Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2800
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2800, 497 aa
1>>>pF1KE2800 497 - 497 aa - 497 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6913+/-0.000926; mu= 16.1521+/- 0.056
mean_var=70.2753+/-14.412, 0's: 0 Z-trim(104.7): 17 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.152993
statistics sampled from 8151 (8161) to 8151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 1.440
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1280.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 ( 497) 3269 731.0 7.5e-211
CCDS2468.1 SLC19A3 gene_id:80704|Hs109|chr2 ( 496) 1607 364.1 2e-100
CCDS81398.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 ( 296) 1479 335.8 4.1e-92
CCDS56218.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 ( 489) 641 150.9 3.1e-36
CCDS13725.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 ( 591) 641 150.9 3.6e-36
CCDS56217.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 ( 551) 500 119.8 7.9e-27
>>CCDS1280.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 (497 aa)
initn: 3269 init1: 3269 opt: 3269 Z-score: 3899.1 bits: 731.0 E(33420): 7.5e-211
Smith-Waterman score: 3269; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
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CCDS12 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMK
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE2 KCRKLEDPQSSSQVTTS
:::::::::::::::::
CCDS12 KCRKLEDPQSSSQVTTS
490
>>CCDS2468.1 SLC19A3 gene_id:80704|Hs109|chr2 (496 aa)
initn: 1612 init1: 879 opt: 1607 Z-score: 1916.6 bits: 364.1 E(33420): 2e-100
Smith-Waterman score: 1607; 52.1% identity (79.4% similar) in 466 aa overlap (30-490:12-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
:. ::..:: .:::. .::::::: ::: ::
CCDS24 MDCYRTSLSSSWIYPTVILCLFGFFSMMRPSEPFLIPYLSGP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG
::::: :. :::.:::::::::::.:::. :::.:::::..:::.:.:.::..::..::
CCDS24 DKNLTSAEITNEIFPVWTYSYLVLLLPVFVLTDYVRYKPVIILQGISFIITWLLLLFGQG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV
. ..: .:::::..::.:.:::.::::::. ::.:..::::.::...:.::::.:.::
CCDS24 VKTMQVVEFFYGMVTAAEVAYYAYIYSVVSPEHYQRVSGYCRSVTLAAYTAGSVLAQLLV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD
:.:. : : ::::::. ::::: . :::::.::.::: :: . : .. . : .
CCDS24 SLANMSYFYLNVISLASVSVAFLFSLFLPMPKKSMFFHAKPSREIK----KSSSVNPVLE
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEP---KPDRLLV-LKVLW-NDFLMCYSSRPL
.. :: :. . . ... . ::. . : . : : .:. ::::. :
CCDS24 ETHEGEAPGCEEQKPTSEILSTSGKLNKGQLNSLKPSNVTVDVFVQWFQDLKECYSSKRL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LCWSVWWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIK
. ::.:::..: :. ::.::.: ::. ::. ..::::.:::..:. ::::.:::::.:
CCDS24 FYWSLWWAFATAGFNQVLNYVQILWDYKAPSQDSSIYNGAVEAIATFGGAVAAFAVGYVK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ISWSTWGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANL
..:. ::..: .::.. :.....: ..:::.:::.:..:. ::::::::.::::.::
CCDS24 VNWDLLGELALVVFSVVNAGSLFLMHYTANIWACYAGYLIFKSSYMLLITIAVFQIAVNL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SMERYALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGA
..::::::::.::::::..::..:.:::: ::.: .. :::.:.::::.:: .:: .
CCDS24 NVERYALVFGINTFIALVIQTIMTVIVVDQRGLNLPVSIQFLVYGSYFAVIAGIFLMR-S
400 410 420 430 440 450
480 490
pF1KE2 VSVMKKCRKLEDPQSSSQVTTS
. . . .. .: ::
CCDS24 MYITYSTKSQKDVQSPAPSENPDVSHPEEESNIIMSTKL
460 470 480 490
>>CCDS81398.1 SLC19A2 gene_id:10560|Hs109|chr1 (296 aa)
initn: 1479 init1: 1479 opt: 1479 Z-score: 1767.4 bits: 335.8 E(33420): 4.1e-92
Smith-Waterman score: 1521; 59.6% identity (59.6% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG
::::::::
CCDS81 DKNLTERE----------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV
CCDS81 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD
CCDS81 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 -----------------------------EPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV
70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWST
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANLSMERY
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMK
220 230 240 250 260 270
490
pF1KE2 KCRKLEDPQSSSQVTTS
:::::::::::::::::
CCDS81 KCRKLEDPQSSSQVTTS
280 290
>>CCDS56218.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 (489 aa)
initn: 1118 init1: 638 opt: 641 Z-score: 764.3 bits: 150.9 E(33420): 3.1e-36
Smith-Waterman score: 1075; 42.7% identity (71.9% similar) in 431 aa overlap (30-455:25-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
: . :: :::.:..::.: :.:::::::
CCDS56 MVPSSPAVEKQVPVEPGPDPELRSWRHLVCYLCFYGFMAQIRPGESFITPYLLGP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG
:::.:...: ::: :: .::::..: :::: :::::: ::.::::::.. .:..:: ...
CCDS56 DKNFTREQVTNEITPVLSYSYLAVLVPVFLLTDYLRYTPVLLLQGLSFVSVWLLLLLGHS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV
. .:..:.::... :..::: :::.:.: . ::.:..: :.:.:.: ..:::::.::
CCDS56 VAHMQLMELFYSVTMAARIAYSSYIFSLVRPARYQRVAGYSRAAVLLGVFTSSVLGQLLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD
.:. :. .:: :::. .. . ..: :: :..::::. : . . .... ..
CCDS56 TVGRVSFSTLNYISLAFLTFSVVLALFLKRPKRSLFFN-------RDDRGRCETSA--SE
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLL-CWS
: :: .:. .. : . :.: . : .: : :: : ::
CCDS56 LERMNPGPG-----GKLGHALR---VACGDSVLARML--REL-GDSL----RRPQLRLWS
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VWWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAA-IYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISW
.::.... ::. :: :.. ::..: :. .: .:::...:.::::::.. ::.:..:: :
CCDS56 LWWVFNSAGYYLVVYYVHILWNEVDPTTNSARVYNGAADAASTLLGAITSFAAGFVKIRW
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 STWGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTV---GNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANL
. :... .. . :. :... . ..::.:::..:.:: :..:. :::::::..:
CCDS56 ARWSKLLIAGVTATQAGLVFLLAHTRHPSSIWLCYAAFVLFRGSYQFLVPIATFQIASSL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SMERYALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGA
: : :::::::::.: ..:..:.:: :. :::: . :
CCDS56 SKELCALVFGVNTFFATIVKTIITFIVSDVRGLGLPVRKQNEELHVASLSLWKSHLRLAA
400 410 420 430 440 450
480 490
pF1KE2 VSVMKKCRKLEDPQSSSQVTTS
CCDS56 DTLSSEGSSGSGPRSWFLSPTLRAALHGPVCPSEVCPS
460 470 480
>>CCDS13725.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 (591 aa)
initn: 1165 init1: 638 opt: 641 Z-score: 763.0 bits: 150.9 E(33420): 3.6e-36
Smith-Waterman score: 1145; 40.9% identity (72.3% similar) in 465 aa overlap (30-489:25-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGP
: . :: :::.:..::.: :.:::::::
CCDS13 MVPSSPAVEKQVPVEPGPDPELRSWRHLVCYLCFYGFMAQIRPGESFITPYLLGP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQG
:::.:...: ::: :: .::::..: :::: :::::: ::.::::::.. .:..:: ...
CCDS13 DKNFTREQVTNEITPVLSYSYLAVLVPVFLLTDYLRYTPVLLLQGLSFVSVWLLLLLGHS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILV
. .:..:.::... :..::: :::.:.: . ::.:..: :.:.:.: ..:::::.::
CCDS13 VAHMQLMELFYSVTMAARIAYSSYIFSLVRPARYQRVAGYSRAAVLLGVFTSSVLGQLLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SVAGWSLFSLNVISLTCVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTD
.:. :. .:: :::. .. . ..: :: :..::::. : . . ... ...
CCDS13 TVGRVSFSTLNYISLAFLTFSVVLALFLKRPKRSLFFN-------RDDRGRCETS--ASE
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE2 TPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLL-CWS
: :: .:. .. : . :. :. : .: : :: : ::
CCDS13 LERMNPGPG-----GKLGHALR---VACGDSVLARM--LREL-GDSL----RRPQLRLWS
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VWWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAA-IYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISW
.::.... ::. :: :.. ::..: :. .: .:::...:.::::::.. ::.:..:: :
CCDS13 LWWVFNSAGYYLVVYYVHILWNEVDPTTNSARVYNGAADAASTLLGAITSFAAGFVKIRW
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 STWGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTV---GNIWVCYASYVVFRIIYMLLITIATFQIAANL
. :... .. . :. :... . ..::.:::..:.:: :..:. :::::::..:
CCDS13 ARWSKLLIAGVTATQAGLVFLLAHTRHPSSIWLCYAAFVLFRGSYQFLVPIATFQIASSL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SMERYALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGA
: : :::::::::.: ..:..:.:: :. :::: . :: .:. :: ....... ..
CCDS13 SKELCALVFGVNTFFATIVKTIITFIVSDVRGLGLPVRKQFQLYSVYFLILSIIYFLGAM
400 410 420 430 440 450
480 490
pF1KE2 VSVMKKCRKLEDPQSSSQVTTS
.. ...:.. . :.
CCDS13 LDGLRHCQRGHHPRQPPAQGLRSAAEEKAAQALSVQDKGLGGLQPAQSPPLSPEDSLGAV
460 470 480 490 500 510
>>CCDS56217.1 SLC19A1 gene_id:6573|Hs109|chr21 (551 aa)
initn: 1024 init1: 497 opt: 500 Z-score: 595.3 bits: 119.8 E(33420): 7.9e-27
Smith-Waterman score: 1004; 38.8% identity (70.3% similar) in 448 aa overlap (47-489:4-425)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 TVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGPDKNLTEREVFNEIYPV
.:.:: .: : . . :: ::: ::
CCDS56 MRPQPAEP--APGGRGNEACSIHSEVTNEITPV
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 WTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPVVLLQGLSLIVTWFMLLYAQGLLAIQFLEFFYGIATA
.::::..: :::: :::::: ::.::::::.. .:..:: .... .:..:.::... :
CCDS56 LSYSYLAVLVPVFLLTDYLRYTPVLLLQGLSFVSVWLLLLLGHSVAHMQLMELFYSVTMA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 TEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILVSVAGWSLFSLNVISLT
..::: :::.:.: . ::.:..: :.:.:.: ..:::::.::.:. :. .:: :::.
CCDS56 ARIAYSSYIFSLVRPARYQRVAGYSRAAVLLGVFTSSVLGQLLVTVGRVSFSTLNYISLA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 CVSVAFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTDTPASNHLPGWEDIESK
.. . ..: :: :..::::. : . . ... ... : :: .:
CCDS56 FLTFSVVLALFLKRPKRSLFFN-------RDDRGRCETS--ASELERMNPGPG-----GK
160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 IPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLL-CWSVWWALSTCGYFQVVNY
. .. : . :. :. : .: : :: : ::.::.... ::. :: :
CCDS56 LGHALR---VACGDSVLARM--LREL-GDSL----RRPQLRLWSLWWVFNSAGYYLVVYY
200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 TQGLWEKVMPSRYAA-IYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWSTWGEMTLSLFSLLIA
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