0 4.2e-26
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 718 117.7 5.3e-26
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 683 112.8 6.4e-24
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 683 112.8 6.8e-24
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 608 101.5 3.7e-21
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 586 98.3 3.5e-20
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 582 97.6 4.3e-20
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 558 94.1 6.3e-19
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 497 85.1 2.1e-16
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 474 81.8 3.5e-15
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 410) 467 80.7 4.2e-15
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 465 80.4 4.7e-15
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 463 80.1 6.8e-15
>>CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (602 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4072 Z-score: 3248.6 bits: 611.1 E(32554): 1.3e-174
Smith-Waterman score: 4072; 100.0% identity (100.0% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 QPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 ASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 YNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFPTSQFQYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFPTSQFQYV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 MQAGNAASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MQAGNAASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 TLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVH
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MV
::
CCDS81 MV
>>CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (496 aa)
initn: 3387 init1: 3387 opt: 3387 Z-score: 2705.3 bits: 510.3 E(32554): 2.3e-144
Smith-Waterman score: 3387; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (107-602:1-496)
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 DSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 KAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRV
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 YIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLS
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 PTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIM
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 ETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTFH
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 LAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPSE
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 TFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFPTSQFQYVMQAGNAASSSSSPHMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFPTSQFQYVMQAGNAASSSSSPHMF
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 GGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQ
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600
pF1KE3 YLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
460 470 480 490
>>CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 (607 aa)
initn: 1873 init1: 1405 opt: 1557 Z-score: 1248.7 bits: 241.1 E(32554): 3.1e-63
Smith-Waterman score: 1988; 55.2% identity (73.6% similar) in 636 aa overlap (1-602:1-607)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSERRRSA--VALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEK-GLDLSMEALSPAG---PLG
:.:.::.. :: .:::::::::::..:...:. ..: : . . :.. .: :
CCDS34 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAAGAVDDGGCSRGGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE3 DTEDAAAHGLE----PHPDSEQSTGSDSEVLTERTS---C--SFSTH-TDLASGAAGP--
: ....: : : : . : . : . :: . : .:. . ::: ...:
CCDS34 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE3 VPA--------AMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLD
:: . : . .:.:: :.::::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS34 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::.
CCDS34 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 SFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:::: :::: :.:::.:.:::
CCDS34 SFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 TVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::..:.:::::: .:::::::.
CCDS34 TVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFEDI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLS-PSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCN
. :: :....: ..::. :.. :::: ::: :.:::.::: ::::.
CCDS34 PGIPKQ--GNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNT-------SQLCS
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 LNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTP
: .:: ::::... . .:... :::: . : .::: : :::: . :. .
CCDS34 LAPADYSACARSGLTLNRYSTSLAET-YNRLTN------QAGETFAPPRTPSYV-GVSSS
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE3 PSLPGNSKMEAYGGQLG-SFPTSQFQYVMQAGNAASS------SSSPHMFGGSHMQQSSY
:. : .: :: : .: : . :: .. . . : : . :. .. .:.::
CCDS34 TSV--NMSM---GGTDGDTFSCPQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQTHQGSY
470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 NAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSM
:.: ::.: :::::: :::.:::::::. .::...: :::: :.. .::.:: .: ..
CCDS34 NTFRLHSPCALYGYNFSTSPKLAASPEKIVSSQGSFLGSSPS-GTMTDRQMLPP-VE-GV
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600
pF1KE3 HMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
:..: ..::. :.: :.. ::::.:.:::
CCDS34 HLLSS--GGQQS--FFDSRTLGSLTLSSSQVSAHMV
580 590 600
>>CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 914 init1: 634 opt: 1265 Z-score: 1017.6 bits: 198.1 E(32554): 2.3e-50
Smith-Waterman score: 1400; 45.5% identity (69.0% similar) in 565 aa overlap (9-566:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAA
.::::::.:::::::.: .::::.: ..: .: :
CCDS14 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQD--------PIQAEQP-------ELRE
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE3 AHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEE--IQVELQ
.: : . . ..:... :: : .. . :: .. . :. . . :.:: ::.:::
CCDS14 KKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQ
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYH
..:::::::::::::::::::::::..:::. :::: .::..:.:.::::.::::::::
CCDS14 GSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYH
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SSKWMVAGNADSP-VPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSM
::.::::::.: . :: :.:::: ::.:::::..:::..::::::.::.:::::.::
CCDS14 SSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSM
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 HKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNP
:::.::::::.. : ::: . .:. .:::::.: :: :::::::::::::.:::.:::
CCDS14 HKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPT-EGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 FAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTP
:::::::.:::: :....::: ::: :: :. : . :.::.:.::.::: :.:
CCDS14 FAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYP-WRPSF-TLDFKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAP
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SPSASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLS
:: : :::: : : ::: ..... : :. : :.:: : : . . . . :
CCDS14 SPLNS--LLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCPEAYLPNVNL---PLCYKICPTNFWQQQPLV
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 DSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFP--TS
. .:: :...: : .: ...: ..:.. . : :.: : . : . : :.
CCDS14 LPAPERLASSNSS--QSLAPLM-MEVP-MLSSLGVTNSKSGSS--EDSSDQYLQAPNSTN
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 QFQYVMQA-GNA-ASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPE
:. : .:. :: .: .:. . . :.: :..: ::: :: .. .
CCDS14 QMLYGLQSPGNIFLPNSITPEAL-----------SCSFHPSYDFYRYNFSMPSRLISGSN
450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 KLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGS
.:...... . : ..: .. .. :. ..: .
CCDS14 HLKVNDDSQV--SFGEGKCNHVHWYPA-INHYL
500 510 520
600
pF1KE3 SSQMSVHMV
>>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 (447 aa)
initn: 935 init1: 646 opt: 931 Z-score: 753.1 bits: 149.0 E(32554): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 1008; 42.2% identity (64.8% similar) in 455 aa overlap (11-450:11-436)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALI--GSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTED
:::::.:::. ::. :..:... . : :. .: : : :::. .
CCDS43 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 AAAHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQ
::: : . :: : .: :. :. . . .:. : .: :.
CCDS43 LDAHG-------EFGGGSGSSP----SSSSLCTEPLIPTTPI--IPSE--EMAKIACSLE
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYH
.:: .::..::::::::.::::::..::...:.::. .: . :::::::::::::.::
CCDS43 TKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMH
:.:.:::.:: :.: :.:.:::: .:. ..:.:::.:.::::::::..:::::.:::
CCDS43 RSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KYQPRVHVIRK-DFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNP
:::::::.:.: : ...: : .. .:: :::::::.::::::: ::.:::: ::
CCDS43 KYQPRVHIIKKKDHTASLLNLK----SEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 FAKGFRDSGR----NRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSS
::::::::.: .: ..:.... ... : :.:: :. : . :.:. .:
CCDS43 FAKGFRDSSRLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEE-----DVLGDESQTTPNRGS
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pF1KE3 TGTPSPSAS-SHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLC----NLNLSDYPPCARSNMA
. : : . : : .: : : : :. . .: ... . .. :: .: .:
CCDS43 AFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMP
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 ALQSYPGLSDSGYNRLQSGTT--SATQPSETFMPQRTP-SLISGIPTPPSLPGNSKMEAY
: . : .: :: : : .: . :. : . :.:.
CCDS43 LTPSAIASSMQG-----SGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV
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470 480 490 500 510 520
pF1KE3 GGQLGSFPTSQFQYVMQAGNAASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTS
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20 30 40 50 60 70
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: : : ::: : : : .
CCDS13 ASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPHAYPFAP
20 30 40 50 60 70
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pF1KE3 DSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
. . : .. . .. :..: .:: ... ..:.:. :: .:...:::::.:
CCDS13 AAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKN-AKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVT
80 90 100 110 120 130
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pF1KE3 KAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRV
::::::::...::. :.:: .:.. ::.::::.:::::..:::.:.:::.:: .: ::
CCDS13 KAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADPATPGRV
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pF1KE3 YIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLS
. :::: :.: ::.:.::::::::::: :::.:::::.:::.:::: ::. : .:
CCDS13 HYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDSE
200 210 220 230 240 250
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pF1KE3 PTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSG-----RN-RT
.. ::: : :: ::.::::::..::.::: ::::::::: :: :
CCDS13 KYAE----ENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRP
260 270 280 290 300
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pF1KE3 GLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSC
: .: ..: : :: . : . : :: : .: .. :: .:. : :
CCDS13 GALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGLVTEGS-GLQPGLLDVLLKPPSKKSESLRPPH
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 SPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTS
CCDS13 CKDT
370
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20 30 40 50 60 70
pF1KE3 SVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAAAHGLE--PHPDSEQSTGS
: : : ::: : : : .
CCDS13 ASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPHAYPFAP
20 30 40 50 60 70
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pF1KE3 DSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
. . : .. . .. :..: .:: ... ..:.:. :: .:...:::::.:
CCDS13 AAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKN-AKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVT
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::::::::...::. :.:: .:.. ::.::::.:::::..:::.:.:::.:: .: ::
CCDS13 KAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADPATPGRV
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pF1KE3 YIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLS
. :::: :.: ::.:.::::::::::: :::.:::::.:::.:::: ::. : .:
CCDS13 HYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDSE
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.. ::: : :: ::.::::::..::.::: ::::::::: :: :
CCDS13 KYAE----ENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRP
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pF1KE3 GLEAIMETYAFWRPPVRTLT-----FEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHL
: .: ..: : :: . : .: . ... ..: . .. . : :. ...
CCDS13 GALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKDAAEARREFQRDAGGPAVLGDPAHP-PQLLARV
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pF1KE3 LSPSC--SPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNR
:::: . . :.: : : : :: . . : :: :. ...
CCDS13 LSPSLPGAGGAGGLVPLPGAPGGRPS----------PPNPELRLEA----PGASEPLHHH
370 380 390 400 410
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pF1KE3 LQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFPTSQFQYVMQA
. ..: . .. .. :.: ::: ....: . . : . . : :
CCDS13 PYKYPAAAY---DHYLGAKSR------PAPYPLPG---LRGHGYHPHAHPHHHHHPVSPA
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pF1KE3 GNAASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLL
. ::.....
CCDS13 AAAAAAAAAAAAAANMYSSAGAAPPGSYDYCPR
470 480 490
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: : : ::: : : : .
CCDS13 ASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPHAYPFAP
20 30 40 50 60 70
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. . : .. . .. :..: .:: ... ..:.:. :: .:...:::::.:
CCDS13 AAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKN-AKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVT
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140 150 160 170 180 190
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pF1KE3 YIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLS
. :::: :.: ::.:.::::::::::: :::.:::::.:::.:::: ::. : .:
CCDS13 HYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDSE
200 210 220 230 240 250
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pF1KE3 PTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSG-----RN-RT
.. ::: : :: ::.::::::..::.::: ::::::::: :: :
CCDS13 KYAE----ENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRP
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pF1KE3 GLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSC
: .: ..: : :: . :
CCDS13 GALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVKAETSRNTPEREVELLRDAGGCV
310 320 330 340 350 360
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pF1KE3 AFSVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTE--DAAAHGLE-PHPDSEQS
:.:: : .:. : :.: . :. :. .
CCDS10 MYHPRELYPSLGAGYRLGPAQPGADSSFPPALAEGYRYPELDTPKL
10 20 30 40
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pF1KE3 TGSDSEVLTERTSCSFSTHTDL-----ASGA--AGPVPAAMSSMEEIQVELQCADLWKRF
: . : . ....: : : :. : .: :. :. ... :. .:::.:
CCDS10 DCFLSGM--EAAPRTLAAHPPLPLLPPAMGTEPAPSAPEALHSLPGVSLSLENRELWKEF
50 60 70 80 90 100
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pF1KE3 HDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAG
..:::::::::::::::: ::..:::::. .: . .:..:::. ::: ... .: .:
CCDS10 SSVGTEMIITKAGRRMFPACRVSVTGLDPEARYLFLLDVIPVDGARYR--WQGRRWEPSG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHV
.:. .: :::::::: :.: :::: ::: ..::::. :: .::.:::::::::::.:.
CCDS10 KAEPRLPDRVYIHPDSPATGAHWMRQPVSFHRVKLTNSTLDPHGHLILHSMHKYQPRIHL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 IRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSG
.: ...: . :. .: ::::.: .:::::: :::.::: ::::::::..:
CCDS10 VR---AAQLCSQH----WGGMASFRFPETTFISVTAYQNPQITQLKIAANPFAKGFRENG
230 240 250 260 270
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pF1KE3 RN-RTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSST-GTPSPSASSH
:: . .: .. :. : .. . : .. : . :. .:.:. ..
CCDS10 RNCKRERDARVKRKLRGPEPAATEAYGSGDTPGGPCDSTLGGDIRESDPEQAPAPGEATA
280 290 300 310 320 330
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pF1KE3 LLSPSCSPPT---FHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSN--MAALQSYP-GLSD
.: :. :. . : : .:. . . . .. . : .:: ::. : : .
CCDS10 APAPLCGGPSAEAYLLHPAAFHGAPSHLPTRSPSFPEAPDSGRSAPYSAAFLELPHGSGG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 SGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQL--GSFPTSQ
::: :. :. : :. ...: : : :: . : :: : :: :
CCDS10 SGY--------PAAPPAVPFAPH----FLQGGPFP--LP----YTAPGGYLDVGSKPMY
400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 FQYVMQAGNAASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLS
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pF1KE3 EDAAAHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPV-PAA---MSSMEE
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CCDS91 MADADEGFGLAHTPLEPDAKDLPCDSKPESALGAPSKSPSSPQAAFTQQGMEG
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IQVELQCADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKR
:.: :. .:: .::..:::::::::::::::...::.:::.:. .: . :::::.:..:
CCDS91 IKVFLHERELWLKFHEVGTEMIITKAGRRMFPSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHR
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 YRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHI
:... ..:: :.:.:. .: :.:.:::: :.: ::::.:::.:::::::.:: :::
CCDS91 YKFA--DNKWSVTGKAEPAMPGRLYVHPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFGHI
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLK
::.::::::::.:... : .. .. . . : ::::.: .::.:::..::.::
CCDS91 ILNSMHKYQPRLHIVKADENNGFGSKNTA-----FCTHVFPETAFIAVTSYQNHKITQLK
180 190 200 210 220
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pF1KE3 IDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTL------TFEDFTTMQKQQGGSTG
:. :::::::: : . . :.. . : :. . :.. .. . :..
CCDS91 IENNPFAKGFRGSDDMELHRMSRMQSKEYPVVPRSTVRQKVASNHSPFSSESRALSTSSN
230 240 250 260 270 280
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pF1KE3 T-SPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYP---PC
: .:. .:: . :: : : . . .. :. . :. .:.: :
CCDS91 LGSQYQCENGVSGPS--QDLLPPPNPYPLPQEHSQIYHCTKRKEEECST--TDHPYKKPY
290 300 310 320 330 340
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pF1KE3 ARSNMAALQS-----YPGLSDSGYN-RLQSGTTSATQPSETFMPQR-TPSL--ISGIPTP
... . .: :: . : . : .:. .: . . . :.. .::: :: :
CCDS91 METSPSEEDSFYRSSYPQQQGLGASYRTESAQRQACMYASSAPPSEPVPSLEDIS-CNTW
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 PSLPGNSKMEAYGGQ-LGSFPTSQFQYVMQAG------NAASSSSSPHMFGGSHMQQSSY
::.:. :. . : . .: ..:. . .: . .. .::.. : ..:.:
CCDS91 PSMPSYSSCTVTTVQPMDRLPYQHFSAHFTSGPLVPRLAGMANHGSPQLGEGMFQHQTSV
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 NAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSM
CCDS91 AHQPVVRQCGPQTGLQSPGTLQPPEFLYSHGVPRTLSPHQYHSVHGVGMVPEWSDNS
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602 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]