Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2634
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2634, 1478 aa
1>>>pF1KE2634 1478 - 1478 aa - 1478 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9669+/-0.000608; mu= -15.8806+/- 0.037
mean_var=674.2938+/-139.647, 0's: 0 Z-trim(119.9): 481 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.049391
statistics sampled from 33977 (34493) to 33977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.404), width: 16
Scan time: 9.530
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_078789 (OMIM: 607182,610019) FYVE and coiled-co (1478) 9561 698.3 1.1e-199
XP_006713397 (OMIM: 607182,610019) PREDICTED: FYVE (1478) 9561 698.3 1.1e-199
XP_011532413 (OMIM: 607182,610019) PREDICTED: FYVE (1478) 9561 698.3 1.1e-199
XP_006713396 (OMIM: 607182,610019) PREDICTED: FYVE (1478) 9561 698.3 1.1e-199
XP_011537117 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endos (1365) 599 59.7 1.8e-07
NP_003557 (OMIM: 605070) early endosome antigen 1 (1411) 599 59.7 1.9e-07
XP_016875507 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endos (1417) 599 59.7 1.9e-07
XP_011537116 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endos (1453) 599 59.7 1.9e-07
XP_016883107 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2198) 544 56.0 3.8e-06
XP_011526821 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2240) 544 56.0 3.9e-06
XP_011526820 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2319) 544 56.0 4e-06
XP_016883106 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2332) 544 56.0 4e-06
XP_011526819 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2355) 544 56.0 4e-06
XP_005260320 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2370) 544 56.0 4e-06
XP_006723757 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2404) 544 56.0 4.1e-06
XP_006723756 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 544 56.1 4.1e-06
NP_009117 (OMIM: 609689) centrosome-associated pro (2442) 544 56.1 4.1e-06
XP_006723754 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 544 56.1 4.1e-06
XP_006723753 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 544 56.1 4.1e-06
XP_006723755 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 544 56.1 4.1e-06
XP_005260319 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 544 56.1 4.1e-06
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943) 524 54.5 9.4e-06
NP_005955 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 2 [Homo (1976) 517 54.0 1.3e-05
XP_016880170 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 517 54.0 1.3e-05
XP_016880171 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 517 54.0 1.3e-05
NP_001243024 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 3 [H (1985) 517 54.0 1.4e-05
XP_016880169 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1985) 517 54.0 1.4e-05
XP_016880167 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 517 54.0 1.4e-05
XP_016880166 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 517 54.0 1.4e-05
XP_016880168 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 517 54.0 1.4e-05
XP_011522182 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2006) 517 54.0 1.4e-05
NP_001242941 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 1 [H (2007) 517 54.0 1.4e-05
XP_011522181 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2015) 517 54.0 1.4e-05
XP_011522180 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2016) 517 54.0 1.4e-05
XP_011522177 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2037) 517 54.0 1.4e-05
XP_016873320 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2101) 483 51.6 7.5e-05
NP_001273490 (OMIM: 164009,612376) nuclear mitotic (2101) 483 51.6 7.5e-05
XP_011543368 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2101) 483 51.6 7.5e-05
XP_016873319 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2101) 483 51.6 7.5e-05
XP_006718627 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2115) 483 51.6 7.6e-05
NP_006176 (OMIM: 164009,612376) nuclear mitotic ap (2115) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543367 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2119) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543361 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543357 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543364 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543365 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543363 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543358 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543360 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
XP_011543366 (OMIM: 164009,612376) PREDICTED: nucl (2133) 483 51.6 7.6e-05
>>NP_078789 (OMIM: 607182,610019) FYVE and coiled-coil d (1478 aa)
initn: 9561 init1: 9561 opt: 9561 Z-score: 3705.9 bits: 698.3 E(85289): 1.1e-199
Smith-Waterman score: 9561; 100.0% identity (100.0% similar) in 1478 aa overlap (1-1478:1-1478)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 ATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 LQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 RTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERERGRTAAEDNVRLTCLVAELQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERERGRTAAEDNVRLTCLVAELQK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 QWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQELEATRDSLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQELEATRDSLDK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 KNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHT
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 SSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLI
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pF1KE2 QDKDHLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QDKDHLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQL
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pF1KE2 DDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVGRNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 DDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVGRNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSL
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pF1KE2 ASLEAEQASIRHLGDQMEASLLAVRKAKEAMKAQMAEKEAILQSKEGECQQLREEVEQCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 ASLEAEQASIRHLGDQMEASLLAVRKAKEAMKAQMAEKEAILQSKEGECQQLREEVEQCQ
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pF1KE2 QLAEARHRELRALESQCQQQTQLIEVLTAEKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QLAEARHRELRALESQCQQQTQLIEVLTAEKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEV
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pF1KE2 HQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKVQSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 HQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKVQSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRA
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pF1KE2 HVQELLQCSEREGALQEERADEAQQREEELRALQEELSQAKCSSEEAQLEHAELQEQLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 HVQELLQCSEREGALQEERADEAQQREEELRALQEELSQAKCSSEEAQLEHAELQEQLHR
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pF1KE2 ANTDTAELGIQVCALTVEKERVEEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 ANTDTAELGIQVCALTVEKERVEEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 LQEKLKAAKAAAGSLPGLQAQLAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 AGEECKSLRGQLEEQGRQLQAAEEAVEKLKATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKE
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pF1KE2 GAALREDLERTQKELEKATTKIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 GAALREDLERTQKELEKATTKIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEER
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pF1KE2 LIELLRDKDALWQKSDALEFQQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 LIELLRDKDALWQKSDALEFQQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 IFCYYCCNNYVLSKHGGKKERCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGP
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pF1KE2 QATGGQGANTDYRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETPTETDSLDPNAAEQDTTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QATGGQGANTDYRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETPTETDSLDPNAAEQDTTST
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pF1KE2 SLTPEDTEDMPVGQDSEICLLKSGELMIKVPLTVDEIASFGEGSRELFVRSSTYSLIPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 SLTPEDTEDMPVGQDSEICLLKSGELMIKVPLTVDEIASFGEGSRELFVRSSTYSLIPIT
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pF1KE2 VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRT
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pF1KE2 PGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 PGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL
1450 1460 1470
>>XP_006713397 (OMIM: 607182,610019) PREDICTED: FYVE and (1478 aa)
initn: 9561 init1: 9561 opt: 9561 Z-score: 3705.9 bits: 698.3 E(85289): 1.1e-199
Smith-Waterman score: 9561; 100.0% identity (100.0% similar) in 1478 aa overlap (1-1478:1-1478)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADT
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 LQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFAR
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pF1KE2 RTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERERGRTAAEDNVRLTCLVAELQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERERGRTAAEDNVRLTCLVAELQK
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pF1KE2 QWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQELEATRDSLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQELEATRDSLDK
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pF1KE2 KNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QDKDHLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRT
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pF1KE2 PGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL
1450 1460 1470
>>XP_006713396 (OMIM: 607182,610019) PREDICTED: FYVE and (1478 aa)
initn: 9561 init1: 9561 opt: 9561 Z-score: 3705.9 bits: 698.3 E(85289): 1.1e-199
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pF1KE2 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEK
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XP_006 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEK
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pF1KE2 ATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADT
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pF1KE2 LQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFAR
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XP_006 LQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFAR
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pF1KE2 RTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELD
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XP_006 RTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV
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XP_006 NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHT
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pF1KE2 SSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLI
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 QDKDHLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QDKDHLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQL
550 560 570 580 590 600
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pF1KE2 DDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVGRNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVGRNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 QLAEARHRELRALESQCQQQTQLIEVLTAEKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEV
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XP_006 QLAEARHRELRALESQCQQQTQLIEVLTAEKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEV
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pF1KE2 HQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKVQSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKVQSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRA
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XP_006 ANTDTAELGIQVCALTVEKERVEEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKES
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pF1KE2 LQEKLKAAKAAAGSLPGLQAQLAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LQEKLKAAKAAAGSLPGLQAQLAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKN
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 AGEECKSLRGQLEEQGRQLQAAEEAVEKLKATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKE
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XP_006 AGEECKSLRGQLEEQGRQLQAAEEAVEKLKATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KE2 GAALREDLERTQKELEKATTKIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GAALREDLERTQKELEKATTKIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEER
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 LIELLRDKDALWQKSDALEFQQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LIELLRDKDALWQKSDALEFQQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE2 IFCYYCCNNYVLSKHGGKKERCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IFCYYCCNNYVLSKHGGKKERCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGP
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pF1KE2 QATGGQGANTDYRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETPTETDSLDPNAAEQDTTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QATGGQGANTDYRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETPTETDSLDPNAAEQDTTST
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pF1KE2 SLTPEDTEDMPVGQDSEICLLKSGELMIKVPLTVDEIASFGEGSRELFVRSSTYSLIPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLTPEDTEDMPVGQDSEICLLKSGELMIKVPLTVDEIASFGEGSRELFVRSSTYSLIPIT
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pF1KE2 VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRT
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1450 1460 1470
pF1KE2 PGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL
1450 1460 1470
>>XP_011537117 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endosome (1365 aa)
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pF1KE2 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVT---ELSKEFQEAG
::... :. ..:. .: .:. :. .
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.: .: . :.: ... :.. :. . :: : : . .....
XP_011 RPGIEDVAVLKKELVQVQTLMDNMTLERERESEKLKDE----CKKLQSQYASSEA-----
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pF1KE2 SISELRTSLGKGRAFIR-YSLVHQRLADTLQQCFM-NTKVTSDWYYARSPF--LQPKLSS
.::.::. :.:: . : :.: ..... . : .: . .. . :. : .
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. :.. ..: : .. .: . . : .: . : . ..... .:
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. :.. ..: .:.. ... .:. ... :..::. . :.:: : :...
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.:.:.: .:. .:. ::: .:. ...: . .: . :.: . :.
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: ..: :. :. . ..:.. .. ::..:: .. :: :..: : :
XP_011 TTAKLREAQNDLEQVLRQIGDKDQK----IQNLEALLQKSKENISLLEKEREDLYAKIQA
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. . : . :.: : .. : ... ::: .:: .:.: . .
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pF1KE2 ----RTKVEEVNRQ------QSAQLEQLVK---ELQLKEDARASLER--LVKEMAPLQEE
.:.:.:.: : . .::. .: :: :. .: . .: : ... :.
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pF1KE2 LSGKGQEADQLWRRLQELLAHTSSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFL
:. : :: ... .:... :. .. .:. ..:. . :. .:. :::... : :.. :
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pF1KE2 ETQLAQVS----QHVSDLEEQKKQLIQDKD----HLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEK
:.. .:. : ..::..:. :: : . .::.:. : ..... .: .:
XP_011 EADSLEVKASKEQALQDLQQQR-QLNTDLELRATELSKQLEMEKEIVSSTRLDLQ---KK
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pF1KE2 NEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQLDDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVG
.::: :... : :::.. :.. . ::: ... ..::....:..:
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pF1KE2 RNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSLASLEAEQASIRHLGDQMEASLLAVRKAKEA
. : .. . .::... ...... : .. :: . ..: . . : .:..: ..:. .
XP_011 ELQKVKMEKEALMTELSTVKDKLSKVSDSLKNSKSEFEKENQKG---KAAILDLEKTCKE
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pF1KE2 MKAQMAEKEAILQSKEGECQQLREEVEQCQQLAEARHRELRALESQC-QQQTQLIEVLTA
.: :. .. ... : ..:.. .:. .. .. . :: ... : : :. : .
XP_011 LKHQL---QVQMENTLKEQKELKKSLEKEKEASHQLKLELNSMQEQLIQAQNTLKQNEKE
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pF1KE2 EKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEVHQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKV
:. :: . :: .. . : .. :.:. :::.. : ..:. .:.
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pF1KE2 QSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRAHVQELLQCSEREGALQEERADEAQQREEE
:.::..: : .: .. :... : ... : . ::. : : : .. ::.
XP_011 QQQLTQAAQELAAEKEKISVLQNNYEKSQETFKQLQSDFYGRESELLATRQD-LKSVEEK
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pF1KE2 LRALQEELSQAKCSSEEAQLEHAELQEQLHRANTDTAELGIQV---C-ALT-VEKERV--
: ::.: . . . . . ::. . :.:. :. : :: ..::.
XP_011 LSLAQEDLISNRNQIGNQNKLIQELKTAKATLEQDSAKKEQQLQERCKALQDIQKEKSLK
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pF1KE2 EEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKESLQ-EKLKAAKAAAGSLPGLQAQ
:. :. ..: . .: :. :.... :..: .: . :..: . : :
XP_011 EKELVNEKSKLAEIEEIKCRQ----EKEITKLNEELKSHKLESIKEITNLKDAKQLLIQQ
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pF1KE2 LAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKNAG-EECKSLRGQLEEQGRQLQ
. . .:.::. :..:: . .. :. .. . .::. :. .:.....:. ..
XP_011 KLELQGKADSLKAAVEQEKRNQQI-LKDQVKKEEEELKKEFIEKEAKLHSEIKEKEVGMK
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pF1KE2 AAEEAVEKLKATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKEGAALREDLERTQKELEKATT
:: :: . ..:.:. .... : :. .: .::. :: ..
XP_011 KHEENEAKLTMQITALNENLGTVKKEWQSSQ----RRVSELEKQTDDLRGEIAVLEATVQ
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pF1KE2 KIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEERLIELLRDKDALWQKSDALEF
. :. : .. . : . .:. . . .:.: . :: :....: :
XP_011 NNQDERRALLERCLKGEGEIEKLQTKVLELQRKLDNTTAAVQELGRENQSLQIKHT----
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pF1KE2 QQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGRIFCYYCCNNYVLSKHGGKKE
: :. ..: :.:...:. : . :: ::::::: :: ::: : . .:. . :
XP_011 -QALN--RKWAEDNEVQNCMACGKGFSVTVRRHHCRQCGNIFCAECSAKNALTPSSKKPV
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pF1KE2 RCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGPQATGGQGANTDYRPPDDAVF
: : :::. :
XP_011 RVCDACFNDLQG
1360
>>NP_003557 (OMIM: 605070) early endosome antigen 1 [Hom (1411 aa)
initn: 398 init1: 168 opt: 599 Z-score: 254.8 bits: 59.7 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 690; 23.0% identity (54.5% similar) in 1300 aa overlap (6-1230:189-1409)
10 20 30
pF1KE2 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVT---ELSKEFQEAG
::... :. ..:. .: .:. :. .
NP_003 DLFEQKAAQLATEIADIKSKYDEERSLREAAEQKVTRLTEELNKEATVIQDLKTELLQ--
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pF1KE2 EPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEKATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVK
.: .: . :.: ... :.. :. . :: : : . .....
NP_003 RPGIEDVAVLKKELVQVQTLMDNMTLERERESEKLKDE----CKKLQSQYASSEA-----
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pF1KE2 SISELRTSLGKGRAFIR-YSLVHQRLADTLQQCFM-NTKVTSDWYYARSPF--LQPKLSS
.::.::. :.:: . : :.: ..... . : .: . .. . :. : .
NP_003 TISQLRSELAKGPQEVAVYVQELQKLKSSVNELTQKNQTLTENLLKKEQDYTKLEEKHNE
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pF1KE2 DIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTF-ARRTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSS
. :.. ..: : .. .: . . : .: . : . ..... .:
NP_003 ESVSK----KNIQATLHQKDLDCQQLQSRLSASETSLHRIHVELSEKGEATQKLKEELSE
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pF1KE2 Y-LQTQEMVSNF-DLNSPLNNEALEGFDEMRLELDQLEVR----EKQLRE---RMQQ---
. :.. ..: .:.. ... .:. ... :..::. . :.:: : :...
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pF1KE2 ------LDRENQ--ELRAAVSQQGEQLQTERERGRTAAEDNVRLTCLVAELQKQWEVTQA
.:.:.: .:. .:. ::: .:. ...: . .: . :.: . :.
NP_003 LSSEKLMDKEQQVADLQLKLSRLEEQL---KEKVTNSTELQHQLDKTKQQHQEQQALQQS
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: ..: :. :. . ..:.. .. ::..:: .. :: :..: : :
NP_003 TTAKLREAQNDLEQVLRQIGDKDQK----IQNLEALLQKSKENISLLEKEREDLYAKIQA
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pF1KE2 LASFPGWLAMAQQKADTASDT------KGRQEPIPSDAAQE-----MQELGEKLQALERE
. . : . :.: : .. : ... ::: .:: .:.: . .
NP_003 GEGETAVLNQLQEKNHTLQEQVTQLTEKLKNQSESHKQAQENLHDQVQEQKAHLRAAQDR
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pF1KE2 ----RTKVEEVNRQ------QSAQLEQLVK---ELQLKEDARASLER--LVKEMAPLQEE
.:.:.:.: : . .::. .: :: :. .: . .: : ... :.
NP_003 VLSLETSVNELNSQLNESKEKVSQLDIQIKAKTELLLSAEAAKTAQRADLQNHLDTAQNA
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pF1KE2 LSGKGQEADQLWRRLQELLAHTSSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFL
:. : :: ... .:... :. .. .:. ..:. . :. .:. :::... : :.. :
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pF1KE2 ETQLAQVS----QHVSDLEEQKKQLIQDKD----HLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEK
:.. .:. : ..::..:. :: : . .::.:. : ..... .: .:
NP_003 EADSLEVKASKEQALQDLQQQR-QLNTDLELRATELSKQLEMEKEIVSSTRLDLQ---KK
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.::: :... : :::.. :.. . ::: ... ..::....:..:
NP_003 SEAL----ESIKQKLTKQEEEKQILKQ------DFETLSQETKIQ--HEELNNRIQTTVT
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pF1KE2 RNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSLASLEAEQASIRHLGDQMEASLLAVRKAKEA
. : .. . .::... ...... : .. :: . ..: . . : .:..: ..:. .
NP_003 ELQKVKMEKEALMTELSTVKDKLSKVSDSLKNSKSEFEKENQKG---KAAILDLEKTCKE
840 850 860 870 880 890
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pF1KE2 MKAQMAEKEAILQSKEGECQQLREEVEQCQQLAEARHRELRALESQC-QQQTQLIEVLTA
.: :. .. ... : ..:.. .:. .. .. . :: ... : : :. : .
NP_003 LKHQL---QVQMENTLKEQKELKKSLEKEKEASHQLKLELNSMQEQLIQAQNTLKQNEKE
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pF1KE2 EKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEVHQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKV
:. :: . :: .. . : .. :.:. :::.. : ..:. .:.
NP_003 EQQLQG----NINELKQSSEQ---KKKQIEALQGELKIAVLQKTELE----------NKL
960 970 980 990
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pF1KE2 QSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRAHVQELLQCSEREGALQEERADEAQQREEE
:.::..: : .: .. :... : ... : . ::. : : : .. ::.
NP_003 QQQLTQAAQELAAEKEKISVLQNNYEKSQETFKQLQSDFYGRESELLATRQD-LKSVEEK
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pF1KE2 LRALQEELSQAKCSSEEAQLEHAELQEQLHRANTDTAELGIQV---C-ALT-VEKERV--
: ::.: . . . . . ::. . :.:. :. : :: ..::.
NP_003 LSLAQEDLISNRNQIGNQNKLIQELKTAKATLEQDSAKKEQQLQERCKALQDIQKEKSLK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KE2 EEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKESLQ-EKLKAAKAAAGSLPGLQAQ
:. :. ..: . .: :. :.... :..: .: . :..: . : :
NP_003 EKELVNEKSKLAEIEEIKCRQ----EKEITKLNEELKSHKLESIKEITNLKDAKQLLIQQ
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KE2 LAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKNAG-EECKSLRGQLEEQGRQLQ
. . .:.::. :..:: . .. :. .. . .::. :. .:.....:. ..
NP_003 KLELQGKADSLKAAVEQEKRNQQI-LKDQVKKEEEELKKEFIEKEAKLHSEIKEKEVGMK
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KE2 AAEEAVEKLKATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKEGAALREDLERTQKELEKATT
:: :: . ..:.:. .... : :. .: .::. :: ..
NP_003 KHEENEAKLTMQITALNENLGTVKKEWQSSQ----RRVSELEKQTDDLRGEIAVLEATVQ
1240 1250 1260 1270 1280
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 KIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEERLIELLRDKDALWQKSDALEF
. :. : .. . : . .:. . . .:.: . :: :....: :
NP_003 NNQDERRALLERCLKGEGEIEKLQTKVLELQRKLDNTTAAVQELGRENQSLQIKHT----
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 QQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGRIFCYYCCNNYVLSKHGGKKE
: :. ..: :.:...:. : . :: ::::::: :: ::: : . .:. . :
NP_003 -QALN--RKWAEDNEVQNCMACGKGFSVTVRRHHCRQCGNIFCAECSAKNALTPSSKKPV
1350 1360 1370 1380 1390
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 RCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGPQATGGQGANTDYRPPDDAVF
: : :::. :
NP_003 RVCDACFNDLQG
1400 1410
>>XP_016875507 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endosome (1417 aa)
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. . : . :.: : .. : ... ::: .:: .:.: . .
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XP_016 RVCDACFNDLQG
1410
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10 20 30
pF1KE2 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVT---ELSKEFQEAG
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XP_011 ESVSK----KNIQATLHQKDLDCQQLQSRLSASETSLHRIHVELSEKGEATQKLKEELSE
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XP_011 RVCDACFNDLQG
1450
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