Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3411, 315 aa
1>>>pF1KE3411 315 - 315 aa - 315 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1117+/-0.000673; mu= -13.5724+/- 0.039
mean_var=714.3608+/-164.009, 0's: 0 Z-trim(113.6): 1645 B-trim: 355 in 1/54
Lambda= 0.047986
statistics sampled from 20826 (23043) to 20826 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 7.130
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004187 (OMIM: 603441) cyclin-dependent kinase-l ( 358) 1534 122.1 1.7e-27
XP_016877218 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 358) 1534 122.1 1.7e-27
XP_005268214 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 358) 1534 122.1 1.7e-27
NP_001269165 (OMIM: 603441) cyclin-dependent kinas ( 276) 1423 114.3 3e-25
XP_016877220 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 301) 1420 114.1 3.6e-25
XP_016877219 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 301) 1420 114.1 3.6e-25
XP_005268216 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 301) 1420 114.1 3.6e-25
XP_016877221 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 279) 1415 113.7 4.4e-25
XP_011535578 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 308) 1218 100.1 5.9e-21
XP_016864300 (OMIM: 603442) PREDICTED: cyclin-depe ( 479) 1212 100.0 1e-20
XP_016864299 (OMIM: 603442) PREDICTED: cyclin-depe ( 493) 1212 100.0 1e-20
NP_003939 (OMIM: 603442) cyclin-dependent kinase-l ( 493) 1212 100.0 1e-20
XP_006714469 (OMIM: 603442) PREDICTED: cyclin-depe ( 530) 1212 100.1 1.1e-20
XP_016864298 (OMIM: 603442) PREDICTED: cyclin-depe ( 570) 1212 100.1 1.1e-20
NP_001317653 (OMIM: 603442) cyclin-dependent kinas ( 570) 1212 100.1 1.1e-20
NP_057592 (OMIM: 608459) cyclin-dependent kinase-l ( 455) 1012 86.1 1.4e-16
NP_001107047 (OMIM: 608459) cyclin-dependent kinas ( 592) 1012 86.3 1.6e-16
XP_016865024 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 592) 1012 86.3 1.6e-16
XP_016865021 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 607) 1012 86.3 1.7e-16
NP_001310218 (OMIM: 300203,300672) cyclin-dependen ( 960) 947 82.1 4.8e-15
NP_001032420 (OMIM: 300203,300672) cyclin-dependen (1030) 947 82.2 5e-15
NP_003150 (OMIM: 300203,300672) cyclin-dependent k (1030) 947 82.2 5e-15
XP_016865016 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 622) 939 81.3 5.6e-15
XP_005268217 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-depe ( 244) 864 75.5 1.2e-13
NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 ( 305) 751 67.8 3.2e-11
XP_016865037 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 307) 733 66.6 7.6e-11
XP_016865025 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 538) 733 66.9 1e-10
XP_016865023 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 602) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865022 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 604) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865019 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 617) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865020 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 617) 733 67.0 1.1e-10
XP_011541731 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 619) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865017 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 619) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865018 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 619) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865014 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 634) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865013 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 634) 733 67.0 1.1e-10
XP_016865015 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 634) 733 67.0 1.1e-10
NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinas ( 297) 723 65.8 1.2e-10
NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 ( 297) 723 65.8 1.2e-10
XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-depe ( 297) 723 65.8 1.2e-10
NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 ( 298) 723 65.8 1.2e-10
NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-l ( 292) 713 65.1 1.9e-10
NP_001790 (OMIM: 601955) cyclin-dependent kinase 7 ( 346) 675 62.6 1.3e-09
NP_001034892 (OMIM: 610076) cyclin-dependent kinas ( 346) 671 62.3 1.6e-09
XP_016870050 (OMIM: 610076) PREDICTED: cyclin-depe ( 351) 651 61.0 4.2e-09
XP_016870051 (OMIM: 610076) PREDICTED: cyclin-depe ( 329) 639 60.1 7.2e-09
XP_016866355 (OMIM: 154235,614181) PREDICTED: seri ( 439) 635 60.0 1e-08
XP_011512924 (OMIM: 154235,614181) PREDICTED: seri ( 583) 635 60.2 1.2e-08
NP_001229314 (OMIM: 154235,614181) serine/threonin ( 583) 635 60.2 1.2e-08
XP_011536034 (OMIM: 116953) PREDICTED: cyclin-depe ( 346) 629 59.4 1.2e-08
>>NP_004187 (OMIM: 603441) cyclin-dependent kinase-like (358 aa)
initn: 1514 init1: 849 opt: 1534 Z-score: 614.8 bits: 122.1 E(85289): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 1534; 70.5% identity (88.7% similar) in 302 aa overlap (1-301:2-303)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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NP_004 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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NP_004 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
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120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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NP_004 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
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180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
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NP_004 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
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NP_004 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE3 RNEGRNRRRQQVLPLKS
.:.
NP_004 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
310 320 330 340 350
>>XP_016877218 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (358 aa)
initn: 1514 init1: 849 opt: 1534 Z-score: 614.8 bits: 122.1 E(85289): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 1534; 70.5% identity (88.7% similar) in 302 aa overlap (1-301:2-303)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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XP_016 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
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pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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XP_016 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
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pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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XP_016 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
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pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
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XP_016 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
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XP_016 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE3 RNEGRNRRRQQVLPLKS
.:.
XP_016 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
310 320 330 340 350
>>XP_005268214 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (358 aa)
initn: 1514 init1: 849 opt: 1534 Z-score: 614.8 bits: 122.1 E(85289): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 1534; 70.5% identity (88.7% similar) in 302 aa overlap (1-301:2-303)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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XP_005 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
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pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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XP_005 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
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pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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XP_005 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
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pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
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XP_005 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
::.::::: :: :: .. ::...::::.:.: .:::: :::. ::....: . :
XP_005 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE3 RNEGRNRRRQQVLPLKS
.:.
XP_005 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
310 320 330 340 350
>>NP_001269165 (OMIM: 603441) cyclin-dependent kinase-li (276 aa)
initn: 849 init1: 849 opt: 1423 Z-score: 574.3 bits: 114.3 E(85289): 3e-25
Smith-Waterman score: 1423; 74.1% identity (90.6% similar) in 266 aa overlap (1-265:2-267)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
::::::..: :::::::::::::. .::.::.:::.:::::::.:::::::::::::::
NP_001 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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NP_001 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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NP_001 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
: ::.:::::::::::.: ::::::::::::::: .::: ::::::..:..: .: :..
NP_001 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
::.::::: :: :: .. ::...::
NP_001 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE
250 260 270
>>XP_016877220 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (301 aa)
initn: 1399 init1: 849 opt: 1420 Z-score: 572.8 bits: 114.1 E(85289): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 1420; 71.6% identity (89.0% similar) in 282 aa overlap (1-281:2-279)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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XP_016 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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XP_016 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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XP_016 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
: ::.:::::::::::.: ::::::::::::::: .::: ::::::..:..: .: :..
XP_016 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
::.::::: :: :: .. ::...: :.. : .:: :..:
XP_016 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLK--LQYLP--QLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNY
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE3 RNEGRNRRRQQVLPLKS
XP_016 RFPNI
300
>>XP_016877219 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (301 aa)
initn: 1399 init1: 849 opt: 1420 Z-score: 572.8 bits: 114.1 E(85289): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 1420; 71.6% identity (89.0% similar) in 282 aa overlap (1-281:2-279)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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XP_016 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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XP_016 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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XP_016 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
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XP_016 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
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XP_016 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLK--LQYLP--QLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNY
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE3 RNEGRNRRRQQVLPLKS
XP_016 RFPNI
300
>>XP_005268216 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (301 aa)
initn: 1399 init1: 849 opt: 1420 Z-score: 572.8 bits: 114.1 E(85289): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 1420; 71.6% identity (89.0% similar) in 282 aa overlap (1-281:2-279)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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XP_005 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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XP_005 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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XP_005 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
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pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
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XP_005 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
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XP_005 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLK--LQYLP--QLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNY
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE3 RNEGRNRRRQQVLPLKS
XP_005 RFPNI
300
>>XP_016877221 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (279 aa)
initn: 1399 init1: 849 opt: 1415 Z-score: 571.3 bits: 113.7 E(85289): 4.4e-25
Smith-Waterman score: 1415; 74.0% identity (90.6% similar) in 265 aa overlap (1-264:2-266)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
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XP_016 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
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XP_016 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
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XP_016 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
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XP_016 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
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XP_016 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKFHLSKKKKMTLIS
250 260 270
>>XP_011535578 (OMIM: 603441) PREDICTED: cyclin-dependen (308 aa)
initn: 1198 init1: 679 opt: 1218 Z-score: 497.2 bits: 100.1 E(85289): 5.9e-21
Smith-Waterman score: 1218; 67.7% identity (86.7% similar) in 248 aa overlap (55-301:6-253)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 TSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKHPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCD
: ::::::::::.:::::::..::::::::
XP_011 MKPQTLAQLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 HTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIHNCIHRDIKPENILITKQGIIKICD
::.:.::.: :: . ..::. ::::::.:::: :::::::.:::::::::...::.::
XP_011 HTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCD
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pF1KE3 FGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYGSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPG
::::..: :.: :::::::::::.::::::::::: ::.:::::::::::.: :::::
XP_011 FGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 KSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISIPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFM
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XP_011 KSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVKIPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLL
160 170 180 190 200 210
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pF1KE3 KGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKARNEGRNRRRQQVLPLKS
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XP_011 KGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKEHNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQ
220 230 240 250 260 270
XP_011 YLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
280 290 300
>>XP_016864300 (OMIM: 603442) PREDICTED: cyclin-dependen (479 aa)
initn: 1195 init1: 663 opt: 1212 Z-score: 493.1 bits: 100.0 E(85289): 1e-20
Smith-Waterman score: 1218; 53.8% identity (82.1% similar) in 318 aa overlap (1-308:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH
:::::.:. .::::::.:.::::: .:..::.:::.::.:: .:::::.:::..::::.:
XP_016 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH
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XP_016 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
70 80 90 100 110 120
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XP_016 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
130 140 150 160 170 180
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pF1KE3 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI
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XP_016 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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XP_016 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE3 QIK--RKARNEGRNRRRQQVLPLKS
:.: . ::: . ... :
XP_016 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
310 320 330 340 350 360
315 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 04:42:47 2016 done: Sun Nov 6 04:42:48 2016
Total Scan time: 7.130 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]