Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2668
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2668, 1358 aa
1>>>pF1KE2668 1358 - 1358 aa - 1358 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61127809 residues in 85815 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3005+/-0.000676; mu= 2.0004+/- 0.041
mean_var=285.6675+/-59.760, 0's: 0 Z-trim(110.7): 379 B-trim: 641 in 2/56
Lambda= 0.075883
statistics sampled from 18802 (19216) to 18802 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 14.870
The best scores are: opt bits E(85815)
XP_016857707 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 9150 1017.9 0
NP_003276 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 1 prec (1358) 9150 1017.9 0
XP_016857708 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 9150 1017.9 0
XP_011508251 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1199) 6817 762.5 0
NP_001315564 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 2 [ (1025) 6579 736.4 2.6e-211
XP_005252031 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 3843 437.0 5.3e-121
XP_006717164 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 3793 431.6 2.3e-119
XP_005252032 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1564) 3008 345.6 1.7e-93
XP_011516930 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 2491 289.1 2e-76
XP_011516931 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 2491 289.1 2e-76
XP_005252030 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1837) 2260 263.8 8.4e-69
XP_011516928 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1929) 2211 258.4 3.6e-67
XP_011516927 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 2165 253.4 1.2e-65
XP_006717161 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 2101 246.4 1.6e-63
XP_016870170 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2020) 2098 246.1 2e-63
XP_016870168 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2293) 2077 243.8 1.1e-62
XP_016870167 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2384) 2077 243.9 1.1e-62
XP_005252029 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2110) 2055 241.4 5.3e-62
XP_006717160 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2110) 2049 240.7 8.3e-62
NP_002151 (OMIM: 187380,615629) tenascin precursor (2201) 2044 240.2 1.2e-61
XP_016870169 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2292) 2042 240.0 1.5e-61
XP_006717159 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2293) 2020 237.6 7.9e-61
NP_061978 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X (4242) 1490 179.8 3.6e-43
NP_115859 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X ( 673) 1456 175.3 1.3e-42
XP_006717078 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 264) 726 95.0 7.6e-19
NP_056652 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform b precu ( 275) 726 95.0 7.8e-19
XP_011516694 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 302) 726 95.1 8.4e-19
NP_004099 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform a precu ( 313) 726 95.1 8.6e-19
NP_775628 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 288) 708 93.1 3.2e-18
NP_001994 (OMIM: 601252) ficolin-1 precursor [Homo ( 326) 701 92.4 5.9e-18
NP_003656 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 299) 698 92.0 7e-18
NP_036230 (OMIM: 605001) angiopoietin-related prot ( 493) 660 88.1 1.8e-16
NP_001138578 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-co ( 461) 656 87.6 2.3e-16
NP_116232 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-conta ( 461) 656 87.6 2.3e-16
NP_004664 (OMIM: 603874) angiopoietin-related prot ( 491) 640 85.9 8.1e-16
XP_005245634 (OMIM: 603874) PREDICTED: angiopoieti ( 491) 640 85.9 8.1e-16
XP_011526652 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 636 85.4 1.1e-15
NP_114123 (OMIM: 609336) angiopoietin-related prot ( 470) 636 85.4 1.1e-15
XP_011526649 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 636 85.4 1.1e-15
XP_016882836 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 636 85.4 1.1e-15
NP_001308340 (OMIM: 609336) angiopoietin-related p ( 470) 636 85.4 1.1e-15
XP_011526651 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 636 85.5 1.2e-15
XP_011526650 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 636 85.5 1.2e-15
XP_005260148 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 551) 636 85.5 1.2e-15
NP_002395 (OMIM: 600596) microfibril-associated gl ( 255) 597 80.9 1.3e-14
NP_001185624 (OMIM: 600596) microfibril-associated ( 279) 597 80.9 1.4e-14
XP_016868807 (OMIM: 601922) PREDICTED: angiopoieti ( 443) 579 79.2 7.7e-14
NP_001112360 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 444) 579 79.2 7.7e-14
NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 495) 579 79.2 8.3e-14
NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a ( 496) 579 79.2 8.3e-14
>>XP_016857707 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R isof (1358 aa)
initn: 9150 init1: 9150 opt: 9150 Z-score: 5434.4 bits: 1017.9 E(85815): 0
Smith-Waterman score: 9150; 100.0% identity (100.0% similar) in 1358 aa overlap (1-1358:1-1358)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGADGETVVLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGADGETVVLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
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pF1KE2 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 HFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEY
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850 860 870 880 890 900
pF1KE2 IVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRP
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910 920 930 940 950 960
pF1KE2 TQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 ATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTAT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 MYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KE2 SRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KE2 NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQG
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1330 1340 1350
pF1KE2 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
1330 1340 1350
>>NP_003276 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 1 precurso (1358 aa)
initn: 9150 init1: 9150 opt: 9150 Z-score: 5434.4 bits: 1017.9 E(85815): 0
Smith-Waterman score: 9150; 100.0% identity (100.0% similar) in 1358 aa overlap (1-1358:1-1358)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGADGETVVLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MGADGETVVLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNA
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310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQ
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
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pF1KE2 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
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pF1KE2 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_003 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
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NP_003 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
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NP_003 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
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XP_016 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
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pF1KE2 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAAT--------------
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XP_011 ------------------------------------------------------------
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
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pF1KE2 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
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pF1KE2 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
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pF1KE2 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
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pF1KE2 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
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pF1KE2 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
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pF1KE2 HFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEY
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pF1KE2 IVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRP
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pF1KE2 TQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLI
750 760 770 780 790 800
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 ATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTAT
810 820 830 840 850 860
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pF1KE2 MYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDG
870 880 890 900 910 920
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQ
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KE2 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQG
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KE2 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
1170 1180 1190
>>NP_001315564 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 2 [Homo (1025 aa)
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Smith-Waterman score: 6579; 99.4% identity (99.7% similar) in 1006 aa overlap (353-1358:20-1025)
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 CSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQPTALGGLQLQQRVPGDWSGVTI
:. . . :::::::::::::::::::::::
NP_001 MPAVGEDNVRRGSASVKRATRALTAQQPTALGGLQLQQRVPGDWSGVTI
10 20 30 40
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 TELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQGLQFKTITETTVEVQWEPFSFSF
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NP_001 TELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQGLQFKTITETTVEVQWEPFSFSF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEYIVNVVALKEQARSPPTSASVST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEYIVNLVAVHGTVTSEPIVGSITT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLIATNITPTEALLQWKAPVGEVEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDGSRKELIVDAEDTWIRLEGLLEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQ
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pF1KE2 KLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQG
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NP_001 YNHRLMAGRKRQSLQF
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: . :.. ::: : :.:.:::.: ::: :.::.:: :. .......: ::. : ::::.
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. : :: :::..: ::::: ... : :::::. : : :.:.. : :.:..:.:::.:
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::.:: ... .:...:.: . ..: .:.:.:: :.::.::.:.. :. : :..: :
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:::.::: :.: .:. ::: :..: .. :.. :. ..: .. :: ::.. ::..:::
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: ::::::.:.::: ....: :::.:: ::::.:.::.:. ..:::..:.: . .:
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.::.... .: : .:.. :::.: :::: :: . .:::.::..: . : : :
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.: ...: : .: .. ..:. : ..:. .. : .:..: : .: . :
XP_005 EPEVDNLLVSDATPDGFRLSWTADEGVFDNFVLKIRDTKKQSEPLEITLLAPERTRDITG
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:. :::: ..: .. :. . . ::.. ::.. .:..:..:. ::: :.:. .
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:.: :...::: .::: .:. .. :..::: : : : :.: . :. :.:: :
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pF1KE2 STHYTATMYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVL
.:.:: ..: .:: :.::...:.: :: : .:::.:: ..::..:.:::: . .:.:
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.:.:.::. ::.:: . : : : .: ::. .:: . :.. .: ::: : ..:
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:.::.: ..:::: ::.: :.:::. .. :.:.::::.:::::::: ::.::. .:...
XP_005 FPKDCSQAMLNGDTTSGLYTIYLNGDKAEALEVFCDMTSDGGGWIVFLRRKNGRENFYQN
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: : .:::. ..::::::::...::.::.::::::.:: :.::: ::.::: :... :
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::.. .:.::::::..::.:: ::: :.:.: :.::::.:::::.::.::::.:: :.::
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XP_005 YNIKLPVGSQCSVDLESASGEKDLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVFTHRINIPRRACGC
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pF1KE2 ASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNAN--CCQESAATGQLDYIPHCSGHGNFSFES
:.. .: .:::::.: :: :: ::.::.:. :: . : ::.:: : :::.:::: :.
XP_005 AAAPDV-KELLSRLEELENLVSSLREQCTAGAGCCLQPA-TGRLDTRPFCSGRGNFSTEG
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:::.:. :: : ::::: :: .: :: :.:::::::. ..:.:::.: ::.::...: :
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:.: :.: : :.: :: . :: :: . : :..: :.:..:..:.::.. ::: : .:
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:.: :. :::.::. : ::: . :.:
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: :.::. :..:..: :: .: ..: : .:
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:: :.:.:::.::::.: .: : :
XP_005 NGQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCVEGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCHQHGR
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130 140 150 160 170
pF1KE2 KKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQC-NANCCQESAATG----QLDYIPHCS
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pF1KE2 GHGNFSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]