Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2705
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2705, 400 aa
1>>>pF1KE2705 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7305+/-0.00121; mu= 1.3797+/- 0.072
mean_var=200.0291+/-39.774, 0's: 0 Z-trim(108.4): 90 B-trim: 67 in 1/50
Lambda= 0.090683
statistics sampled from 10077 (10167) to 10077 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 2520 342.5 4.2e-94
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1638 227.1 2.4e-59
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1586 220.3 2.9e-57
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1573 218.6 9.5e-57
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1562 217.2 2.5e-56
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1524 212.2 7.9e-55
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1523 212.0 8.1e-55
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1422 198.9 1e-50
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1420 198.6 1e-50
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1322 185.8 7.9e-47
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1309 184.1 2.4e-46
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1242 175.3 1e-43
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1229 173.7 4.2e-43
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1219 172.3 8e-43
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1217 172.0 9.7e-43
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1208 170.9 2.2e-42
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1207 170.7 2.4e-42
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1174 166.4 4.3e-41
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1174 166.4 4.5e-41
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1173 166.2 4.8e-41
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1168 165.6 7.8e-41
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1157 164.2 2.2e-40
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1156 164.1 2.5e-40
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1113 158.4 1.2e-38
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1060 151.5 1.4e-36
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1052 150.4 2.9e-36
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1027 147.2 3.1e-35
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1024 146.8 3.9e-35
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 1000 143.6 3.4e-34
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 700 104.3 1.5e-22
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 644 97.1 3.7e-20
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 648 97.8 4.3e-20
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 634 95.8 9e-20
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 628 95.0 1.5e-19
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 628 95.0 1.5e-19
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 628 95.0 1.5e-19
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 624 94.5 2.4e-19
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 624 94.5 2.5e-19
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 586 89.5 7e-18
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3 ( 415) 575 88.0 1.7e-17
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 571 87.5 2.8e-17
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 571 87.6 2.9e-17
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 570 87.5 3.8e-17
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 565 86.8 5.7e-17
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 563 86.5 6.4e-17
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 558 86.1 1.6e-16
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 549 84.7 2.3e-16
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 545 84.1 2.9e-16
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 545 84.1 3e-16
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 546 84.3 3.1e-16
>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 (400 aa)
initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520 Z-score: 1802.9 bits: 342.5 E(32554): 4.2e-94
Smith-Waterman score: 2520; 99.8% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE2 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
370 380 390 400
>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 1691 init1: 1588 opt: 1638 Z-score: 1178.8 bits: 227.1 E(32554): 2.4e-59
Smith-Waterman score: 1638; 66.7% identity (87.6% similar) in 396 aa overlap (1-390:1-394)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGSVRFGPGVA--FRAPSIHGGS-GGRGVSVSSARFVS
::. : :: ...::. .:::::: : . .. . : : . :: :: : ..... . :
CCDS11 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSY-S
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
: : : :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: ::::::::
CCDS11 SCYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
:::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.::::::::::::::::::::::
CCDS11 WYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVS
::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::...
CCDS11 LRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRS
::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..:
CCDS11 VEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRA
:...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
CCDS11 EISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE2 DSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
. :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :
CCDS11 EMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDG
360 370 380 390 400 410
CCDS11 KVISSREQVHQTTR
420 430
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 1773 init1: 1522 opt: 1586 Z-score: 1141.5 bits: 220.3 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 1592; 61.6% identity (81.2% similar) in 432 aa overlap (7-398:6-430)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSA
:: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .:: :.::::.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGG----GLSVSSS
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KE2 RF---------------VSSSSS-------GGYGGG--------YGGVLTASDGLLAGNE
:: ::::: :::::: .:: ....::::.:.:
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSE
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 KLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDK
:.:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.:
CCDS11 KVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNK
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 ILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDL
:: ::..:. ..::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 ILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 EMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMA
:::::.:::::::::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: ::
CCDS11 EMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 EQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAAL
:.:::::: :: ..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.:
CCDS11 EKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASL
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 EDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATY
:..: ::..:. :::.:: .:...: ::...: . :.:::::. :.:.:.:::::::::
CCDS11 ENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATY
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE2 RSLLEGQEDHYNNLSASKVL
: ::::.. : ::.:.
CCDS11 RRLLEGEDAH---LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 1544 init1: 1544 opt: 1573 Z-score: 1132.3 bits: 218.6 E(32554): 9.5e-57
Smith-Waterman score: 1595; 60.8% identity (82.1% similar) in 429 aa overlap (7-397:6-434)
10 20 30 40
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGS----------
:: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .::.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KE2 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGGYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL
:: : . ::. .:. .:::::: .:: ....::::.:.::.
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL
:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM
.:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ
::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.
CCDS11 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED
::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::.
CCDS11 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS
.: ::..:. ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.::::::::::
CCDS11 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE2 LLEGQEDHYNNLSASKVL
::::.. : .. .::
CCDS11 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1500 init1: 1227 opt: 1562 Z-score: 1124.7 bits: 217.2 E(32554): 2.5e-56
Smith-Waterman score: 1622; 63.5% identity (85.4% similar) in 417 aa overlap (1-388:1-414)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
::. .. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
CCDS11 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE2 GGYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
:::::: .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
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CCDS11 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
.:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
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CCDS11 AYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
:.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..::::: :.
CCDS11 FSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::.
CCDS11 ATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
360 370 380 390 400 410
400
pF1KE2 NNLSASKVL
CCDS11 AGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
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:::..: ::.:::: ..: : . . : . ::: :: : .:: . : ...
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10 20 30 40 50
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.:: : :::::: : : :: ::.::::.:::::::::::
CCDS11 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS
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100 110 120 130 140 150
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CCDS11 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI
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160 170 180 190 200 210
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:.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.::::
CCDS11 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA
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220 230 240 250 260 270
pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT
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CCDS11 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH
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280 290 300 310 320 330
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... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :..
CCDS11 TKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA
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340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN
:: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. ..
CCDS11 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMI
360 370 380 390 400 410
400
pF1KE2 NLSASKVL
.. .:
CCDS11 GFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
420 430 440 450
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10 20 30 40 50
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:::..: ::.:::: ..: : . . : . ::: :: : .:: . : ...
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE2 SSG-------GYGGGYGGVLT---------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLAS
.:: : :::::: : : :: ::.::::.:::::::::::
CCDS11 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS
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CCDS11 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI
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160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA
:.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.::::
CCDS11 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA
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pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT
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CCDS11 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH
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... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :..
CCDS11 TKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA
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:: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::.
CCDS11 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKR
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CCDS11 QPP
420
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10 20 30
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CCDS11 GGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGI--FGGG-SFGGG
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:. ::: :: : . .::.:::.:: . .. :::.::::.:::::::::::
CCDS11 SFGGGSFGGGGFG-----------GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLAS
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100 110 120 130 140 150
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::::::::: .: ::: ::..::.:.: : ::::.:: ::.::...::. : .:.
CCDS11 YLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNAN
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160 170 180 190 200 210
pF1KE2 IVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEE
:.:::::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::...:::::::.: ::
CCDS11 ILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
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:::::::::::.. ::. :.:.::...:::.::...:..:::::: .:::::::::::
CCDS11 LAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW
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280 290 300 310 320 330
pF1KE2 FTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEAR
:. ...::. :. .. ::.. .::.:.:::..:.:::::::::..: .:: .:::::.:
CCDS11 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 FGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDH
. .::..::: ::..: :: ..::..: :: :::.:.::: :::.:: ::::::::.
CCDS11 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSS
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400
pF1KE2 YNNLSASKVL
CCDS11 GGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSS
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: ::.: .: ::.. :: : .: :
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAA
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40 50 60 70
pF1KE2 SIHGGS----GGRGVSVSSA------RFVSSSSSGGYGGGYGG--------VLTASDG-L
:. :.: :: : :.... : ....: :: : :.:: .:...:: :
CCDS11 SMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGNDGGL
70 80 90 100 110 120
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:.:.:: :::::::::::::::::::: :: ::: :::.::. .: : . :::.::
CCDS11 LSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYY
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 TTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLD
:.:::.::..:.: :....::::::::::.::: :.:.: :::..:::::::::::::
CCDS11 PLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLD
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 ELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSD
::::.:::::::::.:.:::::.:::::.:....: :.::::.:.:::.::...:.:
CCDS11 ELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLND
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pF1KE2 MRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQ
::.:::..:::::::::::: .. :: .:.. .::::: :.::::::::..:.::::::
CCDS11 MRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQ
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320 330 340 350 360 370
pF1KE2 SQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKS
:::.:: .:::.:::.:. . :::...: :::..:::: .::::.:::: ..:::...:.
CCDS11 SQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKA
370 380 390 400 410 420
380 390 400
pF1KE2 RLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
::: :: ::: ::.:.
CCDS11 RLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVNG
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10 20 30 40
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGG-SG-GR
::.::.: : :..: . : :: :: ::
CCDS11 GGASSCSLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGAS---GSGTGFGGGSSFGGVSGFGR
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90
pF1KE2 GVSV-SSARFVSSSSSGG---YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVR
: . .:.:: ::...:: ::::.:: . .. ::..:.:: ::::::::::.::::::
CCDS11 GSGFCGSSRF-SSGATGGFYSYGGGMGGGV-GDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVR
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::: :: .:: ::..::.: ::: . ::::.::. :.:::..:..::.::. :.:.
CCDS11 ALEEANTDLENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILH
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CCDS11 IDNARLAADDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYL
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pF1KE2 KKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSR
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CCDS11 RKNHEEEMKNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQ
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CCDS11 SASLQAQISTDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQ
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CCDS11 LSEIQTQISALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFA
400 410 420 430 440 450
400
pF1KE2 SASKVL
CCDS11 EFGGRNSGSVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSI
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]