Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2474
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2474, 1333 aa
1>>>pF1KE2474 1333 - 1333 aa - 1333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2972+/-0.00106; mu= 23.0723+/- 0.064
mean_var=71.7751+/-14.181, 0's: 0 Z-trim(103.5): 21 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.151387
statistics sampled from 7451 (7459) to 7451 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 5.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1775.1 XDH gene_id:7498|Hs108|chr2 (1333) 8939 1962.7 0
CCDS33360.1 AOX1 gene_id:316|Hs108|chr2 (1338) 4523 998.2 0
>>CCDS1775.1 XDH gene_id:7498|Hs108|chr2 (1333 aa)
initn: 8939 init1: 8939 opt: 8939 Z-score: 10540.5 bits: 1962.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8939; 100.0% identity (100.0% similar) in 1333 aa overlap (1-1333:1-1333)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTADKLVFFVNGRKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MTADKLVFFVNGRKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LQNKIVHFSANACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERIAKSHGSQCGFCTPGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LQNKIVHFSANACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERIAKSHGSQCGFCTPGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VMSMYTLLRNQPEPTMEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFARDGGCCGGDGNNPNCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VMSMYTLLRNQPEPTMEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFARDGGCCGGDGNNPNCC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MNQKKDHSVSLSPSLFKPEEFTPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPRKQLRFEGERVTWIQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MNQKKDHSVSLSPSLFKPEEFTPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPRKQLRFEGERVTWIQAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TLKELLDLKAQHPDAKLVVGNTEIGIEMKFKNMLFPMIVCPAWIPELNSVEHGPDGISFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TLKELLDLKAQHPDAKLVVGNTEIGIEMKFKNMLFPMIVCPAWIPELNSVEHGPDGISFG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AACPLSIVEKTLVDAVAKLPAQKTEVFRGVLEQLRWFAGKQVKSVASVGGNIITASPISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 AACPLSIVEKTLVDAVAKLPAQKTEVFRGVLEQLRWFAGKQVKSVASVGGNIITASPISD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVQMDHTFFPGYRKTLLSPEEILLSIEIPYSREGEYFSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVQMDHTFFPGYRKTLLSPEEILLSIEIPYSREGEYFSA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTTEVQELALCYGGMANRTISALKTTQRQLSKLWKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTTEVQELALCYGGMANRTISALKTTQRQLSKLWKE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ELLQDVCAGLAEELHLPPDAPGGMVDFRCTLTLSFFFKFYLTVLQKLGQENLEDKCGKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ELLQDVCAGLAEELHLPPDAPGGMVDFRCTLTLSFFFKFYLTVLQKLGQENLEDKCGKLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 PTFASATLLFQKDPPADVQLFQEVPKGQSEEDMVGRPLPHLAADMQASGEAVYCDDIPRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PTFASATLLFQKDPPADVQLFQEVPKGQSEEDMVGRPLPHLAADMQASGEAVYCDDIPRY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ENELSLRLVTSTRAHAKIKSIDTSEAKKVPGFVCFISADDVPGSNITGICNDETVFAKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ENELSLRLVTSTRAHAKIKSIDTSEAKKVPGFVCFISADDVPGSNITGICNDETVFAKDK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VTCVGHIIGAVVADTPEHTQRAAQGVKITYEELPAIITIEDAIKNNSFYGPELKIEKGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VTCVGHIIGAVVADTPEHTQRAAQGVKITYEELPAIITIEDAIKNNSFYGPELKIEKGDL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KKGFSEADNVVSGEIYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEAGEMELFVSTQNTMKTQSFVAKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KKGFSEADNVVSGEIYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEAGEMELFVSTQNTMKTQSFVAKM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 LGVPANRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAYKTGRPVRCMLDRDEDMLITGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LGVPANRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAYKTGRPVRCMLDRDEDMLITGGR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 HPFLARYKVGFMKTGTVVALEVDHFSNVGNTQDLSQSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 HPFLARYKVGFMKTGTVVALEVDHFSNVGNTQDLSQSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 LCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMLIAECWMSEVAVTCGMPAEEVRRKNLYKEGDLTHFNQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMLIAECWMSEVAVTCGMPAEEVRRKNLYKEGDLTHFNQKL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 EGFTLPRCWEECLASSQYHARKSEVDKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EGFTLPRCWEECLASSQYHARKSEVDKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 LLHVYTDGSVLLTHGGTEMGQGLHTKMVQVASRALKIPTSKIYISETSTNTVPNTSPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LLHVYTDGSVLLTHGGTEMGQGLHTKMVQVASRALKIPTSKIYISETSTNTVPNTSPTAA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SVSADLNGQAVYAACQTILKRLEPYKKKNPSGSWEDWVTAAYMDTVSLSATGFYRTPNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SVSADLNGQAVYAACQTILKRLEPYKKKNPSGSWEDWVTAAYMDTVSLSATGFYRTPNLG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 YSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 YSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 VQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 GEPPLFLAASIFFAIKDAIRAARAQHTGNNVKELFRLDSPATPEKIRNACVDKFTTLCVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GEPPLFLAASIFFAIKDAIRAARAQHTGNNVKELFRLDSPATPEKIRNACVDKFTTLCVT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KE2 GVPENCKPWSVRV
:::::::::::::
CCDS17 GVPENCKPWSVRV
1330
>>CCDS33360.1 AOX1 gene_id:316|Hs108|chr2 (1338 aa)
initn: 4041 init1: 2246 opt: 4523 Z-score: 5328.0 bits: 998.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4523; 50.0% identity (78.2% similar) in 1342 aa overlap (3-1333:4-1338)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTADKLVFFVNGRKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYD
:..:.:.::::::.:::.:::: :: :::.:: :.::: ::: :::::::::.:.:.
CCDS33 MDRASELLFYVNGRKVIEKNVDPETMLLPYLRKKLRLTGTKYGCGGGGCGACTVMISRYN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RLQNKIVHFSANACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERIAKSHGSQCGFCTPG
. ..: : ::::: :::::. .:::::::::::.::.::::::::: ::.::::::::
CCDS33 PITKRIRHHPANACLIPICSLYGAAVTTVEGIGSTHTRIHPVQERIAKCHGTQCGFCTPG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 IVMSMYTLLRNQPEPTMEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFARDGGCCGGDGNNPNC
.:::.::::::.::::.... .:. ::::::::::::... .:: . .::: . .: :
CCDS33 MVMSIYTLLRNHPEPTLDQLTDALGGNLCRCTGYRPIIDACKTFCKTSGCCQSK-ENGVC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CMNQ------KKDHSVSLSPSLFKPEEFTPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPRKQLR-FEGE
:..: . ... . ::.:: ::: ::::::: ::::::. . . .. : : .:
CCDS33 CLDQGINGLPEFEEGSKTSPKLFAEEEFLPLDPTQELIFPPELMIMAEKQSQRTRVFGSE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RVTWIQASTLKELLDLKAQHPDAKLVVGNTEIGIEMKFKNMLFPMIVCPAWIPELNSVEH
:. :.. ::::::..: ..:.: ...::: .: :.:::... :.:. : : ::. :.:
CCDS33 RMMWFSPVTLKELLEFKFKYPQAPVIMGNTSVGPEVKFKGVFHPVIISPDRIEELSVVNH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GPDGISFGAACPLSIVEKTLVDAVAKLPAQKTEVFRGVLEQLRWFAGKQVKSVASVGGNI
. .:...::. :. :. :.:.: ::: .::......:..: .::.:....::.::.:
CCDS33 AYNGLTLGAGLSLAQVKDILADVVQKLPEEKTQMYHALLKHLGTLAGSQIRNMASLGGHI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ITASPISDLNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVQMDHTFFPGYRKTLLSPEEILLSIEIPYS
:. : :::::.. ... :.:.:. .: . ... :. .. :.:.:::.:..::::
CCDS33 ISRHPDSDLNPILAVGNCTLNLLSKEGKRQIPLNEQFLSKCPNADLKPQEILVSVNIPYS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 REGEYFSAFKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTTEVQELALCYGGMANRTISALKTTQR
:. :. :::.::.:.:. .: :.:::::.: : ..:: . :::.. :: : .. :.
CCDS33 RKWEFVSAFRQAQRQENALAIVNSGMRVFFGEGDGIIRELCISYGGVGPATICAKNSCQK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 QLSKLWKEELLQDVCAGLAEELHLPPDAPGGMVDFRCTLTLSFFFKFYLTVLQKLGQENL
... :.:..:. .: . .:. : .:::: :.:. :: .::.::::: : : : . .
CCDS33 LIGRHWNEQMLDIACRLILNEVSLLGSAPGGKVEFKRTLIISFLFKFYLEVSQILKKMD-
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 EDKCGKLDPTFASATLLFQKDPPADVQLFQEVPKGQSEEDMVGRPLPHLAADMQASGEAV
. .: . :: ... .. .:.. : :: .:.:. ::.. .:.:::.
CCDS33 PVHYPSLADKYESALEDLHSKHHCSTLKYQNIGPKQHPEDPIGHPIMHLSGVKHATGEAI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 YCDDIPRYENELSLRLVTSTRAHAKIKSIDTSEAKKVPGFVCFISADDVPGSNITGIC--
::::.: ..:: : .:::.:::::: ::: ::: ..:: : ...:. . :.....:
CCDS33 YCDDMPLVDQELFLTFVTSSRAHAKIVSIDLSEALSMPGVVDIMTAEHL--SDVNSFCFF
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KE2 -NDETVFAKDKVTCVGHIIGAVVADTPEHTQRAAQGVKITYEEL-PAIITIEDAIKNNSF
. : .: ::: :::... ::.::. ...:::. :::.:..: : :.:::..:..::
CCDS33 TEAEKFLATDKVFCVGQLVCAVLADSEVQAKRAAKRVKIVYQDLEPLILTIEESIQHNSS
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 YGPELKIEKGDLKKGFSEADNVVSGEIYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEAGEMELFVSTQ
. :: :.: :.. ..:. .:... :::..:::::::.::. ..::::: ::...::::
CCDS33 FKPERKLEYGNVDEAFKVVDQILEGEIHMGGQEHFYMETQSMLVVPKGEDQEMDVYVSTQ
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 NTMKTQSFVAKMLGVPANRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAYKTGRPVRCML
:..::. : .:::... .:.:.::.:::: .. ......:.:: : :: :::.:
CCDS33 FPKYIQDIVASTLKLPANKVMCHVRRVGGAFGGKVLKTGIIAAVTAFAANKHGRAVRCVL
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 DRDEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGTVVALEVDHFSNVGNTQDLSQSIMERALFHMDN
.: :::::::::::.:..::.:::. : ..::...:.::.: . : : ..: .:..:::
CCDS33 ERGEDMLITGGRHPYLGKYKAGFMNDGRILALDMEHYSNAGASLDESLFVIEMGLLKMDN
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 CYKIPNIRGTGRLCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMLIAECWMSEVAVTCGMPAEEVRRKNLY
::.::.: : :.::::::::::::: ::. ::.: ..:::. ::. :.:: :.:
CCDS33 AYKFPNLRCRGWACRTNLPSNTAFRGFGFPQAALITESCITEVAAKCGLSPEKVRIINMY
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 KEGDLTHFNQKLEGFTLPRCWEECLASSQYHARKSEVDKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGI
:: : : ..:.... .: .::.::.: :.: :: :.::: :: :::.:: ..: :: .
CCDS33 KEIDQTPYKQEINAKNLIQCWRECMAMSSYSLRKVAVEKFNAENYWKKKGLAMVPLKFPV
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE2 SFTVPFLNQAGALLHVYTDGSVLLTHGGTEMGQGLHTKMVQVASRALKIPTSKIYISETS
.. .::.::.:.: :::::.:::: :::::.::::.::.:: :..: :.... ::
CCDS33 GLGSRAAGQAAALVHIYLDGSVLVTHGGIEMGQGVHTKMIQVVSRELRMPMSNVHLRGTS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE2 TNTVPNTSPTAASVSADLNGQAVYAACQTILKRLEPYKKKNPSGSWEDWVTAAYMDTVSL
:.::::.. ...:: ::::: :: ::::.:::::: .:::.:.:.::. .:. ....:
CCDS33 TETVPNANISGGSVVADLNGLAVKDACQTLLKRLEPIISKNPKGTWKDWAQTAFDESINL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE2 SATGFYRTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLN
::.:..: . ...: . :.::.:: ::.::::::::::::::::.::::::::: :.:
CCDS33 SAVGYFRGYESDMNWEKGEGQPFEYFVYGAACSEVEIDCLTGDHKNIRTDIVMDVGCSIN
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE2 PAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDC
:::::::.::::.::.::.:.:::.:::.: ::::::. :::::. ..: :....::
CCDS33 PAIDIGQIEGAFIQGMGLYTIEELNYSPQGILHTRGPDQYKIPAICDMPTELHIALLPPS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE2 PNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIRAARAQHTGNNVKELFRLDSPATPEKIRN
:....:.::..:: .::. :.::::.::. ::: :. : .. . :.:: ::::::
CCDS33 QNSNTLYSSKGLGESGVFLGCSVFFAIHDAVSAAR-QERG--LHGPLTLNSPLTPEKIRM
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1310 1320 1330
pF1KE2 ACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSVRV
:: :::: . : . ::.: .
CCDS33 ACEDKFTKMIPRDEPGSYVPWNVPI
1320 1330
1333 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 20:37:51 2016 done: Mon Nov 7 20:37:52 2016
Total Scan time: 5.400 Total Display time: 0.190
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]