Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3408
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3408, 293 aa
1>>>pF1KE3408 293 - 293 aa - 293 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3737+/-0.00208; mu= 12.9350+/- 0.124
mean_var=327.1449+/-61.388, 0's: 0 Z-trim(105.8): 917 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.070909
statistics sampled from 7597 (8626) to 7597 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34645.2 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 293) 2064 225.3 4.3e-59
CCDS64661.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 287) 2021 220.8 9e-58
CCDS64660.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 319) 1783 196.6 2e-50
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 1543 172.8 7.6e-43
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1531 171.2 1.5e-42
CCDS46027.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 412) 1377 155.2 7.2e-38
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1369 155.2 2e-37
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 1311 149.1 1.1e-35
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1301 147.8 1.9e-35
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 1293 147.2 3.7e-35
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 1287 146.3 5e-35
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 1271 144.7 1.5e-34
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 1268 144.3 1.8e-34
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 1268 144.3 1.8e-34
CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 ( 483) 1260 143.4 3.1e-34
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1260 143.5 3.3e-34
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1242 141.7 1.2e-33
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 1238 141.3 1.6e-33
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1231 140.5 2.5e-33
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 1223 139.7 4.6e-33
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1219 139.4 6.4e-33
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1199 137.3 2.5e-32
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 1196 137.0 3.1e-32
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1185 135.9 6.8e-32
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1165 134.0 3.1e-31
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 1163 133.6 3.2e-31
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1163 133.7 3.4e-31
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1161 133.4 3.8e-31
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1161 133.4 3.8e-31
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 1155 132.7 5.6e-31
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1160 133.9 5.8e-31
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 1151 132.4 7.9e-31
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1151 132.5 8.2e-31
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 1146 132.2 1.3e-30
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1140 131.2 1.6e-30
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 1134 130.7 2.6e-30
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 1134 130.7 2.6e-30
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7 ( 495) 1132 130.3 2.8e-30
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 1131 130.1 2.8e-30
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1132 131.0 4.1e-30
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 1111 128.0 1.1e-29
CCDS78236.1 ZNF735 gene_id:730291|Hs108|chr7 ( 412) 1104 127.3 1.8e-29
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1100 127.4 3.3e-29
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1100 127.4 3.3e-29
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1100 127.5 3.3e-29
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 1079 124.9 1.2e-28
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1072 124.2 2e-28
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 1061 123.2 4.6e-28
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 1055 122.4 6.3e-28
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1056 123.0 8e-28
>>CCDS34645.2 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 (293 aa)
initn: 2064 init1: 2064 opt: 2064 Z-score: 1174.3 bits: 225.3 E(32554): 4.3e-59
Smith-Waterman score: 2064; 99.7% identity (100.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS34 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGFNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
250 260 270 280 290
>>CCDS64661.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 (287 aa)
initn: 2021 init1: 2021 opt: 2021 Z-score: 1150.6 bits: 220.8 E(32554): 9e-58
Smith-Waterman score: 2021; 99.7% identity (100.0% similar) in 287 aa overlap (7-293:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS64 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGFNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
240 250 260 270 280
>>CCDS64660.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 (319 aa)
initn: 1771 init1: 1771 opt: 1783 Z-score: 1018.7 bits: 196.6 E(32554): 2e-50
Smith-Waterman score: 2002; 91.5% identity (91.8% similar) in 319 aa overlap (1-293:1-319)
10 20 30 40
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFL-----------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLDLITCLEQGKEPWNMKR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE3 ---------ALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QGGFNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
250 260 270 280 290 300
280 290
pF1KE3 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::::::::::::::::
CCDS64 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
310
>>CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (820 aa)
initn: 5115 init1: 1543 opt: 1543 Z-score: 882.7 bits: 172.8 E(32554): 7.6e-43
Smith-Waterman score: 1543; 75.3% identity (88.7% similar) in 292 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
: :::: :::::::::::::::::::..::.:.::::::::::.. .:::::: :::::
CCDS75 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLVMSFHFAQDLWPEQNIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::::: :::: ..::::::::: :::: ::.::.: .:::: : :::::::::::
CCDS75 DSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
:. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:.::.::::..:::: : ::::::::.:::
CCDS75 VFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::
CCDS75 FSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
: :::::: ::::: :.:::::.:: :: ..:..:::. :::.::::::::
CCDS75 TIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHK
250 260 270 280 290 300
CCDS75 RIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILM
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 487.9 bits: 99.7 E(32554): 7.4e-21
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (76-293:325-545)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
CCDS75 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150
pF1KE3 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
CCDS75 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
360 370 380 390 400 410
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
CCDS75 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
CCDS75 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
480 490 500 510 520 530
280 290
pF1KE3 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
CCDS75 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 446.4 bits: 92.1 E(32554): 1.5e-18
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (71-293:570-797)
50 60 70 80 90
pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
CCDS75 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
540 550 560 570 580 590
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
CCDS75 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
600 610 620 630 640 650
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
CCDS75 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
660 670 680 690 700 710
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
CCDS75 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
720 730 740 750 760 770
280 290
pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
CCDS75 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
780 790 800 810 820
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
:::::: :: :::::::::::::::::.:: ::::::::::::..::.::::.: :..::
CCDS75 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLVMCSHFAQDVWPEHSIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::: : ::::::.:::::: :::: :: ..:::::::::: : ::::::.::::
CCDS75 DSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
:.::: : ::.::::: .: :.::. ::.::::.::::::::::: ::::::::.:::
CCDS75 VFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
:..:.: : ::::::::::: :::::..:: :::::::.:::::::: .:::::..:: :
CCDS75 SSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:.:: :::::::::::.:::.:.: :.::. :. ..:::::::::::
CCDS75 TKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHK
250 260 270 280 290 300
CCDS75 IIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHT
310 320 330 340 350 360
>--
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Smith-Waterman score: 788; 65.7% identity (84.6% similar) in 169 aa overlap (125-293:293-461)
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
:: ..::: :: .: ..:.:: :.. ..:
CCDS75 NQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFS
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
::.:: ::: :. :::.::::.:: :..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.
CCDS75 NLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTE
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
::::.:::::::: .:::::. :: .:.:: : :.::::::.:::.:. :::::.::
CCDS75 HKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKII
390 400 410 420 430 440
280 290
pF1KE3 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
.: :.:::::::::::: :
CCDS75 HTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGE
450 460 470 480 490 500
>>CCDS46027.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 (412 aa)
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Smith-Waterman score: 1377; 67.6% identity (82.9% similar) in 293 aa overlap (1-293:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
:::: : :::::::::::.:::.::::.:: :::::::::.::.. :.:::::: ::.::
CCDS46 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDAAQRNLYRDVMLENYRNLIFLVMYSHFAQDLWSEQSIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::: : :: : : ::::.:::.::::: :. :::::.::: : :::::..:::
CCDS46 DSFQKVILRRYEKCRHDNLQLKKGCESVDECPVHKRGYNGLKQCLATTQRKIFQCDEYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
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CCDS46 FLHKFSNSNKHKIRDTGKKSFKCIEYGKTFNQSSTRTTYKKIDAGEKRYKCEECGKAYKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
:..:. ::::::::::::: ::::..:: :: ::::.::::::.: .:::::.. . :
CCDS46 SSHLTTHKKIHTGEKPYKCEECGKAYKQSCNLTTHKIIHTGEKPYRCRECGKAFNHPATL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:: ::: ::::::..:::.: .: :::::.::.:::.:::::::::::: :
CCDS46 FSHKKIHTGEKPYKCDKCGKAFISSSTLTKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHK
250 260 270 280 290 300
CCDS46 RIHTGDVPYKCDECGKTFTWYSSLSKHKRAHTGEKPYKCEECGKAFTAFSTLTEHKIIHT
310 320 330 340 350 360
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQ
:: ::: ::::::: ::::::::::.:.::.:::::::::.::..: .: :
CCDS74 MPGTPGSLEMGLLTFRDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLAFLGICPHFPQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 DLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSK
:.: ::...:::::: : .: : ::.::::::::::::::: :. ::: ::::: . ::
CCDS74 DFWPEQSMEDSFQKVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLTTAQSK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKC
.:::.::.::..:: ::::: :::: .: :.::.: ::.:. . :::: .. :. ::
CCDS74 VFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 EECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCG
.:: :::.::..:.. :.::: .:::::: :::::.: : :: :::: . :: ::: .::
CCDS74 KECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFN
::: :: ::::: ::: :::::::.:::.:..: ::.::. :.:::.:::::::::::.
CCDS74 KAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFS
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LS
:
CCDS74 RSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLST
310 320 330 340 350 360
>--
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90 100 110 120 130 140
pF1KE3 LRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKH
:...:.. :.... :: . ::: ::..:
CCDS74 GEKPYKCKECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKP
790 800 810 820 830 840
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 FRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCE
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CCDS74 SKSEECDKAFIWSSTLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCE
850 860 870 880 890 900
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 VCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGK
::::: ::: :: ::::.:::::::: .:::::..:: ::.:::::: :::::::.:::
CCDS74 ECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGK
910 920 930 940 950 960
270 280 290
pF1KE3 VFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:.:: :::.: ..:::.:::::::::::: :
CCDS74 AFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIS
970 980 990 1000 1010 1020
CCDS74 SSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSAL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
>--
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pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
:: .. . . .:: . ..: .
CCDS74 STHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHK
560 570 580 590 600 610
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 KITTS-KIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHT
.: :. : ..:.. :.. . :. ::: :::.: ..::::::.. :: ::.:: ::.
CCDS74 RIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHA
620 630 640 650 660 670
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKP
:..::::::::.:: :.::. : ::::::::::: :::::. :: ::::: :.: :::
CCDS74 GEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKP
680 690 700 710 720 730
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCE
.:: .::::: :: ::::: ::: :::::::.:::.:..: :::::. :.:::.::::.
CCDS74 FKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCK
740 750 760 770 780 790
290
pF1KE3 ECGKAFNLS
::::::. :
CCDS74 ECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDK
800 810 820 830 840 850
>--
initn: 2827 init1: 788 opt: 808 Z-score: 475.1 bits: 97.9 E(32554): 3.9e-20
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80 90 100 110 120 130
pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.. . :. ::: :::
CCDS74 IHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTE
290 300 310 320 330 340
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::::.. :: ::.:: ::. :..::::::::.:: :.::. : ::::::::
CCDS74 EKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPY
350 360 370 380 390 400
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::::. :: ::::: ..: :::.:: .::::: :: ::::: ::: :::::::.
CCDS74 KCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEE
410 420 430 440 450 460
260 270 280 290
pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: :::::.::.:::.::: ::::::: :
CCDS74 CGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKA
470 480 490 500 510 520
CCDS74 FKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWS
530 540 550 560 570 580
>--
initn: 579 init1: 579 opt: 587 Z-score: 352.9 bits: 75.2 E(32554): 2.5e-13
Smith-Waterman score: 587; 69.1% identity (85.4% similar) in 123 aa overlap (154-276:1003-1125)
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTN
:.:: :: ::: :. ::::::::.: :..
CCDS74 QSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSST
980 990 1000 1010 1020 1030
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pF1KE3 LSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRH
:. :.::: ::::::: ::::: ::: ::.:: ..::::::::..::::::.:: ::.:
CCDS74 LNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KE3 KIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::: :::::::.:::.:.:: ::.:. :.:
CCDS74 KIIHTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHTITPVIPLLWEAEAGGSRGQEMETILAN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
CCDS74 TVKPLLY
>>CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (852 aa)
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10 20 30 40
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLAL---------CSR---
: :::: :::::::::::::::::::..::.:.::::::::::.. : .
CCDS75 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KE3 --------------------FAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSV
:::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: :
CCDS75 EPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHV
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 DECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDK
::: ::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.:
CCDS75 DECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 SLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQ
:.:.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.:
CCDS75 SFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQ
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 SSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTL
:: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: :
CCDS75 SSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHL
250 260 270 280 290 300
270 280 290
pF1KE3 TKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
: ..:..:::. :::.::::::::
CCDS75 TTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQE
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 487.8 bits: 99.8 E(32554): 7.6e-21
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (76-293:357-577)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
CCDS75 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
330 340 350 360 370 380
110 120 130 140 150
pF1KE3 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
CCDS75 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
390 400 410 420 430 440
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
CCDS75 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
CCDS75 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
510 520 530 540 550 560
280 290
pF1KE3 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
CCDS75 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
570 580 590 600 610 620
>--
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50 60 70 80 90
pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
CCDS75 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
580 590 600 610 620
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
CCDS75 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
630 640 650 660 670 680
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pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
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CCDS75 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
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pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
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CCDS75 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
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280 290
pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
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CCDS75 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
810 820 830 840 850
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50 60 70 80
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CCDS32 EAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCES
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pF1KE3 VDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECD
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CCDS32 MDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCG
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150 160 170 180 190 200
pF1KE3 KSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFH
::. :.: ::.:..:::: ::::::::::.::::..:.: :.::::::::::: :::::.
CCDS32 KSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
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210 220 230 240 250 260
pF1KE3 QSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPT
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CCDS32 QSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSST
250 260 270 280 290 300
270 280 290
pF1KE3 LTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:: :. :.:::.:::::::::::. :
CCDS32 LTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTH
310 320 330 340 350 360
>--
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pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.... :. ..::: ::
CCDS32 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
370 380 390 400 410 420
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pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: ::::
CCDS32 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
430 440 450 460 470 480
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::.
CCDS32 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
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pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. :
CCDS32 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
550 560 570 580 590
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20 30 40 50 60 70
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pF1KE3 LQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTEN
:::::::: :::: ::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: :
CCDS55 LQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGN
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pF1KE3 KHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYK
:::.::::.::.:.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.:::::::::
CCDS55 KHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYK
110 120 130 140 150 160
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pF1KE3 CEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQC
:: :::::.::: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:
CCDS55 CEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEEC
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pF1KE3 GKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::.:: :: ..:..:::. :::.::::::::
CCDS55 GKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAF
230 240 250 260 270 280
CCDS55 NISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFS
290 300 310 320 330 340
>--
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pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
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pF1KE3 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
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CCDS55 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
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CCDS55 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
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CCDS55 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
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.:::::::::::: :
CCDS55 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 446.6 bits: 92.0 E(32554): 1.5e-18
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (71-293:533-760)
50 60 70 80 90
pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
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CCDS55 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
510 520 530 540 550 560
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pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
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CCDS55 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
570 580 590 600 610
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
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CCDS55 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
620 630 640 650 660 670
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pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
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CCDS55 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]