FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2619, 456 aa
1>>>pF1KE2619 456 - 456 aa - 456 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1325+/-0.00117; mu= 12.2237+/- 0.070
mean_var=64.7348+/-13.261, 0's: 0 Z-trim(101.2): 74 B-trim: 2 in 1/47
Lambda= 0.159406
statistics sampled from 6333 (6407) to 6333 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 3058 712.7 2e-205
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 2930 683.2 1.5e-196
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 1846 433.9 1.6e-121
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CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 740 179.6 8.7e-45
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 740 179.6 9.1e-45
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CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 738 179.1 1.2e-44
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 738 179.1 1.2e-44
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CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 738 179.1 1.3e-44
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CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 738 179.1 1.4e-44
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 727 176.6 5.2e-44
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 722 175.4 1.2e-43
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 722 175.4 1.2e-43
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 720 175.0 2e-43
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CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 720 175.0 2.7e-43
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 720 175.0 2.7e-43
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 720 175.0 2.7e-43
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 601 147.6 2.7e-35
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 601 147.6 2.8e-35
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 601 147.6 2.9e-35
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 583 143.5 6e-34
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 583 143.5 6.7e-34
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 583 143.5 7.3e-34
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 575 141.6 1.7e-33
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 575 141.6 1.8e-33
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 575 141.6 1.8e-33
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 575 141.6 1.9e-33
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 544 134.5 2.1e-31
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 544 134.5 2.2e-31
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 544 134.5 2.2e-31
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 544 134.5 2.2e-31
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 544 134.5 2.4e-31
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 544 134.5 2.4e-31
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 544 134.5 2.4e-31
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 544 134.5 2.5e-31
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 544 134.5 2.6e-31
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 544 134.5 2.6e-31
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 544 134.5 2.6e-31
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 544 134.5 2.7e-31
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 544 134.5 2.8e-31
CCDS34055.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 833) 464 116.1 1.4e-25
CCDS3713.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 875) 464 116.1 1.4e-25
CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 489) 460 115.2 1.5e-25
CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 575) 460 115.2 1.8e-25
>>CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 (456 aa)
initn: 3058 init1: 3058 opt: 3058 Z-score: 3801.6 bits: 712.7 E(32554): 2e-205
Smith-Waterman score: 3058; 100.0% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 MLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE2 NKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
430 440 450
>>CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 (482 aa)
initn: 2930 init1: 2930 opt: 2930 Z-score: 3642.0 bits: 683.2 E(32554): 1.5e-196
Smith-Waterman score: 2930; 99.8% identity (100.0% similar) in 438 aa overlap (19-456:45-482)
10 20 30 40
pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSR
:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PVPQHVLSRRGAISFSSSSALFGCPNPRQLSQRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSR
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLN
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 RRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDL
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQI
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSK
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNT
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450
pF1KE2 RLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
440 450 460 470 480
>>CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 (450 aa)
initn: 1810 init1: 1740 opt: 1846 Z-score: 2295.3 bits: 433.9 E(32554): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 1846; 61.7% identity (86.5% similar) in 423 aa overlap (20-441:7-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHP
.: : : ... ::.: . ::::.:.:...: ..:::::.:
CCDS51 MSCLMVERCGEILFENPDQNAKCVCMLGDIRLRGQTGVRAERRGSYP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKC
.::::...: . . ....::::::::...::..:: . :..::.:: :::.
CCDS51 FIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 MLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYH
:: ::: :.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :.:::::.:::::
CCDS51 MLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIK
::::::::::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.::::::::::::
CCDS51 SQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQ
:::.::.::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.:.:::::::.::
CCDS51 TNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFH
::.:. ...:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::::::.: :::..
CCDS51 NEFLTRLKAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYR
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE2 QGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-NTRLSQTMLGHVG
::..:.:..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :. ::..::::..
CCDS51 QGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KE2 LNKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
:::.::.: .: :. ....
CCDS51 HNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
410 420 430 440 450
>>CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (606 aa)
initn: 581 init1: 289 opt: 740 Z-score: 918.4 bits: 179.6 E(32554): 7.8e-45
Smith-Waterman score: 740; 30.7% identity (62.4% similar) in 449 aa overlap (5-439:107-541)
10 20 30
pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTA
: ::: . : . : ... .:..
CCDS46 QGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLE----TLQTRHSVGEMASNKFK
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80
pF1KE2 LYI-RMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEV-SVSARN----IRRLLSF
. : : . ::.: . . :. ..: .:.:.:. .:.:.. . :. ..
CCDS46 RILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLD-----QQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGL
140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 QRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLT
. .:. . ..:. ... :. . :: :: ...:..:.: .:... :...
CCDS46 HGLCHSASL--SSATVPRFGVQTDQEEQLAK-ELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAII
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 FHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLA
: .:. . :.. :.. : .:.:.. ::.. :::..:::::.:. : : : :
CCDS46 FSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALE
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 NSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLR
: .:: .:.:.: ::.:::::.. :::.:: :: .:...::::::: . ::.
CCDS46 AVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQ
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 ESG--LFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDR------GDLCLED
. .:..: ..: ... .. ..::::.:.. . :. ... .. : : :..
CCDS46 AENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDN
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 TRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHT
: ::: ..:::. :: . : .::.... :::.::: :.. : .::.::.::
CCDS46 YSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHT
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDA
:. . :.::. :...::. :: . . .: .: . :. : . .: :. :.
CCDS46 ASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPD-AQDLLDTLEDNRE-WYQSKIPRSPSDLTNP
490 500 510 520 530 540
450
pF1KE2 AFELNSQLLPQENRLS
CCDS46 ERDGPDRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLD
550 560 570 580 590 600
>>CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (680 aa)
initn: 581 init1: 289 opt: 740 Z-score: 917.5 bits: 179.6 E(32554): 8.7e-45
Smith-Waterman score: 740; 30.7% identity (62.4% similar) in 449 aa overlap (5-439:181-615)
10 20 30
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. : : . ::.: . . :. ..: .:.:.:. .:.:.. . :. ..
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. .:. . ..:. ... :. . :: :: ...:..:.: .:... :...
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. : : . ::.: . . :. ..: .:.:.:. .:.:.. . :. ..
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270 280 290 300 310
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380 390 400 410 420 430
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CCDS56 VFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQE
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pF1KE2 LYI-RMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRI---FHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQR
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pF1KE2 -LFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLAN
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CCDS56 TIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPALEA
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 SVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRE
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CCDS56 VFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQE
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CCDS56 ENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNY
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pF1KE2 RHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTE
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CCDS56 SDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDKHNA
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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