Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3293, 765 aa
1>>>pF1KE3293 765 - 765 aa - 765 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6853+/-0.00238; mu= -17.8679+/- 0.133
mean_var=638.3211+/-143.952, 0's: 0 Z-trim(105.1): 498 B-trim: 487 in 1/48
Lambda= 0.050764
statistics sampled from 7727 (8221) to 7727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 5123 392.3 1.5e-108
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 920 84.5 7.1e-16
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 811 77.0 3.1e-13
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 811 77.0 3.1e-13
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 811 77.4 5.4e-13
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 796 75.9 6.8e-13
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 796 75.9 6.8e-13
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 796 75.9 6.8e-13
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 785 75.1 1.2e-12
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 785 75.1 1.2e-12
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 785 75.5 1.9e-12
>>CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 (765 aa)
initn: 5123 init1: 5123 opt: 5123 Z-score: 2062.2 bits: 392.3 E(32554): 1.5e-108
Smith-Waterman score: 5123; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAADPTELRLGSLPVFTRDDFEGDWRLVASGGFSQVFQARHRRWRTEYAIKCAPCLPPDA
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CCDS44 MAADPTELRLGSLPVFTRDDFEGDWRLVASGGFSQVFQARHRRWRTEYAIKCAPCLPPDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ASSDVNYLIEEAAKMKKIKFQHIVSIYGVCKQPLGIVMEFMANGSLEKVLSTHSLCWKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASSDVNYLIEEAAKMKKIKFQHIVSIYGVCKQPLGIVMEFMANGSLEKVLSTHSLCWKLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMHVKISDFGLSKWMEQSTRMQYIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMHVKISDFGLSKWMEQSTRMQYIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 RSALRGMLSYIPPEMFLESNKAPGPKYDVYSFAIVIWELLTQKKPYSGFNMMMIIIRVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSALRGMLSYIPPEMFLESNKAPGPKYDVYSFAIVIWELLTQKKPYSGFNMMMIIIRVAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GMRPSLQPVSDQWPSEAQQMVDLMKRCWDQDPKKRPCFLDITIETDILLSLLQSRVAVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GMRPSLQPVSDQWPSEAQQMVDLMKRCWDQDPKKRPCFLDITIETDILLSLLQSRVAVPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SKALARKVSCKLSLRQPGEVNEDISQELMDSDSGNYLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKALARKVSCKLSLRQPGEVNEDISQELMDSDSGNYLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 NKVTPLHFLVAQGSVEQVRLLLAHEVDVDCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NKVTPLHFLVAQGSVEQVRLLLAHEVDVDCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLLLDHGACVDAQEREGWTPLHLAAQNNFENVARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLLLDHGACVDAQEREGWTPLHLAAQNNFENVARLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VSRQADPNLHEAEGKTPLHVAAYFGHVSLVKLLTSQGAELDAQQRNLRTPLHLAVERGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VSRQADPNLHEAEGKTPLHVAAYFGHVSLVKLLTSQGAELDAQQRNLRTPLHLAVERGKV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RAIQHLLKSGAVPDALDQSGYGPLHTAAARGKYLICKMLLRYGASLELPTHQGWTPLHLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RAIQHLLKSGAVPDALDQSGYGPLHTAAARGKYLICKMLLRYGASLELPTHQGWTPLHLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 AYKGHLEIIHLLAESHANMGALGAVNWTPLHLAARHGEEAVVSALLQCGADPNAAEQSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYKGHLEIIHLLAESHANMGALGAVNWTPLHLAARHGEEAVVSALLQCGADPNAAEQSGW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TPLHLAVQRSTFLSVINLLEHHANVHARNKVGWTPAHLAALKGNTAILKVLVEAGAQLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPLHLAVQRSTFLSVINLLEHHANVHARNKVGWTPAHLAALKGNTAILKVLVEAGAQLDV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE3 QDGVSCTPLQLALRSRKQGIMSFLEGKEPSVATLGGSKPGAEMEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QDGVSCTPLQLALRSRKQGIMSFLEGKEPSVATLGGSKPGAEMEI
730 740 750 760
>>CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 (784 aa)
initn: 1212 init1: 605 opt: 920 Z-score: 398.5 bits: 84.5 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 1507; 38.6% identity (64.4% similar) in 759 aa overlap (10-686:11-762)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAADPTELRLGSLPVFTRDDFEGDWRLVASGGFSQVFQARHRRWRTEYAIKCAPCLPPD
:. : .: .: : :. :.::::.::...:: .:.: ::::.: : :
CCDS13 MEGDGGTPWALALLRTFDAGEFTG-WEKVGSGGFGQVYKVRHVHWKTWLAIKCSPSLHVD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 AASSDVNYLIEEAAKMKKIKFQHIVSIYGVCKQPLGIVMEFMANGSLEKVLSTHSLCWKL
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CCDS13 --DRERMELLEEAKKMEMAKFRYILPVYGICREPVGLVMEYMETGSLEKLLASEPLPWDL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RFRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMHVKISDFGLSKWMEQSTRMQYI
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CCDS13 RFRIIHETAVGMNFLHCMAPPLLHLDLKPANILLDAHYHVKISDFGLAK-CNGLSHSHDL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 ERSALRGMLSYIPPEMFLESNKAPGPKYDVYSFAIVIWELLTQKKPYSGF-NMMMIIIRV
..: : ..:.::: . :... :.:::::::::: .::::::.. :.. :...:
CCDS13 SMDGLFGTIAYLPPERIREKSRLFDTKHDVYSFAIVIWGVLTQKKPFADEKNILHIMVKV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AAGMRPSLQPVSDQWPSEAQQMVDLMKRCWDQDPKKRPCFLDITIETDILLSLLQSRV--
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CCDS13 VKGHRPELPPVCRARPRACSHLIRLMQRCWQGDPRVRPTFQEITSETEDLCEKPDDEVKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE3 --------AVPESK-----ALARKVSC-------KLS--LRQ-----------PGEVNED
. :: . : ...: .:: : : : :....
CCDS13 TAHDLDVKSPPEPRSEVVPARLKRASAPTFDNDYSLSELLSQLDSGVSQAVEGPEELSRS
300 310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KE3 ISQ-ELMDSDSGNYL------------KRALQLS---------------DRKNLV-----
:. .: .: ::. : . .:.:: ..:.::
CCDS13 SSESKLPSSGSGKRLSGVSSVDSAFSSRGSLSLSFEREPSTSDLGTTDVQKKKLVDAIVS
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390
pF1KE3 -----------PRDEELCIYENKVTPLHFLVAQGSVEQVRLLLAHEVDVDCQTASGYTPL
:.: .: . .. .. ::. : :. : .. :: .... . .. : :::
CCDS13 GDTSKLMKILQPQDVDLAL-DSGASLLHLAVEAGQEECAKWLLLNNANPNLSNRRGSTPL
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 LIAAQDQQPDLCALLLAHGADANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLLLDHGACVDAQER
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CCDS13 HMAVERRVRGVVELLLARKISVNAKDEDQWTALHFAAQNGDESSTRLLLEKNASVNEVDF
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 EGWTPLHLAAQNNFENVARLLVSRQADPNLHEAEGKTPLHVAAYFGHVSLVKLLTSQ-GA
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CCDS13 EGRTPMHVACQHGQENIVRILLRRGVDVSLQGKDAWLPLHYAAWQGHLPIVKLLAKQPGV
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 ELDAQQRNLRTPLHLAVERGKVRAIQHLLKSGAVPDALDQSGYGPLHTAAARGKYLICKM
..:: . :::::::..::. :. . :. . .. . . :::.:: :. ..
CCDS13 SVNAQTLDGRTPLHLAAQRGHYRVARILIDLCSDVNVCSLLAQTPLHVAAETGHTSTARL
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 LLRYGASLELPTHQGWTPLHLAAYKGHLEIIHLLAESHANMGALGAVNWTPLHLAARHGE
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CCDS13 LLHRGAGKEAMTSDGYTALHLAARNGHLATVKLLVEEKADVLARGPLNQTALHLAAAHGH
660 670 680 690 700 710
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 EAVVSALLQCGADP-NAAEQSGWTPLHLAVQRSTFLSVINLLEHHANVHARNKVGWTPAH
:: :. .:: . ...: . ::::.: .: .::.: :...
CCDS13 SEVVEELV--SADVIDLFDEQGLSALHLAAQGRHAQTVETLLRHGAHINLQSLKFQGGHG
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 LAALKGNTAILKVLVEAGAQLDVQDGVSCTPLQLALRSRKQGIMSFLEGKEPSVATLGGS
CCDS13 PAATLLRRSKT
780
>>CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861 aa)
initn: 2244 init1: 796 opt: 811 Z-score: 351.0 bits: 77.0 E(32554): 3.1e-13
Smith-Waterman score: 811; 35.7% identity (70.2% similar) in 403 aa overlap (360-759:326-727)
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 DSDSGNYLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYENKVTPLHFLVAQGS-VEQVRLLLAHEVDV
.: ..::: ...::. .. :.::: :.: :
CCDS55 LTPLHCGARSGHEQVVEMLLDRAAPILSKTKNGLSPLH-MATQGDHLNCVQLLLQHNVPV
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 DCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGADANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLLL
: : . : : .::. . . .:: . :. : .:..:::.: ... . .:::
CCDS55 DDVTNDYLTALHVAAHCGHYKVAKVLLDKKANPNAKALNGFTPLHIACKKNRIKVMELLL
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 DHGACVDAQEREGWTPLHLAAQNNFENVARLLVSRQADPNLHEAEGKTPLHVAAYFGHVS
::: ..: . : ::.:.:: . :.. :. . :.:: ...:.: ::.:: :..
CCDS55 KHGASIQAVTESGLTPIHVAAFMGHVNIVSQLMHHGASPNTTNVRGETALHMAARSGQAE
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LVKLLTSQGAELDAQQRNLRTPLHLAVERGKVRAIQHLLKSGAVPDALDQSGYGPLHTAA
.:. :...::...:. .. .::::.... ::. .:.::..:: :.: ::: ::: .:
CCDS55 VVRYLVQDGAQVEAKAKDDQTPLHISARLGKADIVQQLLQQGASPNAATTSGYTPLHLSA
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 ARGKYLICKMLLRYGASLELPTHQGWTPLHLAAYKGHLEIIHLLAESHANMGALGAVNWT
.:. . .:: .:::: . :..:.::::.:: :.::. .:: .. :. : : . :
CCDS55 REGHEDVAAFLLDHGASLSITTKKGFTPLHVAAKYGKLEVANLLLQKSASPDAAGKSGLT
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 PLHLAARHGEEAVVSALLQCGADPNAAEQSGWTPLHLAVQRSTFLSVINLLEHHANVHAR
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CCDS55 PLHVAAHYDNQKVALLLLDQGASPHAAAKNGYTPLHIAAKKNQMDIATTLLEYGADANAV
600 610 620 630 640 650
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pF1KE3 NKVGWTPAHLAALKGNTAILKVLVEAGAQLDVQDGVSCTPLQLALRSRKQGIMSFL--EG
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CCDS55 TRQGIASVHLAAQEGHVDMVSLLLGRNANVNLSNKSGLTPLHLAAQEDRVNVAEVLVNQG
660 670 680 690 700 710
750 760
pF1KE3 KEPSVATLGGSKPGAEMEI
. .. : : :
CCDS55 AHVDAQTKMGYTPLHVGCHYGNIKIVNFLLQHSAKVNAKTKNGYTPLHQAAQQGHTHIIN
720 730 740 750 760 770
>>CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868 aa)
initn: 2244 init1: 796 opt: 811 Z-score: 351.0 bits: 77.0 E(32554): 3.1e-13
Smith-Waterman score: 811; 35.7% identity (70.2% similar) in 403 aa overlap (360-759:315-716)
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 DSDSGNYLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYENKVTPLHFLVAQGS-VEQVRLLLAHEVDV
.: ..::: ...::. .. :.::: :.: :
CCDS55 LTPLHCGARSGHEQVVEMLLDRAAPILSKTKNGLSPLH-MATQGDHLNCVQLLLQHNVPV
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 DCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGADANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLLL
: : . : : .::. . . .:: . :. : .:..:::.: ... . .:::
CCDS55 DDVTNDYLTALHVAAHCGHYKVAKVLLDKKANPNAKALNGFTPLHIACKKNRIKVMELLL
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 DHGACVDAQEREGWTPLHLAAQNNFENVARLLVSRQADPNLHEAEGKTPLHVAAYFGHVS
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CCDS55 KHGASIQAVTESGLTPIHVAAFMGHVNIVSQLMHHGASPNTTNVRGETALHMAARSGQAE
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LVKLLTSQGAELDAQQRNLRTPLHLAVERGKVRAIQHLLKSGAVPDALDQSGYGPLHTAA
.:. :...::...:. .. .::::.... ::. .:.::..:: :.: ::: ::: .:
CCDS55 VVRYLVQDGAQVEAKAKDDQTPLHISARLGKADIVQQLLQQGASPNAATTSGYTPLHLSA
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 ARGKYLICKMLLRYGASLELPTHQGWTPLHLAAYKGHLEIIHLLAESHANMGALGAVNWT
.:. . .:: .:::: . :..:.::::.:: :.::. .:: .. :. : : . :
CCDS55 REGHEDVAAFLLDHGASLSITTKKGFTPLHVAAKYGKLEVANLLLQKSASPDAAGKSGLT
530 540 550 560 570 580
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 PLHLAARHGEEAVVSALLQCGADPNAAEQSGWTPLHLAVQRSTFLSVINLLEHHANVHAR
:::.::.. .. :. ::. ::.:.:: ..:.::::.:.... . . .:::. :...:
CCDS55 PLHVAAHYDNQKVALLLLDQGASPHAAAKNGYTPLHIAAKKNQMDIATTLLEYGADANAV
590 600 610 620 630 640
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 NKVGWTPAHLAALKGNTAILKVLVEAGAQLDVQDGVSCTPLQLALRSRKQGIMSFL--EG
.. : . .:::: .:.. ....:. .:...... . :::.:: . . .. : .:
CCDS55 TRQGIASVHLAAQEGHVDMVSLLLGRNANVNLSNKSGLTPLHLAAQEDRVNVAEVLVNQG
650 660 670 680 690 700
750 760
pF1KE3 KEPSVATLGGSKPGAEMEI
. .. : : :
CCDS55 AHVDAQTKMGYTPLHVGCHYGNIKIVNFLLQHSAKVNAKTKNGYTPLHQAAQQGHTHIIN
710 720 730 740 750 760
>>CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377 aa)
initn: 2244 init1: 796 opt: 811 Z-score: 346.7 bits: 77.4 E(32554): 5.4e-13
Smith-Waterman score: 811; 35.7% identity (70.2% similar) in 403 aa overlap (360-759:332-733)
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 DSDSGNYLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYENKVTPLHFLVAQGS-VEQVRLLLAHEVDV
.: ..::: ...::. .. :.::: :.: :
CCDS72 LTPLHCGARSGHEQVVEMLLDRAAPILSKTKNGLSPLH-MATQGDHLNCVQLLLQHNVPV
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 DCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGADANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLLL
: : . : : .::. . . .:: . :. : .:..:::.: ... . .:::
CCDS72 DDVTNDYLTALHVAAHCGHYKVAKVLLDKKANPNAKALNGFTPLHIACKKNRIKVMELLL
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 DHGACVDAQEREGWTPLHLAAQNNFENVARLLVSRQADPNLHEAEGKTPLHVAAYFGHVS
::: ..: . : ::.:.:: . :.. :. . :.:: ...:.: ::.:: :..
CCDS72 KHGASIQAVTESGLTPIHVAAFMGHVNIVSQLMHHGASPNTTNVRGETALHMAARSGQAE
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LVKLLTSQGAELDAQQRNLRTPLHLAVERGKVRAIQHLLKSGAVPDALDQSGYGPLHTAA
.:. :...::...:. .. .::::.... ::. .:.::..:: :.: ::: ::: .:
CCDS72 VVRYLVQDGAQVEAKAKDDQTPLHISARLGKADIVQQLLQQGASPNAATTSGYTPLHLSA
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CCDS43 TKQGVTPLHLASQEGHTDMVTLLLDKGANIHMSTKSGLTSLHLAAQEDKVNVADILTKHG
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