Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2384, 316 aa
1>>>pF1KE2384 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5630+/-0.000857; mu= 14.6121+/- 0.051
mean_var=66.1983+/-13.404, 0's: 0 Z-trim(106.5): 32 B-trim: 53 in 1/47
Lambda= 0.157634
statistics sampled from 8987 (9016) to 8987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 2138 494.9 3.4e-140
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1573 366.4 1.6e-101
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 1401 327.3 1e-89
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1095 257.7 8.8e-69
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 1080 254.3 9.4e-68
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 1069 251.8 5.3e-67
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 1064 250.7 1.2e-66
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1060 249.8 2.2e-66
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1048 247.0 1.4e-65
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1046 246.6 2e-65
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 980 231.5 5.9e-61
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 609 147.2 1.5e-35
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 501 122.6 2.9e-28
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 501 122.6 3.4e-28
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 501 122.6 4e-28
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 456 112.4 4.4e-25
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 382 95.4 2.7e-20
>>CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 2138 init1: 2138 opt: 2138 Z-score: 2630.4 bits: 494.9 E(32554): 3.4e-140
Smith-Waterman score: 2138; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEVGVAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEVGVAIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKPGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKYKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKYKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIKAIAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIKAIAAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWRVCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWRVCA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE2 LLSCTSHKDYPFHEEF
::::::::::::::::
CCDS58 LLSCTSHKDYPFHEEF
310
>>CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 1613 init1: 1573 opt: 1573 Z-score: 1936.0 bits: 366.4 E(32554): 1.6e-101
Smith-Waterman score: 1573; 70.6% identity (91.5% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEVGVAIQ
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CCDS58 MATFVELSTKAKMPIVGLGTWKSPLGKVKEAVKVAIDAGYRHIDCAYVYQNEHEVGEAIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKPGK
::..:..::::.:::::::: :. :. ::. : .:::.::::.:::.:::::: ::: :
CCDS58 EKIQEKAVKREDLFIVSKLWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQGFKSGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKYKP
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CCDS58 DLFPKDDKGNAIGGKATFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFSHFQIEKLLNKPGLKYKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIKAIAAK
..::.:::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::.:: ::::
CCDS58 VTNQVECHPYLTQEKLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKIKEIAAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWRVCA
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CCDS58 HKKTAAQVLIRFHIQRNVIVIPKSVTPARIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNRNWRACN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE2 LLSCTSHKDYPFHEEF
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CCDS58 VLQSSHLEDYPFNAEY
310
>>CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 (344 aa)
initn: 1408 init1: 1387 opt: 1401 Z-score: 1724.0 bits: 327.3 E(32554): 1e-89
Smith-Waterman score: 1401; 68.4% identity (89.3% similar) in 291 aa overlap (26-316:54-344)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEV
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CCDS47 VGPLTGLKSSLLKDTTSAGPLLRPYPASLLGKVKEAVKVAIDAEYRHIDCAYFYENQHEV
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 GVAIQEKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTG
: :::::..:..: ::.::::::.: :. :. ::. : .:::.::::.:::.:::::: :
CCDS47 GEAIQEKIQEKAVMREDLFIVSKVWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQG
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 FKPGKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPG
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CCDS47 FKTGDDFFPKDDKGNMISGKGTFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFNHFQIERLLNKPG
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LKYKPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIK
:::::..::.:::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS47 LKYKPVTNQVECHPYLTQEKLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKIK
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 AIAAKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRN
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CCDS47 EIAAKHKKTTAQVLIRFHIQRNVTVIPKSMTPAHIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNRN
270 280 290 300 310 320
300 310
pF1KE2 WRVCALLSCTSHKDYPFHEEF
::. . . .:.:: :.
CCDS47 WRAFDFKEFSHLEDFPFDAEY
330 340
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 1024 init1: 756 opt: 1095 Z-score: 1348.3 bits: 257.7 E(32554): 8.8e-69
Smith-Waterman score: 1095; 50.0% identity (77.0% similar) in 318 aa overlap (4-316:9-326)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWK----SPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQN
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CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ENEVGVAIQEKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIH
:.::: ::.::. : :.::..: .::: : : .:. . ..:: :.:::.:::.:.
CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 WPTGFKPGKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMIL
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CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRP-WAKPEDPSLLE
::::::.::. ::.:::::.:: ::...::.. ::.:::::::. : :.. .: ::.
CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DPRIKAIAAKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLL
: ..... ..:::.::...:: .::..:::::: . ::: :::..::: :. ..: .
CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE2 SYNRNWRVCALLSCTSHKDYPFHEEF
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CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
310 320
>>CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 (325 aa)
initn: 1076 init1: 484 opt: 1080 Z-score: 1329.9 bits: 254.3 E(32554): 9.4e-68
Smith-Waterman score: 1087; 49.5% identity (75.7% similar) in 325 aa overlap (2-316:3-325)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEVGVAI
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CCDS52 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QEKLRE-QVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKP
.: . ..: :::::..:::: : :. :. : .:::.::.:.::::::.::: .:.
CCDS52 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKY
: . :: . .:.. ..:. .:: :.: :: .:::.:.:.:::: :.. ::. ...
CCDS52 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVR-
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIKAIA
::: :.::::::.:..:: .::..:. ::::::::: :: : :..: :::.: . :.:
CCDS52 -PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 AKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWR-
:.... ::.:.:. .::... ::::.:: :: .:.::::: .: ..: : . :.:::
CCDS52 EKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRY
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE2 VCALLSC--------TSHKDYPFHEEF
. .:. ..: :::.. .
CCDS52 IVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY
300 310 320
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1074 init1: 755 opt: 1069 Z-score: 1316.4 bits: 251.8 E(32554): 5.3e-67
Smith-Waterman score: 1069; 48.7% identity (80.3% similar) in 314 aa overlap (7-316:10-323)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTW---KSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENE
::.: ::.::.::. . : ... ::.:.::..:.:::: ::.:.::..
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 VGVAIQEKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPT
::.::. :. . ::::..: .:::::. :. ::. : ...:..:.:::.::::::.:.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GFKPGKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKP
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CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSP-DRPWAKPEDPSLLEDPR
::::::. ::.:::::..:.::...:.:: ::..::: ::: ..::. :..: :::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 IKAIAAKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYN
. :.: ::..: : . .:. .::..::. :: . .:: .: .::.:.:.:..: .. . :
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE2 RNWRVCALLSCTSHKDYPFHEEF
:: : .: .. .::: .:.
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1069 init1: 750 opt: 1064 Z-score: 1310.3 bits: 250.7 E(32554): 1.2e-66
Smith-Waterman score: 1064; 49.0% identity (79.6% similar) in 314 aa overlap (7-316:10-323)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASRLLLNNGAKMPILGLGTW---KSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENE
::.: ::.::.::. . : ... ::::.::..:..::: ::::.::..
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 VGVAIQEKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPT
::.::. :. . ::::..: .:::: . :. ::. : ...:..:.:::.::::::.:.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GFKPGKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKP
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CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSP-DRPWAKPEDPSLLEDPR
::::::. ::.:::::..:.::...:.:: ::..::: ::: ..::. :..: :::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 IKAIAAKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYN
. :.: ::..: : . .:. .::..::. :: . .:: .: .::.:.:.:..: .. . :
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE2 RNWRVCALLSCTSHKDYPFHEEF
:: : .: .. .::: .:.
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 980 init1: 721 opt: 1060 Z-score: 1305.4 bits: 249.8 E(32554): 2.2e-66
Smith-Waterman score: 1060; 48.3% identity (79.2% similar) in 317 aa overlap (4-316:7-323)
10 20 30 40 50
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]