Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2531
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2531, 701 aa
1>>>pF1KE2531 701 - 701 aa - 701 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9123+/-0.00108; mu= 16.1202+/- 0.065
mean_var=72.9621+/-14.201, 0's: 0 Z-trim(103.2): 59 B-trim: 5 in 1/48
Lambda= 0.150150
statistics sampled from 7229 (7279) to 7229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 701) 4808 1051.5 0
CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 700) 4789 1047.4 0
CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 ( 746) 1789 397.6 3.6e-110
CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 ( 431) 460 109.6 1e-23
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 444 106.3 2.4e-22
CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 ( 392) 434 103.9 4.6e-22
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 434 104.0 8e-22
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 434 104.1 1e-21
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 434 104.1 1.1e-21
CCDS47417.1 MDGA1 gene_id:266727|Hs108|chr6 ( 955) 285 71.8 5.3e-12
>>CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (701 aa)
initn: 4808 init1: 4808 opt: 4808 Z-score: 5626.3 bits: 1051.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4808; 100.0% identity (100.0% similar) in 701 aa overlap (1-701:1-701)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQLTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 APSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSST
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE2 VAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF
670 680 690 700
>>CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (700 aa)
initn: 4779 init1: 4779 opt: 4789 Z-score: 5604.0 bits: 1047.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4789; 99.9% identity (99.9% similar) in 701 aa overlap (1-701:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQLTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 APSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 APSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSST
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE2 VAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS77 VAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQN-HAF
670 680 690 700
>>CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 (746 aa)
initn: 1632 init1: 599 opt: 1789 Z-score: 2091.4 bits: 397.6 E(32554): 3.6e-110
Smith-Waterman score: 1843; 41.0% identity (66.0% similar) in 744 aa overlap (4-670:3-736)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI
: : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.:::
CCDS49 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET
:... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::.
CCDS49 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV
.:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.::::::
CCDS49 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE
: ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:.
CCDS49 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP
..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ...
CCDS49 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES
: : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: :
CCDS49 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE2 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG
:.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::.
CCDS49 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN
: ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . :
CCDS49 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLY
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF
..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::.
CCDS49 PNSRESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI
:. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. :
CCDS49 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII
540 550 560 570 580
590 600
pF1KE2 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS
.. :::.::..:.. .:.: ::
CCDS49 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640
pF1KE2 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC
: : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: ::::
CCDS49 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF
. ... .....:..:. : . :
CCDS49 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
710 720 730 740
>>CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 (431 aa)
initn: 457 init1: 186 opt: 460 Z-score: 539.3 bits: 109.6 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 497; 37.4% identity (64.2% similar) in 254 aa overlap (20-258:41-284)
10 20 30 40
pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLD--
:: :::. ...: :.:: ::.:: :.
CCDS33 VLGLLSLPGVILGAPLASSCAGACGTSFPDGL-TPEGTQASG--DKDIPAINQGLILEET
20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE2 -----LFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYRWPH------TIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFE
:.:::: : . . . . .:: .:..: .. . .. :::.:.
CCDS33 PESSFLIEGDI--IRPSPFRLLSATSNKWPMGGSGVVEVPFLLSSKYDEPSRQVILEALA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIAT--VQHEF
... .::: : . . ..::.. ::.:::: : : : .:.. .: . . : ::.
CCDS33 EFERSTCIRFVTYQDQRDFISIIPMYGCFSSVG-RSGGMQVVSLAPTCLQKGRGIVLHEL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKT
.:.::::::..:.::: :.:. :..:: : : :: . :... .::::.:::::..
CCDS33 MHVLGFWHEHTRADRDRYIRVNWNEILPGFEINFIKSQ---SSNMLTPYDYSSVMHYGRL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 AFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCG
::. :::. . :::: ..: ::. .. .::.:: :
CCDS33 AFSRRGLPTITPLWAPSVH-IGQRWNLSASDITRVLKLYGCSPSGPRPRGRGSHAHSTGR
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYP
CCDS33 SPAPASLSLQRLLEALSAESRSPDPSGSSAGGQPVPAGPGESPHGWESPALKKLSAEASA
310 320 330 340 350 360
>>CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015 aa)
initn: 390 init1: 308 opt: 444 Z-score: 514.7 bits: 106.3 E(32554): 2.4e-22
Smith-Waterman score: 444; 30.5% identity (61.0% similar) in 269 aa overlap (22-280:105-366)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEG
..:.. .: : . : :. : :
CCDS74 FHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAGKDGRENTTLLHSPG
80 90 100 110 120 130
60 70 80 90 100
pF1KE2 DI----RLDRAQIRNSIIGEKYR-WPH-TIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCID
. . ..: . .. : :: .::::. .. . .... .:..... .::.
CCDS74 TLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIFKQAMRHWEKHTCVT
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 FKPWAGETNYISV-FKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQ
: . : ..: .. :: : :: : : : .::: :::... : ::. :..:::::.
CCDS74 FIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVAHELGHVVGFWHEH
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTE-PT
.: :::..: :. . : :.:.:: . .::. ::. :.:::....:. :. :
CCDS74 TRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMHYARNTFSRGVFLDT
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IVTRISD--FEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGD
:. : .: . .::::. .:..:. . .::.: .:. :... : ... :
CCDS74 ILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCP-------ACGETLQDTTGNFSAPGF
320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 NADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCL
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50 60 70 80 90
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:: .::::. .. . .... .:.....
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100 110 120 130 140 150
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.::. : . : .:: ... :: : :: : : : .::: :::... : ::. :..
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190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260 270
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: ::. .: .. .:::: .: .:. . .:: : . :. :.. :
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..: :
CCDS56 LSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEKVVFSLC
360 370 380 390
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:.. : . .. : :: .::.:. ..
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90 100 110 120 130 140
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. ..:. .:..... .::. : . : .:: ... :: : :: : : : .::: :
CCDS34 GSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKN
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150 160 170 180 190 200
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::... : ::. :..:::::..: ::: .: :. . : :.:.:: . . .::. :
CCDS34 CDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETY
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
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:. :.:::....:. : ::: . .. . :::: .: .:. . .::.:
CCDS34 DFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKC-----
270 280 290 300 310
270 280 290 300 310
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.:. :.. : ..: .: .: : :.: .:
CCDS34 --PACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVW-RISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCW
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
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30 40 50 60 70 80
pF1KE2 FDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYR-WPH-TIPYVLEDSLE
:.. : . .. : :: .::.:. ..
CCDS60 KAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFT
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 MNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYIS-VFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGAN
. ..:. .:..... .::. : . : .:: ... :: : :: : : : .::: :
CCDS60 GSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKN
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 CDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPY
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CCDS60 CDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETY
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 DYTSVMHYSKTAFQNGTE-PTIVTR--ISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLS
:. :.:::....:. : ::: . .. . :::: .: .:. . .::.:
CCDS60 DFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKC-----
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270 280 290 300 310
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.:. :.. : ..: .: .: : :.: .:
CCDS60 --PACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVW-RISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCW
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 HFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLT
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CCDS38 TVKGKVPLQFSGQNEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAMFKQAMRHWE
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100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LKTCIDFKPWAGETNYIS-VFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHAL
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CCDS38 KHTCVTFIERSDEESYIVFTYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVI
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 GFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQN
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CCDS38 GFWHEHTRPDRDNHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARNTFSR
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 GTE-PTIVTRISD--FEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGM
: ::. .: .. .:::: .: .:. . .:: : . :. :.. :
CCDS38 GMFLDTILPSRDDNGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPA-------CGETLQESNGN
310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 IQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPK
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CCDS38 LSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEKIVLNFTTMDLYKSSLCWYDYIEVRDGYWRKSPL
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CCDS47 LTPYTTFGAGDMASRIIHYTEPINSPNLSDNTCHFEDEKICGYTQDLTDNFDWTRQNALT
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CCDS47 QNPKRSPNTGPPTDISGTPE----GYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAKFYCVSF
790 800 810 820 830
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CCDS47 FYHMYGKHIGSLNLLVRSRNKGALD---THAWSLSGNKGNVWQQAHVPISPSGPFQIIFE
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CCDS47 GVRGPGY-LGDIAIDDVTLKKGECPRKQTDPNKVVVMPGSGAPCQSSPQLWGPMAIFLLA
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CCDS47 LQR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]