Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2331
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2331, 727 aa
1>>>pF1KE2331 727 - 727 aa - 727 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9619+/-0.00102; mu= 16.8820+/- 0.061
mean_var=74.2949+/-14.604, 0's: 0 Z-trim(104.5): 30 B-trim: 4 in 2/48
Lambda= 0.148797
statistics sampled from 7944 (7958) to 7944 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 727) 4806 1041.5 0
CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 720) 3705 805.2 0
CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 632) 3286 715.2 7.6e-206
CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 ( 773) 2125 466.0 9.6e-131
CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 247) 1662 366.4 2.9e-101
>>CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (727 aa)
initn: 4806 init1: 4806 opt: 4806 Z-score: 5571.6 bits: 1041.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4806; 100.0% identity (100.0% similar) in 727 aa overlap (1-727:1-727)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPPPADIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALQHADSSNFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPPPADIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALQHADSSNFY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 INLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 INLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNSSGSMEKRKSMYTRDYKKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNSSGSMEKRKSMYTRDYKKLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 MQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 HDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNY
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DFVYDCN
:::::::
CCDS54 DFVYDCN
>>CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (720 aa)
initn: 2768 init1: 2157 opt: 3705 Z-score: 4294.3 bits: 805.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3705; 75.7% identity (92.8% similar) in 725 aa overlap (1-724:1-717)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPPPADIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALQHADSSNFY
::::.:::::::::::: .:.:::::.::..::::::::::: : ::..:..::. ..:
CCDS13 MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKRPLASIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEF
:::..:..:::::::.:. ::.. :.:: :: :::.:...:.:.:.::.:: ::::: ::
CCDS13 ITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 INLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAF
::.::: .::..::::: :... ...::.::::::.::::::::::: :..:
CCDS13 INMDGIIVLTRLVESGT-------KLLSH-YSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITF
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQ
::.::..:.. .:.:::::::::::::::::..::::.:.:::.:::: ::: :.::::
CCDS13 IKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVL
::.::.:::::::::...::.::: .:::.::::::.::::..: :..::::::::::::
CCDS13 TYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE2 TFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNSSGS-MEKRKSMYTRDYKKL
::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.:.:. :: ::::.:::.::: :
CCDS13 TFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKML
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 GFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIE
:: ::.:::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::::.::
CCDS13 GFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNK
:::::::::.:::::.: ::.:::::::::.:::.: ::::::::::::::::.:::::
CCDS13 LTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 VMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEK
:::::.::. ::: .::.:::::::::..:::.:::..::::::.:.:::: ::.::.::
CCDS13 VMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 IQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEV
::::::::::::::::: ::. :::.. ::::..::::::. ::::::::::...:::::
CCDS13 IQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 PHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDK
.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::: . ::::::.:
CCDS13 TFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 HEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSN
.::::: :::.::::::: :.::..:::::::::.:::::::::::::.::::::::::.
CCDS13 YEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSS
660 670 680 690 700 710
720
pF1KE2 YDFVYDCN
:::::
CCDS13 YDFVYHYG
720
>>CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (632 aa)
initn: 2348 init1: 2157 opt: 3286 Z-score: 3809.1 bits: 715.2 E(32554): 7.6e-206
Smith-Waterman score: 3286; 77.0% identity (93.1% similar) in 636 aa overlap (90-724:2-629)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 YITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQE
:: :::.:...:.:.:.::.:: ::::: :
CCDS82 MERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 FINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVA
:::.::: .::..::::: :... ...::.::::::.::::::::::: :..
CCDS82 FINMDGIIVLTRLVESGT-------KLLSH-YSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSIT
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEI
:::.::..:.. .:.:::::::::::::::::..::::.:.:::.:::: ::: :.:::
CCDS82 FIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEI
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQV
:::.::.:::::::::...::.::: .:::.::::::.::::..: :..:::::::::::
CCDS82 QTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQV
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNSSGS-MEKRKSMYTRDYKK
:::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.:.:. :: ::::.:::.:::
CCDS82 LTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKM
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSI
::: ::.:::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS82 LGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAI
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 ELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFN
::::::::::.:::::.: ::.:::::::::.:::.: ::::::::::::::::.::::
CCDS82 ELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFN
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 KVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKE
::::::.::. ::: .::.:::::::::..:::.:::..::::::.:.:::: ::.::.:
CCDS82 KVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELRE
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 KIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGE
:::::::::::::::::: ::. :::.. ::::..::::::. ::::::::::...::::
CCDS82 KIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGE
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 VPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPD
: .:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::: . ::::::.
CCDS82 VTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPN
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 KHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPS
:.::::: :::.::::::: :.::..:::::::::.:::::::::::::.::::::::::
CCDS82 KYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPS
570 580 590 600 610 620
720
pF1KE2 NYDFVYDCN
.:::::
CCDS82 SYDFVYHYG
630
>>CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 (773 aa)
initn: 2577 init1: 1045 opt: 2125 Z-score: 2460.8 bits: 466.0 E(32554): 9.6e-131
Smith-Waterman score: 2530; 51.6% identity (79.8% similar) in 732 aa overlap (1-727:54-769)
10 20 30
pF1KE2 MPPPADIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPL
: :: ..::.::. : :.:...:: :::
CCDS10 PRPQGPQARCTLGRRCTVSGKCRRPRPSWTMAPPRNVVKIAIKMRDAIPQLIQLDQAKPL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SAIIKEVCDGWSLANHEYFALQHADSSNFYITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHE
.:..:::::.:::.. : .::: ::. ::::.:: :::::.:: :.:.: .:.::
CCDS10 AAVLKEVCDAWSLTHSERYALQFADGHRRYITENNRAEIKNGSILCLSTAPDLEAEQLLG
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPC
.::.: ... :::. :. :. :. ::.: :. .:...: ..:.: .
CCDS10 GLQSNSPEGRREALRRLVPLASDMIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDD------------
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 FGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVL
.:..:...: :: :::.::.:::.:.:. :..:.. .:: . .: :. .:..:::..:
CCDS10 LGEVLALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 NSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQ
.: : : : .:. . .:. ::: .:..:: ..:...::. : .:..: . : :..
CCDS10 SSPALGQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRN
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRI
::..: ..:.. ...::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::.
CCDS10 LRQFIYKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AFDAESEPNNSSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKH
::..:.: .... : ..:.:. .:...:::: : :::.:. ..:::.:::::::::...
CCDS10 AFEVEGESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRN
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 HQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDR
.:: :.:::::::::::::::.:.::.:: .:::.:.::: ::: .:: :::: .:.
CCDS10 APSAYSRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQ
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLS
::.:.::. ::::::::::::::.:::.::::::.::. :.:. ::.::. :..:.. :.
CCDS10 SFHELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALT
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR
: :.:..::.::..:: . :::::.::..::.. ::.:::: :: ::: :::...:::
CCDS10 YGEVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRR
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620
pF1KE2 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPH--DSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEK
:::.:.: ::::::.:.:::.:: : : .:: ..:::::..:..:::::::..::
CCDS10 QDKLWFCCLSPNHKLLQYGDMEE---GASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREK
620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 GALKQNKEVLELAFSILYDSNCQ---LNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRND
:. ::::.. :::::: :: . . ::::::.:.:. .:::::.::::. : :. :: :
CCDS10 GSGKQNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLD
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720
pF1KE2 LDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN
:. ::.:: :::::.:::. ::. :::.: :.:..: :::.
CCDS10 LEQLLTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
730 740 750 760 770
>>CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (247 aa)
initn: 1662 init1: 1662 opt: 1662 Z-score: 1931.5 bits: 366.4 E(32554): 2.9e-101
Smith-Waterman score: 1662; 100.0% identity (100.0% similar) in 247 aa overlap (481-727:1-247)
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLS
10 20 30
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR
40 50 60 70 80 90
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGA
100 110 120 130 140 150
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLL
160 170 180 190 200 210
700 710 720
pF1KE2 SMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN
220 230 240
727 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:35:08 2016 done: Sun Nov 6 09:35:08 2016
Total Scan time: 3.500 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]