Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2628
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2628, 617 aa
1>>>pF1KE2628 617 - 617 aa - 617 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0875+/-0.0011; mu= 19.9255+/- 0.066
mean_var=61.1063+/-12.909, 0's: 0 Z-trim(102.2): 54 B-trim: 800 in 2/46
Lambda= 0.164071
statistics sampled from 6794 (6842) to 6794 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 4181 998.8 0
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 4134 987.7 0
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 3256 779.8 0
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 2850 683.8 1.8e-196
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 2089 503.6 3.1e-142
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 1815 438.8 1e-122
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 1775 429.3 7.3e-120
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 1770 428.1 1.6e-119
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 1770 428.2 1.9e-119
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 1766 427.2 3.1e-119
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 1765 427.0 3.8e-119
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1742 421.5 1.7e-117
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 1431 347.9 2e-95
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 1264 308.4 1.8e-83
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1242 303.2 8.5e-82
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 1195 292.0 1.3e-78
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1129 276.4 7.9e-74
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1129 276.4 8.1e-74
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1129 276.4 8.6e-74
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 753 187.4 4.4e-47
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 630 158.0 1.1e-38
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 621 155.9 4.9e-38
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 586 147.9 3.9e-35
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 503 128.0 1.6e-29
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 471 120.6 5.7e-27
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 456 117.1 7e-26
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 440 113.3 9.8e-25
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 423 109.3 1.8e-23
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 410 106.2 1.3e-22
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 410 106.3 1.5e-22
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 385 100.3 9.2e-21
>>CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 (617 aa)
initn: 4181 init1: 4181 opt: 4181 Z-score: 5343.4 bits: 998.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4181; 100.0% identity (100.0% similar) in 617 aa overlap (1-617:1-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 REGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 REGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 MGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHL
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE2 VAQRDIRQFQLQHWLAI
:::::::::::::::::
CCDS10 VAQRDIRQFQLQHWLAI
610
>>CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 (628 aa)
initn: 4172 init1: 4134 opt: 4134 Z-score: 5283.2 bits: 987.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4134; 99.7% identity (100.0% similar) in 612 aa overlap (1-612:1-612)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 REGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 MGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHL
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE2 VAQRDIRQFQLQHWLAI
::::::::::..
CCDS54 VAQRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
610 620
>>CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 (512 aa)
initn: 3248 init1: 3248 opt: 3256 Z-score: 4161.3 bits: 779.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3256; 99.4% identity (99.4% similar) in 487 aa overlap (131-617:27-512)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 FLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSL
:: :::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGVQWWSHTQGEVAVGLGLGDSYLTPCPC-PGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSL
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 YYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLH
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVH
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCY
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 RDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSG
240 250 260 270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 STFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 STFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFC
300 310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLC
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 WKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLST
420 430 440 450 460 470
590 600 610
pF1KE2 QGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
480 490 500 510
>>CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 (620 aa)
initn: 2847 init1: 1978 opt: 2850 Z-score: 3640.7 bits: 683.8 E(32554): 1.8e-196
Smith-Waterman score: 2850; 67.0% identity (85.6% similar) in 619 aa overlap (6-617:11-620)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
CCDS38 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE2 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
CCDS38 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
CCDS38 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
CCDS38 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
CCDS38 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
CCDS38 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
CCDS38 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
CCDS38 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
CCDS38 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
CCDS38 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
540 550 560 570 580 590
590 600 610
pF1KE2 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
::.:.::....:: . ..::: :.::: .
CCDS38 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
600 610 620
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30 40 50 60 70 80
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90 100 110 120 130 140
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CCDS11 CYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICII
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
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:.:.. :::.:.::.::::.:::: .::::.: ..::. :::. .. ..
CCDS11 AFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTN------YFSEDNITWTL
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210 220 230 240 250 260
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CCDS11 HSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVW
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270 280 290 300 310 320
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330 340 350 360 370 380
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CCDS11 VLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAG
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390 400 410 420 430 440
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CCDS11 PSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRR
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450 460 470 480 490 500
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CCDS11 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFC
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510 520 530 540 550 560
pF1KE2 NDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIA
:...:.:: :: .::.:: .:: ::::.. ... : .: .: :. .:. :.
CCDS11 RDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIG
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
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CCDS11 TSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPTE-IPCGDIRLNAV
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20 30 40 50 60 70
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: .: : .. : : .:..:.:::.: .
CCDS85 MDGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEII
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CCDS85 GLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPL
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:.:.: : ..: :.. :: .:.::.:.::::::: .:::: :.. ::. .::: .::
CCDS85 FQGIGLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTD--FLNH
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pF1KE2 SVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLW
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CCDS85 SGAGTVTPFENFT-SPVMEFWERRVLGI--TSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIW
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CCDS85 KGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGT
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CCDS85 QIFFSFAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQG
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pF1KE2 VNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLAD
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CCDS85 VPISEVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASID
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pF1KE2 DF--QVLKRHRK-LFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAA-GTSILFAVLMEA
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CCDS85 MFPRQLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEV
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. .:: ::.::: ..:..:.:.:: .. : :..:.. : . . :. .. :: :.. :
CCDS85 VCISWVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVY
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pF1KE2 IFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQ
..:::. .:: .:::::: ::..:. .:.:.: . .:: :::..
CCDS85 VYPPWGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLD
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610
pF1KE2 FQLQHWLAI
CCDS85 GSAGRNFGPSPTREGLIAGEKETHL
590 600 610
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30 40 50 60 70 80
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CCDS14 PLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPY
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pF1KE2 LCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILI
::::::::.:::::.:. ...:.:.:..:..:::. . :. .::.:::.:::.::: ..:
CCDS14 LCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVI
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pF1KE2 ALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTD----PKLLNGSVLGNHT
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CCDS14 VFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTC
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210 220 230 240 250 260
pF1KE2 KYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSG
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CCDS14 DQLADRRSPVIEFWENKVLRL--SGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTG
210 220 230 240 250
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pF1KE2 KVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLG
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CCDS14 KIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYA
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pF1KE2 AGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVA
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CCDS14 IGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVA
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pF1KE2 TEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKR
: ::.:: ::.:.. . . .::..:: ::: :::::.. :.:. :::: : . .
CCDS14 ESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYY
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 HRKLFTFGVTFST---FLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAA-GTSILFAVLMEAIGVSWFY
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CCDS14 FRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVY
440 450 460 470 480 490
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pF1KE2 GVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDD-YIFPPWAN
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CCDS14 GADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGE
500 510 520 530 540 550
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pF1KE2 WVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITP-ENEHHLVAQRDIRQFQLQHW
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CCDS14 AMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLTT
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pF1KE2 LAI
CCDS14 LTPVSESSKVVVVESVM
620 630
>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa)
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CCDS33 MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSS
10 20 30 40
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CCDS33 KIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTS
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pF1KE2 EGAATVW-KICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTW
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CCDS33 EGGITCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSW
110 120 130 140 150 160
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CCDS33 NTPHCMEDTMRKNKSVW---ITISSTNFTSPVIEFWERNVLSL--SPGIDHPGSLKWDLA
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pF1KE2 LCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHID
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CCDS33 LCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPD
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pF1KE2 FYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSG
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CCDS33 ITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSG
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CCDS33 FAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLD
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pF1KE2 SSMGGMEAVITGLADDFQVLKRH---RKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTF
:.. .:. ::.:.: . . :. :..: : ..::.: .:.::.::. :.: .
CCDS33 SQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYY
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pF1KE2 AA-GTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVV
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CCDS33 AASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFI
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pF1KE2 VSIINFKPLTYDD-YIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGIT
:.... ::::. :..: :: .::..:::::. ::. .. .. .:.: . :. : .:
CCDS33 FSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLT
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pF1KE2 PENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
:.. .. ...:.
CCDS33 PREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
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pF1KE2 RMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRD-GDAQP--RETWGK
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CCDS77 TRTTALLRSSQTKEMATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSS
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pF1KE2 KIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNR
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CCDS77 KIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTS
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pF1KE2 EGAATVW-KICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTW
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CCDS77 EGGITCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSW
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pF1KE2 NSPNCTDPKLL-NGSVLGNHTKYSKYKFT-PAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLL
:.:.: . . : :: :. .:: :. ::.::.:: : : :: : .:.:
CCDS77 NTPHCMEDTMRKNKSVW---ITISSTNFTSPVIEFWERNVLSL--SPGIDHPGSLKWDLA
270 280 290 300 310 320
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pF1KE2 LCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHID
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CCDS77 LCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPD
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pF1KE2 FYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSG
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CCDS77 ITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSG
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CCDS77 FAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLD
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pF1KE2 SSMGGMEAVITGLADDFQVLKRH---RKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTF
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CCDS77 SQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYY
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