FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2785, 198 aa
1>>>pF1KE2785 198 - 198 aa - 198 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4715+/-0.00082; mu= 4.6567+/- 0.049
mean_var=191.8806+/-38.518, 0's: 0 Z-trim(114.1): 933 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.092589
statistics sampled from 13828 (14848) to 13828 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16
Scan time: 0.970
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6397.2 ZFP41 gene_id:286128|Hs109|chr8 ( 199) 1438 203.4 7.5e-53
CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs109|chr8 ( 376) 581 89.3 3.4e-18
CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 ( 350) 570 87.8 8.9e-18
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs109|chr22 ( 446) 569 87.7 1.2e-17
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 ( 527) 570 87.9 1.2e-17
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 ( 364) 567 87.4 1.2e-17
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 ( 563) 570 88.0 1.2e-17
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 ( 474) 567 87.5 1.4e-17
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 ( 498) 567 87.5 1.5e-17
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs109|chr8 ( 682) 569 87.9 1.5e-17
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 616) 567 87.6 1.7e-17
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 658) 567 87.6 1.8e-17
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 670) 567 87.6 1.8e-17
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 682) 567 87.7 1.9e-17
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs109|chr19 ( 314) 560 86.4 2.1e-17
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs109|chr19 ( 488) 562 86.8 2.3e-17
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs109|chr19 ( 418) 560 86.5 2.5e-17
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs109|chr19 ( 419) 560 86.5 2.5e-17
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs109|chr3 ( 754) 564 87.3 2.6e-17
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs109|chr17 ( 511) 558 86.3 3.5e-17
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs109|chr17 ( 521) 558 86.3 3.5e-17
CCDS74207.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs109|chr18 ( 307) 554 85.6 3.6e-17
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs109|chr17 ( 522) 557 86.2 3.9e-17
CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs109|chr12 ( 261) 550 85.0 4.6e-17
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs109|chr18 ( 494) 554 85.8 5e-17
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs109|chr8 ( 590) 554 85.8 5.6e-17
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs109|chr3 ( 544) 553 85.7 5.8e-17
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs109|chr8 ( 686) 554 85.9 6.2e-17
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs109|chr8 ( 697) 554 85.9 6.3e-17
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs109|chr1 ( 470) 550 85.2 6.9e-17
CCDS2011.1 ZNF514 gene_id:84874|Hs109|chr2 ( 400) 548 84.9 7.5e-17
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs109|chr5 ( 461) 549 85.1 7.5e-17
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs109|chr18 ( 534) 548 85.0 9.1e-17
CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs109|chr17 ( 807) 551 85.6 9.2e-17
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs109|chr8 ( 529) 546 84.7 1.1e-16
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs109|chr10 ( 561) 546 84.8 1.1e-16
CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs109|chr3 ( 271) 540 83.6 1.2e-16
CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs109|chr6 ( 390) 542 84.1 1.3e-16
CCDS54330.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 390) 542 84.1 1.3e-16
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs109|chr7 ( 446) 543 84.3 1.3e-16
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs109|chr19 ( 591) 545 84.6 1.3e-16
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs109|chr19 ( 676) 545 84.7 1.4e-16
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs109|chr19 ( 697) 545 84.7 1.4e-16
CCDS2708.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs109|chr3 ( 426) 541 84.0 1.5e-16
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs109|chr16 ( 585) 543 84.4 1.5e-16
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs109|chr19 ( 670) 544 84.6 1.5e-16
CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs109|chr3 ( 452) 541 84.0 1.6e-16
CCDS42462.1 ZNF554 gene_id:115196|Hs109|chr19 ( 538) 542 84.2 1.6e-16
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs109|chr6 ( 538) 542 84.2 1.6e-16
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs109|chr9 ( 630) 543 84.4 1.6e-16
>>CCDS6397.2 ZFP41 gene_id:286128|Hs109|chr8 (199 aa)
initn: 1438 init1: 1438 opt: 1438 Z-score: 1062.5 bits: 203.4 E(33420): 7.5e-53
Smith-Waterman score: 1438; 100.0% identity (100.0% similar) in 198 aa overlap (1-198:2-199)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEKPAGRKKKTPTPREEADVQKSALREEKVSGDRKPPERPTVPRKPRTEPCLSPEDEEH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MMEKPAGRKKKTPTPREEADVQKSALREEKVSGDRKPPERPTVPRKPRTEPCLSPEDEEH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 VFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 CGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 CGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKA
130 140 150 160 170 180
180 190
pF1KE2 FAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:::::::::::::::::::
CCDS63 FAYSSCLIRHQKRHPRKKP
190
>>CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs109|chr8 (376 aa)
initn: 1122 init1: 559 opt: 581 Z-score: 440.4 bits: 89.3 E(33420): 3.4e-18
Smith-Waterman score: 581; 42.4% identity (66.0% similar) in 203 aa overlap (2-198:124-322)
10 20 30
pF1KE2 MEKPAGRKKKTPTPREEADVQKSALREEKVS
:.:::. . . . . .: .. ..
CCDS63 EGAGGALRSLLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAA
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80
pF1KE2 GDRKPPERPTV--PRKPRTEPCLSPEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQR----KK
: . ::: . :.. . . : .: ::: . ... :: .:
CCDS63 GPEGAPERAAELGVNFGRSRQGSARGAKPHRCEACGKSFKYN----SLLLKHQRIHTGEK
160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 PYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKC
:: : :::. :. . :.:.:.::::::..:.:::.:: ::: :.: : :.::::.::
CCDS63 PYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKC
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190
pF1KE2 GECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
::::.::. .:::..::. ::::::: :..::::: .:: ::.::. : .::
CCDS63 GECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCG
270 280 290 300 310 320
CCDS63 KAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
330 340 350 360 370
>>CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 (350 aa)
initn: 558 init1: 558 opt: 570 Z-score: 432.9 bits: 87.8 E(33420): 8.9e-18
Smith-Waterman score: 582; 43.0% identity (66.2% similar) in 207 aa overlap (3-198:97-303)
10 20
pF1KE2 MEKPAGRKKKTP---TPREEADVQKSALREEK
: . :..:.: : .:. : . ...:
CCDS75 KAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKK
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 -VSGDRKPPERPT-VPRK-PRTEPCLSPED-----EEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPF
..:.: : :. . :. . .::. . : : : . . :
CCDS75 TITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIH
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 QRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEK
.:::::::::. :. ... . :::.:::::: .: .::::: :::.. ::: :.:::
CCDS75 TGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEK
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190
pF1KE2 PFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:..:.::::::. .:.: :::. :::::::::..::::: .: :: :.. : :.::
CCDS75 PYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKC
250 260 270 280 290 300
CCDS75 TKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
310 320 330 340 350
>>CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs109|chr22 (446 aa)
initn: 867 init1: 569 opt: 569 Z-score: 430.8 bits: 87.7 E(33420): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 569; 61.7% identity (85.2% similar) in 115 aa overlap (84-198:277-391)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK
:::.::. ::. : :.. :::::.:::.:
CCDS13 TGERPYQCKECGKSFNQSSGLSQHRKIHTLKKPHECDLCGKAFCHRSHLIRHQRIHTGKK
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC
:.:: .::::: .::.. .:..:::::::.:: .:::::. .:.:..::. :::::::::
CCDS13 PYKCDECGKAFSQSSNLIEHRKTHTGEKPYKCQKCGKAFSQSSSLIEHQRIHTGEKPYEC
310 320 330 340 350 360
180 190
pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
.::::: .:: ::.::. : :::
CCDS13 CQCGKAFCHSSALIQHQRIHTGKKPYTCECGKAFRHRSALIEHYKTHTREKPYVCNLCGK
370 380 390 400 410 420
>--
initn: 1384 init1: 497 opt: 498 Z-score: 379.6 bits: 78.2 E(33420): 8.2e-15
Smith-Waterman score: 500; 37.9% identity (62.6% similar) in 203 aa overlap (2-198:50-251)
10 20 30
pF1KE2 MEKPAGRKKKTPTPRE-EADVQKSALREEKV
: : :.. . : . .. .: ......
CCDS13 ESQQGLFPGEDLGDPFLQERGLEQMAVIYKEIPLGEQDEENDDYEGNFSLCSSPVQHQSI
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE2 SGDRKPPERP----TVPRKPRTEPCLSPEDEEHV-FDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKK
.: . : .: : ..:: : ... :. ..: : : :
CCDS13 PPGTRPQDDELFGQTFLQKSDLSMCQIIHSEEPSPCDCAETDRGDSGPNAPHRTP-QPAK
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 PYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKC
:: : :::. :.... .:: .::::::..: .::::: .:: . .:: ::::::..:
CCDS13 PYACRECGKAFSQSSHLLRHLVIHTGEKPYECCECGKAFSQSSHLLRHQIIHTGEKPYEC
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190
pF1KE2 GECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:::::: .: : .::: :::..:::: .::: :. :: : .:.. : ..:
CCDS13 RECGKAFRQSSALTQHQKIHTGKRPYECRECGKDFSRSSSLRKHERIHTGERPYQCKECG
200 210 220 230 240 250
CCDS13 KSFNQSSGLSQHRKIHTLKKPHECDLCGKAFCHRSHLIRHQRIHTGKKPYKCDECGKAFS
260 270 280 290 300 310
>>CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 (527 aa)
initn: 558 init1: 558 opt: 570 Z-score: 430.7 bits: 87.9 E(33420): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 582; 43.0% identity (66.2% similar) in 207 aa overlap (3-198:274-480)
10 20
pF1KE2 MEKPAGRKKKTP---TPREEADVQKSALREEK
: . :..:.: : .:. : . ...:
CCDS69 KAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKK
250 260 270 280 290 300
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 -VSGDRKPPERPT-VPRK-PRTEPCLSPED-----EEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPF
..:.: : :. . :. . .::. . : : : . . :
CCDS69 TITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIH
310 320 330 340 350 360
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 QRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEK
.:::::::::. :. ... . :::.:::::: .: .::::: :::.. ::: :.:::
CCDS69 TGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEK
370 380 390 400 410 420
150 160 170 180 190
pF1KE2 PFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:..:.::::::. .:.: :::. :::::::::..::::: .: :: :.. : :.::
CCDS69 PYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKC
430 440 450 460 470 480
CCDS69 TKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
490 500 510 520
>>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 (364 aa)
initn: 567 init1: 567 opt: 567 Z-score: 430.5 bits: 87.4 E(33420): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 567; 63.5% identity (87.0% similar) in 115 aa overlap (84-198:196-310)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK
.:::.:::::. :.. . :.:::.:::::
CCDS75 TGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEK
170 180 190 200 210 220
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC
:..:: ::::: .:...:.::::::::::.::.::::::. ..::. :::::::::::.:
CCDS75 PYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKC
230 240 250 260 270 280
180 190
pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
..::: :. :: ::::. : .::
CCDS75 NECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECG
290 300 310 320 330 340
>--
initn: 575 init1: 546 opt: 547 Z-score: 416.0 bits: 84.7 E(33420): 7.7e-17
Smith-Waterman score: 548; 48.7% identity (77.0% similar) in 152 aa overlap (50-198:21-170)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 VQKSALREEKVSGDRKPPERPTVPRKPRTEPCLSPEDEEHVFDAFD---ASFKDDFEGVP
: :::... : .: . ..:..
CCDS75 MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPV-EARPRKCETHTESFKNSE
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 VFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRT
.. : .: ::: :.:::. :.. .. .::. ::::::..:..::::: .::.. .:::
CCDS75 ILKP-HRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRI
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 HTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRK
::::::.::.:::.::. ..:: :::.::::::::.:..: :::. : :..::. : .
CCDS75 HTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGE
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KP
::
CCDS75 KPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYR
170 180 190 200 210 220
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10 20
pF1KE2 MEKPAGRKKKTP---TPREEADVQKSALREEK
: . :..:.: : .:. : . ...:
CCDS34 KAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKK
280 290 300 310 320 330
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 -VSGDRKPPERPT-VPRK-PRTEPCLSPED-----EEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPF
..:.: : :. . :. . .::. . : : : . . :
CCDS34 TITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIH
340 350 360 370 380 390
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 QRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEK
.:::::::::. :. ... . :::.:::::: .: .::::: :::.. ::: :.:::
CCDS34 TGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEK
400 410 420 430 440 450
150 160 170 180 190
pF1KE2 PFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:..:.::::::. .:.: :::. :::::::::..::::: .: :: :.. : :.::
CCDS34 PYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKC
460 470 480 490 500 510
CCDS34 TKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
520 530 540 550 560
>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 (474 aa)
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Smith-Waterman score: 567; 63.5% identity (87.0% similar) in 115 aa overlap (84-198:306-420)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK
.:::.:::::. :.. . :.:::.:::::
CCDS69 TGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEK
280 290 300 310 320 330
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC
:..:: ::::: .:...:.::::::::::.::.::::::. ..::. :::::::::::.:
CCDS69 PYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKC
340 350 360 370 380 390
180 190
pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
..::: :. :: ::::. : .::
CCDS69 NECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECG
400 410 420 430 440 450
>--
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10 20
pF1KE2 MEKPA-GRKKKTPTPREEADVQKSALREEK
...:. : : . .: :.: ........
CCDS69 LVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPEQA-LSEASFQDPC
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 VSGDRKPPERPT--VPRKPRTEPCLSPEDEEHVFDAFD---ASFKDDFEGVPVFIPFQRK
: .. : . .. .: :::... : .: . ..:.. .. : .:
CCDS69 VEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPV-EARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 KPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFK
::: :.:::. :.. .. .::. ::::::..:..::::: .::.. .::: ::::::.:
CCDS69 KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYK
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190
pF1KE2 CGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:.:::.::. ..:: :::.::::::::.:..: :::. : :..::. : .::
CCDS69 CSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDC
230 240 250 260 270 280
CCDS69 GKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAF
290 300 310 320 330 340
>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 (498 aa)
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Smith-Waterman score: 567; 63.5% identity (87.0% similar) in 115 aa overlap (84-198:330-444)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK
.:::.:::::. :.. . :.:::.:::::
CCDS68 TGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEK
300 310 320 330 340 350
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC
:..:: ::::: .:...:.::::::::::.::.::::::. ..::. :::::::::::.:
CCDS68 PYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKC
360 370 380 390 400 410
180 190
pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
..::: :. :: ::::. : .::
CCDS68 NECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECG
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 575 init1: 546 opt: 547 Z-score: 414.4 bits: 84.8 E(33420): 9.5e-17
Smith-Waterman score: 550; 40.2% identity (71.6% similar) in 204 aa overlap (1-198:104-304)
10 20
pF1KE2 MEKPA-GRKKKTPTPREEADVQKSALREEK
...:. : : . .: :.: ........
CCDS68 LVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPEQA-LSEASFQDPC
80 90 100 110 120 130
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 VSGDRKPPERPT--VPRKPRTEPCLSPEDEEHVFDAFD---ASFKDDFEGVPVFIPFQRK
: .. : . .. .: :::... : .: . ..:.. .. : .:
CCDS68 VEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPV-EARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA
140 150 160 170 180 190
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 KPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFK
::: :.:::. :.. .. .::. ::::::..:..::::: .::.. .::: ::::::.:
CCDS68 KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYK
200 210 220 230 240 250
150 160 170 180 190
pF1KE2 CGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
:.:::.::. ..:: :::.::::::::.:..: :::. : :..::. : .::
CCDS68 CSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDC
260 270 280 290 300 310
CCDS68 GKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAF
320 330 340 350 360 370
>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs109|chr8 (682 aa)
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60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK
.:::::.:::. :..... :.:::.:.:::
CCDS64 SSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEK
290 300 310 320 330 340
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC
:. :..::::::.::.. ::.:::::::::.::::::::. ...: :::..:::::::::
CCDS64 PYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYEC
350 360 370 380 390 400
180 190
pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
. ::: :. : ::.:.. : .::
CCDS64 NDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCG
410 420 430 440 450 460
>--
initn: 587 init1: 516 opt: 516 Z-score: 390.3 bits: 80.8 E(33420): 2.1e-15
Smith-Waterman score: 516; 55.7% identity (82.6% similar) in 115 aa overlap (84-198:542-656)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK
.:::::.:::. :.... :.:::.:.: :
CCDS64 TGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLK
520 530 540 550 560 570
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC
: .: :::::: .::.. .::..::::::. : ::::.:. .:.:..:: ::::.::.:
CCDS64 PHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKC
580 590 600 610 620 630
180 190
pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
..:::::. : ::.::. : ::
CCDS64 SECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
640 650 660 670 680
>--
initn: 457 init1: 457 opt: 466 Z-score: 354.2 bits: 74.2 E(33420): 2.1e-13
Smith-Waterman score: 466; 56.1% identity (80.4% similar) in 107 aa overlap (87-193:433-539)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 EEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFK
:.::.::. :..... :.:.:.::::::
CCDS64 KPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHV
410 420 430 440 450 460
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 CAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHC
: ::::: .:: . ::: ::::::..:. :::::. .: :..:: .:::.::: : .:
CCDS64 CNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHEC
470 480 490 500 510 520
180 190
pF1KE2 GKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP
::.:. :: :: ::. :
CCDS64 GKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]