Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2558, 790 aa
1>>>pF1KE2558 790 - 790 aa - 790 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5203+/-0.000639; mu= -9.0040+/- 0.038
mean_var=784.4043+/-180.998, 0's: 0 Z-trim(115.8): 714 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.045794
statistics sampled from 25757 (26512) to 25757 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 8.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001012331 (OMIM: 155240,191315,256800) high aff ( 790) 5418 375.2 5.9e-103
NP_002520 (OMIM: 155240,191315,256800) high affini ( 796) 5396 373.8 1.6e-102
NP_001007793 (OMIM: 155240,191315,256800) high aff ( 760) 4908 341.5 8e-93
NP_001230030 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 817) 1748 132.8 5.8e-30
XP_006720607 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 817) 1748 132.8 5.8e-30
XP_016877741 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 448) 1619 123.9 1.6e-27
XP_016877740 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 456) 1619 123.9 1.6e-27
NP_001018074 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growt ( 822) 1622 124.5 1.9e-27
XP_016870243 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27
XP_016870242 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27
XP_011517020 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27
XP_016870241 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27
XP_016877732 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27
XP_016877733 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27
XP_016877734 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27
XP_016877735 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27
XP_016877730 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 763) 1619 124.2 2.1e-27
NP_002521 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor recept ( 825) 1619 124.3 2.2e-27
XP_006720606 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 825) 1619 124.3 2.2e-27
XP_016877729 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 825) 1619 124.3 2.2e-27
XP_005252060 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27
XP_005252061 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27
XP_005252058 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27
XP_016870240 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27
NP_006171 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growth f ( 838) 1615 124.0 2.6e-27
XP_016877737 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 559) 982 81.9 8.2e-15
XP_016877736 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 604) 980 81.8 9.3e-15
NP_001307064 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 617) 970 81.2 1.5e-14
XP_006720608 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 715) 970 81.3 1.6e-14
XP_016877731 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 750) 965 81.0 2.1e-14
XP_006720613 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 495) 915 77.4 1.7e-13
XP_006720611 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 528) 907 76.9 2.5e-13
XP_016877738 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 550) 907 77.0 2.5e-13
NP_001307063 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 567) 907 77.0 2.6e-13
NP_001007157 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 612) 907 77.0 2.7e-13
XP_011519939 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 612) 907 77.0 2.7e-13
XP_006720612 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 503) 904 76.7 2.8e-13
XP_011519940 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 469) 899 76.3 3.3e-13
XP_016877739 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 482) 899 76.3 3.4e-13
XP_016856866 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 874) 861 74.2 2.6e-12
XP_011539828 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 874) 861 74.2 2.6e-12
XP_016856865 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 917) 861 74.3 2.7e-12
NP_005003 (OMIM: 602336) inactive tyrosine-protein ( 937) 861 74.3 2.7e-12
XP_011519819 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu ( 922) 836 72.6 8.5e-12
XP_011519818 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1064) 836 72.7 9.2e-12
NP_001014796 (OMIM: 191311,271665) discoidin domai ( 855) 832 72.3 9.9e-12
NP_006173 (OMIM: 191311,271665) discoidin domain-c ( 855) 832 72.3 9.9e-12
XP_011507888 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 832 72.3 9.9e-12
XP_011507889 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 832 72.3 9.9e-12
XP_006711407 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 832 72.3 9.9e-12
>>NP_001012331 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinit (790 aa)
initn: 5418 init1: 5418 opt: 5418 Z-score: 1969.4 bits: 375.2 E(85289): 5.9e-103
Smith-Waterman score: 5418; 99.9% identity (99.9% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQ
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 APPVYLDVLG
::::::::::
NP_001 APPVYLDVLG
790
>>NP_002520 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinity n (796 aa)
initn: 5404 init1: 2715 opt: 5396 Z-score: 1961.5 bits: 373.8 E(85289): 1.6e-102
Smith-Waterman score: 5396; 99.1% identity (99.1% similar) in 796 aa overlap (1-790:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP------DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
NP_002 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG
::::::::::::::::
NP_002 LQALAQAPPVYLDVLG
790
>>NP_001007793 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinit (760 aa)
initn: 4908 init1: 4908 opt: 4908 Z-score: 1787.4 bits: 341.5 E(85289): 8e-93
Smith-Waterman score: 4908; 99.6% identity (99.7% similar) in 723 aa overlap (68-790:38-760)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DACCPHGSSGLRCTRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
:. ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLAPSVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNST
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
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: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
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. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: :
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. : .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::..
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:::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::
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.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:::::::::
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XP_006 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL
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XP_006 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ
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XP_006 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
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XP_006 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
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. : .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::..
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:::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::
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.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:::::::::
XP_006 SQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVG
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pF1KE2 GRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGR
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XP_006 GHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGR
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pF1KE2 ELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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XP_006 VLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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XP_016 LAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPL
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XP_016 IMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQ
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::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::
XP_016 HFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKF
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:::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: :::::.:: ::: .: :::
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::::::: .::... :.::..: :.:::.::
XP_016 QREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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XP_016 MAQPQFMSRLFLGVLDKRSSQPAGAVRESTDNFILFDEVSPTPPITVT-----HKPEEDT
10 20 30 40 50 60
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::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. :. : :: .. : .
XP_016 FGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGIT
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XP_016 TPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 GKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTE
::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:.::: .
XP_016 GKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGD
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XP_016 GDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVY
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::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.
XP_016 LASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIM
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pF1KE2 YRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIM
:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: :::::.:: ::: .:
XP_016 YRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVM
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pF1KE2 RGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
:::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
XP_016 LGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
430 440 450
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pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
::. : . ::... :: :: .: : ..: . :. : .
NP_001 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV
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XP_016 ITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]