Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2514
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2514, 894 aa
1>>>pF1KE2514 894 - 894 aa - 894 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.6359+/-0.00111; mu= -15.0407+/- 0.066
mean_var=633.6293+/-151.254, 0's: 0 Z-trim(117.5): 201 B-trim: 848 in 1/52
Lambda= 0.050951
statistics sampled from 18017 (18251) to 18017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.82), E-opt: 0.2 (0.561), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9950.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 ( 894) 6275 476.8 7.5e-134
CCDS9949.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 ( 823) 4785 367.3 6.6e-101
CCDS1862.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 835) 2921 230.3 1.2e-59
CCDS1861.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 773) 2345 187.9 6.2e-47
>>CCDS9950.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 (894 aa)
initn: 6275 init1: 6275 opt: 6275 Z-score: 2516.5 bits: 476.8 E(32554): 7.5e-134
Smith-Waterman score: 6275; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 MDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 AGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE2 RHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS
850 860 870 880 890
>>CCDS9949.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 (823 aa)
initn: 4785 init1: 4785 opt: 4785 Z-score: 1925.0 bits: 367.3 E(32554): 6.6e-101
Smith-Waterman score: 5605; 92.1% identity (92.1% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC
:::::::::::::::::::::::
CCDS99 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAG-------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 ----------------------------------KDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPA
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 MDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPP
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHK
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 AGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEE
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAP
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRH
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLG
650 660 670 680 690 700
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLT
710 720 730 740 750 760
850 860 870 880 890
pF1KE2 RHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS
770 780 790 800 810 820
>>CCDS1862.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 (835 aa)
initn: 2489 init1: 860 opt: 2921 Z-score: 1184.5 bits: 230.3 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 3459; 61.4% identity (77.8% similar) in 910 aa overlap (1-889:1-835)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
:::::::.:::::.::. .:: .:: :: .:: . . :: : : :::::::
CCDS18 MSRRKQGKPQHLSKREF-SPEP--LEA-ILTDDE----PDHGPLGAPEG--DHDLLTCGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
:::::::::::.:::::::::.::: : .::.:: :: : :..:.:.:::.:::::
CCDS18 CQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSL--CLEKAVDK--PPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVT
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC
:..:: : . ..:::::::.:: : ..:: : :::
CCDS18 PEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLL----------------HWRGLSSPRSAHGAL---
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
.: : ::. :: : : ::::::: ::::::::.:::::::::
CCDS18 IPTPGMSAE-------------YAPQGI-C----KDEPSSYTCTTCKQPFTSAWFLLQHA
150 160 170 180
250 260 270 280 290
pF1KE2 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNF-LGDSNPFNLLRMTGPIL
:::::.::::: . .: ::::. :: :: : .: :: .. ..:.:::::::. : .
CCDS18 QNTHGLRIYLE-SEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNLLRIPGSVS
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RDHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHR---LSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAI
:. :..:::.: ::::::::::::::::: :.::::.:...::::::::.::::::.
CCDS18 REASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRVLRLNPMAM
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DSPAMDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGG
. :::::::::::::::.:.:: .:::: .::.:::.::::. : :::.::::::. ..
CCDS18 EPPAMDFSRRLRELAGNTSSPP-LSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPLPPLQ-SA
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 TPPPQPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKT
:: :::.::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::.:::::::::::
CCDS18 PPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKLKRHMKT
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520
pF1KE2 HMHKAGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEG---LKAADGDFRHHESDPSL----GHE
::::.. .. .::::::.:::::::::.:.: . ::.. . :. :.::.: : :
CCDS18 HMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKS-ENDPNLIPENGDE
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 PEEED----EEEEEEEEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGG-GGVPGVPGAGGGAA
:::: ::::::::: : :.: : . .:... : .:..::.. :.: :: : .
CCDS18 EEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESE-RVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGV----GDES
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 KALADEKALVLGKVMENVGLGALPQYGE----LLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAG
.:: : ::... :... ...: .:..:.::: : .: : :. :.:...
CCDS18 RALPD--------VMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRG-HLAEAEGHRDTCDEDSVA
550 560 570 580 590
650 660 670 680 690
pF1KE2 GCGDAGAGGAVNGRGGGFAPGTEPFPGLFPRKPAPLPSPG-LNSAAKRIKVEKDLELPPA
: .: :.::::: .:: :: : : ::. :. .::::.::...::::
CCDS18 GESDRIDDGTVNGRG--CSPGESASGGL--SKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPA
600 610 620 630 640
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 ALIPSENVYSQWLVGYAASRHFMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDL
:. .::::::::.::::::. .:::::.: :.::::::.::::::::::::::::::.:
CCDS18 AMPNTENVYSQWLAGYAASRQ-LKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGEL
650 660 670 680 690 700
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 LDGGLSGRSGTASGGSTPHLGGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHT
:::.::::::.:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 -DGGISGRSGTGSGGSTPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHT
710 720 730 740 750 760
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 GERPYKCELCNYACAQSSKLTRHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGE
:::::::::::::::::::::::::::::.::.::.:.::.:::::::::::::::::..
CCDS18 GERPYKCELCNYACAQSSKLTRHMKTHGQVGKDVYKCEICKMPFSVYSTLEKHMKKWHSD
770 780 790 800 810 820
880 890
pF1KE2 HLLTNDVKIEQAERS
..:.::.: :
CCDS18 RVLNNDIKTE
830
>>CCDS1861.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 (773 aa)
initn: 1873 init1: 615 opt: 2345 Z-score: 956.1 bits: 187.9 E(32554): 6.2e-47
Smith-Waterman score: 2862; 58.6% identity (75.5% similar) in 819 aa overlap (1-798:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
:::::::.:::::.::. .:: .:: :: .:: . . :: : : :::::::
CCDS18 MSRRKQGKPQHLSKREF-SPEP--LEA-ILTDDE----PDHGPLGAPEG--DHDLLTCGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
:::::::::::.:::::::::.::: : .::.:: :: : :..:.:.:::.:::::
CCDS18 CQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSL--CLEKAVDK--PPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVT
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC
:..:: : . ..:::::::.:: : ..:: : :::
CCDS18 PEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLL----------------HWRGLSSPRSAHGAL---
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
.: : ::. :: : : ::::::: ::::::::.:::::::::
CCDS18 IPTPGMSAE-------------YAPQGI-C----KDEPSSYTCTTCKQPFTSAWFLLQHA
150 160 170 180
250 260 270 280 290
pF1KE2 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNF-LGDSNPFNLLRMTGPIL
:::::.::::: . .: ::::. :: :: : .: :: .. ..:.:::::::. : .
CCDS18 QNTHGLRIYLE-SEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNLLRIPGSVS
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RDHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHR---LSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAI
:. :..:::.: ::::::::::::::::: :.::::.:...::::::::.::::::.
CCDS18 REASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRVLRLNPMAM
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DSPAMDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGG
. :::::::::::::::.:.:: .:::: .::.:::.::::. : :::.::::::. ..
CCDS18 EPPAMDFSRRLRELAGNTSSPP-LSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPLPPLQ-SA
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 TPPPQPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKT
:: :::.::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::.:::::::::::
CCDS18 PPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKLKRHMKT
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520
pF1KE2 HMHKAGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEG---LKAADGDFRHHESDPSL----GHE
::::.. .. .::::::.:::::::::.:.: . ::.. . :. :.::.: : :
CCDS18 HMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKS-ENDPNLIPENGDE
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 PEEED----EEEEEEEEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGG-GGVPGVPGAGGGAA
:::: ::::::::: : :.: : . .:... : .:..::.. :.: :: : .
CCDS18 EEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESE-RVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGV----GDES
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 KALADEKALVLGKVMENVGLGALPQYGE----LLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAG
.:: : ::... :... ...: .:..:.::: : .: : :. :.:...
CCDS18 RALPD--------VMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRG-HLAEAEGHRDTCDEDSVA
550 560 570 580 590
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pF1KE2 GCGDAGAGGAVNGRGGGFAPGTEPFPGLFPRKPAPLPSPG-LNSAAKRIKVEKDLELPPA
: .: :.::::: .:: :: : : ::. :. .::::.::...::::
CCDS18 GESDRIDDGTVNGRG--CSPGESASGGL--SKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPA
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:. .::::::::.::::::. .:::::.: :.::::::.::::::::::::::::::.:
CCDS18 AMPNTENVYSQWLAGYAASRQ-LKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGEL
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:::.::::::.:::::::..::::::::::::::::::
CCDS18 -DGGISGRSGTGSGGSTPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSD
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