Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3314
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3314, 855 aa
1>>>pF1KE3314 855 - 855 aa - 855 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.6698+/-0.00151; mu= -23.0649+/- 0.085
mean_var=472.3574+/-113.515, 0's: 0 Z-trim(105.6): 324 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.059012
statistics sampled from 8185 (8490) to 8185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 5822 512.0 1.8e-144
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 1250 122.8 2.7e-27
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 1250 122.8 2.7e-27
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 1026 103.7 1.5e-21
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 908 93.6 1.4e-18
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 908 93.7 1.6e-18
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 847 88.5 5.4e-17
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 847 88.5 5.4e-17
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 832 87.2 1.2e-16
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 832 87.2 1.3e-16
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 832 87.2 1.3e-16
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 808 85.1 5.4e-16
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 808 85.1 5.5e-16
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 727 78.3 7.1e-14
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 695 75.6 4.7e-13
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 689 75.3 1.4e-12
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 676 74.0 2e-12
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 676 74.0 2e-12
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 663 72.9 4.2e-12
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 663 72.9 4.3e-12
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 648 71.4 5.2e-12
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 648 71.5 5.8e-12
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 648 71.5 6e-12
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 648 71.5 6e-12
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 648 71.5 6e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 648 71.5 6e-12
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 648 71.5 6.2e-12
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 648 71.5 6.4e-12
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 648 71.5 6.8e-12
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 648 71.5 6.8e-12
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 648 71.5 6.8e-12
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 636 70.5 1.3e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 636 70.5 1.3e-11
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 636 70.5 1.4e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 636 70.5 1.4e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 636 70.5 1.4e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 636 70.5 1.4e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 636 70.5 1.4e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 629 69.9 1.8e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 629 69.9 2e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 629 69.9 2.1e-11
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 617 68.9 4.7e-11
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 617 68.9 5e-11
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 617 68.9 5.1e-11
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 617 68.9 5.2e-11
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 617 69.0 5.3e-11
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 612 68.4 5.3e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 612 68.4 5.6e-11
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 617 69.0 6.1e-11
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 601 67.4 7.3e-11
>>CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 (855 aa)
initn: 5822 init1: 5822 opt: 5822 Z-score: 2707.4 bits: 512.0 E(32554): 1.8e-144
Smith-Waterman score: 5822; 100.0% identity (100.0% similar) in 855 aa overlap (1-855:1-855)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MILIPRMLLVLFLLLPILSSAKAQVNPAICRYPLGMSGGQIPDEDITASSQWSESTAAKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MILIPRMLLVLFLLLPILSSAKAQVNPAICRYPLGMSGGQIPDEDITASSQWSESTAAKY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GRLDSEEGDGAWCPEIPVEPDDLKEFLQIDLHTLHFITLVGTQGRHAGGHGIEFAPMYKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRLDSEEGDGAWCPEIPVEPDDLKEFLQIDLHTLHFITLVGTQGRHAGGHGIEFAPMYKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NYSRDGTRWISWRNRHGKQVLDGNSNPYDIFLKDLEPPIVARFVRFIPVTDHSMNVCMRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NYSRDGTRWISWRNRHGKQVLDGNSNPYDIFLKDLEPPIVARFVRFIPVTDHSMNVCMRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ELYGCVWLDGLVSYNAPAGQQFVLPGGSIIYLNDSVYDGAVGYSMTEGLGQLTDGVSGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELYGCVWLDGLVSYNAPAGQQFVLPGGSIIYLNDSVYDGAVGYSMTEGLGQLTDGVSGLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DFTQTHEYHVWPGYDYVGWRNESATNGYIEIMFEFDRIRNFTTMKVHCNNMFAKGVKIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DFTQTHEYHVWPGYDYVGWRNESATNGYIEIMFEFDRIRNFTTMKVHCNNMFAKGVKIFK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EVQCYFRSEASEWEPNAISFPLVLDDVNPSARFVTVPLHHRMASAIKCQYHFADTWMMFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EVQCYFRSEASEWEPNAISFPLVLDDVNPSARFVTVPLHHRMASAIKCQYHFADTWMMFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EITFQSDAAMYNNSEALPTSPMAPTTYDPMLKVDDSNTRILIGCLVAIIFILLAIIVIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EITFQSDAAMYNNSEALPTSPMAPTTYDPMLKVDDSNTRILIGCLVAIIFILLAIIVIIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 WRQFWQKMLEKASRRMLDDEMTVSLSLPSDSSMFNNNRSSSPSEQGSNSTYDRIFPLRPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WRQFWQKMLEKASRRMLDDEMTVSLSLPSDSSMFNNNRSSSPSEQGSNSTYDRIFPLRPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 YQEPSRLIRKLPEFAPGEEESGCSGVVKPVQPSGPEGVPHYAEADIVNLQGVTGGNTYSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YQEPSRLIRKLPEFAPGEEESGCSGVVKPVQPSGPEGVPHYAEADIVNLQGVTGGNTYSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PAVTMDLLSGKDVAVEEFPRKLLTFKEKLGEGQFGEVHLCEVEGMEKFKDKDFALDVSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PAVTMDLLSGKDVAVEEFPRKLLTFKEKLGEGQFGEVHLCEVEGMEKFKDKDFALDVSAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 QPVLVAVKMLRADANKNARNDFLKEIKIMSRLKDPNIIHLLAVCITDDPLCMITEYMENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QPVLVAVKMLRADANKNARNDFLKEIKIMSRLKDPNIIHLLAVCITDDPLCMITEYMENG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DLNQFLSRHEPPNSSSSDVRTVSYTNLKFMATQIASGMKYLSSLNFVHRDLATRNCLVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLNQFLSRHEPPNSSSSDVRTVSYTNLKFMATQIASGMKYLSSLNFVHRDLATRNCLVGK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NYTIKIADFGMSRNLYSGDYYRIQGRAVLPIRWMSWESILLGKFTTASDVWAFGVTLWET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NYTIKIADFGMSRNLYSGDYYRIQGRAVLPIRWMSWESILLGKFTTASDVWAFGVTLWET
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 FTFCQEQPYSQLSDEQVIENTGEFFRDQGRQTYLPQPAICPDSVYKLMLSCWRRDTKNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FTFCQEQPYSQLSDEQVIENTGEFFRDQGRQTYLPQPAICPDSVYKLMLSCWRRDTKNRP
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE3 SFQEIHLLLLQQGDE
:::::::::::::::
CCDS12 SFQEIHLLLLQQGDE
850
>>CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 (876 aa)
initn: 3015 init1: 887 opt: 1250 Z-score: 603.6 bits: 122.8 E(32554): 2.7e-27
Smith-Waterman score: 3152; 54.8% identity (75.8% similar) in 887 aa overlap (5-849:3-868)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MILIPRMLLVLFLLLPILSS---AKAQVNPAICRYPLGMSGGQIPDEDITASSQWSESTA
:. : :.::: . :. :.. .:: ::: :::. ::: ::.:::.::.:::
CCDS46 MGPEALSSLLLLLLVASGDADMKGHFDPAKCRYALGMQDRTIPDSDISASSSWSDSTA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 AKYGRLDSEEGDGAWCPEIPVEPDDLKEFLQIDLHTLHFITLVGTQGRHAGGHGIEFAPM
:...::.: .::::::: : : . .:.::.::. ::...::::::::::: : ::.
CCDS46 ARHSRLESSDGDGAWCPAGSVFPKE-EEYLQVDLQRLHLVALVGTQGRHAGGLGKEFSRS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 YKINYSRDGTRWISWRNRHGKQVLDGNSNPYDIFLKDLEPPIVARFVRFIPVTDHSMNVC
:.. ::::: ::..:..: :..:..:: .: . :::: ::.:::.::: : .:. :.::
CCDS46 YRLRYSRDGRRWMGWKDRWGQEVISGNEDPEGVVLKDLGPPMVARLVRFYPRADRVMSVC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 MRVELYGCVWLDGLVSYNAPAGQQFVLPGGSIIYLNDSVYDG-AVGYSMTEGLGQLTDGV
.:::::::.: :::.::.::.:: . : . .:::::.::: .:: . :::::.:::
CCDS46 LRVELYGCLWRDGLLSYTAPVGQTMYL--SEAVYLNDSTYDGHTVGGLQYGGLGQLADGV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SGLDDFTQTHEYHVWPGYDYVGWRNESATNGYIEIMFEFDRIRNFTTMKVHCNNMFAKGV
::::: ...: .:::::::::: :.: ..::.:. :::::.: : .:.:::::: . :.
CCDS46 VGLDDFRKSQELRVWPGYDYVGWSNHSFSSGYVEMEFEFDRLRAFQAMQVHCNNMHTLGA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 KIFKEVQCYFR-SEASEWEPNAISFPLVLDDVNPSARFVTVPLHHRMASAIKCQYHFADT
.. :.: :: . : :: . . : . .: :: :.::: :.: ..:.. ::
CCDS46 RLPGGVECRFRRGPAMAWEGEPMRHNLGGNLGDPRARAVSVPLGGRVARFLQCRFLFAGP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KE3 WMMFSEITFQSDAAMYNNSEAL----PTSP---------------MAPTTYDPMLKVDDS
:..::::.: ::. . :.: :: : .: . : .:. :.. :
CCDS46 WLLFSEISFISDV-VNNSSPALGGTFPPAPWWPPGPPPTNFSSLELEPRGQQPVAKAEGS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 NTRILIGCLVAIIFILLAIIVIILWRQFWQKMLEKASRRMLDDEMTVSLSLPSDSSMFNN
: ::::::::::..:: ::...::: :...: :: ::.:..:.:: ::.:.:. ..::
CCDS46 PTAILIGCLVAIILLLLLIIALMLWRLHWRRLLSKAERRVLEEELTVHLSVPGDTILINN
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 NRSSSPSEQGSNSTYDRIFPLRPDYQEPSRLIRKLPEFAPGEEE-SGCSG-VVKPVQPSG
.: : : : :::: : . :. :: . :. :: ..: .:..
CCDS46 --RPGPRE-----------P--PPYQEP-RPRGNPPHSAPCVPNGSAYSGDYMEPEKPGA
480 490 500 510
520 530 540 550 560
pF1KE3 P-------EGVPHYAEADIVNLQGVTGGNTYSVPAVTMDLLSGKDVAVEEFPRKLLTFKE
: ..::::::::::.::::::::::.:::. . : .:::. : :::
CCDS46 PLLPPPPQNSVPHYAEADIVTLQGVTGGNTYAVPALPPGAV-GDGPPRVDFPRSRLRFKE
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 KLGEGQFGEVHLCEVEGMEKFKDKDFALDVSANQPVLVAVKMLRADANKNARNDFLKEIK
:::::::::::::::.. . . . :: :.: ..:.:::::.:: ::.::::::::::.:
CCDS46 KLGEGQFGEVHLCEVDSPQDLVSLDFPLNVRKGHPLLVAVKILRPDATKNARNDFLKEVK
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670
pF1KE3 IMSRLKDPNIIHLLAVCITDDPLCMITEYMENGDLNQFLSRHE---------PPNSSSSD
:::::::::::.::.::. ::::::::.:::::::::::: :. : ......
CCDS46 IMSRLKDPNIIRLLGVCVQDDPLCMITDYMENGDLNQFLSAHQLEDKAAEGAPGDGQAAQ
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 VRTVSYTNLKFMATQIASGMKYLSSLNFVHRDLATRNCLVGKNYTIKIADFGMSRNLYSG
:.:: : .:.::::::.::..::::::::::::::::.:.::::::::::::::.:
CCDS46 GPTISYPMLLHVAAQIASGMRYLATLNFVHRDLATRNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAG
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 DYYRIQGRAVLPIRWMSWESILLGKFTTASDVWAFGVTLWETFTFCQEQPYSQLSDEQVI
::::.:::::::::::.:: ::.::::::::::::::::::.. .:. ::..::.:::::
CCDS46 DYYRVQGRAVLPIRWMAWECILMGKFTTASDVWAFGVTLWEVLMLCRAQPFGQLTDEQVI
760 770 780 790 800 810
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 ENTGEFFRDQGRQTYLPQPAICPDSVYKLMLSCWRRDTKNRPSFQEIHLLLLQQGDE
::.::::::::::.:: .: ::...:.::: :: :....:: :...: .:
CCDS46 ENAGEFFRDQGRQVYLSRPPACPQGLYELMLRCWSRESEQRPPFSQLHRFLAEDALNTV
820 830 840 850 860 870
>>CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 (894 aa)
initn: 3015 init1: 887 opt: 1250 Z-score: 603.5 bits: 122.8 E(32554): 2.7e-27
Smith-Waterman score: 3152; 54.8% identity (75.8% similar) in 887 aa overlap (5-849:21-886)
10 20 30 40
pF1KE3 MILIPRMLLVLFLLLPILSS---AKAQVNPAICRYPLGMSGGQI
:. : :.::: . :. :.. .:: ::: :::. :
CCDS56 MSLPRCCPHPLRPEGSGAMGPEALSSLLLLLLVASGDADMKGHFDPAKCRYALGMQDRTI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 PDEDITASSQWSESTAAKYGRLDSEEGDGAWCPEIPVEPDDLKEFLQIDLHTLHFITLVG
:: ::.:::.::.::::...::.: .::::::: : : . .:.::.::. ::...:::
CCDS56 PDSDISASSSWSDSTAARHSRLESSDGDGAWCPAGSVFPKE-EEYLQVDLQRLHLVALVG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 TQGRHAGGHGIEFAPMYKINYSRDGTRWISWRNRHGKQVLDGNSNPYDIFLKDLEPPIVA
:::::::: : ::. :.. ::::: ::..:..: :..:..:: .: . :::: ::.::
CCDS56 TQGRHAGGLGKEFSRSYRLRYSRDGRRWMGWKDRWGQEVISGNEDPEGVVLKDLGPPMVA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RFVRFIPVTDHSMNVCMRVELYGCVWLDGLVSYNAPAGQQFVLPGGSIIYLNDSVYDG-A
:.::: : .:. :.::.:::::::.: :::.::.::.:: . : . .:::::.::: .
CCDS56 RLVRFYPRADRVMSVCLRVELYGCLWRDGLLSYTAPVGQTMYL--SEAVYLNDSTYDGHT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 VGYSMTEGLGQLTDGVSGLDDFTQTHEYHVWPGYDYVGWRNESATNGYIEIMFEFDRIRN
:: . :::::.::: ::::: ...: .:::::::::: :.: ..::.:. :::::.:
CCDS56 VGGLQYGGLGQLADGVVGLDDFRKSQELRVWPGYDYVGWSNHSFSSGYVEMEFEFDRLRA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 FTTMKVHCNNMFAKGVKIFKEVQCYFR-SEASEWEPNAISFPLVLDDVNPSARFVTVPLH
: .:.:::::: . :... :.: :: . : :: . . : . .: :: :.:::
CCDS56 FQAMQVHCNNMHTLGARLPGGVECRFRRGPAMAWEGEPMRHNLGGNLGDPRARAVSVPLG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE3 HRMASAIKCQYHFADTWMMFSEITFQSDAAMYNNSEAL----PTSP--------------
:.: ..:.. :: :..::::.: ::. . :.: :: : .:
CCDS56 GRVARFLQCRFLFAGPWLLFSEISFISDV-VNNSSPALGGTFPPAPWWPPGPPPTNFSSL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 -MAPTTYDPMLKVDDSNTRILIGCLVAIIFILLAIIVIILWRQFWQKMLEKASRRMLDDE
. : .:. :.. : : ::::::::::..:: ::...::: :...: :: ::.:..:
CCDS56 ELEPRGQQPVAKAEGSPTAILIGCLVAIILLLLLIIALMLWRLHWRRLLSKAERRVLEEE
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 MTVSLSLPSDSSMFNNNRSSSPSEQGSNSTYDRIFPLRPDYQEPSRLIRKLPEFAPGEEE
.:: ::.:.:. ..:: .: : : : :::: : . :. :: .
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510 520 530 540 550
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:. :: ..: .:..: ..::::::::::.::::::::::.:::. . :
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560 570 580 590 600 610
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.:::. : ::::::::::::::::::.. . . . :: :.: ..:.:::::.::
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::.::::::::::.::::::::::::.::.::. ::::::::.:::::::::::: :.
CCDS56 PDATKNARNDFLKEVKIMSRLKDPNIIRLLGVCVQDDPLCMITDYMENGDLNQFLSAHQL
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680 690 700 710 720
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: ...... :.:: : .:.::::::.::..::::::::::::::::.:.
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730 740 750 760 770 780
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::::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: ::.::::::::::::::::::..
CCDS56 TIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQGRAVLPIRWMAWECILMGKFTTASDVWAFGVTLWEVLM
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790 800 810 820 830 840
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.:. ::..::.:::::::.::::::::::.:: .: ::...:.::: :: :....:: :
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850
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...: .:
CCDS56 SQLHRFLAEDALNTV
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.::::.: ::. . :.: :: : .: . : .:. :.. : :
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. .. :: ..: .:..: ..::::::::::.::::::::::.:::. .
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.:: ::.::::::::::.::::::::::::.::.::. ::::::::.::::::::::::
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670 680 690 700 710
pF1KE3 HE---------PPNSSSSDVRTVSYTNLKFMATQIASGMKYLSSLNFVHRDLATRNCLVG
:. : ...... :.:: : .:.::::::.::..::::::::::::::::
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720 730 740 750 760 770
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.:.::::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: ::.::::::::::::::::::
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780 790 800 810 820 830
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840 850
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CCDS34 PPFSQLHRFLAEDALNTV
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:..::::.: ::. . :.: :: : .: . : .:. :.. :
CCDS75 WLLFSEISFISDV-VNNSSPALGGTFPPAPWWPPGPPPTNFSSLELEPRGQQPVAKAEGS
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: ::::::::::..:: ::...::: :...: : : : :
CCDS75 PTAILIGCLVAIILLLLLIIALMLWRLHWRRLLSK-----------VLESHP--------
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: :
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::::::.. . . . :: :.: ..:.:::::.:: ::.::::::::::.::::::::::
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::.::.::. ::::::::.:::::::::::: :. : ...... :.:: :
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.:.::::::.::..::::::::::::::::.:.::::::::::::::.:::::.::::
CCDS75 LHVAAQIASGMRYLATLNFVHRDLATRNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQGRA
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CCDS75 QGRQVYLSRPPACPQGLYELMLRCWSRESEQRPPFSQLHRFLAEDALNTV
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CCDS47 MGPEALSSLLLLLLVASGDADMKGHFDPAKCRYALGMQDRTIPDSDISASSSWSDSTAAR
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pF1KE3 YGRLDSEEGDGAWCPEIPVEPDDLKEFLQIDLHTLHFITLVGTQGRHAGGHGIEFAPMYK
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CCDS47 HSRLESSDGDGAWCPAGSVFPKE-EEYLQVDLQRLHLVALVGTQGRHAGGLGKEFSRSYR
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pF1KE3 INYSRDGTRWISWRNRHGKQVLDGNSNPYDIFLKDLEPPIVARFVRFIPVTDHSMNVCMR
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CCDS47 LRYSRDGRRWMGWKDRWGQEVISGNEDPEGVVLKDLGPPMVARLVRFYPRADRVMSVCLR
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pF1KE3 VELYGCVWLDGLVSYNAPAGQQFVLPGGSIIYLNDSVYDG-AVGYSMTEGLGQLTDGVSG
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CCDS47 VELYGCLWRDGLLSYTAPVGQTMYL--SEAVYLNDSTYDGHTVGGLQYGGLGQLADGVVG
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pF1KE3 LDDFTQTHEYHVWPGYDYVGWRNESATNGYIEIMFEFDRIRNFTTMKVHCNNMFAKGVKI
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CCDS47 LDDFRKSQELRVWPGYDYVGWSNHSFSSGYVEMEFEFDRLRAFQAMQVHCNNMHTLGARL
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CCDS47 PGGVECRFRRGPAMAWEGEPMRHNLGGNLGDPRARAVSVPLGGRVARFLQCRFLFAGPWL
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pF1KE3 MFSEITFQSDAAMYNNSEAL----PTSP---------------MAPTTYDPMLKVDDSNT
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CCDS47 LFSEISFISDV-VNNSSPALGGTFPPAPWWPPGPPPTNFSSLELEPRGQQPVAKAEGSPT
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CCDS47 AILIGCLVAIILLLLLIIALMLWRLHWRRLLSKAERRVLEEELTVHLSVPGDTILINNRP
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CCDS47 GPREPPPYQEPRPRGNPPHSAPCVPNGSALLLSNPAYRLLLATYARPPRGPGPPTPAWAK
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CCDS47 -GDGPPRVDFPRSRLRFKEKLGEGQFGEVHLCEVDSPQDLVSLDFPLNVRKGHPLLVAVK
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CCDS47 ILRPDATKNASFSLFSRNDFLKEVKIMSRLKDPNIIRLLGVCVQDDPLCMITDYMENGDL
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pF1KE3 NQFLSRHE---------PPNSSSSDVRTVSYTNLKFMATQIASGMKYLSSLNFVHRDLAT
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720 730 740 750 760 770
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::::::.:.::::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: ::.::::::::::::
CCDS47 RNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQGRAVLPIRWMAWECILMGKFTTASDVWAF
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780 790 800 810 820 830
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840 850
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CCDS10 RPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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CCDS30 GMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPP
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CCDS30 MTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAE
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pF1KE3 VEGMEKFKDKDFALDVSANQPVLVAVKMLRADANKNARNDFLKEIKIMSRLKDPNIIHLL
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CCDS30 CHNLLPEQDK-----------MLVAVKALK-EASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFF
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pF1KE3 AVCITDDPLCMITEYMENGDLNQFLSRHEPPN---SSSSDVRT--VSYTNLKFMATQIAS
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CCDS30 GVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAA
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CCDS30 GMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]