Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2528
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2528, 449 aa
1>>>pF1KE2528 449 - 449 aa - 449 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0583+/-0.000738; mu= 19.6481+/- 0.045
mean_var=68.9713+/-14.006, 0's: 0 Z-trim(108.6): 75 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.154433
statistics sampled from 10274 (10350) to 10274 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 3026 683.0 1.6e-196
CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 3000 677.3 8.9e-195
CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 2523 571.0 8.7e-163
CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 2387 540.7 1.2e-153
CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 2337 529.5 2.6e-150
CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 2331 528.2 6.6e-150
CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 2070 470.0 2e-132
CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 2008 456.2 2.5e-128
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 1170 269.6 5.2e-72
CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 987 228.6 6.7e-60
CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 983 227.9 1.7e-59
CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 954 221.4 1.5e-57
CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 943 219.0 8.4e-57
CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 940 218.3 1.4e-56
CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 938 217.8 1.8e-56
CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 936 217.4 2.4e-56
CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 935 217.2 2.9e-56
CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 935 217.2 2.9e-56
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 927 215.4 9.4e-56
CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 927 215.4 9.6e-56
CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 920 213.8 2.9e-55
CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 920 213.8 3e-55
CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 910 211.6 1.4e-54
CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 905 210.5 2.9e-54
CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 901 209.5 4.8e-54
CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 902 209.9 5.9e-54
CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 876 204.1 3e-52
CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 873 203.4 4.1e-52
CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 872 203.1 4.7e-52
CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 866 201.8 1.3e-51
CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 855 199.4 6.9e-51
CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 854 199.1 7.9e-51
CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 845 197.1 3.1e-50
CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 807 188.6 9.8e-48
CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 806 188.4 1.3e-47
CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 787 184.1 2.1e-46
CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 787 184.2 2.6e-46
CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 680 160.2 2.5e-39
CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 465 112.5 1e-24
CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 438 106.3 3.8e-23
CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 305 76.8 5.4e-14
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 303 76.4 7.2e-14
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 289 73.2 6e-13
CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs108|chr15 ( 531) 281 71.5 2.3e-12
CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 280 71.3 2.6e-12
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 279 71.0 2.9e-12
CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2 ( 457) 269 68.8 1.3e-11
CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 489) 263 67.5 3.5e-11
CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 505) 263 67.5 3.6e-11
CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs108|chr15 ( 498) 262 67.3 4.1e-11
>>CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (449 aa)
initn: 3026 init1: 3026 opt: 3026 Z-score: 3641.7 bits: 683.0 E(32554): 1.6e-196
Smith-Waterman score: 3026; 100.0% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (1-449:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDPSMLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDPSMLDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPMDVQTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPMDVQTC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKFTCIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKFTCIEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKEDEAGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKEDEAGEG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISR
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE2 IGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
430 440
>>CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (457 aa)
initn: 2371 init1: 2371 opt: 3000 Z-score: 3610.3 bits: 677.3 E(32554): 8.9e-195
Smith-Waterman score: 3000; 98.2% identity (98.2% similar) in 457 aa overlap (1-449:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDPSMLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDPSMLDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPMDVQTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPMDVQTC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKFTCIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKFTCIEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE2 SLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHK-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKSPMLNLF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 -EDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRA
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE2 KKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
430 440 450
>>CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 (449 aa)
initn: 2454 init1: 2111 opt: 2523 Z-score: 3036.0 bits: 571.0 E(32554): 8.7e-163
Smith-Waterman score: 2523; 83.9% identity (94.8% similar) in 441 aa overlap (9-449:14-447)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR
.:.::. ...::.:.::...::: :::::::::::::::::::::
CCDS43 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 IRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDP
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS43 IRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAYSEYPDDSLDLDP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPM
:::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::.::::.::::::::::
CCDS43 SMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCPMDLKNFPM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKF
::::::::::::::::::::::::... ::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS43 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRYCTKHYNTGKF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQS
::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
CCDS43 TCIEVRFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTTQS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. :.:
CCDS43 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRKN-KDD
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRAKKI
:. :.::.:.:::::: :::::::.. :: :. . : :::.::::.::.:::::
CCDS43 EVRESRFSFTAYGMGP-CLQAKDGMTPKGPNHPVQVMP-----KSPDEMRKVFIDRAKKI
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE2 DKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
: ::: ::.::::::.:::.::::.:.::.:.:
CCDS43 DTISRACFPLAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD
420 430 440
>>CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 (464 aa)
initn: 2457 init1: 2136 opt: 2387 Z-score: 2872.1 bits: 540.7 E(32554): 1.2e-153
Smith-Waterman score: 2494; 81.3% identity (91.9% similar) in 455 aa overlap (9-449:14-462)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR
.:.::. ...::.:.::...::: :::::::::::::::::::::
CCDS38 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 IRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDP
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS38 IRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAYSEYPDDSLDLDP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPM
:::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::.::::.::::::::::
CCDS38 SMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCPMDLKNFPM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKF
::::::::::::::::::::::::... ::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS38 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRYCTKHYNTGKF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQS
::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
CCDS38 TCIEVRFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTTQS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKE-
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... :
CCDS38 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRKNKTEA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KE2 -------------DEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSP
::. :.::.:.:::::: :::::::.. :: :. . : :::
CCDS38 FALEKFYRFSDMDDEVRESRFSFTAYGMGP-CLQAKDGMTPKGPNHPVQVMP-----KSP
370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KE2 EEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
.::::.::.:::::: ::: ::.::::::.:::.::::.:.::.:.:
CCDS38 DEMRKVFIDRAKKIDTISRACFPLAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD
420 430 440 450 460
>>CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (452 aa)
initn: 2236 init1: 1988 opt: 2337 Z-score: 2812.0 bits: 529.5 E(32554): 2.6e-150
Smith-Waterman score: 2337; 79.9% identity (91.5% similar) in 437 aa overlap (18-449:22-452)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKP---MSPSDFLDKLMGRTSGYD
: : :. .. ::. .: .:::::::::::::::::
CCDS48 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDS-RSGKQPSQTLSPSDFLDKLMGRTSGYD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDL
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS48 ARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDSRLAYSEYPDDSLDL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNF
:::::::::::::::::::::.::..::::::::::.::.::::::.::::.::::::::
CCDS48 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLKNF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG
::::::: ::::::::::::::::: .: ::::.:::::::::::::.: :::::::::
CCDS48 PMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQFILKEEKELGYCTKHYNTG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT
::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS48 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRR--KRRH
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:: ::..
CCDS48 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFVSRQHKEFLRLRRRQKRQN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HKEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQR
..:: . :.:::::.:::: :::.::: .:: .. .:: : : :. . ..: :..:
CCDS48 KEEDVTRESRFNFSGYGMGH-CLQVKDGTAVK----ATPANPLPQPPKDGDAIKKKFVDR
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE2 AKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
::.:: ::: .::.::::::.:::: :::.:.::::..
CCDS48 AKRIDTISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK
420 430 440 450
>>CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (452 aa)
initn: 2230 init1: 1982 opt: 2331 Z-score: 2804.8 bits: 528.2 E(32554): 6.6e-150
Smith-Waterman score: 2331; 79.4% identity (91.5% similar) in 437 aa overlap (18-449:22-452)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKP---MSPSDFLDKLMGRTSGYD
: : :. .. ::. .: .:::::::::::::::::
CCDS14 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDS-RSGKQPSQTLSPSDFLDKLMGRTSGYD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDL
::::::::::::::.::::::::::..:::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS14 ARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSVTETTMDYRVNIFLRQQWNDSRLAYSEYPDDSLDL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNF
:::::::::::::::::::::.::..::::::::::.::.::::::.::::.::::::::
CCDS14 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLKNF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG
::::::: ::::::::::::::::: .: ::::.:::::::::::::.: :::::::::
CCDS14 PMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQFILKEEKELGYCTKHYNTG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT
::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRR--KRRH
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:: ::..
CCDS14 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFVSRQHKEFLRLRRRQKRQN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HKEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQR
..:: . :.:::::.:::: :::.::: .:: .. .:: : : :. . ..: :..:
CCDS14 KEEDVTRESRFNFSGYGMGH-CLQVKDGTAVK----ATPANPLPQPPKDGDAIKKKFVDR
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE2 AKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
::.:: ::: .::.::::::.:::: :::.:.::::..
CCDS14 AKRIDTISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK
420 430 440 450
>>CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX (417 aa)
initn: 2031 init1: 1056 opt: 2070 Z-score: 2491.0 bits: 470.0 E(32554): 2e-132
Smith-Waterman score: 2070; 76.3% identity (89.7% similar) in 409 aa overlap (9-409:12-416)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETI--VFFSLA-ASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDA
: :: :.. .: :..:.... .. .::::::::::::::::::::
CCDS43 MTTLVPATLSFLLLWTLPGQVLLRVALAKEEVKSGTKGSQPMSPSDFLDKLMGRTSGYDA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLD
:::::::::::::.::::::::.::..::::::::.:::::::::::.: ::::::::::
CCDS43 RIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFSSITKTTMDYRVNVFLRQQWNDPRLSYREYPDDSLDLD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFP
::::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::.:: :.: :::::::
CCDS43 PSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLILSCLMDLKNFP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 MDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQG-AVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG
::.::: ::::::::::.::.::: :.. :::::.:::::::::..:::: ::::::::
CCDS43 MDIQTCTMQLESFGYTMKDLVFEWLEDAPAVQVAEGLTLPQFILRDEKDLGCCTKHYNTG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT
::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHK
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::..:.::..:...
CCDS43 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAINFVSRQHKEFIRLRRRQRRQR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KE2 --EDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNP-PPAPS-KSPEEMRKLFI
:: :.:: : .::.: ::::.:: ..: :. .: :::: . : :::..
CCDS43 LEEDIIQESRFYFRGYGLGH-CLQARDGGPMEG---SGIYSPQPPAPLLREGETTRKLYV
370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KE2 QRAKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
CCDS43 D
>>CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (363 aa)
initn: 1912 init1: 1664 opt: 2008 Z-score: 2417.2 bits: 456.2 E(32554): 2.5e-128
Smith-Waterman score: 2008; 80.7% identity (92.7% similar) in 368 aa overlap (84-449:1-363)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDL
::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS55 MDYRVNIFLRQQWNDSRLAYSEYPDDSLDL
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNF
:::::::::::::::::::::.::..::::::::::.::.::::::.::::.::::::::
CCDS55 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLKNF
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG
::::::: ::::::::::::::::: .: ::::.:::::::::::::.: :::::::::
CCDS55 PMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQFILKEEKELGYCTKHYNTG
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT
::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRR--KRRH
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:: ::..
CCDS55 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFVSRQHKEFLRLRRRQKRQN
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HKEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQR
..:: . :.:::::.:::: :::.::: .:: .. .:: : : :. . ..: :..:
CCDS55 KEEDVTRESRFNFSGYGMGH-CLQVKDGTAVK----ATPANPLPQPPKDGDAIKKKFVDR
280 290 300 310 320
420 430 440
pF1KE2 AKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
::.:: ::: .::.::::::.:::: :::.:.::::..
CCDS55 AKRIDTISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK
330 340 350 360
>>CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (497 aa)
initn: 1235 init1: 438 opt: 1170 Z-score: 1406.3 bits: 269.6 E(32554): 5.2e-72
Smith-Waterman score: 1206; 44.8% identity (67.5% similar) in 462 aa overlap (22-438:41-496)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG
... :: .: : :..:..:. .
CCDS37 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD
:: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .:
CCDS37 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD
.: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.:
CCDS37 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT
: ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: ::
CCDS37 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT
:.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: :::
CCDS37 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIF
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHK--ELLR
.::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . . : : .
CCDS37 SVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380
pF1KE2 FRRKRRHHKEDEAGEGRFNFSAYGMG-PA---------------CLQAKD----GISVKG
: . .. . ..:. . .. : : :. : . .: .:. :
CCDS37 ARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420
pF1KE2 A-------NNSNTTNPP-----------PAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMA
. .: . . : .:.: . .. ::.:: .: ::.
CCDS37 SLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFC
430 440 450 460 470 480
430 440
pF1KE2 FLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
::.::..:: ::
CCDS37 FLFFNVIYWSIYL
490
>>CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (303 aa)
initn: 955 init1: 424 opt: 987 Z-score: 1188.9 bits: 228.6 E(32554): 6.7e-60
Smith-Waterman score: 987; 56.7% identity (77.6% similar) in 268 aa overlap (22-284:41-302)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG
... :: .: : :..:..:. .
CCDS54 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD
:: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .:
CCDS54 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD
.: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.:
CCDS54 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT
: ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: ::
CCDS54 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT
:.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::
CCDS54 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGW
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFR
449 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:28:01 2016 done: Tue Nov 8 03:28:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]