Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2705
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2705, 400 aa
1>>>pF1KE2705 400 - 400 aa - 400 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
63214209 residues in 88908 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5665+/-0.000506; mu= -3.4571+/- 0.031
mean_var=242.7688+/-49.413, 0's: 0 Z-trim(115.8): 152 B-trim: 321 in 2/53
Lambda= 0.082315
statistics sampled from 26849 (27002) to 26849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 9.960
The best scores are: opt bits E(88908)
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 2520 312.7 1e-84
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1638 208.0 3.8e-53
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1592 202.6 1.8e-51
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1573 200.3 8.5e-51
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1562 199.0 2e-50
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1543 196.7 9.5e-50
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1543 196.7 9.9e-50
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1523 194.3 5.1e-49
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1522 194.2 5.2e-49
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1424 182.7 2.1e-45
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1420 182.1 2.6e-45
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1422 182.4 2.7e-45
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1322 170.5 8.3e-42
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1322 170.5 8.7e-42
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1309 168.9 2.3e-41
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1242 161.0 5.6e-39
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1242 161.0 5.6e-39
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1229 159.5 2.1e-38
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1219 158.2 3.7e-38
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1217 158.0 4.4e-38
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1216 157.9 4.7e-38
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1208 156.9 9.4e-38
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1207 156.8 9.9e-38
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1174 152.9 1.4e-36
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1174 152.9 1.4e-36
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1173 152.7 1.5e-36
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1168 152.2 2.4e-36
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1157 150.9 5.7e-36
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1157 150.9 5.9e-36
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1156 150.8 6.8e-36
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1135 148.3 3.6e-35
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1122 146.7 1e-34
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1113 145.6 2.2e-34
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1113 145.6 2.2e-34
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 1060 139.3 1.7e-32
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1052 138.4 3.3e-32
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1052 138.4 3.7e-32
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1027 135.5 2.9e-31
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1024 135.1 3.5e-31
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1000 132.2 2.5e-30
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 700 96.5 9.2e-20
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 700 96.5 9.2e-20
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 700 96.5 9.2e-20
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 644 90.0 1.4e-17
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 648 90.7 1.7e-17
XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 631 88.2 2.4e-17
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 634 88.8 3.1e-17
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 634 88.8 3.1e-17
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 628 88.0 4.8e-17
NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432) 628 88.0 4.8e-17
>>NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskeletal (400 aa)
initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520 Z-score: 1642.1 bits: 312.7 E(88908): 1e-84
Smith-Waterman score: 2520; 99.8% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_002 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE2 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
370 380 390 400
>>NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, type I (432 aa)
initn: 1691 init1: 1588 opt: 1638 Z-score: 1075.5 bits: 208.0 E(88908): 3.8e-53
Smith-Waterman score: 1638; 66.7% identity (87.6% similar) in 396 aa overlap (1-390:1-394)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGSVRFGPGVA--FRAPSIHGGS-GGRGVSVSSARFVS
::. : :: ...::. .:::::: : . .. . : : . :: :: : ..... . :
NP_000 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSY-S
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
: : : :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: ::::::::
NP_000 SCYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
:::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.::::::::::::::::::::::
NP_000 WYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVS
::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::...
NP_000 LRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRS
::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..:
NP_000 VEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRA
:...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
NP_000 EISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE2 DSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
. :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :
NP_000 EMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDG
360 370 380 390 400 410
NP_000 KVISSREQVHQTTR
420 430
>>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16 (472 aa)
initn: 1771 init1: 1522 opt: 1592 Z-score: 1045.5 bits: 202.6 E(88908): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1592; 64.4% identity (86.1% similar) in 396 aa overlap (11-398:42-430)
10 20 30
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGG-LGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGG
: :..:: :. .: ::. : :. .. ::
NP_000 SSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSGGAY---GLGGG
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SGGRGVSVSSARFVSSSSSG-------GYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLA
:: : : ::. : :. ..: : :::.:: ....::::.:.::.::::::::::
NP_000 YGG-GFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIV
:::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.::: ::..:. ..
NP_000 SYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA
::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::
NP_000 LQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT
:::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: ::
NP_000 YLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG
..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.::..: ::..:.
NP_000 TKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYC
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN
:::.:: .:...: ::...: . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :
NP_000 MQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAH--
370 380 390 400 410 420
400
pF1KE2 NLSASKVL
::.:.
NP_000 -LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
430 440 450 460 470
>>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I (473 aa)
initn: 1544 init1: 1544 opt: 1573 Z-score: 1033.3 bits: 200.3 E(88908): 8.5e-51
Smith-Waterman score: 1595; 60.8% identity (82.1% similar) in 429 aa overlap (7-397:6-434)
10 20 30 40
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGS----------
:: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .::.
NP_005 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KE2 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGGYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL
:: : . ::. .:. .:::::: .:: ....::::.:.::.
NP_005 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL
:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.::.
NP_005 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM
.:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.:::::::::::::::::::
NP_005 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ
::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.
NP_005 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED
::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::.
NP_005 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS
.: ::..:. ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.::::::::::
NP_005 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE2 LLEGQEDHYNNLSASKVL
::::.. : .. .::
NP_005 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
>>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal (456 aa)
initn: 1500 init1: 1227 opt: 1562 Z-score: 1026.4 bits: 199.0 E(88908): 2e-50
Smith-Waterman score: 1622; 63.5% identity (85.4% similar) in 417 aa overlap (1-388:1-414)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
::. .. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
NP_002 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE2 GGYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
:::::: .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
NP_002 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
:::::::::: ::..:::::.:::::: : .: :::.:. ::..:::::...::.:::.
NP_002 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
.:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_002 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
::::::::::.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::.:.::::
NP_002 AYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
:.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..::::: :.
NP_002 FSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::.
NP_002 ATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
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400
pF1KE2 NNLSASKVL
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.. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
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10 20 30 40 50
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:::::: .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
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pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
:::::::::: ::..:::::.:::::: : .: :::.:. ::..:::::...::.:::.
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160 170 180 190 200 210
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.:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
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::::::::: :.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::
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.:.:::: :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..:
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:::: :...:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.:::::::::::::
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390 400
pF1KE2 EGQEDHYNNLSASKVL
:::.
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
.. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
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:::::: .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
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:::::::::: ::..:::::.:::::: : .: :::.:. ::..:::::...::.:::.
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160 170 180 190 200 210
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.:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
XP_011 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL
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220 230 240 250 260
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::::::::: :.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::
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.:.:::: :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..:
XP_011 RDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSL
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330 340 350 360 370 380
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:::: :...:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.:::::::::::::
XP_011 AETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLL
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390 400
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:::.
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.:: : :::::: : : :: ::.::::.:::::::::::
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::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:..
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:.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.::::
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:.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: ::
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... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :..
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:: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. ..
NP_705 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMI
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400
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.. .:
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pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS
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NP_002 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA
10 20 30 40 50
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pF1KE2 SSG-------GYGGGYGGVLT---------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLAS
.:: : :::::: : : :: ::.::::.:::::::::::
NP_002 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS
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pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIV
::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:..
NP_002 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI
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160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA
:.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.::::
NP_002 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA
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220 230 240 250 260 270
pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT
:.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: ::
NP_002 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG
... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :..
NP_002 AKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN
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NP_002 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKR
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pF1KE2 NLSASKVL
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10 20 30
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAP
:.: : ..::::: ::: :: : .: .
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:. ::: :: : . .::.:::.:: . .. :::.::::.:::::::::::
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::::::::: .: ::: ::..::.:.: : ::::.:: ::.::...::. : .:.
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:.:::::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::...:::::::.: ::
NP_000 ILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEE
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pF1KE2 FTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEAR
:. ...::. :. .. ::.. .::.:.:::..:.:::::::::..: .:: .:::::.:
NP_000 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR
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NP_000 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSS
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pF1KE2 YNNLSASKVL
NP_000 GGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSS
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400 residues in 1 query sequences
63214209 residues in 88908 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Sep 21 11:31:06 2017 done: Thu Sep 21 11:31:08 2017
Total Scan time: 9.960 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]