Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2669, 354 aa
1>>>pF1KE2669 354 - 354 aa - 354 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61127809 residues in 85815 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9850+/-0.000478; mu= 18.2381+/- 0.030
mean_var=105.9812+/-28.431, 0's: 0 Z-trim(108.5): 483 B-trim: 1807 in 2/47
Lambda= 0.124583
statistics sampled from 16030 (16642) to 16030 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 6.650
The best scores are: opt bits E(85815)
NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo ( 354) 2316 427.9 1.7e-119
XP_006713727 (OMIM: 606380) PREDICTED: P2Y purinoc ( 224) 1347 253.5 3.4e-67
NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 1083 206.2 8.6e-53
NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 1083 206.2 8.6e-53
XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y ( 342) 1083 206.2 8.6e-53
XP_011511642 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50
XP_005247979 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50
XP_005247980 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50
NP_001074924 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [H ( 338) 1031 196.9 5.6e-50
XP_016863072 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50
NP_055694 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [Homo ( 338) 1031 196.9 5.6e-50
NP_076404 (OMIM: 606379) G-protein coupled recepto ( 358) 915 176.1 1.1e-43
NP_005291 (OMIM: 300241) probable G-protein couple ( 381) 537 108.2 3.2e-23
XP_005272654 (OMIM: 300241) PREDICTED: probable G- ( 381) 537 108.2 3.2e-23
NP_001091048 (OMIM: 300241) probable G-protein cou ( 381) 537 108.2 3.2e-23
XP_016875894 (OMIM: 605741) PREDICTED: G-protein c ( 361) 500 101.5 3.1e-21
NP_004942 (OMIM: 605741) G-protein coupled recepto ( 361) 500 101.5 3.1e-21
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 480 97.8 3.6e-20
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 480 97.8 3.6e-20
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 480 97.9 3.8e-20
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 480 97.9 3.8e-20
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 480 97.9 3.8e-20
NP_001269117 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 95.0 2.6e-19
NP_006630 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene rec ( 337) 464 95.0 2.6e-19
NP_001269115 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 95.0 2.6e-19
NP_001269116 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 95.0 2.6e-19
NP_000943 (OMIM: 173393) platelet-activating facto ( 342) 447 91.9 2.2e-18
NP_001158194 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 91.9 2.2e-18
NP_001158195 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 91.9 2.2e-18
NP_001158193 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 91.9 2.2e-18
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 432 89.3 1.5e-17
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 432 89.3 1.5e-17
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 432 89.3 1.6e-17
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 432 89.3 1.6e-17
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 432 89.3 1.6e-17
NP_002556 (OMIM: 300038) P2Y purinoceptor 4 [Homo ( 365) 415 86.2 1.2e-16
NP_001155970 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 410 85.3 2.2e-16
NP_001155969 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 410 85.3 2.2e-16
NP_005758 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidic a ( 344) 410 85.3 2.2e-16
XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16
XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16
XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16
XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16
NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 403 84.1 5.6e-16
NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 403 84.1 5.6e-16
NP_002554 (OMIM: 601167) P2Y purinoceptor 1 [Homo ( 373) 401 83.7 7.2e-16
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 399 83.3 8.8e-16
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 399 83.3 8.8e-16
NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 399 83.3 8.8e-16
NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 399 83.3 8.8e-16
>>NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo sap (354 aa)
initn: 2316 init1: 2316 opt: 2316 Z-score: 2266.4 bits: 427.9 E(85815): 1.7e-119
Smith-Waterman score: 2316; 99.7% identity (99.7% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
NP_795 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE2 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
310 320 330 340 350
>>XP_006713727 (OMIM: 606380) PREDICTED: P2Y purinocepto (224 aa)
initn: 1368 init1: 1347 opt: 1347 Z-score: 1327.3 bits: 253.5 E(85815): 3.4e-67
Smith-Waterman score: 1347; 99.0% identity (99.5% similar) in 209 aa overlap (1-209:1-209)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_006 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
::::::::::::::::::::::::::::.
XP_006 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMICAERKKKRPTLEVHC
190 200 210 220
>>NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 12 [H (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1068.8 bits: 206.2 E(85815): 8.6e-53
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
: :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::
NP_795 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE
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NP_795 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE
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NP_795 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK
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NP_795 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL
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NP_795 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE2 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
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NP_795 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
290 300 310 320 330 340
>>NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 12 [H (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1068.8 bits: 206.2 E(85815): 8.6e-53
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
: :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::
NP_073 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE
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NP_073 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE
:::..: .::::..::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:..
NP_073 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK
..::::. ::. .:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: ....
NP_073 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL
. ::.. :::...::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.:
NP_073 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE2 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
.. : :.::.::.::::.: ..: : ..:.: :.:.... :
NP_073 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
290 300 310 320 330 340
>>XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y puri (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1068.8 bits: 206.2 E(85815): 8.6e-53
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
: :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::
XP_016 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE
. .: .: :.:.:::.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .:::::
XP_016 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE
:::..: .::::..::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:..
XP_016 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK
..::::. ::. .:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: ....
XP_016 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL
. ::.. :::...::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.:
XP_016 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE2 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
.. : :.::.::.::::.: ..: : ..:.: :.:.... :
XP_016 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
290 300 310 320 330 340
>>XP_011511642 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinocepto (338 aa)
initn: 1009 init1: 988 opt: 1031 Z-score: 1018.4 bits: 196.9 E(85815): 5.6e-50
Smith-Waterman score: 1031; 46.6% identity (79.0% similar) in 309 aa overlap (22-330:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
.:.: : ..: : .. :.: ..:.:: .::..:::
XP_011 MINSTSTQPPDES--CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGIL
10 20 30
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NP_001 FTLLLSAANVCLDPIIYFFLCQPFREIL-CKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDT
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XP_016 MINSTSTQPPDES--CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGIL
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XP_016 LNGVSGWIFFYVPSSKSFIIYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
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XP_016 VLFYVNMYVSIVFFGLISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNII
100 110 120 130 140 150
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pF1KE2 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]