Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3141
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3141, 351 aa
1>>>pF1KE3141 351 - 351 aa - 351 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7074+/-0.000374; mu= 10.1281+/- 0.023
mean_var=100.5038+/-20.308, 0's: 0 Z-trim(115.1): 73 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.127933
statistics sampled from 25225 (25311) to 25225 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 6.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055363 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform a ( 351) 2226 421.2 1.7e-117
XP_016877578 (OMIM: 602928) PREDICTED: tropomoduli ( 306) 1857 353.1 4.7e-97
XP_016877576 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomoduli ( 352) 1739 331.3 1.9e-90
NP_055362 (OMIM: 605112) tropomodulin-3 [Homo sapi ( 352) 1739 331.3 1.9e-90
XP_016877577 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomoduli ( 352) 1739 331.3 1.9e-90
NP_001136357 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform ( 315) 1397 268.2 1.7e-71
NP_001159588 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo s ( 359) 1362 261.8 1.7e-69
NP_003266 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo sapi ( 359) 1362 261.8 1.7e-69
XP_011507751 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomoduli ( 345) 1254 241.8 1.7e-63
XP_016856578 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomoduli ( 345) 1254 241.8 1.7e-63
NP_037485 (OMIM: 605834) tropomodulin-4 [Homo sapi ( 345) 1254 241.8 1.7e-63
XP_016856579 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomoduli ( 261) 736 146.2 7.9e-35
NP_997046 (OMIM: 608006) leiomodin-2 [Homo sapiens ( 547) 607 122.5 2.2e-27
NP_001291347 (OMIM: 616112,616165) leiomodin-3 [Ho ( 560) 538 109.8 1.5e-23
NP_938012 (OMIM: 616112,616165) leiomodin-3 [Homo ( 560) 538 109.8 1.5e-23
NP_036266 (OMIM: 602715) leiomodin-1 [Homo sapiens ( 600) 536 109.4 2.1e-23
XP_005249633 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 705) 192 46.0 0.00031
XP_011513385 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 937) 193 46.2 0.00035
XP_011513381 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 953) 192 46.0 0.0004
XP_011513382 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 953) 192 46.0 0.0004
XP_005249629 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 953) 192 46.0 0.0004
XP_005249625 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 953) 192 46.0 0.0004
XP_011513383 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 953) 192 46.0 0.0004
XP_006715696 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 953) 192 46.0 0.0004
NP_006083 (OMIM: 605980) nucleotide-binding oligom ( 953) 192 46.0 0.0004
XP_016867164 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 925) 190 45.6 0.00051
XP_011513386 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 925) 190 45.6 0.00051
XP_016867163 (OMIM: 605980) PREDICTED: nucleotide- ( 929) 169 41.8 0.0075
>>NP_055363 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform a [Hom (351 aa)
initn: 2226 init1: 2226 opt: 2226 Z-score: 2230.6 bits: 421.2 E(85289): 1.7e-117
Smith-Waterman score: 2226; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 EMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
310 320 330 340 350
>>XP_016877578 (OMIM: 602928) PREDICTED: tropomodulin-2 (306 aa)
initn: 1856 init1: 1856 opt: 1857 Z-score: 1863.4 bits: 353.1 E(85289): 4.7e-97
Smith-Waterman score: 1857; 98.7% identity (99.3% similar) in 298 aa overlap (1-296:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 PVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQ--RQQLGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :..:
XP_016 PVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQFVRRELKQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AVEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
XP_016 TEGKLP
>>XP_016877576 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomodulin-3 (352 aa)
initn: 1805 init1: 962 opt: 1739 Z-score: 1744.8 bits: 331.3 E(85289): 1.9e-90
Smith-Waterman score: 1739; 75.9% identity (92.3% similar) in 352 aa overlap (1-351:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
:::::.:.:::::..:::::::.::: ::::::.::::::::.:.::::::::.::.:..
XP_016 MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
:::::::::: ::::::::.:::::.::.::::::..::::.::..: ::::.::::::
XP_016 TGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKIFIPKQKPVQTFTEEKVSLDPELE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKG-GKGPVRNVVKGEKVKPVFEEP
:::.::::::: ::::.::.:::..: :: . ....: . :::::::. :::.::
XP_016 EALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTKFCNIMGSSNGVDQEHFSNVVKGEKILPVFDEP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSN
::::::: ::.. : :: : :::::::::::::::..:::::::::::: :::::::::
XP_016 PNPTNVEESLKRTKENDAHLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKCFSLAATRSN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTA
:::: :::.:::::::: :::.:::::::.:::::..::..:.::.:.::::::::::::
XP_016 DPVATAFAEMLKVNKTLKSLNVESNFITGVGILALIDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
::.:.:.:::::. :::::::::.::::::.: :::::::::::.:::.:..
XP_016 VELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ
310 320 330 340 350
>>NP_055362 (OMIM: 605112) tropomodulin-3 [Homo sapiens] (352 aa)
initn: 1805 init1: 962 opt: 1739 Z-score: 1744.8 bits: 331.3 E(85289): 1.9e-90
Smith-Waterman score: 1739; 75.9% identity (92.3% similar) in 352 aa overlap (1-351:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
:::::.:.:::::..:::::::.::: ::::::.::::::::.:.::::::::.::.:..
NP_055 MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
:::::::::: ::::::::.:::::.::.::::::..::::.::..: ::::.::::::
NP_055 TGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKIFIPKQKPVQTFTEEKVSLDPELE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKG-GKGPVRNVVKGEKVKPVFEEP
:::.::::::: ::::.::.:::..: :: . ....: . :::::::. :::.::
NP_055 EALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTKFCNIMGSSNGVDQEHFSNVVKGEKILPVFDEP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSN
::::::: ::.. : :: : :::::::::::::::..:::::::::::: :::::::::
NP_055 PNPTNVEESLKRTKENDAHLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKCFSLAATRSN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTA
:::: :::.:::::::: :::.:::::::.:::::..::..:.::.:.::::::::::::
NP_055 DPVATAFAEMLKVNKTLKSLNVESNFITGVGILALIDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
::.:.:.:::::. :::::::::.::::::.: :::::::::::.:::.:..
NP_055 VELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ
310 320 330 340 350
>>XP_016877577 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomodulin-3 (352 aa)
initn: 1805 init1: 962 opt: 1739 Z-score: 1744.8 bits: 331.3 E(85289): 1.9e-90
Smith-Waterman score: 1739; 75.9% identity (92.3% similar) in 352 aa overlap (1-351:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
:::::.:.:::::..:::::::.::: ::::::.::::::::.:.::::::::.::.:..
XP_016 MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
:::::::::: ::::::::.:::::.::.::::::..::::.::..: ::::.::::::
XP_016 TGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKIFIPKQKPVQTFTEEKVSLDPELE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKG-GKGPVRNVVKGEKVKPVFEEP
:::.::::::: ::::.::.:::..: :: . ....: . :::::::. :::.::
XP_016 EALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTKFCNIMGSSNGVDQEHFSNVVKGEKILPVFDEP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSN
::::::: ::.. : :: : :::::::::::::::..:::::::::::: :::::::::
XP_016 PNPTNVEESLKRTKENDAHLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKCFSLAATRSN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTA
:::: :::.:::::::: :::.:::::::.:::::..::..:.::.:.::::::::::::
XP_016 DPVATAFAEMLKVNKTLKSLNVESNFITGVGILALIDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
::.:.:.:::::. :::::::::.::::::.: :::::::::::.:::.:..
XP_016 VELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ
310 320 330 340 350
>>NP_001136357 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform b [ (315 aa)
initn: 1988 init1: 1349 opt: 1397 Z-score: 1404.4 bits: 268.2 E(85289): 1.7e-71
Smith-Waterman score: 1920; 89.7% identity (89.7% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSND
::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIK--------------------------------
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ----AFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTAV
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE3 EMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
270 280 290 300 310
>>NP_001159588 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo sapie (359 aa)
initn: 1394 init1: 1177 opt: 1362 Z-score: 1368.6 bits: 261.8 E(85289): 1.7e-69
Smith-Waterman score: 1362; 59.8% identity (85.9% similar) in 348 aa overlap (3-349:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
. ...:::::...::::.:: :.::::. ::: ::.:::..:.::::.:::::: ::
NP_001 MSYRRELEKYRDLDEDEILGALTEEELRTLENELDELDPDNALLPAGLRQKDQTTKAP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
:::: ::.:: .:::.: : :::::.::.::::.:.:..::.::.. : .:::.::::
NP_001 TGPFKREELLDHLEKQAKEFKDREDLVPYTGEKRGKVWVPKQKPLDPVLE-SVTLEPELE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNK-GGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEP
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NP_001 EALANASDAELCDIAAILGMHTLMSNQQYYQALSSSSIMNKEGLNSVIKPTQYKPVPDEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSN
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NP_001 PNSTDVEETLERIKNNDPKLEEVNLNNIRNIPIPTLKAYAEALKENSYVKKFSIVGTRSN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTA
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NP_001 DPVAYALAEMLKENKVLKTLNVESNFISGAGILRLVEALPYNTSLVEMKIDNQSQPLGNK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
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NP_001 VEMEIVSMLEKNATLLKFGYHFTQQGPRLRASNAMMNNNDLVRKRRL-ADLTGPIIPKCR
300 310 320 330 340 350
NP_001 SGV
>>NP_003266 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo sapiens] (359 aa)
initn: 1394 init1: 1177 opt: 1362 Z-score: 1368.6 bits: 261.8 E(85289): 1.7e-69
Smith-Waterman score: 1362; 59.8% identity (85.9% similar) in 348 aa overlap (3-349:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
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NP_003 MSYRRELEKYRDLDEDEILGALTEEELRTLENELDELDPDNALLPAGLRQKDQTTKAP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
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NP_003 TGPFKREELLDHLEKQAKEFKDREDLVPYTGEKRGKVWVPKQKPLDPVLE-SVTLEPELE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNK-GGKGPVRNVVKGEKVKPVFEEP
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NP_003 EALANASDAELCDIAAILGMHTLMSNQQYYQALSSSSIMNKEGLNSVIKPTQYKPVPDEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAATRSN
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NP_003 PNSTDVEETLERIKNNDPKLEEVNLNNIRNIPIPTLKAYAEALKENSYVKKFSIVGTRSN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQLGTA
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NP_003 DPVAYALAEMLKENKVLKTLNVESNFISGAGILRLVEALPYNTSLVEMKIDNQSQPLGNK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
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NP_003 VEMEIVSMLEKNATLLKFGYHFTQQGPRLRASNAMMNNNDLVRKRRL-ADLTGPIIPKCR
300 310 320 330 340 350
NP_003 SGV
>>XP_011507751 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomodulin-4 (345 aa)
initn: 1258 init1: 706 opt: 1254 Z-score: 1261.1 bits: 241.8 E(85289): 1.7e-63
Smith-Waterman score: 1254; 54.6% identity (83.5% similar) in 346 aa overlap (5-345:4-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
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XP_011 MSSYQKELEKYRDIDEDEILRTLSPEELEQLDCELQEMDPENMLLPAGLRQRDQTKKSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
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XP_011 TGPLDREALLQYLEQQALEVKERDDLVPFTGEKKGKPYIQPKREIPA--EEQITLEPELE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDE-----ETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPV
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XP_011 EALAHATDAEMCDIAAILDMYTLMSNKQYYDALCSGEICNTEG----ISSVVQPDKYKPV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 FEEPPNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAA
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XP_011 PDEPPNPTNIEEILKRVRSNDKELEEVNLNNIQDIPIPMLSELCEAMKANTYVRSFSLVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 TRSNDPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQ
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XP_011 TRSGDPIANAVADMLRENRSLQSLNIESNFISSTGLMAVLKAVRENATLTELRVDNQRQW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LGTAVEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
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XP_011 PGDAVEMEMATVLEQCPSIVRFGYHFTQQGPRARAAQAMTRNNELRRQQKKR
300 310 320 330 340
>>XP_016856578 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomodulin-4 (345 aa)
initn: 1258 init1: 706 opt: 1254 Z-score: 1261.1 bits: 241.8 E(85289): 1.7e-63
Smith-Waterman score: 1254; 54.6% identity (83.5% similar) in 346 aa overlap (5-345:4-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKAA
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XP_016 MSSYQKELEKYRDIDEDEILRTLSPEELEQLDCELQEMDPENMLLPAGLRQRDQTKKSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TGPFDREHLLMYLEKEALEQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPIETRKEEKVTLDPELE
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XP_016 TGPLDREALLQYLEQQALEVKERDDLVPFTGEKKGKPYIQPKREIPA--EEQITLEPELE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 EALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDE-----ETANNKGGKGPVRNVVKGEKVKPV
:::: :.:.:. :.::.: ...:..: .. . : :..: . .::. .: :::
XP_016 EALAHATDAEMCDIAAILDMYTLMSNKQYYDALCSGEICNTEG----ISSVVQPDKYKPV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 FEEPPNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKALETNTHVKKFSLAA
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XP_016 PDEPPNPTNIEEILKRVRSNDKELEEVNLNNIQDIPIPMLSELCEAMKANTYVRSFSLVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 TRSNDPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKENDTLTEIKIDNQRQQ
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XP_016 TRSGDPIANAVADMLRENRSLQSLNIESNFISSTGLMAVLKAVRENATLTELRVDNQRQW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LGTAVEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLVRKKRVEADRR
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XP_016 PGDAVEMEMATVLEQCPSIVRFGYHFTQQGPRARAAQAMTRNNELRRQQKKR
300 310 320 330 340
351 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:13:17 2016 done: Sun Nov 6 14:13:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]