Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3204
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3204, 473 aa
1>>>pF1KE3204 473 - 473 aa - 473 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5646+/-0.000847; mu= 16.7820+/- 0.051
mean_var=74.3801+/-14.519, 0's: 0 Z-trim(106.9): 33 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.148712
statistics sampled from 9251 (9266) to 9251 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 ( 473) 3188 693.4 1.3e-199
CCDS4203.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 ( 400) 2184 478.0 7.9e-135
CCDS74701.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 489) 918 206.4 5.5e-53
CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 516) 910 204.7 1.9e-52
CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 539) 910 204.7 1.9e-52
CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 566) 910 204.7 2e-52
CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 580) 910 204.8 2.1e-52
CCDS2761.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 ( 484) 860 194.0 3e-49
CCDS2760.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 ( 524) 860 194.0 3.2e-49
>>CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 (473 aa)
initn: 3188 init1: 3188 opt: 3188 Z-score: 3697.1 bits: 693.4 E(32554): 1.3e-199
Smith-Waterman score: 3188; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSTELFSSTREEGSSGSGPSFRSNQRKMLNLLLERDTSFTVCPDVPRTPVGKFLGDSANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSTELFSSTREEGSSGSGPSFRSNQRKMLNLLLERDTSFTVCPDVPRTPVGKFLGDSANL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SILSGGTPKRCLDLSNLSSGEITATQLTTSADLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SILSGGTPKRCLDLSNLSSGEITATQLTTSADLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 CSPAQLLCSTPNGLDRGHRKRDAMCSSSANKENDNGNLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CSPAQLLCSTPNGLDRGHRKRDAMCSSSANKENDNGNLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NLGEDQAEEISDELMEFSLKDQEAKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NLGEDQAEEISDELMEFSLKDQEAKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VKKKYFSGQGKLRKGLCLKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKKKYFSGQGKLRKGLCLKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DLKYVNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLKYVNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PIVPLDTQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PIVPLDTQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE3 PEYMELCEPQSYCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PEYMELCEPQSYCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
430 440 450 460 470
>>CCDS4203.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 (400 aa)
initn: 2590 init1: 2184 opt: 2184 Z-score: 2534.0 bits: 478.0 E(32554): 7.9e-135
Smith-Waterman score: 2456; 82.7% identity (83.7% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSTELFSSTREEGSSGSGPSFRSNQRKMLNLLLERDTSFTVCPDVPRTPVGKFLGDSANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSTELFSSTREEGSSGSGPSFRSNQRKMLNLLLERDTSFTVCPDVPRTPVGKFLGDSANL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SILSGGTPKRCLDLSNLSSGEITATQLTTSADLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMK
::::: .: : . .::
CCDS42 SILSG-SP----------------------------GFFRTSG-----------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 CSPAQLLCSTPNGLDRGHRKRDAMCSSSANKENDNGNLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNP
:: . .:::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ---------------------------SAFSWDDNGNLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNP
80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NLGEDQAEEISDELMEFSLKDQEAKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NLGEDQAEEISDELMEFSLKDQEAKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDK
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VKKKYFSGQGKLRKGLCLKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKKKYFSGQGKLRKGLCLKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQ
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DLKYVNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLKYVNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKK
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PIVPLDTQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PIVPLDTQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFF
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470
pF1KE3 PEYMELCEPQSYCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PEYMELCEPQSYCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
350 360 370 380 390 400
>>CCDS74701.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (489 aa)
initn: 919 init1: 807 opt: 918 Z-score: 1064.8 bits: 206.4 E(32554): 5.5e-53
Smith-Waterman score: 918; 45.8% identity (75.1% similar) in 301 aa overlap (168-462:185-481)
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 HRKRDAMCSSSANKENDNGNLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNPNLGEDQAEEISDELMEF
::.. . ... .: :. . .. ...:
CCDS74 SRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDRKMEVEELSPLA-LGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILES
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 SLKDQEAKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDKVKKKYF------SGQGK
.::: . . :.:::::: .. :: ::..:. .: : . :.. . ...
CCDS74 DLKDLVMYSKCQRLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVTPPEEQQEAE
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LRKGLCLKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVA
:. :. . ::: : ..: ::.. .::::.::. : ::.::::::::..:::..
CCDS74 EPKARVLR-SKSLCHDEIENLL--DSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMV
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 ALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKKPIVPLDTQKRI
:::.:::.....:: ..:::::::: ::::. :.:: ... .:.::.::.: . .::.
CCDS74 ALLTGKFSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRV
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 IIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFFPEYMELCEPQS
:..::::::::::::::: .::.::..:.::.:::::.:::::::..:::.. ..::::.
CCDS74 ILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQD
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470
pF1KE3 YCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
: ::.:. : :: : ... :::. ::
CCDS74 YRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
460 470 480
>>CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (516 aa)
initn: 917 init1: 807 opt: 910 Z-score: 1055.2 bits: 204.7 E(32554): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 910; 42.3% identity (70.1% similar) in 355 aa overlap (122-462:166-508)
100 110 120 130 140
pF1KE3 DLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMKCSPAQLLCSTPNG------LDRGHRKRDAMC
: .:.: .:. :. : ..
CCDS74 KMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDRKMEVEELSPLALGRFSLT
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 SSSANKENDNG--NLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNPNLGEDQAEEISDELMEFSLKDQE
. .. :.:.: ....:..: . . .: . : . . :: .: .: .:
CCDS74 PAEGDTEEDDGFVDILESDLKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVM-YS-----
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KE3 AKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDKVKKKYF------SGQGKLRKGLC
: .: :.:::::: .. :: ::..:. .: : . :.. . ... :.
CCDS74 -KCQR--LFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVTPPEEQQEAEEPKARV
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVAALLSGK
:. . ::: : ..: ::.. .::::.::. : ::.::::::::..:::..:::.::
CCDS74 LR-SKSLCHDEIENLL--DSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGK
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 FQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKKPIVPLDTQKRIIIVFHC
:.....:: ..:::::::: ::::. :.:: ... .:.::.::.: . .::.:..:::
CCDS74 FSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHC
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 EFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFFPEYMELCEPQSYCPMHH
:::::::::::: .::.::..:.::.:::::.:::::::..:::.. ..::::.: ::.:
CCDS74 EFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNH
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470
pF1KE3 QDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
. : :: : ... :::. ::
CCDS74 EAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
490 500 510
>>CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (539 aa)
initn: 890 init1: 807 opt: 910 Z-score: 1054.9 bits: 204.7 E(32554): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 910; 42.3% identity (70.1% similar) in 355 aa overlap (122-462:189-531)
100 110 120 130 140
pF1KE3 DLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMKCSPAQLLCSTPNG------LDRGHRKRDAMC
: .:.: .:. :. : ..
CCDS13 KMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDRKMEVEELSPLALGRFSLT
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 SSSANKENDNG--NLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNPNLGEDQAEEISDELMEFSLKDQE
. .. :.:.: ....:..: . . .: . : . . :: .: .: .:
CCDS13 PAEGDTEEDDGFVDILESDLKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVM-YS-----
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KE3 AKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDKVKKKYF------SGQGKLRKGLC
: .: :.:::::: .. :: ::..:. .: : . :.. . ... :.
CCDS13 -KCQR--LFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVTPPEEQQEAEEPKARV
280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVAALLSGK
:. . ::: : ..: ::.. .::::.::. : ::.::::::::..:::..:::.::
CCDS13 LR-SKSLCHDEIENLL--DSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGK
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 FQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKKPIVPLDTQKRIIIVFHC
:.....:: ..:::::::: ::::. :.:: ... .:.::.::.: . .::.:..:::
CCDS13 FSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHC
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 EFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFFPEYMELCEPQSYCPMHH
:::::::::::: .::.::..:.::.:::::.:::::::..:::.. ..::::.: ::.:
CCDS13 EFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNH
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470
pF1KE3 QDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
. : :: : ... :::. ::
CCDS13 EAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
510 520 530
>>CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (566 aa)
initn: 917 init1: 807 opt: 910 Z-score: 1054.6 bits: 204.7 E(32554): 2e-52
Smith-Waterman score: 910; 42.3% identity (70.1% similar) in 355 aa overlap (122-462:216-558)
100 110 120 130 140
pF1KE3 DLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMKCSPAQLLCSTPNG------LDRGHRKRDAMC
: .:.: .:. :. : ..
CCDS13 KMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDRKMEVEELSPLALGRFSLT
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 SSSANKENDNG--NLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNPNLGEDQAEEISDELMEFSLKDQE
. .. :.:.: ....:..: . . .: . : . . :: .: .: .:
CCDS13 PAEGDTEEDDGFVDILESDLKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVM-YS-----
250 260 270 280 290
210 220 230 240 250
pF1KE3 AKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDKVKKKYF------SGQGKLRKGLC
: .: :.:::::: .. :: ::..:. .: : . :.. . ... :.
CCDS13 -KCQR--LFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVTPPEEQQEAEEPKARV
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVAALLSGK
:. . ::: : ..: ::.. .::::.::. : ::.::::::::..:::..:::.::
CCDS13 LR-SKSLCHDEIENLL--DSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGK
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 FQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKKPIVPLDTQKRIIIVFHC
:.....:: ..:::::::: ::::. :.:: ... .:.::.::.: . .::.:..:::
CCDS13 FSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHC
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 EFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFFPEYMELCEPQSYCPMHH
:::::::::::: .::.::..:.::.:::::.:::::::..:::.. ..::::.: ::.:
CCDS13 EFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNH
480 490 500 510 520 530
440 450 460 470
pF1KE3 QDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
. : :: : ... :::. ::
CCDS13 EAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
540 550 560
>>CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (580 aa)
initn: 917 init1: 807 opt: 910 Z-score: 1054.4 bits: 204.8 E(32554): 2.1e-52
Smith-Waterman score: 910; 42.3% identity (70.1% similar) in 355 aa overlap (122-462:230-572)
100 110 120 130 140
pF1KE3 DLDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMKCSPAQLLCSTPNG------LDRGHRKRDAMC
: .:.: .:. :. : ..
CCDS13 KMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDRKMEVEELSPLALGRFSLT
200 210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 SSSANKENDNG--NLVDSEMKYLGSPITTVPKLDKNPNLGEDQAEEISDELMEFSLKDQE
. .. :.:.: ....:..: . . .: . : . . :: .: .: .:
CCDS13 PAEGDTEEDDGFVDILESDLKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVM-YS-----
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250
pF1KE3 AKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDKVKKKYF------SGQGKLRKGLC
: .: :.:::::: .. :: ::..:. .: : . :.. . ... :.
CCDS13 -KCQR--LFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVTPPEEQQEAEEPKARV
320 330 340 350 360 370
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LKKTVSLCDITITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVAALLSGK
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:.....:: ..:::::::: ::::. :.:: ... .:.::.::.: . .::.:..:::
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. : :: : ... :::. ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]