Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2441, 1836 aa
1>>>pF1KE2441 1836 - 1836 aa - 1836 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5938+/-0.000371; mu= 13.8710+/- 0.023
mean_var=125.8954+/-26.246, 0's: 0 Z-trim(116.6): 302 B-trim: 13 in 1/53
Lambda= 0.114306
statistics sampled from 27526 (27854) to 27526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 14.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000325 (OMIM: 168300,170400,170500,603967,60839 (1836) 12368 2052.0 0
XP_005246812 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (1754) 6257 1044.3 0
XP_016860147 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (1754) 6257 1044.3 0
XP_016860144 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (2005) 6257 1044.3 0
XP_016860145 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (2005) 6257 1044.3 0
NP_001035233 (OMIM: 182390,607745,613721) sodium c (2005) 6257 1044.3 0
NP_066287 (OMIM: 182390,607745,613721) sodium chan (2005) 6257 1044.3 0
NP_001035232 (OMIM: 182390,607745,613721) sodium c (2005) 6257 1044.3 0
XP_016860146 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (2005) 6257 1044.3 0
XP_005246810 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (2005) 6257 1044.3 0
XP_016860142 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1980) 6177 1031.1 0
XP_011509908 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1981) 6177 1031.1 0
XP_016860141 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1981) 6177 1031.1 0
NP_001159436 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) s (1981) 6177 1031.1 0
XP_016860140 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1981) 6177 1031.1 0
XP_011509907 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1997) 6177 1031.1 0
XP_016860139 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1997) 6177 1031.1 0
XP_016860138 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1998) 6177 1031.1 0
XP_016860135 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1998) 6177 1031.1 0
XP_016860137 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1998) 6177 1031.1 0
XP_016860134 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1998) 6177 1031.1 0
NP_008851 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) sodi (1998) 6177 1031.1 0
XP_016860136 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1998) 6177 1031.1 0
XP_011509906 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1998) 6177 1031.1 0
XP_011509904 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (2009) 6177 1031.1 0
NP_001189364 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) s (2009) 6177 1031.1 0
XP_016860133 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (2009) 6177 1031.1 0
NP_001159435 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) s (2009) 6177 1031.1 0
XP_016860148 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTE (1271) 6138 1024.6 0
NP_002968 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60341 (1977) 6046 1009.5 0
XP_011509920 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60 (1977) 6044 1009.2 0
XP_016860158 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60 (1740) 6040 1008.5 0
XP_016860157 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60 (1859) 6040 1008.5 0
XP_005246814 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60 (1988) 6040 1008.5 0
XP_011509919 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60 (1988) 6040 1008.5 0
XP_011509918 (OMIM: 133020,167400,201300,243000,60 (1988) 6040 1008.5 0
NP_001317189 (OMIM: 600702,614306,614558,617080) s (1980) 6012 1003.9 0
XP_006719619 (OMIM: 600702,614306,614558,617080) P (1980) 6012 1003.9 0
XP_011536953 (OMIM: 600702,614306,614558,617080) P (1980) 6012 1003.9 0
NP_055006 (OMIM: 600702,614306,614558,617080) sodi (1980) 6012 1003.9 0
XP_016875283 (OMIM: 600702,614306,614558,617080) P (1980) 6012 1003.9 0
XP_016860143 (OMIM: 182389,604403,607208,609634) P (1195) 5671 947.5 0
XP_011509915 (OMIM: 182391) PREDICTED: sodium chan (1370) 4360 731.4 1.5e-209
XP_016860152 (OMIM: 182391) PREDICTED: sodium chan (1370) 4360 731.4 1.5e-209
NP_001075146 (OMIM: 182391) sodium channel protein (1951) 4360 731.4 2e-209
NP_001075145 (OMIM: 182391) sodium channel protein (1951) 4360 731.4 2e-209
XP_016860151 (OMIM: 182391) PREDICTED: sodium chan (1954) 4360 731.4 2e-209
XP_016860150 (OMIM: 182391) PREDICTED: sodium chan (1983) 4360 731.5 2e-209
NP_008853 (OMIM: 182391) sodium channel protein ty (2000) 4360 731.5 2e-209
XP_011509912 (OMIM: 182391) PREDICTED: sodium chan (2000) 4360 731.5 2e-209
>>NP_000325 (OMIM: 168300,170400,170500,603967,608390,61 (1836 aa)
initn: 12368 init1: 12368 opt: 12368 Z-score: 11018.4 bits: 2052.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12368; 100.0% identity (100.0% similar) in 1836 aa overlap (1-1836:1-1836)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSNDTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSNDTW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDALLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDALLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRAAG
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430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKHQE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ELEKAKAAQALEGGEADGDPAHGKDCNGSLDTSQGEKGAPRQSSSGDSGISDAMEELEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ELEKAKAAQALEGGEADGDPAHGKDCNGSLDTSQGEKGAPRQSSSGDSGISDAMEELEEA
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 HQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LFGKSYKECVCKIALDCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDEDGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFL
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pF1KE2 LGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAPEDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAPEDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DGPPSSLELDHLNFINNPYLTIQVPIASEESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDG
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pF1KE2 NSSVCSTADYKPPEEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NSSVCSTADYKPPEEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTL
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pF1KE2 RRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEM
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pF1KE2 LLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRAL
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pF1KE2 SRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDI
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pF1KE2 SEVNNKSECESLMHTGQVRWLNVKVNYDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SEVNNKSECESLMHTGQVRWLNVKVNYDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKE
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 EQPQYEVNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EQPQYEVNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NAMKKLGSKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE2 KVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKY
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pF1KE2 FVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFG
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pF1KE2 MSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSIICLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSIICLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENP
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pF1KE2 GTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMF
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KE2 YETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDIL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KE2 FALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRR
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pF1KE2 HLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGD
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1810 1820 1830
pF1KE2 AGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPGVKESLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPGVKESLV
1810 1820 1830
>>XP_005246812 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTED: s (1754 aa)
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.:: :: ::::::::.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::
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pF1KE2 QFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSG
::: ...::::.:.:. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.::
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pF1KE2 MYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGN--SSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPI
.:.... : .: :: : . ... :. . :. ::
XP_005 IYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENSTPEKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEKFEKDK
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XP_005 SEKEDKGKDIRESKK
1740 1750
>>XP_016860147 (OMIM: 182390,607745,613721) PREDICTED: s (1754 aa)
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230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LRALKTITVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRW
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XP_016 MILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQW
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XP_016 ESNQTARWKNVKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEDNLYMY
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pF1KE2 LYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQ
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XP_016 IDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKDHPGSSVKGDCGNPS
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pF1KE2 IGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDAT
.:: :: ::::::::.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::
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pF1KE2 QFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSG
::: ...::::.:.:. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.::
XP_016 QFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESG
1560 1570 1580 1590 1600 1610
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pF1KE2 EMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASY
:::::. :::.:::.:::::::::::::::::.::: :: :::::::.::....:..:
XP_016 EMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSS
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pF1KE2 MYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGN--SSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPI
.:.... : .: :: : . ... :. . :. ::
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.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
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pF1KE2 VVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
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XP_016 PIRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
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:.::::::::.::.. :: :.: . ... .. . .: : . .. ..
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.. .:: :.. . : ..: ::.: :...::::: ::. ::::
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:::.: . :: .. :. :.:: . : .:: ::.: : : :: : .:: .
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.:: :::: ::... : ..: .:.:: ::.::..:.:::::::::::::::::::::::
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..::.:: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::: ...::::.:.:
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. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::
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pF1KE2 ANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPE
.:::::::::::::::::.::: :: :::::::.::....:..: .:.... : .:
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:: : . ... :. . :. ::
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:::.::.:::: :::....::::::::: :::::::::::::: :::::::::.:.::.
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.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
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::: . : :: .
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:::
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:.: :.:
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: .:: :::: : :: :. .:. :.:::
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NP_001 ESDFENLNTEEFSSESDMEESK---EKLNATSSSEGSTVDIGAPAEG--EQPEVEPEESL
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.:: :::: ::... : ..: .:.:: ::.::..:.:::::::::::::::::::::::
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..::.:: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEA-RLQRNKQMEIEEPERKPRSDLE
::: ::. .: :::::::::::: .::.: : ..... : .: :: ::::
NP_001 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQERKDEDDENGPKPNSDLE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 AGKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSV
:::.::.:::: :::....::::::::: :::::::::::::: :::::::::.:.::.
NP_001 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
NP_001 IRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
120 130 140 150 160 170
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120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
:::.:: :.:::::::::::::::::::::
NP_066 PIRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
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::::..::::::::::::::.:: .::.::::::::.:::::::::::::::.:::::::
NP_066 RGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKT
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::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::..::: :... :
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: . :.. :: . :.: .: :.:: :: :...::::::.::::
NP_066 TSFFNNSLDGN-----------GTTFNRTVS-----IFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDAL
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:::::::::.::::: :.:.::::::::::.::::::::.::::::::.::::.::::::
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::::::::::..:::::::::::::::::::: :::.::: : ..:: :::::::..::.
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::: . : :: .
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pF1KE2 ------------------------LEG---------------------------------
:::
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:.: :.:
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: .:: :::: : :: :. .:. :.:::
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: ....::::::..::::: ::: :. :::.:: :::: :....:.:
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:::::::.:::::::::::::::::::::.:..::.:::::::::::::: ::.::::::
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:::.::::::..::.:::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_066 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKISNDCELPRWHMHDFFHSFLIVF
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.. .:: :.. . : ..: ::.: :...::::: ::. ::::
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:::.: . :: .. :. :.:: . : .:: ::.: : : :: : .:: .
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pF1KE2 QPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL
.:: :::: ::... : ..: .:.:: ::.::..:.:::::::::::::::::::::::
NP_066 EPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTCYKIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL
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::::::::::..:.:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::
NP_066 AFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVS
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pF1KE2 IISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCL
..::.:: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCL
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pF1KE2 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSECESLMHTGQV-RWLNVKVNY
:::::::::::::::::::.::: ::.: ::.: ::: :::..:....:. :: :::::.
NP_066 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGEMFDVSVVNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNF
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::::::::::::::::::::::::::::::. : ::.:: ::::::::::::::::::::
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pF1KE2 DLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLAL
:.::::.:::.:::::::::::::::::.::: ..::: ::..::..::::::::...:
NP_066 DFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEMTNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISL
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pF1KE2 RQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKG
: ::::.::::::::::::::::. :..::.:::::::::::::::::::.::::.::::
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:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ::::::::::::::.:
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:::.::::::::::: ::::::::::::. ..::.::::::::::.:: :: ::::::::
NP_066 CLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKDHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL
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pF1KE2 IVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTL
.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::: ...::::.:.:
NP_066 VVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADAL
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pF1KE2 QEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMA
. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::
NP_066 DPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMA
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pF1KE2 ANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPE
.:::::::::::::::::.::: :: :::::::.::....:..: .:.... : .:
NP_066 SNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPI
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pF1KE2 KEGLLANTMSKMYGHENGN--SSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQ
:: : . ... :. . :. ::
NP_066 KEDTLIDKLNENSTPEKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEKFEKDKSEKEDKGKDIRESKK
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>--
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pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEA-RLQRNKQMEIEEPERKPRSDLE
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NP_066 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQERKDEDDENGPKPNSDLE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 AGKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSV
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NP_066 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 VRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
NP_066 IRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
120 130 140 150 160 170
>>NP_001035232 (OMIM: 182390,607745,613721) sodium chann (2005 aa)
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120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
:::.:: :.:::::::::::::::::::::
NP_001 PIRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
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pF1KE2 RGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKT
::::..::::::::::::::.:: .::.::::::::.:::::::::::::::.:::::::
NP_001 RGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKT
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pF1KE2 IVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSND
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::..::: :... :
NP_001 IVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPD----NSSFEINI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 TWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDAL
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NP_001 TSFFNNSLDGN-----------GTTFNRTVS-----IFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDAL
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::: . : :: .
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:.: :.:
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NP_001 DPTSRQRAMSIASILTNTMEELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVV
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pF1KE2 EYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
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NP_001 YYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
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NP_001 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKISNDCELPRWHMHDFFHSFLIVF
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pF1KE2 RILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDE
:.::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::.:.:::.:.
NP_001 RVLCGEWIETMWDCMEVAGQTMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDD
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pF1KE2 DGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAP
:.::::::::.::.. :: :.: . ... .. . .: : . .. ..
NP_001 DNEMNNLQIAVGRMQKGIDFVKRKIREFIQKAFVRKQK---ALDEIKPLEDLNNKKDSCI
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KE2 EDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLADGPPSSLEL------DHLNFINNPYLTIQVPIASE
.. .:: :.. . : ..: ::.: :...::::: ::. ::::
NP_001 SNHTTIEIGKDL---NYLKDGNGTTSGIGSSVEKYVVDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVG
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pF1KE2 ESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDGNSSVCSTADYKPPEEDPEEQAEENPE-GE
:::.: . :: .. :. :.:: . : .:: ::.: : : :: : .:: .
NP_001 ESDFENLNTEEFSSESDMEESK---EKLNATSSSEGSTVDIGAPAEG--EQPEVEPEESL
1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KE2 QPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL
.:: :::: ::... : ..: .:.:: ::.::..:.:::::::::::::::::::::::
NP_001 EPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTCYKIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL
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pF1KE2 AFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVS
::::::::::..:.:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::
NP_001 AFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVS
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pF1KE2 IISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCL
..::.:: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCL
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pF1KE2 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSECESLMHTGQV-RWLNVKVNY
:::::::::::::::::::.::: ::.: ::.: ::: :::..:....:. :: :::::.
NP_001 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGEMFDVSVVNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNF
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::::::::::::::::::::::::::::::. : ::.:: ::::::::::::::::::::
NP_001 DNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTL
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:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.
NP_001 NLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVF
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pF1KE2 DLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLAL
:.::::.:::.:::::::::::::::::.::: ..::: ::..::..::::::::...:
NP_001 DFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEMTNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISL
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pF1KE2 RQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKG
: ::::.::::::::::::::::. :..::.:::::::::::::::::::.::::.::::
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pF1KE2 IRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSII
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ::::::::::::::.:
NP_001 IRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMI
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:::.::::::::::: ::::::::::::. ..::.::::::::::.:: :: ::::::::
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pF1KE2 IVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTL
.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::: ...::::.:.:
NP_001 VVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADAL
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pF1KE2 QEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMA
. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::
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pF1KE2 ANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPE
.:::::::::::::::::.::: :: :::::::.::....:..: .:.... : .:
NP_001 SNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPI
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pF1KE2 KEGLLANTMSKMYGHENGN--SSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQ
:: : . ... :. . :. ::
NP_001 KEDTLIDKLNENSTPEKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEKFEKDKSEKEDKGKDIRESKK
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::: ::. .: :::::::::::: .::.: : ..... : .: :: ::::
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pF1KE2 AGKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSV
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NP_001 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP
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.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
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pF1KE2 VVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
:::.:: :.:::::::::::::::::::::
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::::..::::::::::::::.:: .::.::::.:::.:::::::::::::::.:::::::
XP_016 RGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKT
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: . :.. :: . :.: .: :.:: :: :...::::::.::::
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::: . : :: .
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pF1KE2 ------------------------LEG---------------------------------
:::
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:.: :.:
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: .:: :::: : :: :. .:. :.:::
XP_016 ILPMNGKMHSAVDCNGVVSLVGGPSTLTSAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLE
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: ....::::::..::::: ::: :. :::.:: :::: :....:.:
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:.::::::::.::.. :: :.: . ... .. . .: : . .. ..
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:::.: . :: .. :. :.:: . : .:: ::.: : : :: : .:: .
XP_016 ESDFENLNTEEFSSESDMEESK---EKLNATSSSEGSTVDIGAPAEG--EQPEVEPEESL
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.:: :::: ::... : ..: .:.:: ::.::..:.:::::::::::::::::::::::
XP_016 EPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTCYKIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL
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..::.:: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCL
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XP_016 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQERKDEDDENGPKPNSDLE
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pF1KE2 AGKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSV
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XP_016 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP
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