Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3247
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3247, 570 aa
1>>>pF1KE3247 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5970+/-0.000943; mu= -2.9425+/- 0.056
mean_var=359.6065+/-75.723, 0's: 0 Z-trim(116.3): 767 B-trim: 1028 in 2/51
Lambda= 0.067633
statistics sampled from 15996 (16905) to 15996 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.803), E-opt: 0.2 (0.519), width: 16
Scan time: 4.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31553.1 ZFP91 gene_id:80829|Hs108|chr11 ( 570) 3852 389.7 5.3e-108
CCDS53487.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 ( 474) 728 84.8 2.7e-16
CCDS31127.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 ( 519) 728 84.8 2.8e-16
CCDS44348.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 ( 524) 728 84.8 2.9e-16
CCDS12261.1 ZNF653 gene_id:115950|Hs108|chr19 ( 615) 592 71.6 3.2e-12
CCDS10986.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 ( 539) 578 70.2 7.4e-12
CCDS45554.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 ( 614) 578 70.2 8.2e-12
>>CCDS31553.1 ZFP91 gene_id:80829|Hs108|chr11 (570 aa)
initn: 3852 init1: 3852 opt: 3852 Z-score: 2052.5 bits: 389.7 E(32554): 5.3e-108
Smith-Waterman score: 3852; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPGETEEPRPPEQQDQEGGEAAKAAPEEPQQRPPEAVAAAPAGTTSSRVLRGGRDRGRAA
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CCDS31 MPGETEEPRPPEQQDQEGGEAAKAAPEEPQQRPPEAVAAAPAGTTSSRVLRGGRDRGRAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AAAAAAAVSRRRKAEYPRRRRSSPSARPPDVPGQQPQAAKSPSPVQGKKSPRLLCIEKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAAAAAAVSRRRKAEYPRRRRSSPSARPPDVPGQQPQAAKSPSPVQGKKSPRLLCIEKVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPSRGWRSSRTSVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPSRGWRSSRTSVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 RETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KRRKKPPIQYVRCEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KRRKKPPIQYVRCEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RHAKHHTDQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RHAKHHTDQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KHDADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KHDADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ESLTQPSDGQGLPLLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESLTQPSDGQGLPLLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE3 SGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSDSAGP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSDSAGP
550 560 570
>>CCDS53487.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 (474 aa)
initn: 727 init1: 571 opt: 728 Z-score: 406.1 bits: 84.8 E(32554): 2.7e-16
Smith-Waterman score: 742; 36.5% identity (58.8% similar) in 381 aa overlap (135-497:127-473)
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 VQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPS---RGWRSSRTSVSR
: :.:. :: : :.: : :: ..
CCDS53 VPGLRGPGGQDGGLVWECSAGHTFSWGPSLSPTPSEAPKPASLPHTTRRSWCSEATSGQE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KE3 HRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQL-------DYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEE
: :. .. :.. . : .:::.. .: :: .:...::
CCDS53 LADLESEHDERTQEARLP---SSEPDAPRLLPSPVTCTPKEGETPPAPAALSSPLAVPAL
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 EEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLERETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVKEEE
.: . : : . .:.: : ::. ... :.
CCDS53 SASSLSSRAPP----PAEVRVQPQLSR-TPQAAQQT------------------EALAST
220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 NEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLPKR-RKKPPIQYVRCEMEGCGTVLAHPRYLQHHIK
. .. : .: . ::: :: . . :.. ::: .... .::.:: :
CCDS53 GSQAQSAPTPAW-----DEDTAQIGPKRIRKAAKRELMPCDFPGCGRIFSNRQYLNHHKK
260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 YQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMI
:::. .:.. ::.:.::. : ..:.: .: : :.: ::::::.:::.:..: ::..:: :
CCDS53 YQHIHQKSFSCPEPACGKSFNFKKHLKEHMKLHSDTRDYICEFCARSFRTSSNLVIHRRI
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 HTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKH-DADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKS
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CCDS53 HTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHQRKHAETVAALRFPCEFCGKRFEKPDSVAAHRSKS
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500
pF1KE3 HPEVLIAEALAANAGAL-----ITSTDILGTNPESLTQPSDGQGLP-LLPEPLGNSTSGE
:: .:.: . .: : :.. ::.. : .:: . : :::.
CCDS53 HPALLLAPQ-ESPSGPLEPCPSISAPGPLGSSEGS--RPSASPQAPTLLPQQ
430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSD
>>CCDS31127.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 (519 aa)
initn: 727 init1: 571 opt: 728 Z-score: 405.6 bits: 84.8 E(32554): 2.8e-16
Smith-Waterman score: 772; 37.1% identity (60.4% similar) in 402 aa overlap (135-497:127-518)
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 VQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPS---RGWRSSRTSVSR
: :.:. :: : :.: : :: ..
CCDS31 VPGLRGPGGQDGGLVWECSAGHTFSWGPSLSPTPSEAPKPASLPHTTRRSWCSEATSGQE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISE
: :. .. :.. . : :.: :::. : :...:.::::: .
CCDS31 LADLESEHDERTQEARLPRRVGPPPETFP---PPGEEE----GEEEEDNDEDEEEMLSDA
160 170 180 190 200
230 240 250 260
pF1KE3 EEIPFKDDPRD-ETYKPHL----------ERETPK-PRRKSGKV-----KEEKEKKEIKV
....: : : :.: : ::: : :. . . . ...
CCDS31 SLWTYSSSPDDSEPDAPRLLPSPVTCTPKEGETPPAPAALSSPLAVPALSASSLSSRAPP
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310
pF1KE3 EVEVEVKEEEN---EIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRL--------PKR-RKKPPIQYVR
.::.:. . . . .. : . : . .. .: ::: :: . .
CCDS31 PAEVRVQPQLSRTPQAAQQTEALASTGSQAQSAPTPAWDEDTAQIGPKRIRKAAKRELMP
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 CEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDY
:.. ::: .... .::.:: ::::. .:.. ::.:.::. : ..:.: .: : :.: :::
CCDS31 CDFPGCGRIFSNRQYLNHHKKYQHIHQKSFSCPEPACGKSFNFKKHLKEHMKLHSDTRDY
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 ICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKH-DADSFYQFS
:::.:::.:..: ::..:: ::::::::::::::::::::::::::..:: .. . .:
CCDS31 ICEFCARSFRTSSNLVIHRRIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHQRKHAETVAALRFP
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480
pF1KE3 CNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGAL-----ITSTDILGTNPESLTQP
:..:::.::: :::.::..:::: .:.: . .: : :.. ::.. : .:
CCDS31 CEFCGKRFEKPDSVAAHRSKSHPALLLAPQ-ESPSGPLEPCPSISAPGPLGSSEGS--RP
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SDGQGLP-LLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTE
: . : :::.
CCDS31 SASPQAPTLLPQQ
510
>>CCDS44348.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 (524 aa)
initn: 727 init1: 571 opt: 728 Z-score: 405.6 bits: 84.8 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 772; 37.1% identity (60.4% similar) in 402 aa overlap (135-497:132-523)
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 VQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPS---RGWRSSRTSVSR
: :.:. :: : :.: : :: ..
CCDS44 VPGLRGPGGQDGGLVWECSAGHTFSWGPSLSPTPSEAPKPASLPHTTRRSWCSEATSGQE
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 HRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISE
: :. .. :.. . : :.: :::. : :...:.::::: .
CCDS44 LADLESEHDERTQEARLPRRVGPPPETFP---PPGEEE----GEEEEDNDEDEEEMLSDA
170 180 190 200 210
230 240 250 260
pF1KE3 EEIPFKDDPRD-ETYKPHL----------ERETPK-PRRKSGKV-----KEEKEKKEIKV
....: : : :.: : ::: : :. . . . ...
CCDS44 SLWTYSSSPDDSEPDAPRLLPSPVTCTPKEGETPPAPAALSSPLAVPALSASSLSSRAPP
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310
pF1KE3 EVEVEVKEEEN---EIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRL--------PKR-RKKPPIQYVR
.::.:. . . . .. : . : . .. .: ::: :: . .
CCDS44 PAEVRVQPQLSRTPQAAQQTEALASTGSQAQSAPTPAWDEDTAQIGPKRIRKAAKRELMP
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 CEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDY
:.. ::: .... .::.:: ::::. .:.. ::.:.::. : ..:.: .: : :.: :::
CCDS44 CDFPGCGRIFSNRQYLNHHKKYQHIHQKSFSCPEPACGKSFNFKKHLKEHMKLHSDTRDY
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 ICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKH-DADSFYQFS
:::.:::.:..: ::..:: ::::::::::::::::::::::::::..:: .. . .:
CCDS44 ICEFCARSFRTSSNLVIHRRIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHQRKHAETVAALRFP
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480
pF1KE3 CNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGAL-----ITSTDILGTNPESLTQP
:..:::.::: :::.::..:::: .:.: . .: : :.. ::.. : .:
CCDS44 CEFCGKRFEKPDSVAAHRSKSHPALLLAPQ-ESPSGPLEPCPSISAPGPLGSSEGS--RP
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SDGQGLP-LLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTE
: . : :::.
CCDS44 SASPQAPTLLPQQ
520
>>CCDS12261.1 ZNF653 gene_id:115950|Hs108|chr19 (615 aa)
initn: 680 init1: 562 opt: 592 Z-score: 333.0 bits: 71.6 E(32554): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 600; 40.0% identity (62.7% similar) in 225 aa overlap (242-455:387-611)
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 EEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLERETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVK
:: : .. .:.:.... . :. . :
CCDS12 AMMEGVAAYTQTEPEGSQPSTMDATAVAGIETKKEKEDLCLLKKEEKEEPVAPELATTVP
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320
pF1KE3 EE-ENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLPKRRKKPP----------IQYVRCEMEGCGT
: : : . : : . :. :..:.. ... .: .:::.
CCDS12 ESAEPEAEADGEELDGSDMSAIIYEIPKEPEKRRRSKRSRVMDADGLLEMFHCPYEGCSQ
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 VLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDYICEYCARA
: . .:.:.. : : :::::.::. : :...: :: :. :.. :: :...
CCDS12 VYVALSSFQNHVNLVHRKGKTKVCPHPGCGKKFYLSNHLRRHMIIHSGVREFTCETCGKS
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 FKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKHDADSFYQFSCNICGKKFE
:: ...: ::: :::: ::::::::. :::.:::::::::: :. :.:.:. :::.::
CCDS12 FKRKNHLEVHRRTHTGETPLQCEICGYQCRQRASLNWHMKKHTAEVQYNFTCDRCGKRFE
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 KKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNPESLTQPSDGQGLPLLPEPLG
: ::: : ::::.
CCDS12 KLDSVKFHTLKSHPDHKPT
600 610
>>CCDS10986.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 (539 aa)
initn: 538 init1: 370 opt: 578 Z-score: 326.3 bits: 70.2 E(32554): 7.4e-12
Smith-Waterman score: 592; 31.8% identity (56.9% similar) in 390 aa overlap (134-498:179-538)
110 120 130 140 150
pF1KE3 PVQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSAL----PQEVSIAASRPS-RGWRSSRT-
:::: : . : :. ::: . .
CCDS10 YCGVIQVVWGCDQGHDYTMDTSSSCKAFLLDSALAVKWPWDKETAPRLPQHRGWNPGDAP
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KE3 SVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVGEEHQ-------SPGGI-----
..:. : : . ....:: . . ..: . : : .:: .
CCDS10 QTSQGRGTGTPVGAETKTLPSTDVAQPPSDSDAVGPRSGFPPQPSLPLCRAPGQLGEKQL
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 --SSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLERET--PKPRRK-SGKVKEEKEKK
:. ... ..: .:: .. ...: :. . . :. : :.:: ::: .: :: :
CCDS10 PSSTSDDRVKDEFSDLSEGDV-LSEDENDKKQNAQSSDESFEPYPERKVSGKKSESKEAK
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 EIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLPKRRKKPPIQYVRCEMEGCGT
: :: .::. .: : : ..: : .:.. : : .: ..:: .
CCDS10 ----------KSEEPRIRK--KPGPKPGWKKK------LRCEREELPTIY-KCPYQGCTA
330 340 350 360
330 340 350 360 370
pF1KE3 VLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKH-HTDQRDYICEYCAR
: ...::: .: .. ::::.:...: ... : ::.: ::. :.:::. :..
CCDS10 VYRGADGMKKHIKEHHEEVRERPCPHPGCNKVFMIDRYLQRHVKLIHTEVRNYICDECGQ
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 AFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKHDADSFYQFSCNICGKKF
.::. ..: ::.: :.: ::::::.::: :::.:::..:: :: :.. .:.:. ::..:
CCDS10 TFKQRKHLLVHQMRHSGAKPLQCEVCGFQCRQRASLKYHMTKHKAETELDFACDQCGRRF
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 EKKDSVVAHKAKSHPEVLIAE-ALAANAGALITSTDILGTNPESLTQPSDGQGLPLLPEP
:: .. .: . :: . . :: .: .: : . ..::.. :::
CCDS10 EKAHNLNVHMSMVHPLTQTQDKALPLEAEP--------PPGPPSPSVTTEGQAVK--PEP
490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 LGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTEGLVMNSDILGATT
CCDS10 T
>>CCDS45554.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 (614 aa)
initn: 538 init1: 370 opt: 578 Z-score: 325.6 bits: 70.2 E(32554): 8.2e-12
Smith-Waterman score: 592; 31.8% identity (56.9% similar) in 390 aa overlap (134-498:254-613)
110 120 130 140 150
pF1KE3 PVQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSAL----PQEVSIAASRPS-RGWRSSRT-
:::: : . : :. ::: . .
CCDS45 YCGVIQVVWGCDQGHDYTMDTSSSCKAFLLDSALAVKWPWDKETAPRLPQHRGWNPGDAP
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200
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CCDS45 T
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