Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2371
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2371, 790 aa
1>>>pF1KE2371 790 - 790 aa - 790 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6576+/-0.00116; mu= 14.7992+/- 0.070
mean_var=112.0496+/-22.196, 0's: 0 Z-trim(105.4): 52 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.121163
statistics sampled from 8379 (8419) to 8379 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 3.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11029.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 ( 790) 5208 922.0 0
CCDS58500.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 ( 791) 5196 919.9 0
CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs108|chr17 ( 839) 1383 253.5 1.1e-66
CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 ( 764) 1151 212.9 1.6e-54
CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs108|chr7 ( 729) 665 127.9 5.9e-29
CCDS53827.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 764) 520 102.6 2.6e-21
CCDS9135.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 811) 520 102.6 2.7e-21
CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 824) 520 102.6 2.8e-21
CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 837) 520 102.6 2.8e-21
CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 871) 520 102.6 2.9e-21
>>CCDS11029.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 (790 aa)
initn: 5208 init1: 5208 opt: 5208 Z-score: 4924.6 bits: 922.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5208; 100.0% identity (100.0% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFE
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 EVEEFPETSV
::::::::::
CCDS11 EVEEFPETSV
790
>>CCDS58500.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 (791 aa)
initn: 5014 init1: 5014 opt: 5196 Z-score: 4913.3 bits: 919.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5196; 99.9% identity (99.9% similar) in 791 aa overlap (1-790:1-791)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE2 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRT-DFNKIQDSSRNNSKTTLNAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS58 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTADFNKIQDSSRNNSKTTLNAF
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE2 EEVEEFPETSV
:::::::::::
CCDS58 EEVEEFPETSV
790
>>CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs108|chr17 (839 aa)
initn: 1685 init1: 394 opt: 1383 Z-score: 1310.7 bits: 253.5 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 1842; 41.3% identity (69.8% similar) in 782 aa overlap (10-759:15-773)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAP-SGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNP
::. : .:.: : ... .:. ...: . .. : :
CCDS45 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TVAKTSPPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRR
. . : .:: : . . . . . : : : : . .. : ... :
CCDS45 V----DCPHEEGELDS----CPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 KKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMK
:: :: ::... ..: ::. ::. ..: : ... .::::::.:
CCDS45 YDRR---SIFEAVAQNNCQDLESLLLFLQK--SKKHLTD------NEFKDPETGKTCLLK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALL
:.::.. . . . .:: .:...: : ...:: ::. :.:::::.::::::. ...::
CCDS45 AMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 IAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHE-QT-DITSR
. ::::.: :.: ::. . :::::: ::.::::::: ::..:... :: ::..:
CCDS45 VENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISAR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE2 DSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNW----ELETTRNNDGLTPLQLA
:: ::..::::: ::.. .. :: ::. ::. ... .:: :. :.::: ::
CCDS45 DSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALA
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 AKMGKAEILKYILSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITV
: :: .: :::.:::.: . : ::::::.:::::: ::::::. .:: :::::. .
CCDS45 AGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIA
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 YNTN-IDNRHEMLTLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEE
:... :::.:: .:::. ::. :: .:.:..:...: : .: : .:...:::: .
CCDS45 YSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVD--
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 AIPHPLALTHKMGWLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFF
..: :. . . .... :... .. .. . . :: :: : ...... :.. ...::
CCDS45 GLP-PFKMEKTGDYFRVTGEILSVLGGVYFFFR-GIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFF
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 IQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDV
.:..... .: ::. :::.: .:...::::.::::::::::.::.:.:::.:.::.:.
CCDS45 LQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDL
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630
pF1KE2 LKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCPKDN------------KDC----SSYGSFSDAVLE
.:.:::::::.::..:...::: .:. : :::.:. .. ::
CCDS45 CRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLE
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERI
:::.:::.:::.. .: . .:..::..:::::..::::::::::::::.....::. :
CCDS45 LFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFIILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNI
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740
pF1KE2 WRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVA-----EDDFRLCLRINEVKWTEWKTHV
:.:::: :::. :: . . .:. :: :.: .:. .::.: :.:..::.:: :.:.:
CCDS45 WKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNV
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790
pF1KE2 SFLNEDPGP---VRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
...::::: :.::
CCDS45 GIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQ
760 770 780 790 800 810
>>CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 (764 aa)
initn: 685 init1: 434 opt: 1151 Z-score: 1092.2 bits: 212.9 E(32554): 1.6e-54
Smith-Waterman score: 1473; 40.5% identity (68.2% similar) in 692 aa overlap (112-767:68-741)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 DMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVE
: .: . :.: :::.: :.:. :
CCDS32 PMESQFQGEDRKFAPQIRVNLNYRKGTGASQPDPNRFDRDRLFNAVSRGVPEDLAGLPEY
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILG
:.. . : . : ..:::::::::.::.. ... . :: . ...
CCDS32 LSKTSKYLTDSEY--------TEGSTGKTCLMKAVLNLKDGVNACILPLLQIDRDSGNPQ
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 RFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYF
..::. :.. :.:..::.::::.:. . . ::. ::.:.:.: : ::. : : :::
CCDS32 PLVNAQCTDDYYRGHSALHIAIEKRSLQCVKLLVENGANVHARACGRFFQ-KGQGTCFYF
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310
pF1KE2 GETPLALAACTNQPEIVQLLME--HEQTDITSRDSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKR
:: ::.:::::.: ..:. :.: :. ... . ::.::..::::: .... . .:
CCDS32 GELPLSLAACTKQWDVVSYLLENPHQPASLQATDSQGNTVLHALVMISDNSAENIALVTS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 MYDMILLRSG-----NWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYILSREIKEKRLRSLS
::: ::..: . .:: :: . ::::.:::: :: ::...::.::.. : ::
CCDS32 MYDG-LLQAGARLCPTVQLEDIRNLQDLTPLKLAAKEGKIEIFRHILQREFSG--LSHLS
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 RKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEMLTLEPLHTLLHMKWK
::::.: :::: :::::..::. .:::::: ... . .::.:..::::. ::. ::
CCDS32 RKFTEWCYGPVRVSLYDLASVDSCEENSVLEIIAFHCKSPHRHRMVVLEPLNKLLQAKWD
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 KFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPR-EEEAIPHPLALTHKMGWLQLL-GRMFVLI
. . :::.: ..: . .: :.:..: ...: :: : ..: .:: :....:.
CCDS32 LLIPK-FFLNFLCNLIYMFIFTAVAYHQPTLKKQAAPH---LKAEVGNSMLLTGHILILL
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 WAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLV
.. . : . . : : . . :..:...:..::.:...: : ..: . :: ::
CCDS32 GGIYLLVGQ-LWYFWRRHVFIWISFIDSYFEILFLFQALLTVVSQVLCFLAIEWYLPLLV
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560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKC
:..::: :.:::::::: :.::::::::::.:.:.::..:.:::.::.:::.:: ..
CCDS32 SALVLGWLNLLYYTRGFQHTGIYSVMIQKVILRDLLRFLLIYLVFLFGFAVALVSLSQEA
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620 630 640 650
pF1KE2 --PK------------------DNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPI
:. :. . ..: .. .: :::::.:::.:.: .:.. ..
CCDS32 WRPEAPTGPNATESVQPMEGQEDEGNGAQYRGILEASLELFKFTIGMGELAFQEQLHFRG
570 580 590 600 610 620
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pF1KE2 LFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLR
. :.::..::.::..::::::::::.:::..:. .: ::.::.: ..::.:. : :
CCDS32 MVLLLLLAYVLLTYILLLNMLIALMSETVNSVATDSWSIWKLQKAISVLEMENGY-WWCR
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.. : : . :. : : :.:..::.:. :. . : :::. : :: : .
CCDS32 KKQRAGVMLTVGTKPDGSPDERWCFRVEEVNWASWEQTLPTLCEDPSGAGVPRTLENPVL
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pF1KE2 DSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
:
CCDS32 ASPPKEDEDGASEENYVPVQLLQSN
740 750 760
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:.:.:.: :. : . .. .:::: ::..:::.:. :::.::.:: .:: ..:: ::.
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........ :. .:.:::..: :::::..:. .. : ::..: . .
CCDS58 VMFQHLMQK-----------RRHIQWTYGPLTSILYDLTEIDSWGEELSFLELVVSSDKR
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. : ..: :.. :. .::.:... .: . .:..: : .: :::
CCDS58 EAR-QILEQTPVKELVSFKWNKYGRPYFCILAALYLLYMICFTTCCVYRPLKFRGGNRTH
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:. . . : : . ..:.:.. .. :. : . : :: . : ..::
CCDS58 SRDITILQQKLLQEAYETREDIIRLVGELVSIVGAVIILLLEIPDIFRVGASRYFGKTIL
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. :: ... : ::.... . : . .. . .:..::: ...:.::::: .: ...
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::::.:. :...: ... : .:::. :. ... ..: .: :.: : :.. :.
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: . . : . . :..: .. ....:.. .:.::..::.::.: :..: ...::
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: . : . .:. ::. : :: . : :. . : : ::.
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pF1KE2 PGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
CCDS58 KNSDKEDDQEHPSEKQPSGAESGTLARASLALPTSSLSRTASQSSSHRGWEILRQNTLGH
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50 60 70 80 90
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. .::..::.: : :.: : . .:.: :....:. .. . . .:. .
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..:.. :. :....:: .::::.:. ::: . . ::: .:.:..::: : ::.:::..
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pF1KE2 MGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCP------KDNKDCS--SYG
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. .::..::.: : :.: : . .:.: :....:. .. . . .:. .
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..:.. :. :....:: .::::.:. ::: . . ::: .:.:..::: : ::.:::..
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CCDS91 GETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCF
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pF1KE2 RINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
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CCDS91 RVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNP
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CCDS53 AELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPA--GPGDGRPNLRMKFQG
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pF1KE2 -FE---PNP------TVAKTS--PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETP
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CCDS53 AFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDS-LFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQP
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pF1KE2 SNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDF
..:..:. : . .: . .: ::.: . .: :: : .: ::.
CCDS53 QSPKAPAPQ-PPPILKVFNRPI---LFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRLTDEE----
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pF1KE2 LMHKLTASDTGKTCLMKALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQT
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CCDS53 ----FREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFR--------
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pF1KE2 ALNIAIERRQGDIAALLIAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEI
:: .: :: ::.::::::::.:
CCDS53 -----------DI----------------------------YYRGELPLSLAACTNQPHI
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CCDS53 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
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CCDS53 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
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CCDS53 PGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLK
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pF1KE2 SMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCP------KDNKDCS--SY
: ::.::::....:...::.::..:..:.. ::.::.. : .:. .:. .:
CCDS53 LTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTY
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670
pF1KE2 GS------FSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIAL
: :: .:.:::::::.:::.. ...:::..:..::.::.::::::::::::::
CCDS53 PSCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIAL
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 MGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVAED-----DFRLC
::::: .:::::..::.:: : :::..:. .: .::. :: ::. :... : : :
CCDS53 MGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWC
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
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.:..::.:..:. .....:::::
CCDS53 FRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSN
740 750 760 770 780 790
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. .: . .: ::.: . .: :: : .: ::. . .::
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:::: :::::.. . .. . .:: .::.. . .:::. . . :.:::::.::::::
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.:. .:::::..:::::..:.. . .. :: .:::..::. . . .::.. :::::
CCDS53 ADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGL
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CCDS53 SPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEA
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::::: :::..:.::::::..::.. ::. ::.::. :... :. . .::..::
CCDS53 SVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYY
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.: : :.: : . .:.: :....:. .. . . .:. . ..:.. :.
CCDS53 QPLEGTP-PYPYRTT--VDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGS
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:....:: .::::.:. ::: . . ::: .:.:..::: : ::.:::.. : ::.::::
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....:...::.::..:..:.. ::.::.. : .:. .:. .: : ::
CCDS53 ILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSCRDSETFST
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.:.:::::::.:::.. ...:::..:..::.::.::::::::::::::::::: .::::
CCDS53 FLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKE
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pF1KE2 SERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVAED-----DFRLCLRINEVKWTEW
:..::.:: : :::..:. .: .::. :: ::. :... : : :.:..::.:..:
CCDS53 SKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHW
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. .....:::::
CCDS53 NQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDEVVVPLDSM
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50 60 70 80 90
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CCDS91 AFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDS-LFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQP
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100 110 120 130 140 150
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CCDS91 QSPKAPAPQ-PPPILKVFNRPI---LFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRLTDEE----
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160 170 180 190 200 210
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. .:::::: :::::.. . .. . .:: .::.. . .:::. . . :.:::
CCDS91 ----FREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
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220 230 240 250 260 270
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::.:::::: . ::.: ::::.:.:.: ::.:: . ::::: ::.::::::::.:
CCDS91 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
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280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VQLLME--HEQTDITSRDSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSG----NW
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CCDS91 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
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CCDS91 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
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CCDS91 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
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pF1KE2 SMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCP------KDNKDCS--SY
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CCDS91 LTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTY
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KE2 GS------FSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIAL
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CCDS91 PSCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIAL
660 670 680 690 700 710
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pF1KE2 MGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVAED-----DFRLC
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CCDS91 MGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWC
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 LRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
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CCDS91 FRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]