Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3270
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3270, 673 aa
1>>>pF1KE3270 673 - 673 aa - 673 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4073+/-0.000716; mu= 16.5447+/- 0.044
mean_var=118.5019+/-23.527, 0's: 0 Z-trim(114.3): 118 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.117818
statistics sampled from 14700 (14836) to 14700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.456), width: 16
Scan time: 4.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46068.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 673) 4690 808.0 0
CCDS59382.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 659) 3415 591.3 1.4e-168
CCDS59383.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 639) 2949 512.1 9.8e-145
CCDS54263.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 576) 2530 440.8 2.5e-123
CCDS54264.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 581) 2185 382.2 1.1e-105
CCDS59384.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 604) 2169 379.5 7.7e-105
CCDS54262.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 484) 1913 335.9 8.1e-92
CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 797) 1903 334.4 3.8e-91
CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 ( 690) 1658 292.7 1.2e-78
CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 ( 689) 1648 291.0 3.8e-78
CCDS31598.1 RASGRP2 gene_id:10235|Hs108|chr11 ( 609) 1616 285.5 1.5e-76
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 597) 1261 225.1 2.2e-58
CCDS45221.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 762) 1261 225.2 2.6e-58
>>CCDS46068.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 (673 aa)
initn: 4690 init1: 4690 opt: 4690 Z-score: 4310.9 bits: 808.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4690; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-673)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
610 620 630 640 650 660
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS46 MDPPSTASSKLDS
670
>>CCDS59382.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 (659 aa)
initn: 4570 init1: 3415 opt: 3415 Z-score: 3139.8 bits: 591.3 E(32554): 1.4e-168
Smith-Waterman score: 4546; 97.9% identity (97.9% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-659)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDL----------
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ----PGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
590 600 610 620 630 640
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS59 MDPPSTASSKLDS
650
>>CCDS59383.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 (639 aa)
initn: 2949 init1: 2949 opt: 2949 Z-score: 2711.9 bits: 512.1 E(32554): 9.8e-145
Smith-Waterman score: 4381; 94.9% identity (94.9% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAIT-------------------
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ---------------VMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
570 580 590 600 610 620
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS59 MDPPSTASSKLDS
630
>>CCDS54263.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 4029 init1: 2530 opt: 2530 Z-score: 2327.6 bits: 440.8 E(32554): 2.5e-123
Smith-Waterman score: 3839; 85.6% identity (85.6% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-576)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAIT-------------------
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
CCDS54 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ------------------ALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
510 520 530 540 550 560
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS54 MDPPSTASSKLDS
570
>>CCDS54264.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 (581 aa)
initn: 2227 init1: 2167 opt: 2185 Z-score: 2010.7 bits: 382.2 E(32554): 1.1e-105
Smith-Waterman score: 3872; 86.3% identity (86.3% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-581)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
::::::::::::::::::
CCDS54 AISRLKDSHAHLSPDSTK------------------------------------------
310
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
::::::::::
CCDS54 --------------------------------------------------LSLDLFYTED
320
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
510 520 530 540 550 560
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS54 MDPPSTASSKLDS
570 580
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
::::::::::::::::::
CCDS59 AISRLKDSHAHLSPDSTK------------------------------------------
310
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ---------------------------ELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
540 550 560 570 580 590
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS59 MDPPSTASSKLDS
600
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Smith-Waterman score: 3031; 71.9% identity (71.9% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAIT-------------------
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHS
CCDS54 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVS
CCDS54 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTED
::::::::::
CCDS54 --------------------------------------------------LSLDLFYTED
230
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDP
240 250 260 270 280 290
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGRGTISQEDFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSKLGLAFL
300 310 320 330 340 350
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRPGAKGDA
360 370 380 390 400 410
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPPGAPVPSTPAPHASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWETDTVPCPV
420 430 440 450 460 470
670
pF1KE3 MDPPSTASSKLDS
:::::::::::::
CCDS54 MDPPSTASSKLDS
480
>>CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 (797 aa)
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Smith-Waterman score: 1904; 47.0% identity (74.3% similar) in 634 aa overlap (4-634:8-629)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MNRKDSKRKSHQECTGKIGGRGRPRQVRR-HKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGG
... :: . : . .: . . . . :: .:.. ..:: :..:.
CCDS45 MGTLGKAREAPRKPSHGCRAASKARLEAKPANSPFPSHPSLAHITQFRMMVSLGHLAKGA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 CSEDELLEKCIQSFDSAGSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQE
: :.:...::::::. :.::. ...:...:.:: :. ::.: ...: :. : . ..
CCDS45 -SLDDLIDSCIQSFDADGNLCRSNQLLQVMLTMHRIVISSAELLQKVITLYKDALAKNSP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LRRLQICHLVRYWLMRHPEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGG
:.::..::::. . ....: .: ... .: : .:. . :: :.... .
CCDS45 GLCLKICYFVRYWITEFWVMFKMDASLTDTMEEFQELVKAKGEELHCRLIDTTQINARDW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PGPPLPMSSPGLGKKRKVSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVR
. . .::::::::::::: ::..:::::::.::. :. .: ..:.... :.
CCDS45 SRKLTQRIKSNTSKKRKVSLLFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 GCPALEGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTG
:..: :..: :..:.:::.:::::: : ::.:. :::.:::.::::::::::::: :
CCDS45 ENPTMERSIALCNGISQWVQLMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHL
:::::.:::::.. .:. . .:.: :.::::.: :: :::... :. :..:.:::::
CCDS45 GLCHSSISRLKETSSHVPHEINKVLGEMTELLSSSRNYDNYRRAYGECTDFKIPILGVHL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 KDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDL
:::.::.::.:: : ::.... :: :: ...::: :: :: ::.::.:::::::::
CCDS45 KDLISLYEAMPDYLEDGKVNVHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 FYTEDEIYELSYAREPRCPKSLPPSPFNAPLVVEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVF
.:::::::::::::::: .. : .: . :.::.:: ::.:::: :...::...:.:::
CCDS45 YYTEDEIYELSYAREPRNHRAPPLTPSKPPVVVDWASGVSPKPDPKTISKHVQRMVDSVF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 KNYDPEGRGTISQEDFERLSGNFPFA-CHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRASAICSK
:::: . : ::::.::.....:::. : . :.: .::.:.:.:..:::.: ::
CCDS45 KNYDHDQDGYISQEEFEKIAASFPFSFC--VMDKDREGL--ISRDEITAYFMRASSIYSK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 LGLAFLHTFHEVTFRKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKKRP
:::.: :.:.:.:. ::::::.:.:::::: ::::::..::. :::.:.: : :::::
CCDS45 LGLGFPHNFQETTYLKPTFCDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKR-
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 GAKGDAGPPGAPVPSTPAPH-ASCGSEENHSYTLSLEPETGCQLRHAWTQTESPHPSWET
::. ..: . :. . : :... : :: :
CCDS45 -AKNPVAPTENNTSVGPVSNLCSLGAKD-----LLHAPEEGPFTFPNGEAVEHGEESKDR
600 610 620 630 640
660 670
pF1KE3 DTVPCPVMDPPSTASSKLDS
CCDS45 TIMLMGVSSQKISLRLKRAVAHKATQTESQPWIGSEGPSGPFVLSSPRKTAQDTLYVLPS
650 660 670 680 690 700
>>CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 (690 aa)
initn: 1611 init1: 902 opt: 1658 Z-score: 1525.5 bits: 292.7 E(32554): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 1667; 43.3% identity (71.1% similar) in 630 aa overlap (43-651:1-620)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
:.: .:: . . :::: ::. ::.
CCDS46 MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
: : .... .:: :: : : :..:: .:: :..:::.. . ::.::...:::...
CCDS46 GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 PEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPLPMSSPGLGKKRK
: .. : : .. .: .... : . : : :.. :. . ..:: :
CCDS46 PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSI--PSYDWMRRVTQRKKVSKKGK
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 VSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSR
. ::::::: :::.:::.:: .::. :. : .:::..: ... :.:: :..: :..:.
CCDS46 ACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISK
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 WVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHL
:::.::::.: : :::.:. :::.::..: ::.::::::::.::: ::.:::::..:.::
CCDS46 WVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 SPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDG
: . :: :.:::..:..:: ::...: : ::..:.::::::::...: :: ..
CCDS46 SSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEEN
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 RLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPR
.... :...: . :.:::.::. : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
CCDS46 KVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPR
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480
pF1KE3 CPKSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQE
:: : :: : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: . : ::::
CCDS46 NSKSQPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQE
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTF
::: ...:::: .. .. : .:..:. .:.::: : . :.: .:.:.:.:.:.
CCDS46 DFESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTY
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKK---RPG-AKGDAGPPG
:::::. :.:::::. ::::.:..:: :::.:.: . . :.. :. ..: .. ::
CCDS46 LKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPG
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650
pF1KE3 AP-VPSTPA-------PHASCGSEENHSYTLSLEP----ETGCQLRHAWT-QTESPHPSW
.: .: :: : .. : .. : ...: . . .:..: : :. . .: :
CCDS46 SPSLP--PAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVW
570 580 590 600 610 620
660 670
pF1KE3 ETDTVPCPVMDPPSTASSKLDS
CCDS46 SEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVHAGVDVVDRGTEFELDQDEG
630 640 650 660 670 680
>>CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 (689 aa)
initn: 1589 init1: 880 opt: 1648 Z-score: 1516.4 bits: 291.0 E(32554): 3.8e-78
Smith-Waterman score: 1657; 43.3% identity (71.1% similar) in 630 aa overlap (43-651:1-619)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
:.: .:: . . :::: ::. ::.
CCDS54 MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
: : .... .:: :: : : :..:: .:: :..:::.. . ::.::...:::...
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