Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2481
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2481, 472 aa
1>>>pF1KE2481 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8025+/-0.000837; mu= 3.2689+/- 0.051
mean_var=187.0480+/-37.328, 0's: 0 Z-trim(114.5): 20 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.093777
statistics sampled from 15079 (15097) to 15079 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.464), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12666.1 RTN2 gene_id:6253|Hs108|chr19 ( 472) 3097 430.9 1.4e-120
CCDS12665.1 RTN2 gene_id:6253|Hs108|chr19 ( 545) 1850 262.3 9.4e-70
CCDS46114.1 RTN2 gene_id:6253|Hs108|chr19 ( 205) 1249 180.7 1.3e-45
CCDS9740.1 RTN1 gene_id:6252|Hs108|chr14 ( 776) 695 106.1 1.4e-22
CCDS42683.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 ( 392) 676 103.3 4.7e-22
CCDS9741.1 RTN1 gene_id:6252|Hs108|chr14 ( 208) 640 98.3 8.1e-21
CCDS1851.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 ( 373) 631 97.2 3.1e-20
CCDS1852.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 ( 986) 626 96.8 1.1e-19
CCDS42684.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 (1192) 626 96.9 1.3e-19
CCDS42685.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 ( 199) 606 93.7 1.9e-19
CCDS41664.1 RTN3 gene_id:10313|Hs108|chr11 ( 255) 563 87.9 1.3e-17
CCDS8049.1 RTN3 gene_id:10313|Hs108|chr11 ( 236) 558 87.3 2e-17
CCDS58142.1 RTN3 gene_id:10313|Hs108|chr11 ( 920) 569 89.1 2.2e-17
CCDS8050.1 RTN3 gene_id:10313|Hs108|chr11 (1013) 569 89.1 2.3e-17
CCDS58141.1 RTN3 gene_id:10313|Hs108|chr11 (1032) 569 89.1 2.4e-17
CCDS8048.1 RTN3 gene_id:10313|Hs108|chr11 ( 241) 464 74.5 1.4e-13
>>CCDS12666.1 RTN2 gene_id:6253|Hs108|chr19 (472 aa)
initn: 3097 init1: 3097 opt: 3097 Z-score: 2278.4 bits: 430.9 E(32554): 1.4e-120
Smith-Waterman score: 3097; 100.0% identity (100.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGQVLPVFAHCKEAPSTASSTPDSTEGGNDDSDFRELHTAREFSEEDEEETTSQDWGTPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGQVLPVFAHCKEAPSTASSTPDSTEGGNDDSDFRELHTAREFSEEDEEETTSQDWGTPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQGRSVSEPRDQHPQPSLGDSLESIPSLSQSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQGRSVSEPRDQHPQPSLGDSLESIPSLSQSPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PGRRGDPDTAPPSERPLEDLRLRLDHLGWVARGTGSGEDSSTSSSTPLEDEEPQEPNRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGRRGDPDTAPPSERPLEDLRLRLDHLGWVARGTGSGEDSSTSSSTPLEDEEPQEPNRLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLTPQLSPGSGTPQAGTPSPSRSRDSNSGPEEPLLEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLTPQLSPGSGTPQAGTPSPSRSRDSNSGPEEPLLEEEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KQWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLLVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLLVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE2 LYRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
430 440 450 460 470
>>CCDS12665.1 RTN2 gene_id:6253|Hs108|chr19 (545 aa)
initn: 1849 init1: 1849 opt: 1850 Z-score: 1365.7 bits: 262.3 E(32554): 9.4e-70
Smith-Waterman score: 2699; 85.5% identity (85.5% similar) in 504 aa overlap (1-431:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGQVLPVFAHCKEAPSTASSTPDSTEGGNDDSDFRELHTAREFSEEDEEETTSQDWGTPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGQVLPVFAHCKEAPSTASSTPDSTEGGNDDSDFRELHTAREFSEEDEEETTSQDWGTPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQGRSVSEPRDQHPQPSLGDSLESIPSLSQSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQGRSVSEPRDQHPQPSLGDSLESIPSLSQSPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PGRRGDPDTAPPSERPLEDLRLRLDHLGWVARGTGSGEDSSTSSSTPLEDEEPQEPNRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGRRGDPDTAPPSERPLEDLRLRLDHLGWVARGTGSGEDSSTSSSTPLEDEEPQEPNRLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLTPQLSPGSGTPQAGTPSPSRSRDSNSGPEEPLLEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLTPQLSPGSGTPQAGTPSPSRSRDSNSGPEEPLLEEEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE2 KQWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLL-----------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLLGTAMEWLKTSLLLAVYKTVPILELSPPLW
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE2 --------------------------------------------VADLLYWKDTRTSGVV
::::::::::::::::
CCDS12 TAIGWVQRGPTPPTPVLRVLLKWAKSPRSSGVPSLSLGADMGSKVADLLYWKDTRTSGVV
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 FTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVD
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LTLTREQTERLSHQITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LTLTREQTERLSHQITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTL
430 440 450 460 470 480
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 LILGVIGLFTIPLLYRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGS
::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LILGVIGLFTIPLLYRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGS
490 500 510 520 530 540
>>CCDS46114.1 RTN2 gene_id:6253|Hs108|chr19 (205 aa)
initn: 1249 init1: 1249 opt: 1249 Z-score: 932.6 bits: 180.7 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1249; 100.0% identity (100.0% similar) in 201 aa overlap (272-472:5-205)
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLLVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGSKVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHF
10 20 30
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQ
40 50 60 70 80 90
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLL
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470
pF1KE2 YRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
160 170 180 190 200
>>CCDS9740.1 RTN1 gene_id:6252|Hs108|chr14 (776 aa)
initn: 723 init1: 640 opt: 695 Z-score: 518.9 bits: 106.1 E(32554): 1.4e-22
Smith-Waterman score: 714; 36.6% identity (63.1% similar) in 407 aa overlap (83-453:381-770)
60 70 80 90 100
pF1KE2 SQDWGTPRELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQGRS----VSEPRDQHPQPSL-GD
: ::. ..:: . : :.. . . ::
CCDS97 ISEDELITAIKEAKGLSYETAENPRPVGQLADRPEVKARSGPPTIPSPLDHEASSAESGD
360 370 380 390 400 410
110 120 130 140 150
pF1KE2 S-LESI---PSLSQSPEP------GRRGDPDTAPPSERPL-----EDLRLRLDHLGWVAR
: .: . : ... : :. : : .: : :. . .:: .
CCDS97 SEIELVSEDPMAAEDALPSGYVSFGHVGGPPPSPASPSIQYSILREEREAELDSELIIE-
420 430 440 450 460
160 170 180 190 200
pF1KE2 GTGSGEDSSTSSSTPL--EDEEPQEPN-----RLETG-EAGEELDLRLRLAQPSS----P
: . ::.: .: .: :..:. : ::: .: :. : ::.:.: :
CCDS97 ---SCDASSASEESPKREQDSPPMKPSALDAIREETGVRAEERAPSRRGLAEPGSFLDYP
470 480 490 500 510 520
210 220 230 240 250
pF1KE2 EVLT---PQLSPGSGTPQAGTPS-PSRSRDSNSGPEEPLLEEEEKQWGPLEREPVRGQCL
. :.: ::.:. . :: : . ....:. . : . :: :
CCDS97 STEPQPGPELPPGDGALEPETPMLPRKPEEDSSSNQSPAATKGPGPLGPGAPPP------
530 540 550 560 570 580
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 DSTDQLEFTVEPRLLVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHLALLLLC
: : . . . :::::.: . .:.:: .... :. : .::.:::.:.::: :
CCDS97 -----LLFLNKQKAI--DLLYWRDIKQTGIVFGSFLLLLFSLTQFSVVSVVAYLALAALS
590 600 610 620 630
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQITSRVVSAATQLRHF
.:::.:.:..:::::.. : ..::.:::....::..:: .. . . : :. .::..
CCDS97 ATISFRIYKSVLQAVQKTDEGHPFKAYLELEITLSQEQIQKYTDCLQFYVNSTLKELRRL
640 650 660 670 680 690
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 FLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLLYRQHQAQIDQYVGLV
:::.:::::::.:.:...::.:::.:::::::...:...::.:..: .::::::::.:::
CCDS97 FLVQDLVDSLKFAVLMWLLTYVGALFNGLTLLLMAVVSMFTLPVVYVKHQAQIDQYLGLV
700 710 720 730 740 750
440 450 460 470
pF1KE2 TNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
.... . :::.:::::
CCDS97 RTHINAVVAKIQAKIPGAKRHAE
760 770
>>CCDS42683.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 (392 aa)
initn: 652 init1: 606 opt: 676 Z-score: 509.4 bits: 103.3 E(32554): 4.7e-22
Smith-Waterman score: 679; 35.5% identity (62.2% similar) in 394 aa overlap (81-453:12-386)
60 70 80 90 100
pF1KE2 TTSQDWGTPRELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQG----RSVSEPRDQHPQP---
:. :::: . : ::.:.. .
CCDS42 MEDLDQSPLVSSSDSPPRPQPAFKYQFVREPEDEEEEEEEE
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 --SLGDSLESIPSLSQSPEPGRRGDP-DTAPPSERPLEDLRLRLDHLGWVARGTGSGEDS
. ..:: . : ..: : . : ::: . :: :. : . . ::
CCDS42 EEDEDEDLEELEVLERKPAAGLSAAPVPTAPAAGAPLMDFG--NDFVPPAPRG-------
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 STSSSTPLEDEEPQEPNRLETGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLTPQLSPGSGTPQAGTPS
:: : :.: . . . .. . .: : ...:. : . : : :
CCDS42 ------PLPAAPPVAPERQPSWDPSP-VSSTVPAPSPLSAAAVSPSKLPEDDEPPARPPP
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270
pF1KE2 PSRSRDSNSGPEEPLLEEEEKQWGPLEREPV----RGQCLDSTDQLEFTV----EPRL--
: . : : ::. . :. ::. :.:. :.. :: .
CCDS42 PPPA--SVSPQAEPVWTPPAPAPAAPPSTPAAPKRRGSS-GSVDETLFALPAASEPVIRS
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320
pF1KE2 -LVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQ
:.:::::.: . .:::: . . :: : ::::::.:..:: :: :::.:.:. :.:
CCDS42 SAVVDLLYWRDIKKTGVVFGASLFLLLSLTVFSIVSVTAYIALALLSVTISFRIYKGVIQ
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 AVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLA
:....: ..::.:::. ......: ... :.. ..: . .::..:::.:::::::.:
CCDS42 AIQKSDEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSNSALGHVNCTIKELRRLFLVDDLVDSLKFA
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLLYRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRA
.:....:.:::.:::::::::..:.::..:..:..::::::.:.::...... :::.:
CCDS42 VLMWVFTYVGALFNGLTLLILALISLFSVPVIYERHQAQIDHYLGLANKNVKDAMAKIQA
330 340 350 360 370 380
450 460 470
pF1KE2 KIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
::::
CCDS42 KIPGLKRKAE
390
>>CCDS9741.1 RTN1 gene_id:6252|Hs108|chr14 (208 aa)
initn: 640 init1: 640 opt: 640 Z-score: 487.2 bits: 98.3 E(32554): 8.1e-21
Smith-Waterman score: 640; 51.7% identity (86.1% similar) in 180 aa overlap (274-453:23-202)
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLLVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHFSI
:::::.: . .:.:: .... :. : .::.
CCDS97 MQATADSTKMDCVWSNWKSQAIDLLYWRDIKQTGIVFGSFLLLLFSLTQFSV
10 20 30 40 50
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQIT
:::.:.::: : .:::.:.:..:::::.. : ..::.:::....::..:: .. . .
CCDS97 VSVVAYLALAALSATISFRIYKSVLQAVQKTDEGHPFKAYLELEITLSQEQIQKYTDCLQ
60 70 80 90 100 110
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLLYR
: :. .::..:::.:::::::.:.:...::.:::.:::::::...:...::.:..:
CCDS97 FYVNSTLKELRRLFLVQDLVDSLKFAVLMWLLTYVGALFNGLTLLLMAVVSMFTLPVVYV
120 130 140 150 160 170
430 440 450 460 470
pF1KE2 QHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
.::::::::.::: .... . :::.:::::
CCDS97 KHQAQIDQYLGLVRTHINAVVAKIQAKIPGAKRHAE
180 190 200
>>CCDS1851.1 RTN4 gene_id:57142|Hs108|chr2 (373 aa)
initn: 653 init1: 607 opt: 631 Z-score: 476.9 bits: 97.2 E(32554): 3.1e-20
Smith-Waterman score: 677; 34.7% identity (61.9% similar) in 383 aa overlap (81-453:12-367)
60 70 80 90 100
pF1KE2 TTSQDWGTPRELTFSYIAFDGVVGSGGRRDSTARRPRPQG----RSVSEPRDQHPQP---
:. :::: . : ::.:.. .
CCDS18 MEDLDQSPLVSSSDSPPRPQPAFKYQFVREPEDEEEEEEEE
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 --SLGDSLESIPSLSQSPEPGRRGDP-DTAPPSERPLEDLRLRLDHLGWVARGTGSGEDS
. ..:: . : ..: : . : ::: . :: :. : . . ::
CCDS18 EEDEDEDLEELEVLERKPAAGLSAAPVPTAPAAGAPLMDFG--NDFVPPAPRG-------
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 STSSSTPLEDEEPQEPNRLETGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLTPQLSPGSGTPQAGTPS
:: : :.: . . . .. . .: : ...:. : . : : :
CCDS18 ------PLPAAPPVAPERQPSWDPSP-VSSTVPAPSPLSAAAVSPSKLPEDDEPPARPPP
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 PSRSRDSNSGPEEPLLEEEEKQWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVEPRLLVADLLYWKD
: : . . : : : :. .. . . . .:.:::::.:
CCDS18 P---------PPASVSPQAEPVWTPPAPAPAAPPSTPAAPKRRGSSGS--VVVDLLYWRD
150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 TRTSGVVFTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPF
. .:::: . . :: : ::::::.:..:: :: :::.:.:. :.::....: ..::
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470
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CCDS18 KRKAE
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Smith-Waterman score: 626; 40.1% identity (74.0% similar) in 269 aa overlap (189-453:918-1186)
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DSSTSSSTPLEDEEPQEPNRLETGEAGEELDLRLRLAQPSSPEVLT--PQLSP-GSGTPQ
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CCDS42 EYTDLEVSHKSEIANAPDGAGSLPCTELPHDLSLKNIQPKVEEKISFSDDFSKNGSATSK
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220 230 240 250 260 270
pF1KE2 AGTPSPSRSRDSNSGPEEPLLEEEEKQWGPLEREPVRGQCLDSTDQLEFTVE-PRLLVAD
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CCDS42 VLLLPPDVSALATQAEIESIVKPKVLVKEAEKKLPSDTEKEDRSPSAIFSAELSKTSVVD
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pF1KE2 LLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRG
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CCDS42 LLYWRDIKKTGVVFGASLFLLLSLTVFSIVSVTAYIALALLSVTISFRIYKGVIQAIQKS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KE2 DGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYI
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CCDS42 DEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSNSALGHVNCTIKELRRLFLVDDLVDSLKFAVLMWV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KE2 LTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLLYRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGT
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CCDS42 FTYVGALFNGLTLLILALISLFSVPVIYERHQAQIDHYLGLANKNVKDAMAKIQAKIPGL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
460 470
pF1KE2 GALASAAAAVSGSKAKAE
CCDS42 KRKAE
1190
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CCDS42 MDGQKKNWKDKVVDLLYWRDIKKTGVVFGASLFLLLSLTVF
10 20 30 40
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SIVSVAAHLALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSHQ
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CCDS42 SIVSVTAYIALALLSVTISFRIYKGVIQAIQKSDEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSNS
50 60 70 80 90 100
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pF1KE2 ITSRVVSAATQLRHFFLVEDLVDSLKLALLFYILTFVGAIFNGLTLLILGVIGLFTIPLL
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110 120 130 140 150 160
430 440 450 460 470
pF1KE2 YRQHQAQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE
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CCDS42 YERHQAQIDHYLGLANKNVKDAMAKIQAKIPGLKRKAE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]