FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2771, 509 aa
1>>>pF1KE2771 509 - 509 aa - 509 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0453+/-0.000899; mu= 19.8492+/- 0.054
mean_var=71.4282+/-14.797, 0's: 0 Z-trim(106.0): 34 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.151754
statistics sampled from 8794 (8822) to 8794 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 1.420
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs109|chr10 ( 509) 3402 754.3 7.3e-218
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CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs109|chr17 ( 426) 482 115.0 1.8e-25
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CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs109|chr17 ( 523) 458 109.8 7.9e-24
CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs109|chr17 ( 505) 450 108.0 2.6e-23
CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs109|chr17 ( 471) 439 105.6 1.3e-22
CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs109|chr12 ( 478) 434 104.5 2.8e-22
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CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs109|chr1 ( 500) 393 95.5 1.5e-19
CCDS5089.1 SLC16A10 gene_id:117247|Hs109|chr6 ( 515) 390 94.9 2.4e-19
CCDS14426.2 SLC16A2 gene_id:6567|Hs109|chrX ( 539) 358 87.9 3.2e-17
CCDS55624.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs109|chr1 ( 319) 337 83.1 5.1e-16
CCDS55622.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs109|chr1 ( 425) 324 80.4 4.6e-15
CCDS55623.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs109|chr1 ( 439) 324 80.4 4.7e-15
>>CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs109|chr10 (509 aa)
initn: 3402 init1: 3402 opt: 3402 Z-score: 4025.0 bits: 754.3 E(33420): 7.3e-218
Smith-Waterman score: 3402; 100.0% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIEWLDAFGEGKGKTAWVGSLASG
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CCDS72 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIEWLDAFGEGKGKTAWVGSLASG
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLSSFAPNIYFLFFSYGIVVGLGCGLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQRMLVEFYGLDGCLLIVGALALN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNEKGKNLEENINILDKSYSSEEKCRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFCKQLAKRKWQLYKNYCGETVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFCKQLAKRKWQLYKNYCGETVAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPLISIIGIMTAVGKLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPLISIIGIMTAVGKLLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGILGFLTGNWSIFPYVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGILGFLTGNWSIFPYVTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDIAFYFSGFCVLLGGFILLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDIAFYFSGFCVLLGGFILLL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE2 AALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
490 500
>>CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs109|chr2 (510 aa)
initn: 918 init1: 566 opt: 584 Z-score: 690.7 bits: 137.4 E(33420): 3.9e-32
Smith-Waterman score: 975; 34.3% identity (69.0% similar) in 481 aa overlap (3-480:22-490)
10 20 30
pF1KE2 MELKKSP--DGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIE
:: : ::::.:..:. ::....: .:: .:.::: .:
CCDS24 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 WLDAFGEGKGKTAWVGSLASGVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLSSFA
::. : ...: ::::.::. :. :...: .: ... : : ..:..:.. . : .::..:
CCDS24 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 PNIYFLFFSYGIVVGLGCGLLYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQR
:...::...:...::: :. : .:... .::. ::.:: :: .::.. : :....: .
CCDS24 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 MLVEFYGLDGCLLIVGALALNILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNEKGK
.: :: . .:: ::..::. .::.:::::. : : :.: : . .. . ..
CCDS24 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLS------PGK-NPND-PGEKDVRGLPAH
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 NLEENINILDKSYSSEEKCRITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFC
. : ... .. .::: :.: . : .. : . .. . . ...
CCDS24 STE-SVKSTGQQGRTEEK-DGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 KQLAKRKWQLYKNYCGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFP-PSLLMEDVARSSNVKE
.. : . :..: : :..:: :..: : :: :: ..: : . . ... :..:
CCDS24 MRVRKGFEDWYSGYFG-TASLFTNRMFVA-FIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSE
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 EEFIMPLISIIGIMTAVGKLLLGILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTL
.. ..:: :::.:. ::..::..::. :.. ... . . . :.. .:. ..:. :
CCDS24 QNDVFPLTSIIAIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 ALLSGILGFLTGNWSIFPYVTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQ
:.. ...:: .: .:..: :: ::::.::.::::.. :.. ::::..::.:: ::
CCDS24 AVICALIGFSSGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE2 TYDIAFYFSGFCVLLGGFILLLAALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
::..::. :. ..: ..::.
CCDS24 KYDFSFYICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
470 480 490 500 510
>>CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs109|chr17 (465 aa)
initn: 608 init1: 484 opt: 492 Z-score: 582.4 bits: 117.2 E(33420): 4.2e-26
Smith-Waterman score: 514; 25.5% identity (53.0% similar) in 498 aa overlap (5-498:14-419)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIEWLDAFGEGKGKT
:.:::::::...: :. . :. : ::.:.. : .. :: : . :
CCDS11 MGGAVVDEGPTGVKAPDGGWGWAVLFGCFVITGFSYAFPKAVSVFFKELIQEFGIGYSDT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 AWVGSLASGVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLSSFAPNIYFLFFSYGI
::..:. .. ..:.::.::. :: ::: . .:.... :.. .:: .: .... :.
CCDS11 AWISSILLAMLYGTGPLCSVCVNRFGCRPVMLVGGLFASLGMVAASFCRSIIQVYLTTGV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VVGLGCGLLYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQRMLVEFYGLDGCL
..::: .: . .. . .::. :: .: :: ..:: : : . : ..: . :: : .
CCDS11 ITGLGLALNFQPSLIMLNRYFSKRRPMANGLAAAGSPVFLCALSPLGQLLQDRYGWRGGF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LIVGALALNILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNEKGKNLEENINILDKS
::.:.: :: .:..::::: . : . :. :.. .:: :
CCDS11 LILGGLLLNCCVCAALMRPLVVT--AQPGSGPPR--PSRR---------------LLDLS
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 YSSEEKCRITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFCKQLAKRKWQLYK
CCDS11 ------------------------------------------------------------
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 NYCGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPLISIIGI
.:... : .: .. .: : : ... . :.. .: . . . :..:.:.
CCDS11 --------VFRDRGFVLYAVAASVMVLGLFVPPVFVVSYAKDLGVPDTKAAF-LLTILGF
230 240 250 260 270
360 370 380 390 400
pF1KE2 MTAVGKLLLGILADFKWIN--TLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGILGFLT
. .. :..: . . ..::. .... ::: : : .: :... ..:.
CCDS11 IDIFARPAAGFVAGLGKVRPYSVYLFSFSMFFNGLADLAGSTAGDYGGLVVFCIFFGISY
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 GNWSIFPY-VTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDIAFYFSG
: . . . : :: .:.. : :..... ... .::: : . : :..: .: ..:
CCDS11 GMVGALQFEVLMAIVGTHKFSSAIGLVLLMEAVAVLVGPPSGGKLLDATHVYMYVFILAG
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500
pF1KE2 FCVLLGGFILLLAALPSWDTCNKQLPK-PAPTTFLYKVASNV
:: ...::::. . : .. :: : :
CCDS11 AEVLTSSLILLLGNF----FCIRKKPKEPQPEVAAAEEEKLHKPPADSGVDLREVEHFLK
400 410 420 430 440
CCDS11 AEPEKNGEVVHTPETSV
450 460
>>CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs109|chr17 (426 aa)
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Smith-Waterman score: 533; 26.9% identity (54.2% similar) in 480 aa overlap (7-484:8-392)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIEWLDAFGEGKGKTAWVGSLAS
::::::::.:. .:. . : .: . ::...:.. :: : ....:..:..
CCDS11 MARRTEPPDGGWGWVVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVEFVAAFEEQAARVSWIASIGI
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pF1KE2 GVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLSSFAPNIYFLFFSYGIVVGLGCGL
.: ..::: : ..:: :::.. .:...: :..:.::: .. :..: :.. : : .:
CCDS11 AVQQFGSPVGSALSTKFGPRPVVMTGGILAALGMLLASFATSLTHLYLSIGLLSGSGWAL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 LYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQRMLVEFYGLDGCLLIVGALAL
.. :.. ::. ::.:: :: :: ... : .: . . :. :. : ::.:.::.:
CCDS11 TFAPTLACLSCYFSRRRSLATGLALTGVGLSSFTFAPFFQWLLSHYAWRGSLLLVSALSL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNEKGKNLEENINILDKSYSSEEKCR
...:::.:.:: : .: :. . . . .
CCDS11 HLVACGALLRP--------P--------------------SLAEDPAV------GGPRAQ
190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFCKQLAKRKWQLYKNYCGETVA
.: ::::..: . .:
CCDS11 LT---------SLLHHGPFLRYT-------------------------------------
210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMP-LISIIGIMTAVGKL
.:. :.. : : : : . ::. ... . . :.:...: ::..
CCDS11 -----------VALTLINTGYFIPYLHL--VAHLQDLDWDPLPAAFLLSVVAISDLVGRV
230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LLGILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGILGFLTGNWSIFPY-
. : :.: . : . . :..: .: :.. ..:. :. :: .: . . .
CCDS11 VSGWLGDAVPGPVTRLLMLWTTLTGVSLALFPVAQAPTALVALAVAYGFTSGALAPLAFS
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDIAFYFSGFCVLLGGFI
: . .: ... . :.:... ..:. ::::. :.. : : .: .: .: .: :. :
CCDS11 VLPELIGTRRIYCGLGLLQMIESIGGLLGPPLSGYLRDVTGNYTASFVVAGAFLLSGSGI
330 340 350 360 370 380
480 490 500
pF1KE2 LLLAALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
:: .::
CCDS11 LL--TLPHFFCFSTTTSGPQDLVTEALDTKVPLPKEGLEED
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>>CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs109|chr22 (504 aa)
initn: 544 init1: 458 opt: 464 Z-score: 548.8 bits: 111.1 E(33420): 3.1e-24
Smith-Waterman score: 584; 27.2% identity (56.0% similar) in 496 aa overlap (7-499:13-443)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIEWLDAFGEGKGKTAWV
::::::::.. . :.. . :: : ::.:.. . : : . ::::
CCDS13 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 GSLASGVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLSSFAPNIYFLFFSYGIVVG
.:. .. ..:: :. :. :: ::: . .:.....:..:.::: . :... :...:
CCDS13 SSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLTG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LGCGLLYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQRMLVEFYGLDGCLLIV
:: .: . .. . ::. :: :: :: ..:: : : . : ..:.: .: : .:..
CCDS13 LGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GALALNILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNEKGKNLEENINILDKSYSS
:.: :. :::..::: : .:. : . : .. : : .
CCDS13 GGLLLHCCACGAVMRP--------PPGPGPR--PRRDSAGDRAG----------DAPGEA
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EEKCRITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFCKQLAKRKWQLYKNYC
: :.: : : . .: : .: .... .
CCDS13 E-------ADGAGLQ--LREASPRV----RP---RRRLLD--------------------
230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPLISIIGIMTA
.:. ...:.. .. .:. .: : :..:. . :....: . . . :.::.:..
CCDS13 ---LAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAF-LLSIVGFVDI
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 VGKLLLGILADFKWI--NTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGILGFLTGNW
:.. : :: . . .. ::. .:. ::. . :.:: .:. . .:. :
CCDS13 VARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMV
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 SIFPY-VTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDIAFYFSGFCV
. . . : .:: .. : :.... . . .::: .: . : ..:.: ::..: :
CCDS13 GALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEV
370 380 390 400 410 420
480 490 500
pF1KE2 LLGGFILLLAALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
:.: .. .:. .: . : ::.
CCDS13 ALAGVFMAVAT-----NCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGN
430 440 450 460 470
>>CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs109|chr10 (516 aa)
initn: 593 init1: 456 opt: 458 Z-score: 541.5 bits: 109.8 E(33420): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 627; 27.7% identity (59.7% similar) in 481 aa overlap (7-483:43-462)
10 20 30
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVL
:::::::.:: ::. . . ....
CCDS74 KIITWLLEQPGKEEKRKTMAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIF
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 YIEWLDAFGEGKGKTAWVGSLASGVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLS
..:. : . ..:::. :... : .: .:. :. . .. . ...:.... ::.::
CCDS74 FVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILS
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SFAPNIYFLFFSYGIVVGLGCGLLYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAA
::: .. :... :...::: .: :. ..... .::. :..:: :. .::..: :: :
CCDS74 SFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAP
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LQRMLVEFYGLDGCLLIVGALALNILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNE
. ..:.: .. : :::.:...::. .::.::::. .. . .::. :.
CCDS74 VVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKE----DHTTPEQ--------NH
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 KGKNLEENINILDKSYSSEEKCRITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQT
.. .:.:. .. ::: : .: : :
CCDS74 VCRTQKEDIKRVSP-YSSLTK--------EWAQTCLC-----------------------
250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 YFCKQLAKRKWQLYKNYCGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNV
: : : : . :... : .: ...:.. : : . . : : .:
CCDS74 -CCLQ------QEY------SFLLMSD--FVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYALSVGV
270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 KEEEFIMPLISIIGIMTAVGKLLLGILADFKWINTLYLYVATLIIMGL-ALC--AIPFAK
.... . :.::.:.. .:.. .: :.: . ... : :: :. .:. .:: .:. .
CCDS74 SHQQAAF-LMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKN-YQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQ
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SYVTLALLSGILGFLTGNW-SIFPYVTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGW
: :. .: .:.. : . ...: :::. :: .:. : :...:. .. ..:::.:
CCDS74 SLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGR
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KE2 FYDWTQTYDIAFYFSGFCVLLGGFILLLAALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
. : : .: :: . :: ..... .: .: :
CCDS74 LVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDPKLQLWTNGSVA
440 450 460 470 480 490
CCDS74 YSVARELDQKHGEPVATAVPGYSLT
500 510
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10 20 30 40
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIEWLDAFGEGK
:::::::... :... . :: . ::.. . .:.:.:..
CCDS11 MTQNKLKLCSKANVYTEVPDGGWGWAVAVSFFFVEVFTYGIIKTFGVFFNDLMDSFNESN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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.. .:. :. : ...:. .. . :: : :....:..:. :.. .::. .. .. .
CCDS11 SRISWIISICVFVLTFSAPLATVLSNRFGHRLVVMLGGLLVSTGMVAASFSQEVSHMYVA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
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::. ::: . . :::: ::: ::... .. ::: ..: .: : : :
CCDS11 IGIISGLGYCFSFLPTVTILSQYFGKRRSIVTAVASTGECFAVFAFAPAIMALKERIGWR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
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::.:: : :::. :.:.::. :: . :. . .: . ::: .. .:.
CCDS11 YSLLFVGLLQLNIVIFGALLRPIFIRGPASPKIVIQENRKEAQYMLENEKTRT---SIDS
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LDKSYSSEEKCRITLANGDWKQDSLLHKN-PTVTHTK-EPETYKKKVAEQTYFCKQLAKR
.:.. . :... :: :: :. . ::.. ..: .: . ...
CCDS11 IDSG--------VELTTSP--------KNVPTHTNLELEPKADMQQVLVKT--SPRPSEK
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 KWQLYKNYCGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPL
: : ...:.: : . :. .: : ::: . .. : .. ... . :
CCDS11 KAPLLD------FSILKEKSFICYALFGLFATLGFFAPSLYIIPLGISLGIDQDRAAF-L
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ISIIGIMTAVGKLLLGILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGIL
.: ..: . :.. :.. . . : .:. . .:.. ..: :. :: . : : ..
CCDS11 LSTMAIAEVFGRIGAGFVLNREPIRKIYIELICVILLTVSLFAFTFATEFWGLMSCSIFF
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 GFLTGNW--SIFPYVTTK-TVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDI
::..:. . .: .. .:::::.. : :. .:. .... :::..: . : .. :.
CCDS11 GFMVGTIGGTHIPLLAEDDVVGIEKMSSAAGVYIFIQSIAGLAGPPLAGLLVDQSKIYSR
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
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:::
CCDS11 AFYSCAAGMALAAVCLALVRPCKMGLCQHHHSGETKVVSHRGKTLQDIPEDFLEMDLAKN
460 470 480 490 500 510
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10 20 30 40 50
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::.:.::.......:: : : : .:... : : ....:.: :. .
CCDS11 MPQALERADGSWAWVVLLATMVTQGLTLGFPTCIGIFFTELQWEFQASNSETSWFPSILT
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.: .:.:.::. :. :: : .....: ... :.. :::. :. :.:. :...::: .
CCDS11 AVLHMAGPLCSILVGRFGCRVTVMLGGVLASLGMVASSFSHNLSQLYFTAGFITGLGMCF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQRMLVEFYGLDGCLLIVGALAL
. ...:. :: :: :: .: : : :.:. .. :.:.:.: : : .:. :.. :
CCDS11 SFQSSITVLGFYFVRRRVLANALASMGVSLGITLWPLLSRYLLENLGWRGTFLVFGGIFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSI--YNEKGKNLEENINILDKSYSSEEK
. ::...::. .: : :. : :. .. :....... .
CCDS11 HCCICGAIIRPVATSVAPETKECPPPP-PETPALGCLAACGRTIQRHLAF----------
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 CRITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQTYFCKQLAKRKWQLYKNYCGET
: : :.. .::
CCDS11 ------------DILRHNT-----------------------------------GYC---
230
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFP-PSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPLISIIGIMTAVG
..: ..... ::: :.... : .: :.. . ::::::. .
CCDS11 -----------VYILGVMWSVLGFPLPQVFLVPYAMWHSVDEQQAAL-LISIIGFSNIFL
240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KLLLGILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSYVTLALLSGILGF---LTGNWS
. : :..: . . :. .: .. .: . : : .:.. :.. ..: .
CCDS11 RPLAGLMAGRPAFASHRKYLFSLALLLNGLTNLVCAASGDFWVLVGYCLAYSVSMSGIGA
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 IFPYVTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYDWTQTYDIAFYFSGFCVLL
.. : : .... .: :.. . ::. ..::..: . : :.... .::.:.: ..
CCDS11 LIFQVLMDIVPMDQFPRALGLFTVLDGLAFLISPPLAGLLLDATNNFSYVFYMSSFFLIS
350 360 370 380 390 400
480 490 500
pF1KE2 GGFILLLAALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
.....
CCDS11 AALFMGGSFYALQKKEQGKQAVAADALERDLFLEAKDGPGKQRSPEIMCQSSRQPRPAGV
410 420 430 440 450 460
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10 20 30
pF1KE2 MELKKSPDGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVL
::::::::.. ..: . : :: ..:.
CCDS11 APQRKHRRGGFSHRCFPTPQTAMTPQPAGPPDGGWGWVVAAAAFAINGLSYGLLRSLGLA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 YIEWLDAFGEGKGKTAWVGSLASGVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLS
. . . : .. :::...:: .: :::: : . .:::::.. .: ... :...:
CCDS11 FPDLAEHFDRSAQDTAWISALALAVQQAASPVGSALSTRWGARPVVMVGGVLASLGFVFS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SFAPNIYFLFFSYGIVVGLGCGLLYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAA
.:: .. :... :...:.: .:... .. .::. :: ::.:: ::.... .. :
CCDS11 AFASDLLHLYLGLGLLAGFGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGASSLLLAP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LQRMLVEFYGLDGCLLIVGALALNILACGSLMRPL-QSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYN
..:.. .: : ::..::..:.. ::.:. :: .: : : . :
CCDS11 ALQLLLDTFGWRGALLLLGAITLHLTPCGALLLPLVLPGDPPAPPR----------SPLA
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EKGKNLEENINILDKSYSSEEKCRITLANGDWKQDSLLHKNPTVTHTKEPETYKKKVAEQ
: .: . ...: ...: . .: : :. .
CCDS11 ALGLSL-----FTRRAFSIFALGTALVGGGYFV--PYVHLAP---HALD-----------
240 250 260 270
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pF1KE2 TYFCKQLAKRKWQLYKNYCGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSN
. :. : .::. .: .. : : : :
CCDS11 ----RGLGGYGAAL-------VVAVAAMGDAGARLVCGWLADQGWVP-------------
280 290 300
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pF1KE2 VKEEEFIMP-LISIIGIMTAVGKLLLGIL----ADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIP
.: :....: .:..: ..:.. .. .: . : .:. . .::.
CCDS11 -------LPRLLAVFGALTGLGLWVVGLVPVVGGEESWGGPL---LAAAVAYGLS-----
310 320 330 340 350
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pF1KE2 FAKSYVTLALLSGILGFLTGNWSIFPYVTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIV
: ::. : ..: : : ::. ...: :..:.. .::. ::::.
CCDS11 -AGSYAPL-----VFGVLPG-----------LVGVGGVVQATGLVMMLMSLGGLLGPPLS
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:.. : : . .: .:: .: :.:: : :::: :. : .:
CCDS11 GFLRDETGDFTASFLLSGSLILSGSFIYIGLPRALPS---CGPASPPATPPPETGELLPA
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 V
CCDS11 PQAVLLSPGGPGSTLDTTC
460 470
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CCDS89 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
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CCDS89 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
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::: .. ..:: .:: .: .: :: .:: : : : ....: . .: : .::
CCDS89 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
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CCDS89 LGSLLLNACVAGSLMRPLG---------------PNQTT---SKSKN---------KTGK
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.:. :: :. : : : :. ..:
CCDS89 TED-------------DS------------SPKKIKTK------------KSTWEKVNKY
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pF1KE2 CGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFPPSLLMEDVARSSNVKEEEFIMPLISIIGIMT
.:::.. : . . ... .: : : ... :..... : . :.:.....
CCDS89 LD--FSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAF-LLSVMAFVD
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CCDS89 MFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGS
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CCDS89 VVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSE
420 430 440 450 460 470
509 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]