Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3305
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3305, 796 aa
1>>>pF1KE3305 796 - 796 aa - 796 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6288+/-0.00146; mu= 14.3629+/- 0.087
mean_var=126.2343+/-26.563, 0's: 0 Z-trim(100.8): 142 B-trim: 50 in 1/50
Lambda= 0.114153
statistics sampled from 6125 (6270) to 6125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 3.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 5261 879.2 0
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 3649 613.8 3.5e-175
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 ( 811) 2475 420.4 5.8e-117
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 1174 206.2 1.8e-52
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 487 93.1 2.5e-18
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 487 93.1 2.5e-18
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049) 443 85.9 3.8e-16
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 ( 839) 425 82.8 2.5e-15
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 406 79.7 2.2e-14
>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 (796 aa)
initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4693.2 bits: 879.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5261; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS
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CCDS34 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 FLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS
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CCDS34 FLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE3 FNMKLTLVTENNDVKS
::::::::::::::::
CCDS34 FNMKLTLVTENNDVKS
790
>>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 (786 aa)
initn: 3649 init1: 2832 opt: 3649 Z-score: 3258.5 bits: 613.8 E(32554): 3.5e-175
Smith-Waterman score: 3649; 69.6% identity (88.3% similar) in 777 aa overlap (12-786:5-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS
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CCDS33 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI
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CCDS33 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN
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CCDS33 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF
: .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. :
CCDS33 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT
...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .::
CCDS33 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL
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CCDS33 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG
.:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::.
CCDS33 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL
..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS33 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL
:::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: ::::::
CCDS33 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::.
CCDS33 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF
::.: :::: .::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR
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CCDS33 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS
::.:.:::
CCDS33 AAINIKLTEQAKK
780
>>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 (811 aa)
initn: 2342 init1: 590 opt: 2475 Z-score: 2213.4 bits: 420.4 E(32554): 5.8e-117
Smith-Waterman score: 2475; 47.9% identity (76.3% similar) in 799 aa overlap (8-796:3-790)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIV-GTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDM
....... : ... . : .. . :. .. :. .: .:: :: : .::.
CCDS34 MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHP
: : . .:: ::. .:.: :: : ::::: :::..:.::..:.:::::.:.:.... .
CCDS34 SYNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEFNKELRYLDLSNNRLKSVTWYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLR
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CCDS34 LAGLRYLDLSFNDFDTMPICEEAGNMSHLEILGLSGAKIQKSDFQKIAHLHLNTVFLGFR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 NYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFI
. . . : :: :::. ::.:. . : . . ...: :..::: : . : :.
CCDS34 T--LPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWVLLRDGIKTSKILEMTNI---DGKSQ-FV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KFLSELTRGPTLLN-----FTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTI--IESI
.. :. :. .: : . ::... : : ..::.: ::...: :.:. .
CCDS34 SY--EMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQIRNVTFGGKAYL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 REEDFTYSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAP
...: ::.:..... .::. .:: ..: .: ....:.: ::::.. . ::: :. :
CCDS34 DHNSFDYSNTVMRTIKLEHVHFRVFYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQMPHMLFPNYP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 STFKFLNFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSW
. :..:::..:..:: .:.. : .:.::::. : :. : :. .... : :: ::.:
CCDS34 TKFQYLNFANNILTDELFKRTIQLPHLKTLILNGNKLETLSLVSCFANNTP-LEHLDLSQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 NSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKL
: :. .. :::.: :..: .::: : :.:::::::: :..:::..:.:..:::....:
CCDS34 NLLQH-KNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLPKSIQILDLNNNQIQTVPKETIHL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 EALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQ
::.:::.::: :::::::. :: :::: :. : . :: :: ::::......:: :::.
CCDS34 MALRELNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSVLNIEMNFILSPSLDFVQSCQEVKTLNAGRNPFR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 CTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIG
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CCDS34 CTCELKNFIQ-LETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLKDVHLHELSCNTALLIVTIV
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 ATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHD
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CCDS34 VIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYSEHD
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 SAWVKSELVPYLEKED--IQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSE
: :::.::.: ::::: : :::.: : ::::: :::.. :::::::::::::::::.:
CCDS34 SLWVKNELIPNLEKEDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIFVLSPNFVQNE
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 WCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKR
:::::.::::::::::.:...::::::::: ::..:::::::. ...::.:::.. :
CCDS34 WCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAYLEWPKDRRKC
710 720 730 740 750 760
780 790
pF1KE3 GLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
::::::.:::.:... . : ....
CCDS34 GLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL
770 780 790 800 810
>>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 (784 aa)
initn: 1018 init1: 462 opt: 1174 Z-score: 1055.7 bits: 206.2 E(32554): 1.8e-52
Smith-Waterman score: 1265; 31.5% identity (64.8% similar) in 793 aa overlap (17-780:11-781)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDK------SKRGLIHVPKDLPLKT
: .:: .. . :. .. :. :. .: .:. : .
CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 KVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQK
: ::.:.: :. .. ::.. .: .: :. : :. .. . :. .::.::::.: :..
CCDS37 KSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE3 ISC---HPIVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAM----KLQKLDLLPIA
.: .:. :. :.: : .:.: . :..:..:..: .. : :.:. :. ..
CCDS37 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HLH-LSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLT
:. : ::..: : .:.: .. ::. : :. : :... ... ::.:
CCDS37 FLEELEIDASDLQSYEPK--SLKSIQNVSHLILHMKQH-ILLLEIFVDVT-SSVECLEL-
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGPT---LLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFL-WPKPVEYLN
: . ..: .:::. : : . .::. ... : . : .:...: . . :.
CCDS37 ----RDTDLDTF--HFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE3 IYNLTI--IESIR--EEDFTYSKTTLKALTIE--HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMML
. . :. . ..: ..: . . ...:::. :: .... ..::.. ... . .
CCDS37 FDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITV
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNVFTDSIFEK--C-STLVKLETLILQKNGLKDLF
: . .. : . .....:....:.... ... : .. .:.::::..: : .:
CCDS37 ENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLE
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400 410 420 430 440 450
pF1KE3 KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIK
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CCDS37 KTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHS--MPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 VLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSAD
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CCDS37 ILDVSNNNLNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKE
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CCDS37 QLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQ
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CCDS37 DVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP-
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CCDS37 IEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKL
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CCDS37 RKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
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..: . : .. .. : . . .: . . . .: : . : .: : . :
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. . .. . : .: :. :. : : .: :.. . . .. .. ... .
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:::.:::.. .: . .:. . . : : : . ::. . ..... ..:
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.:. :. : .:. .... .: :. :.. :: :. . :. . :.
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:..:::. ....: . .:.: . :. :. . .:.:::::. :.: .: .:. .
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. . .. . : .: :. :. : : .: :.. . . .. .. ... .
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. . :. : .. : .. :: : : :::. : .. : .. . :: .. :. ..
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.:. :. : .:. .... .: :. :.. :: :. . :. . :.
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CCDS14 KTVFVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRIC
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CCDS14 FKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQAFSSL
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. : : .. ::.. :: .. . .:. : : .. .
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. .. ::. ... .:. .: . .. ::. . : ... .: . :.
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: . . :.. :. .:: : :.. . .: ::.. :.. .. . ..::::.:
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: :. :... : ... . . .... .::. ::: : .. .
CCDS14 ----------LKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQ
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.: .: . . . : ..: ..:: .:: .: :.: .: .:: :.. :. :. :
CCDS14 LFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETL
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... :.:: .: .:. ::. ::. .:.. . :.:. ..: . ..: .:
CCDS14 DLSHNQLTTVPERLSNCS--RSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMI
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:::. :: .... . : : : ...
CCDS14 QKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATD-VTCVGPGAHK
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:. . :.. ::. :. :. ..:......... ..: . :. ::. :. .. .
CCDS14 GQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDV-WYIYHFCK-AKIK
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: : . . . ::: :. .: : :: .::: :: .. ...::.::...
CCDS14 GYQRLI-----SPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWL
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pF1KE3 PGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPI
::. ..::. . :. : :..::.. .....: . .:..:. :. : . .:::.::
CCDS14 PGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKP
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pF1KE3 PQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
:.: :. .:. . . :.:: . . . :: .. :.
CCDS14 FQKS---KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
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pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIII--VGTRIQFSDGNEFA
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CCDS68 MSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKN---
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40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VDKSKRGLIHVPK----DLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLL
.: : : :. . ..: . .:::.:. : .. . .. ::.:..: :. : :: :
CCDS68 LDLSFNPLRHLGSYSFFSFP-ELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSL
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100 110 120 130 140
pF1KE3 DLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI---VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQL
:..:. ..:. : ...: .. :: ....:... : .... . . :.::..:
CCDS68 ALGAFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 NFLGLSAMKLQKL---DLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHP
. : ::. :.:.. :: . .. : . ::: .. . ... . . : : .
CCDS68 EHLDLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNF
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