Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2693
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2693, 3674 aa
1>>>pF1KE2693 3674 - 3674 aa - 3674 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8119+/-0.00146; mu= 6.3662+/- 0.086
mean_var=271.1967+/-55.990, 0's: 0 Z-trim(106.9): 152 B-trim: 4 in 1/49
Lambda= 0.077881
statistics sampled from 9142 (9283) to 9142 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 13.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS61599.1 SPTBN5 gene_id:51332|Hs108|chr15 (3674) 24036 2717.2 0
CCDS12559.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 (2564) 2505 297.9 6.5e-79
CCDS75914.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2452) 1976 238.4 4.9e-61
CCDS6905.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2472) 1789 217.4 1e-54
CCDS48036.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2477) 1789 217.4 1e-54
CCDS33199.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2155) 1716 209.2 2.7e-52
CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2364) 1702 207.6 8.8e-52
CCDS32100.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2137) 1684 205.6 3.3e-51
CCDS32099.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2328) 1684 205.6 3.5e-51
CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11 (2390) 1670 204.1 1.1e-50
CCDS41423.1 SPTA1 gene_id:6708|Hs108|chr1 (2419) 1525 187.8 8.7e-46
CCDS60455.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 1149 145.2 2.1e-33
CCDS1613.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 1145 144.7 2.9e-33
CCDS76439.1 ACTN3 gene_id:89|Hs108|chr11 ( 944) 1129 143.0 1e-32
CCDS45129.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 887) 1125 142.5 1.4e-32
CCDS9792.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 892) 1125 142.5 1.4e-32
CCDS45130.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 914) 1125 142.5 1.4e-32
CCDS12518.1 ACTN4 gene_id:81|Hs108|chr19 ( 911) 1110 140.8 4.5e-32
CCDS43771.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4525) 1023 131.6 1.3e-28
CCDS43772.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4684) 1020 131.3 1.7e-28
CCDS43770.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4533) 1017 130.9 2.1e-28
CCDS43773.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 1017 130.9 2.1e-28
CCDS43769.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4574) 1017 130.9 2.1e-28
CCDS47936.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4515) 1016 130.8 2.3e-28
CCDS43775.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 1016 130.8 2.3e-28
CCDS43774.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4551) 1016 130.8 2.3e-28
CCDS42569.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 ( 678) 842 110.6 4.1e-23
CCDS55395.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3681) 721 97.6 1.9e-18
CCDS14233.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3685) 721 97.6 1.9e-18
CCDS435.1 MACF1 gene_id:23499|Hs108|chr1 (5430) 597 83.8 3.9e-14
CCDS75474.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5537) 594 83.4 5e-14
CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6 (3433) 569 80.5 2.4e-13
CCDS73053.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 686) 487 70.7 4.2e-11
>>CCDS61599.1 SPTBN5 gene_id:51332|Hs108|chr15 (3674 aa)
initn: 24036 init1: 24036 opt: 24036 Z-score: 14602.5 bits: 2717.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 24036; 99.9% identity (100.0% similar) in 3674 aa overlap (1-3674:1-3674)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGQPHSPRELLGAAGHRSRRPSTELRVPPSPSLTMDSQYETGHIRKLQARHMQMQEKTF
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CCDS61 MAGQPHSPRELLGAAGHRSRRPSTELRVPPSPSLTMDSQYETGHIRKLQARHMQMQEKTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TKWINNVFQCGQAGIKIRNLYTELADGIHLLRLLELISGEALPPPSRGRLRVHFLENSSR
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CCDS61 TKWINNVFQCGQAGIKIRNLYTELADGIHLLRLLELISGEALPPPSRGRLRVHFLENSSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ALAFLRAKVPVPLIGPENIVDGDQTLILGLIWVIILRFQISHISLDKEEFGASAALLSTK
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CCDS61 ALAFLRAKVPVPLIGPENIVDGDQTLILGLIWVIILRFQISHISLDKEEFGASAALLSTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EALLVWCQRKTASYTNVNITDFSRSWSDGLGFNALIHAHRPDLLDYGSLRPDRPLHNLAF
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CCDS61 EALLVWCQRKTASYTNVNITDFSRSWSDGLGFNALIHAHRPDLLDYGSLRPDRPLHNLAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AFLVAEQELGIAQLLDPEDVAAAQPDERSIMTYVSLYYHYCSRLHQGQTVQRRLTKILLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AFLVAEQELGIAQLLDPEDVAAAQPDERSIMTYVSLYYHYCSRLHQGQTVQRRLTKILLQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LQETELLQTQYEQLVADLLRWIAEKQMQLEARDFPDSLPAMRQLLAAFTIFRTQEKPPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LQETELLQTQYEQLVADLLRWIAEKQMQLEARDFPDSLPAMRQLLAAFTIFRTQEKPPRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QQRGAAEALLFRLQTALQAQNRRPFLPHEGLGLAELSQCWAGLEWAEAARSQALQQRLLQ
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CCDS61 QQRGAAEALLFRLQTALQAQNRRPFLPHEGLGLAELSQCWAGLEWAEAARSQALQQRLLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LQRLETLARRFQRKAALRESFLKDAEQVLDQARAPPASLATVEAAVQRLGMLEAGILPQE
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LQRLETLARRFQHKAALRESFLKDAEQVLDQARAPPASLATVEAAVQRLGMLEAGILPQE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GRFQALAEIADILRQEQYHSWADVARRQEEVTVRWQRLLQHLQGQRKQVADMQAVLSLLQ
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CCDS61 GRFQALAEIADILRQEQYHSWADVARRQEEVTVRWQRLLQHLQGQRKQVADMQAVLSLLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EVEAASHQLEELQEPARSTACGQQLAEVVELLQRHDLLEAQVSAHGAHVSHLAQQTAELD
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CCDS61 EVEAASHQLEELQEPARSTACGQQLAEVVELLQRHDLLEAQVSAHGAHVSHLAQQTAELD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SSLGTSVEVLQAKARTLAQLQQSLVALVRARRALLEQTLQRAEFLRNCEEEEAWLKECGQ
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CCDS61 SSLGTSVEVLQAKARTLAQLQQSLVALVRARRALLEQTLQRAEFLRNCEEEEAWLKECGQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RVGNAALGRDLSQIAGALQKHKALEAEVHRHQAVCVDLVRRGRDLSARRPPTQPDPGERA
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CCDS61 RVGNAALGRDLSQIAGALQKHKALEAEVHRHQAVCVDLVRRGRDLSARRPPTQPDPGERA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 EAVQGGWQLLQTRVVGRGARLQTALLVLQYFADAAEAASWLRERRSSLERASCGQDQAAA
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CCDS61 EAVQGGWQLLQTRVVGRGARLQTALLVLQYFADAAEAASWLRERRSSLERASCGQDQAAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 ETLLRRHVRLERVLRAFAAELRRLEEQGRAASARASLFTVNSALSPPGESLRNPGPWSEA
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CCDS61 ETLLRRHVRLERVLRAFAAELRRLEEQGRAASARASLFTVNSALSPPGESLRNPGPWSEA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 SCHPGPGDAWKMALPAEPDPDFDPNTILQTQDHLSQDYESLRALAQLRRARLEEAMALFG
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CCDS61 SCHPGPGDAWKMALPAEPDPDFDPNTILQTQDHLSQDYESLRALAQLRRARLEEAMALFG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 FCSSCGELQLWLEKQTVLLQRVQPQADTLEVMQLKYENFLTALAVGKGLWAEVSSSAEQL
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CCDS61 FCSSCGELQLWLEKQTVLLQRVQPQADTLEVMQLKYENFLTALAVGKGLWAEVSSSAEQL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 RQRYPGNSTQIQRQQEELSQRWGQLEALKREKAVQLAHSVEVCSFLQECGPTQVQLRDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RQRYPGNSTQIQRQQEELSQRWGQLEALKREKAVQLAHSVEVCSFLQECGPTQVQLRDVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 LQLEALQPGSSEDTCHALQLAQKKTLVLERRVHFLQSVVVKVEEPGYAESQPLQGQVETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LQLEALQPGSSEDTCHALQLAQKKTLVLERRVHFLQSVVVKVEEPGYAESQPLQGQVETL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 QGLLKQVQEQVAQRARRQAETQARQSFLQESQQLLLWAESVQAQLRSKEVSVDVASAQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QGLLKQVQEQVAQRARRQAETQARQSFLQESQQLLLWAESVQAQLRSKEVSVDVASAQRL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 LREHQDLLEEIHLWQERLQQLDAQSQPMAALDCPDSQEVPNTLRVLGQQGQELKVLWEQR
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CCDS61 LREHQDLLEEIHLWQERLQQLDAQSQPMAALDCPDSQEVPNTLRVLGQQGQELKVLWEQR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 QQWLQEGLELQKFGREVDGFTATCANHQAWLHLDNLGEDVREALSLLQQHREFGRLLSTL
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CCDS61 QQWLQEGLELQKFGREVDGFTATCANHQAWLHLDNLGEDVREALSLLQQHREFGRLLSTL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 GPRAEALRAHGEKLVQSQHPAAHTVREQLQSIQAQWTRLQGRSEQRRRQLLASLQLQEWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GPRAEALRAHGEKLVQSQHPAAHTVREQLQSIQAQWTRLQGRSEQRRRQLLASLQLQEWK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 QDVAELMQWMEEKGLMAAHEPSGARRNILQTLKRHEAAESELLATRRHVEALQQVGRELL
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CCDS61 QDVAELMQWMEEKGLMAAHEPSGARRNILQTLKRHEAAESELLATRRHVEALQQVGRELL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 SRRPCGQEDIQTRLQGLRSKWEALNRKMTERGDELQQAGQQEQLLRQLQDAKEQLEQLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SRRPCGQEDIQTRLQGLRSKWEALNRKMTERGDELQQAGQQEQLLRQLQDAKEQLEQLEG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 ALQSSETGQDLRSSQRLQKRHQQLESESRTLAAKMAALASMAHGMAASPAILEETQKHLR
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CCDS61 ALQSSETGQDLRSSQRLQKRHQQLESESRTLAAKMAALASMAHGMAASPAILEETQKHLR
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 RLELLQGHLAIRGLQLQASVELHQFCHLSNMELSWVAEHMPHGSPTSYTECLNGAQSLHR
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CCDS61 RLELLQGHLAIRGLQLQASVELHQFCHLSNMELSWVAEHMPHGSPTSYTECLNGAQSLHR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 KHKELQVEVKAHQGQVQRVLSSGRSLAASGHPQAQHIVEQCQELEGHWAELERACEARAQ
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CCDS61 KHKELQVEVKAHQGQVQRVLSSGRSLAASGHPQAQHIVEQCQELEGHWAELERACEARAQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 CLQQAVTFQQYFLDVSELEGWVEEKRPLVSSRDYGRDEAATLRLINKHQALQEELAIYWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CLQQAVTFQQYFLDVSELEGWVEEKRPLVSSRDYGRDEAATLRLINKHQALQEELAIYWS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 SMEELDQTAQTLTGPEVPEQQRVVQERLREQLRALQELAATRDRELEGTLRLHEFLREAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SMEELDQTAQTLTGPEVPEQQRVVQERLREQLRALQELAATRDRELEGTLRLHEFLREAE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 DLQGWLASQKQAAKGGESLGEDPEHALHLCTKFAKFQHQVEMGSQRVAACRLLAESLLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DLQGWLASQKQAAKGGESLGEDPEHALHLCTKFAKFQHQVEMGSQRVAACRLLAESLLER
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 GHSAGPMVRQRQQDLQTAWSELWELTQARGHALRDTETTLRVHRDLLEVLTQVQEKATSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GHSAGPMVRQRQQDLQTAWSELWELTQARGHALRDTETTLRVHRDLLEVLTQVQEKATSL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 PNNVARDLCGLEAQLRSHQGLERELVGTERQLQELLETAGRVQKLCPGPQAHAVQQRQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PNNVARDLCGLEAQLRSHQGLERELVGTERQLQELLETAGRVQKLCPGPQAHAVQQRQQA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 VTQAWAVLQRRMEQRRAQLERARLLARFRTAVRDYASWAARVRQDLQVEESSQEPSSGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VTQAWAVLQRRMEQRRAQLERARLLARFRTAVRDYASWAARVRQDLQVEESSQEPSSGPL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 KLSAHQWLRAELEAREKLWQQATQLGQQALLAAGTPTKEVQEELRALQDQRDQVYQTWAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KLSAHQWLRAELEAREKLWQQATQLGQQALLAAGTPTKEVQEELRALQDQRDQVYQTWAR
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 KQERLQAEQQEQLFLRECGRLEEILAAQEVSLKTSALGSSVEEVEQLIRKHEVFLKVLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KQERLQAEQQEQLFLRECGRLEEILAAQEVSLKTSALGSSVEEVEQLIRKHEVFLKVLTA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE2 QDKKEAALRERLKTLRRPRVRDRLPILLQRRMRVKELAESRGHALHASLLMASFTQAATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QDKKEAALRERLKTLRRPRVRDRLPILLQRRMRVKELAESRGHALHASLLMASFTQAATQ
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE2 AEDWIQAWAQQLKEPVPPGDLRDKLKPLLKHQAFEAEVQAHEEVMTSVAKKGEALLAQSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AEDWIQAWAQQLKEPVPPGDLRDKLKPLLKHQAFEAEVQAHEEVMTSVAKKGEALLAQSH
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE2 PRAGEVSQRLQGLRKHWEDLRQAMALRGQELEDRRNFLEFLQRVDLAEAWIQEKEVKMNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PRAGEVSQRLQGLRKHWEDLRQAMALRGQELEDRRNFLEFLQRVDLAEAWIQEKEVKMNV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE2 GDLGQDLEHCLQLRRRLREFRGNSAGDTVGDACIRSISDLSLQLKNRDPEEVKIICQRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GDLGQDLEHCLQLRRRLREFRGNSAGDTVGDACIRSISDLSLQLKNRDPEEVKIICQRRS
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE2 QLNNRWASFHGNLLRYQQQLEGALEIHVLSRELDNVTKRIQEKEALIQALDCGKDLESVQ
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CCDS61 QLNNRWASFHGNLLRYQQQLEGALEIHVLSRELDNVTKRIQEKEALIQALDCGKDLESVQ
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE2 RLLRKHEELEREVHPIQAQVESLEREVGRLCQRSPEAAHGLRHRQQEVAESWWQLRSRAQ
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CCDS61 RLLRKHEELEREVHPIQAQVESLEREVGRLCQRSPEAAHGLRHRQQEVAESWWQLRSRAQ
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE2 KRREALDALHQAQKLQAMLQELLVSAQRLRAQMDTSPAPRSPVEARRMLEEHQECKAELD
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