Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3282
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3282, 714 aa
1>>>pF1KE3282 714 - 714 aa - 714 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0048+/-0.000458; mu= -6.7703+/- 0.028
mean_var=450.5674+/-102.132, 0's: 0 Z-trim(121.3): 1988 B-trim: 880 in 1/53
Lambda= 0.060422
statistics sampled from 35186 (37767) to 35186 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16
Scan time: 12.650
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055401 (OMIM: 606532) hormonally up-regulated n ( 714) 4839 437.1 1.2e-121
XP_011527839 (OMIM: 606532) PREDICTED: hormonally ( 698) 2801 259.4 3.5e-68
XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 708) 744 80.1 3.3e-14
NP_001122392 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 713) 744 80.1 3.3e-14
XP_016876781 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 722) 744 80.1 3.4e-14
XP_016876780 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 728) 744 80.1 3.4e-14
XP_005267699 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 737) 744 80.1 3.4e-14
XP_005267700 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 643) 740 79.7 4e-14
NP_001273055 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 780) 741 79.9 4.2e-14
XP_005273191 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 781) 741 79.9 4.2e-14
XP_011507863 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 788) 741 79.9 4.3e-14
XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre ( 660) 739 79.6 4.3e-14
NP_061120 (OMIM: 606511) serine/threonine-protein ( 795) 741 79.9 4.3e-14
NP_001273053 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 796) 741 79.9 4.3e-14
NP_002367 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affinity- ( 729) 740 79.8 4.3e-14
XP_005267698 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 738) 740 79.8 4.3e-14
XP_006720209 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 739) 740 79.8 4.3e-14
NP_001122391 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 744) 740 79.8 4.4e-14
NP_059672 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 745) 740 79.8 4.4e-14
NP_001122390 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 753) 740 79.8 4.4e-14
XP_016872799 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 763) 740 79.8 4.4e-14
XP_011543093 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 798) 740 79.8 4.6e-14
NP_001156769 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 709) 734 79.2 6.1e-14
NP_004945 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 724) 734 79.2 6.2e-14
XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 734 79.2 6.2e-14
XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 734 79.3 6.2e-14
XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 734 79.3 6.3e-14
XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 734 79.3 6.3e-14
XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1261) 739 79.9 6.6e-14
NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity- ( 688) 732 79.0 6.7e-14
XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1309) 739 80.0 6.7e-14
NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein (1321) 739 80.0 6.8e-14
XP_005271538 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 739 80.0 7e-14
XP_011541023 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 739 80.0 7e-14
NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affini ( 752) 732 79.1 7.1e-14
NP_001156768 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 719) 727 78.6 9.4e-14
XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 727 78.6 9.5e-14
XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 727 78.6 9.6e-14
XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 784) 727 78.7 9.9e-14
NP_001034558 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 788) 727 78.7 9.9e-14
XP_011543094 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 793) 727 78.7 1e-13
XP_011543092 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 799) 727 78.7 1e-13
XP_011543091 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 808) 727 78.7 1e-13
NP_006243 (OMIM: 600497) 5'-AMP-activated protein ( 552) 715 77.5 1.6e-13
NP_006242 (OMIM: 602739) 5'-AMP-activated protein ( 559) 705 76.6 3e-13
XP_016872913 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1213) 706 77.1 4.7e-13
NP_001268678 (OMIM: 614776) serine/threonine-prote (1261) 706 77.1 4.8e-13
XP_005271539 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1321) 706 77.1 5e-13
XP_011516388 (OMIM: 607025) PREDICTED: maternal em ( 373) 686 74.7 7.2e-13
XP_011516381 (OMIM: 607025) PREDICTED: maternal em ( 651) 690 75.4 8.2e-13
>>NP_055401 (OMIM: 606532) hormonally up-regulated neu t (714 aa)
initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 2305.2 bits: 437.1 E(85289): 1.2e-121
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPAAAGDGLLGEPAAPGGGGGAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQHHKRVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MPAAAGDGLLGEPAAPGGGGGAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQHHKRVGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YLIGSRKLGEGSFAKVREGLHVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQIQQMIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YLIGSRKLGEGSFAKVREGLHVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQIQQMIRH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PNITQLLDILETENSYYLVMELCPGGNLMHKIYEKKRLEESEARRYIRQLISAVEHLHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PNITQLLDILETENSYYLVMELCPGGNLMHKIYEKKRLEESEARRYIRQLISAVEHLHRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GVVHRDLKIENLLLDEDNNIKLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPELLARKKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GVVHRDLKIENLLLDEDNNIKLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPELLARKKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GPKIDVWSIGVNMYAMLTGTLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGAISFLRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GPKIDVWSIGVNMYAMLTGTLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGAISFLRSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEPDPVKRPNIQQALANRWLNENYTGKVPCNVTYPNRISLEDLSPSVVLHMTEKLGYKNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LEPDPVKRPNIQQALANRWLNENYTGKVPCNVTYPNRISLEDLSPSVVLHMTEKLGYKNS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DVINTVLSNRACHILAIYFLLNKKLERYLSGKSDIQDSLCYKTRLYQIEKYRAPKESYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DVINTVLSNRACHILAIYFLLNKKLERYLSGKSDIQDSLCYKTRLYQIEKYRAPKESYEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SLDTWTRDLEFHAVQDKKPKEQEKRGDFLHRPFSKKLDKNLPSHKQPSGSLMTQIQNTKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLDTWTRDLEFHAVQDKKPKEQEKRGDFLHRPFSKKLDKNLPSHKQPSGSLMTQIQNTKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LLKDRKASKSSFPDKDSFGCRNIFRKTSDSNCVASSSMEFIPVPPPRTPRIVKKPEPHQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLKDRKASKSSFPDKDSFGCRNIFRKTSDSNCVASSSMEFIPVPPPRTPRIVKKPEPHQP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GPGSTGIPHKEDPLMLDMVRSFESVDRDDHVEVLSPSHHYRILNSPVSLARRNSSERTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GPGSTGIPHKEDPLMLDMVRSFESVDRDDHVEVLSPSHHYRILNSPVSLARRNSSERTLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 PGLPSGSMSPLHTPLHPTLVSFAHEDKNSPPKEEGLCCPPPVPSNGPMQPLGSPNCVKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGLPSGSMSPLHTPLHPTLVSFAHEDKNSPPKEEGLCCPPPVPSNGPMQPLGSPNCVKSR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE3 GRFPMMGIGQMLRKRHQSLQPSADRPLEASLPPLQPLAPVNLAFDMADGVKTQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GRFPMMGIGQMLRKRHQSLQPSADRPLEASLPPLQPLAPVNLAFDMADGVKTQC
670 680 690 700 710
>>XP_011527839 (OMIM: 606532) PREDICTED: hormonally up-r (698 aa)
initn: 2779 init1: 2779 opt: 2801 Z-score: 1345.2 bits: 259.4 E(85289): 3.5e-68
Smith-Waterman score: 4688; 97.8% identity (97.8% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPAAAGDGLLGEPAAPGGGGGAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQHHKRVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPAAAGDGLLGEPAAPGGGGGAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQHHKRVGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YLIGSRKLGEGSFAKVREGLHVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQIQQMIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLIGSRKLGEGSFAKVREGLHVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQIQQMIRH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PNITQLLDILETENSYYLVMELCPGGNLMHKIYEKKRLEESEARRYIRQLISAVEHLHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PNITQLLDILETENSYYLVMELCPGGNLMHKIYEKKRLEESEARRYIRQLISAVEHLHRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GVVHRDLKIENLLLDEDNNIKLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPELLARKKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVVHRDLKIENLLLDEDNNIKLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPELLARKKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GPKIDVWSIGVNMYAMLTGTLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGAISFLRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPKIDVWSIGVNMYAMLTGTLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGAISFLRSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEPDPVKRPNIQQALANRWLNENYTGKVPCNVTYPNRISLEDLSPSVVLHMTEKLGYKNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEPDPVKRPNIQQALANRWLNENYTGKVPCNVTYPNRISLEDLSPSVVLHMTEKLGYKNS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DVINTVLSNRACHILAIYFLLNKKLERYLSGKSDIQDSLCYKTRLYQIEKYRAPKESYEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVINTVLSNRACHILAIYFLLNKKLERYLSGKSDIQDSLCYKTRLYQIEKYRAPKESYE-
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SLDTWTRDLEFHAVQDKKPKEQEKRGDFLHRPFSKKLDKNLPSHKQPSGSLMTQIQNTKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ---------------DKKPKEQEKRGDFLHRPFSKKLDKNLPSHKQPSGSLMTQIQNTKA
420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LLKDRKASKSSFPDKDSFGCRNIFRKTSDSNCVASSSMEFIPVPPPRTPRIVKKPEPHQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLKDRKASKSSFPDKDSFGCRNIFRKTSDSNCVASSSMEFIPVPPPRTPRIVKKPEPHQP
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GPGSTGIPHKEDPLMLDMVRSFESVDRDDHVEVLSPSHHYRILNSPVSLARRNSSERTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPGSTGIPHKEDPLMLDMVRSFESVDRDDHVEVLSPSHHYRILNSPVSLARRNSSERTLS
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 PGLPSGSMSPLHTPLHPTLVSFAHEDKNSPPKEEGLCCPPPVPSNGPMQPLGSPNCVKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGLPSGSMSPLHTPLHPTLVSFAHEDKNSPPKEEGLCCPPPVPSNGPMQPLGSPNCVKSR
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710
pF1KE3 GRFPMMGIGQMLRKRHQSLQPSADRPLEASLPPLQPLAPVNLAFDMADGVKTQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GRFPMMGIGQMLRKRHQSLQPSADRPLEASLPPLQPLAPVNLAFDMADGVKTQC
650 660 670 680 690
>>XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtubule (708 aa)
initn: 637 init1: 356 opt: 744 Z-score: 376.0 bits: 80.1 E(85289): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 804; 32.1% identity (63.6% similar) in 492 aa overlap (51-529:34-507)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 GAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQHHKRVGNYLIGSRKLGEGSFAKVREGL
: : : .::: . . .:.:.::::. .
XP_016 HTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPH--IGNYRL-LKTIGKGNFAKVKLAR
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 HVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQIQQMIRHPNITQLLDILETENSYYLVM
:.:::..::::.::: . . . ..: :: .:.... ::::..:....:::.. ::.:
XP_016 HILTGREVAIKIIDKTQLNPTSL--QKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIM
70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ELCPGGNLMHKIYEKKRLEESEARRYIRQLISAVEHLHRAGVVHRDLKIENLLLDEDNNI
: ::... . . :..:.::: .::..:::.. :. .:::::: :::::: : ::
XP_016 EYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNI
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KE3 KLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPELLARKKY-GPKIDVWSIGVNMYAMLTG
:. :::.:: . : : : :::: ::::::. ::: ::..::::.:: .:....:
XP_016 KIADFGFSNEFTVGGKLDTF---CGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSG
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 TLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGAISFLRSLLEPDPVKRPNIQQALANRW
.::: . .:. : .... .. .: .:: ..:. .: .:.:: ...: . .::
XP_016 SLPFDGQ--NLKELRERVLRGKYR-IPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRW
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 LNENYTGKVPCNVTYPNRISLEDLSPSVVLHMTEKLGYKNSDVINTVLSNRACHILAIYF
.: .. . :. :.: . . . .::.. .. ... . . .: : :.
XP_016 INAGHEEDELKPFVEPEL----DISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYL
300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 LLNKKLERYLSGKSDIQDSLCYKTRLYQIEKYRAPKESYEASLDTWTRDLEFHAVQDKKP
::..: . .::...: .. ..... . ... . : . .. :.
XP_016 LLGRK-SSEVRPSSDLNNSTG-QSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRS
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 KEQEKRGDFLHRPFS-KKLDKNLPSHK--QPSGSLMTQIQN-TKALLKDRKASKSSFPDK
. . .:. . .: .: . . . : :.. .. . .: .:: . .:: : :. :..
XP_016 QTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKS-STVPSS
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540
pF1KE3 D--SFGC--RNIF----RKTSDSNCVASSSMEFIPVPPPRTPRIVKKPEPHQPGPGSTGI
. : : :: . : :.: . : ... : .: :::
XP_016 NTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVASTHSISSAATPDRIRF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PHKEDPLMLDMVRSFESVDRDDHVEVLSPSHHYRILNSPVSLARRNSSERTLSPGLPSGS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]