Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3336, 974 aa
1>>>pF1KE3336 974 - 974 aa - 974 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6851+/-0.000775; mu= 15.5225+/- 0.047
mean_var=103.9244+/-20.795, 0's: 0 Z-trim(110.7): 18 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.125810
statistics sampled from 11814 (11829) to 11814 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 3.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11076.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 ( 974) 6578 1204.9 0
CCDS54080.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 ( 938) 6085 1115.4 0
CCDS73543.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1343) 2042 381.7 5.4e-105
CCDS9242.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1349) 2020 377.7 8.6e-104
CCDS44659.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1243) 1759 330.3 1.5e-89
CCDS31620.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1244) 1759 330.3 1.5e-89
>>CCDS11076.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 (974 aa)
initn: 6578 init1: 6578 opt: 6578 Z-score: 6450.1 bits: 1204.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6578; 99.9% identity (99.9% similar) in 974 aa overlap (1-974:1-974)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAKAGRAGGPPPGGGASWHLRNVLSDSVESSDDEFFDAREEMAEGKNAILIGMSQWNSND
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAKAGRAGGPPPGGGAPWHLRNVLSDSVESSDDEFFDAREEMAEGKNAILIGMSQWNSND
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRVSLRRQRFPAQGSIEIHEDSEEGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRVSLRRQRFPAQGSIEIHEDSEEGC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPAALGHILIKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPAALGHILIKF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQDAVATVIERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQDAVATVIERA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSSRKGSISSTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSSRKGSISSTQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DTPVAVEEDCSLASSKRLSKSNIDISSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DTPVAVEEDCSLASSKRLSKSNIDISSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SSIHSSVLKDESETPAAGGPQLPEVSLGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSIHSSVLKDESETPAAGGPQLPEVSLGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 FQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRPGRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRPGRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 KESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 DQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 ITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 STKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 STKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 MILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KE3 LSWARGPPKFESVP
::::::::::::::
CCDS11 LSWARGPPKFESVP
970
>>CCDS54080.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 (938 aa)
initn: 6075 init1: 6075 opt: 6085 Z-score: 5966.8 bits: 1115.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6260; 96.2% identity (96.2% similar) in 974 aa overlap (1-974:1-938)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAKAGRAGGPPPGGGASWHLRNVLSDSVESSDDEFFDAREEMAEGKNAILIGMSQWNSND
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAKAGRAGGPPPGGGAPWHLRNVLSDSVESSDDEFFDAR---------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRVSLRRQRFPAQGSIEIHEDSEEGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ---------------GEGTAPCTSSILQEKQRELYRVSLRRQRFPAQGSIEIHEDSEEGC
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPAALGHILIKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPAALGHILIKF
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQDAVATVIERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQDAVATVIERA
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSSRKGSISSTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSSRKGSISSTQ
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DTPVAVEEDCSLASSKRLSKSNIDISSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DTPVAVEEDCSLASSKRLSKSNIDISSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SSIHSSVLKDESETPAAGGPQLPEVSLGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSIHSSVLKDESETPAAGGPQLPEVSLGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 FQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADAL
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRPGRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRPGRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGAS
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNI
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 KESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPL
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRG
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 DQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILY
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 ITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYG
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 STKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSR
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 MILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPA
870 880 890 900 910 920
970
pF1KE3 LSWARGPPKFESVP
::::::::::::::
CCDS54 LSWARGPPKFESVP
930
>>CCDS73543.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1343 aa)
initn: 3669 init1: 1849 opt: 2042 Z-score: 1998.5 bits: 381.7 E(32554): 5.4e-105
Smith-Waterman score: 3571; 55.5% identity (75.9% similar) in 1018 aa overlap (22-965:332-1328)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAKAGRAGGPPPGGGASWHLRNVLSDSVESSDDEFFDAREEMAEGKNAILI
.. :: ::::::::::.:.... .. .
CCDS73 KQWSTSSKSSRSSKRGASPSRHSISEWRMQSIARDSDESSDDEFFDAHEDLSDTEEMFPK
310 320 330 340 350 360
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GMSQWNSNDLVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRVSLRRQRFPAQGSIE
...:.::::...::. : ..: : .. .::. . : .:
CCDS73 DITKWSSNDLMDKIESPEPEDTQDG----------LYRQGAPEFRVASSVE----QLNI-
370 380 390 400
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IHEDSEEGCPQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPA
:... . : ::::::::::.:::::::::: : .: .:...:.. : :.:.:.
CCDS73 IEDEVSQPLAAPPSKIHVLLLVLHGGTILDTGAGDPSSKKGDANTIANVFDTVMRVHYPS
410 420 430 440 450 460
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 ALGHILIKFVPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQD
:::.. :..:::: .::.::.:::.:.:::::::::::::::.::::::::: ::::::.
CCDS73 ALGRLAIRLVPCPPVCSDAFALVSNLSPYSHDEGCLSSSQDHIPLAALPLLATSSPQYQE
470 480 490 500 510 520
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AVATVIERANQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSS
::::::.::: .: .:.::..:. :.::::::::::::.:::::.::: : ..: :::
CCDS73 AVATVIQRANLAYGDFIKSQEGMTFNGQVCLIGDCVGGILAFDALCYSNQPVSESQ-SSS
530 540 550 560 570 580
300 310 320
pF1KE3 RKGSISSTQD----TP---VAVEEDC----------------------SLASSKRLSKSN
:.::. : :: .: . . . : :: ::..::.::
CCDS73 RRGSVVSMQDNDLLSPGILMNAAHCCGGGGGGGGGGGSSGGGGSSGGSSLESSRHLSRSN
590 600 610 620 630 640
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 IDI--SSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFLSSIHSSVLKDESETPAAGGP
.:: :.: :: ::: ::::.::::::. ..: ::.:::::.:.:::. : . ...
CCDS73 VDIPRSNGTED--PKRQLPRKRSDSSTYELDTIQQHQAFLSSLHASVLRTEPCSRHSSSS
650 660 670 680 690 700
390 400 410 420 430
pF1KE3 QLPEVS--LGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDGFQVRPACSQVYSFFHCAD
. . . ::::::...:.:::: :::::::.:.::.:.:: ::.::::.:::..:: ::
CCDS73 TMLDGTGALGRFDFEITDLFLFGCPLGLVLALRKTVIPALDVFQLRPACQQVYNLFHPAD
710 720 730 740 750 760
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 PSASRLEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADALHTHSPLFLEGSSRDSPPL
::::::::::: .:: .:: :::::::.::::: : ::..... . : :::. :
CCDS73 PSASRLEPLLERRFHALPPFSVPRYQRYPLGDGCSTLLVETVQRNPELVLEGGPLAPLPH
770 780 790 800 810 820
500 510 520
pF1KE3 LDA------PASPPQASRFQRPG--------------------------------RRMSE
:. :. : . ::: :: ::
CCDS73 GDGFLETSMPVPAPTWQDGPRPGCAESDVLQTHNAAFQEHGAPSSPGTAPASRGFRRASE
830 840 850 860 870 880
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 GSSHSESSESSDSMAPVGASRITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHASYWE
: :. : ..:.. . ..:.:::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS73 ISIASQVSGMAESYTASSIAQIAAKWWGQKRIDYALYCPDALTAFPTVALPHLFHASYWE
890 900 910 920 930 940
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 STDVVAFILRQVMRYESVNIKESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHRAND
:::::.:.::::::... .: : . ....:..::::: ::::.::::::::::: ::
CCDS73 STDVVSFLLRQVMRHDNSSILELDGKEVSVFTPSKPREKWQRKRTHVKLRNVTANHRIND
950 960 970 980 990 1000
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 VIAAEDGPQVLVGRFMYGPLDMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRITYN
..: :::::::.:::::::::::.:::::::. .:..: ::.:..::: .::.:::..:.
CCDS73 ALANEDGPQVLTGRFMYGPLDMVTLTGEKVDVHIMTQPPSGEWLYLDTLVTNNSGRVSYT
1010 1020 1030 1040 1050 1060
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 VPRPRRLGVGVYPVKMVVRGDQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKV
.:. .::::::::.:::::::.: : ::.::::.: : ::::::::::::::::::::::
CCDS73 IPESHRLGVGVYPIKMVVRGDHTFADSYITVLPKGTEFVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 RPGAVDVVRHWQDLGYMILYITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPLRQK
: ::::::::::::::.:.:.::::::::::::.::.:::::.:.. : :::::::::.:
CCDS73 RAGAVDVVRHWQDLGYLIIYVTGRPDMQKQRVVAWLAQHNFPHGVVSFCDGLVHDPLRHK
1130 1140 1150 1160 1170 1180
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 AIFLRNLMQECFIKISAAYGSTKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSEGYA
: ::. :..: ... ::::::::..:::...: ::.:::::::: : ::::...:::
CCDS73 ANFLKLLISELHLRVHAAYGSTKDVAVYSAISLSPMQIYIVGRPTKKLQQQCQFITDGYA
1190 1200 1210 1220 1230 1240
890 900 910 920 930
pF1KE3 AHLAALEASHRSRPKKNN-SRMILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPAANP
:::: :. :::.:: .:. .:: :::::::: .: .:::.:::: ::.:.: :. :.
CCDS73 AHLAQLKYSHRARPARNTATRMALRKGSFGLPGQGDFLRSRNHLLRTISAQ-PSGPS--H
1250 1260 1270 1280 1290 1300
940 950 960 970
pF1KE3 KPERAQSQPESDKDHERPLP--ALSWARGPPKFESVP
. ::.::: .... .: . : :.:
CCDS73 RHERTQSQADGEQRGQRSMSVAAGCWGRAMTGRLEPGAAAGPK
1310 1320 1330 1340
>>CCDS9242.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1349 aa)
initn: 3147 init1: 1823 opt: 2020 Z-score: 1976.9 bits: 377.7 E(32554): 8.6e-104
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MAKAGRAGGPPPGGGASWHLRNVLSDSVESSDDEFFDAREEMAEGKNAILIGMSQWNS
::::::::::.:.... .. . ...:.:
CCDS92 KSSRSSKRGASPSRHSISEWRMQSIARDSDESSDDEFFDAHEDLSDTEEMFPKDITKWSS
310 320 330 340 350 360
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 NDLVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRVSLRRQRFPAQGSIEIHEDSEE
:::...::. : ..: : .. .::. .. ..: :: :
CCDS92 NDLMDKIESPEPEDTQDG----------LYRQGAPEFRVASSVEQ------LNIIED-EV
370 380 390 400 410
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 GCPQRS--CKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPAALGHI
. : . : ::::::::::.:::::::::: : .: .:...:.. : :.:.:.:::..
CCDS92 SQPLAAPPSKIHVLLLVLHGGTILDTGAGDPSSKKGDANTIANVFDTVMRVHYPSALGRL
420 430 440 450 460 470
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LIKFVPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQDAVATV
:..:::: .::.::.:::.:.:::::::::::::::.::::::::: ::::::.:::::
CCDS92 AIRLVPCPPVCSDAFALVSNLSPYSHDEGCLSSSQDHIPLAALPLLATSSPQYQEAVATV
480 490 500 510 520 530
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IERANQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSSRKGSI
:.::: .: .:.::..:. :.::::::::::::.:::::.::: : ..: ::::.::.
CCDS92 IQRANLAYGDFIKSQEGMTFNGQVCLIGDCVGGILAFDALCYSNQPVSESQ-SSSRRGSV
540 550 560 570 580 590
300 310 320
pF1KE3 SSTQD----TP---VAVEEDC----------------------SLASSKRLSKSNIDI--
: :: .: . . . : :: ::..::.::.::
CCDS92 VSMQDNDLLSPGILMNAAHCCGGGGGGGGGGGSSGGGGSSGGSSLESSRHLSRSNVDIPR
600 610 620 630 640 650
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 SSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFLSSIHSSVLKDESETPAAGGPQLPEV
:.: :: ::: ::::.::::::. ..: ::.:::::.:.:::. : . ... . .
CCDS92 SNGTED--PKRQLPRKRSDSSTYELDTIQQHQAFLSSLHASVLRTEPCSRHSSSSTMLDG
660 670 680 690 700
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 S--LGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDGFQVRPACSQVYSFFHCADPSASR
. ::::::...:.:::: :::::::.:.::.:.:: ::.::::.:::..:: :::::::
CCDS92 TGALGRFDFEITDLFLFGCPLGLVLALRKTVIPALDVFQLRPACQQVYNLFHPADPSASR
710 720 730 740 750 760
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADALHTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPA
:::::: .:: .:: :::::::.::::: : ::::.:.::. : : .. .:: :::
CCDS92 LEPLLERRFHALPPFSVPRYQRYPLGDGCSTLLADVLQTHNAAFQEHGAPSSPG--TAPA
770 780 790 800 810 820
510 520
pF1KE3 S------------------------------PPQASRFQRPGRRMS----------EGSS
: :.: ::.: .
CCDS92 SRGFRRASEISIASQVSGMAESYTASSIAQKAPDALSHTPSVRRLSLLALPAPSPTTPGP
830 840 850 860 870 880
530 540 550 560 570
pF1KE3 HSESSESSDSM--AP----VGASRITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHAS
: . ..: .. :: . ....:::::.:::::::::::.::::::::::::::::
CCDS92 HPPARKASPGLERAPGLPELDIGEVAAKWWGQKRIDYALYCPDALTAFPTVALPHLFHAS
890 900 910 920 930 940
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 YWESTDVVAFILRQVMRYESVNIKESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHR
::::::::.:.::::::... .: : . ....:..::::: ::::.:::::::::::
CCDS92 YWESTDVVSFLLRQVMRHDNSSILELDGKEVSVFTPSKPREKWQRKRTHVKLRNVTANHR
950 960 970 980 990 1000
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 ANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPLDMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRI
::..: :::::::.:::::::::::.:::::::. .:..: ::.:..::: .::.:::.
CCDS92 INDALANEDGPQVLTGRFMYGPLDMVTLTGEKVDVHIMTQPPSGEWLYLDTLVTNNSGRV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 TYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRGDQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSD
.:..:. .::::::::.:::::::.: : ::.::::.: : :::::::::::::::::::
CCDS92 SYTIPESHRLGVGVYPIKMVVRGDHTFADSYITVLPKGTEFVVFSIDGSFAASVSIMGSD
1070 1080 1090 1100 1110 1120
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 PKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILYITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPL
:::: ::::::::::::::.:.:.::::::::::::.::.:::::.:.. : ::::::::
CCDS92 PKVRAGAVDVVRHWQDLGYLIIYVTGRPDMQKQRVVAWLAQHNFPHGVVSFCDGLVHDPL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 RQKAIFLRNLMQECFIKISAAYGSTKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSE
:.:: ::. :..: ... ::::::::..:::...: ::.:::::::: : ::::...
CCDS92 RHKANFLKLLISELHLRVHAAYGSTKDVAVYSAISLSPMQIYIVGRPTKKLQQQCQFITD
1190 1200 1210 1220 1230 1240
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 GYAAHLAALEASHRSRPKKNN-SRMILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPA
::::::: :. :::.:: .:. .:: :::::::: .: .:::.:::: ::.:.: :. :.
CCDS92 GYAAHLAQLKYSHRARPARNTATRMALRKGSFGLPGQGDFLRSRNHLLRTISAQ-PSGPS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
940 950 960 970
pF1KE3 ANPKPERAQSQPESDKDHERPLP--ALSWARGPPKFESVP
. ::.::: .... .: . : :.:
CCDS92 --HRHERTQSQADGEQRGQRSMSVAAGCWGRAMTGRLEPGAAAGPK
1310 1320 1330 1340
>>CCDS44659.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1243 aa)
initn: 3024 init1: 1421 opt: 1759 Z-score: 1721.4 bits: 330.3 E(32554): 1.5e-89
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10 20 30
pF1KE3 MAKAGRAGGPPPGGGASWHLRNVLSDSVESSDDEFFD
:. : . . :...:. :: .::..::::
CCDS44 APPGPDASPDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFD
300 310 320 330 340 350
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 AREEMAEGKNAILIGMSQWNSNDLVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRV
:.: ........ :..:::::... . . . : : : ...: . :
CCDS44 AHEGFSDSEEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEA-EGTPEPGAEAAKGIEDGAQAP----
360 370 380 390 400
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SLRRQRFPAQGSIEIHEDSEEGCPQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTF
:. .:. :. . .: .:.:.:.::.:::::.: :: . : ::..:.
CCDS44 ---RDSEGLDGAGELGAE--------ACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTL
410 420 430 440 450
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 SSVLEKVTRAHFPAALGHILIKFVPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLA
::..: ::: ::: ::::. ...:::: ::. :..:::.:.::::: :: ::::.:::
CCDS44 SSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLVPCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLA
460 470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 ALPLLAISSPQYQDAVATVIERANQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAIC
:::::: :: .:: :::::: :.::.: ::.: .: :: ::: :::: :::.:.:::.:
CCDS44 ALPLLATSSSRYQGAVATVIARTNQAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALC
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 YSAGPSGDSPASSSRKGSISSTQDTPVAVEEDCSLASS-KRLSKSNIDISSGLEDEEPKR
.::. .: . .:::.::... .: ::.. . :.... . :.: ..
CCDS44 HSAN-AGTGSRGSSRRGSMNNELLSPEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPE-PSALPPQRIPS
580 590 600 610 620 630
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 PLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFLSSIHSSVLKDESETPAAGG--PQLPEVSLGRFDFDV
. . ..: . .: : :: . . :::.. :. : : .:.:: :
CCDS44 DMASPEPEGSQNSLQAAP---ATTSSWEPRRASTAFCPPAASSEAPDGPS-STARLDFKV
640 650 660 670 680 690
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 SDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDGFQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHL
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CCDS44 SGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEA-QMRPACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQA
700 710 720 730 740
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 VPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADALHTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRP
. :..:::::.::::::.::::::.:.::: :::: .: .:..: ..:
CCDS44 IAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSSLFLE-----ELEML-VPSTPTSTSGAFWK
750 760 770 780 790 800
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 GRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGASRITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLF
: ... . .. :. : . .: .:::.:::::.::::..:::::::.:::::
CCDS44 GSELATDPPAQPAAPSTTSEV----VKILERWWGTKRIDYSLYCPEALTAFPTVTLPHLF
810 820 830 840 850
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 HASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNIKESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTA
:::::::.::::::::::.. : .. : .:. ::: ::::: :::::::.::::.
CCDS44 HASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECE--EPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTS
860 870 880 890 900 910
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 NHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPLDMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSS
::::.:... : :::: :::::::::.:.:::::::. .:..: ::.:.:. ::.::::
CCDS44 NHRASDTVVCEGRPQVLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQPLSGKWIHFGTEVTNSS
920 930 940 950 960 970
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 GRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRGDQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIM
::.:. :: : ::.:::::.::::::.: : :::. :: : :::::::::.::::::
CCDS44 GRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIM
980 990 1000 1010 1020 1030
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 GSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILYITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVH
::::::: ::::::::::: ::.:.:.::::::::.:::.::::::::.:.. : :::.:
CCDS44 GSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 DPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYGSTKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQF
:::::::.::..:.:: ..: :.::: ::..::..::: :: .:::: ..: :.::::
CCDS44 DPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQTYIVGRAVRKLQAQCQF
1100 1110 1120 1130 1140 1150
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 LSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSRMILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDP
::.::.:::. :::. .:. ... : : :.:.:. : .::::...: :. . .: .
CCDS44 LSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFLRKQSQLLRSRGPSQAER
1160 1170 1180 1190 1200 1210
940 950 960 970
pF1KE3 PAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPALSWARGPPKFESVP
. . :
CCDS44 EGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
1220 1230 1240
>>CCDS31620.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1244 aa)
initn: 3035 init1: 1421 opt: 1759 Z-score: 1721.4 bits: 330.3 E(32554): 1.5e-89
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10 20 30
pF1KE3 MAKAGRAGGPPPGGGASWHLRNVLSDSVESSDDEFFD
:. : . . :...:. :: .::..::::
CCDS31 APPGPDASPDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFD
300 310 320 330 340 350
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 AREEMAEGKNAILIGMSQWNSNDLVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRV
:.: ........ :..:::::... . . . : : : ...: . :
CCDS31 AHEGFSDSEEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEA-EGTPEPGAEAAKGIEDGAQAP----
360 370 380 390 400
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SLRRQRFPAQGSIEIHEDSEEGCPQRSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTF
:. .:. :. . .: .:.:.:.::.:::::.: :: . : ::..:.
CCDS31 ---RDSEGLDGAGELGAE--------ACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTL
410 420 430 440 450
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 SSVLEKVTRAHFPAALGHILIKFVPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLA
::..: ::: ::: ::::. ...:::: ::. :..:::.:.::::: :: ::::.:::
CCDS31 SSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLVPCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLA
460 470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 ALPLLAISSPQYQDAVATVIERANQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAIC
:::::: :: .:: :::::: :.::.: ::.: .: :: ::: :::: :::.:.:::.:
CCDS31 ALPLLATSSSRYQGAVATVIARTNQAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALC
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 YSAGPSGDSPASSSRKGSISSTQDTPVAVEEDCSLASS-KRLSKSNIDISSGLEDEEPKR
.::. .: . .:::.::... .: ::.. . :.... . :.: ..
CCDS31 HSAN-AGTGSRGSSRRGSMNNELLSPEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPE-PSALPPQRIPS
580 590 600 610 620 630
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 PLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFLSSIHSSVLKDESETPAAGG--PQLPEVSLGRFDFDV
. . ..: . .: : :: . . :::.. :. : : .:.:: :
CCDS31 DMASPEPEGSQNSLQAAP---ATTSSWEPRRASTAFCPPAASSEAPDGPS-STARLDFKV
640 650 660 670 680 690
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 SDFFLFGSPLGLVLAMRRTVLPGLDGFQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHL
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CCDS31 SGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEAAQMRPACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQA
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pF1KE3 VPPVSVPRYQRFPLGDGQSLLLADALHTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRP
. :..:::::.::::::.::::::.:.::: :::: .: .:..: ..:
CCDS31 IAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSSLFLE-----ELEML-VPSTPTSTSGAFWK
760 770 780 790 800
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pF1KE3 GRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGASRITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLF
: ... . .. :. : . .: .:::.:::::.::::..:::::::.:::::
CCDS31 GSELATDPPAQPAAPSTTSEV----VKILERWWGTKRIDYSLYCPEALTAFPTVTLPHLF
810 820 830 840 850 860
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pF1KE3 HASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNIKESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTA
:::::::.::::::::::.. : .. : .:. ::: ::::: :::::::.::::.
CCDS31 HASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECE--EPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTS
870 880 890 900 910
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 NHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPLDMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSS
::::.:... : :::: :::::::::.:.:::::::. .:..: ::.:.:. ::.::::
CCDS31 NHRASDTVVCEGRPQVLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQPLSGKWIHFGTEVTNSS
920 930 940 950 960 970
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 GRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRGDQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIM
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CCDS31 GRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIM
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pF1KE3 GSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILYITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVH
::::::: ::::::::::: ::.:.:.::::::::.:::.::::::::.:.. : :::.:
CCDS31 GSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 DPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYGSTKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQF
:::::::.::..:.:: ..: :.::: ::..::..::: :: .:::: ..: :.::::
CCDS31 DPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQTYIVGRAVRKLQAQCQF
1100 1110 1120 1130 1140 1150
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 LSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSRMILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDP
::.::.:::. :::. .:. ... : : :.:.:. : .::::...: :. . .: .
CCDS31 LSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFLRKQSQLLRSRGPSQAER
1160 1170 1180 1190 1200 1210
940 950 960 970
pF1KE3 PAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPALSWARGPPKFESVP
. . :
CCDS31 EGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
1220 1230 1240
974 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 05:39:06 2016 done: Sun Nov 6 05:39:06 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]