Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2325
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2325, 1977 aa
1>>>pF1KE2325 1977 - 1977 aa - 1977 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7827+/-0.00122; mu= 12.4268+/- 0.073
mean_var=127.1595+/-26.110, 0's: 0 Z-trim(105.0): 118 B-trim: 27 in 1/50
Lambda= 0.113737
statistics sampled from 8077 (8195) to 8077 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 6.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977) 13014 2148.4 0
CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8808 1458.3 0
CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8808 1458.3 0
CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000) 8561 1417.7 0
CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 8538 1414.0 0
CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 8503 1408.2 0
CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 7660 1269.9 0
CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 7660 1269.9 0
CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951) 6985 1159.1 0
CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009) 6946 1152.7 0
CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836) 6046 1005.0 0
CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998) 4424 738.9 4.7e-212
CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962) 4319 721.7 7.1e-207
CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015) 4111 687.6 1.4e-196
CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 4111 687.6 1.4e-196
CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 4111 687.6 1.4e-196
CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956) 3853 645.2 7.4e-184
CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1939) 3267 549.1 6.5e-155
CCDS46442.1 SCN7A gene_id:6332|Hs108|chr2 (1682) 3189 536.2 4.1e-151
CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3 (1791) 2775 468.3 1.2e-130
CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983) 2185 371.5 1.8e-101
CCDS44801.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1242 216.8 7.5e-55
CCDS44795.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1236 215.8 1.5e-54
CCDS59166.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1912) 1184 207.3 5e-52
CCDS59167.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1966) 1184 207.3 5.1e-52
CCDS35253.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1977) 1184 207.3 5.1e-52
CCDS55665.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2251) 1185 207.5 5.1e-52
CCDS53443.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2270) 1185 207.5 5.2e-52
CCDS55664.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2313) 1185 207.5 5.3e-52
CCDS46849.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2137) 1184 207.3 5.5e-52
CCDS53734.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1115 196.0 1.4e-48
CCDS44791.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1115 196.0 1.4e-48
CCDS53733.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1115 196.0 1.4e-48
CCDS44800.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1105 194.3 4.4e-48
CCDS44787.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1105 194.3 4.4e-48
CCDS53736.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1105 194.3 4.5e-48
CCDS44794.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1099 193.3 8.7e-48
CCDS44789.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2158) 1018 180.0 8.8e-44
CCDS1407.1 CACNA1S gene_id:779|Hs108|chr1 (1873) 816 146.9 7.4e-34
CCDS44792.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2179) 794 143.3 1e-32
CCDS46848.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2161) 761 137.9 4.4e-31
CCDS2872.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2181) 761 137.9 4.4e-31
CCDS44797.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2155) 540 101.6 3.6e-20
CCDS9498.1 NALCN gene_id:259232|Hs108|chr13 (1738) 523 98.8 2e-19
CCDS46711.1 CACNA1I gene_id:8911|Hs108|chr22 (2188) 521 98.5 3.2e-19
CCDS46710.1 CACNA1I gene_id:8911|Hs108|chr22 (2223) 521 98.5 3.2e-19
CCDS45736.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2171) 490 93.4 1.1e-17
CCDS58576.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2227) 490 93.4 1.1e-17
CCDS54145.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2243) 490 93.4 1.1e-17
CCDS45735.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2250) 490 93.4 1.1e-17
>>CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977 aa)
initn: 13014 init1: 13014 opt: 13014 Z-score: 11538.2 bits: 2148.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13014; 99.9% identity (99.9% similar) in 1977 aa overlap (1-1977:1-1977)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPSSDLEAGKQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPSSDLEAGKQLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 FIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRRISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRRISI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCVGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKCFRNSLENNETLESIMNTLESEEDFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKCFRNSLENNETLESIMNTLESEEDFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQANIEEAKQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQANIEEAKQKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLSESSSETSKLSSKSAKERRNRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLSESSSETSKLSSKSAKERRNRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRAHEKRLSTPNQSPLSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRAHEKRLSTPNQSPLSIR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFGDNESRRGSLFVPHRPQERRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFGDNESRRGSLFVPHRPQERRSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NISQASRSPPMLPVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSALMLPNGQLLPEGTTNQIHKKRRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NISQASRSPPMLPVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSALMLPNGQLLPEGTTNQIHKKRRCS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 SYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTVEELEESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTVEELEESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELFLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELFLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMN
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pF1KE2 DFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 SSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQTLREFILKAFSKKPKISREIRQAEDLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQTLREFILKAFSKKPKISREIRQAEDLN
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 TKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKDKISGFGSSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKDKISGFGSSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KE2 APGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSSSSECSTVDNPLPGEGEEAEAEPMNSDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSSSSECSTVDNPLPGEGEEAEAEPMNSDEP
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pF1KE2 EACFTDGCVRRFSCCQVNIESGKGKIWWNIRKTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAF
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EACFTDGCVWRFSCCQVNIESGKGKIWWNIRKTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAF
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pF1KE2 EDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEMLLKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEMLLKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLV
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pF1KE2 TLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIF
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pF1KE2 WLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPASQVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPASQVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDN
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pF1KE2 VGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNVDKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNVDKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNL
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pF1KE2 FIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDL
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pF1KE2 VTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQHMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQHMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRH
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 YYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIETYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIETYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 TLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KE2 FQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVHPGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVHPGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVV
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 VNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDP
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 PLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSAN
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 PSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYRRYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYRRYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKD
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE2 MAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK
1930 1940 1950 1960 1970
>>CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005 aa)
initn: 8884 init1: 4874 opt: 8808 Z-score: 7808.2 bits: 1458.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10319; 78.5% identity (90.9% similar) in 2006 aa overlap (2-1977:4-2005)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKD-DDEEAPKPSSDLEAGK
..: ::::.:: ::..::: :::::::.:.:.::.:.:: :::..:::.:::::::
CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQERKDEDDENGPKPNSDLEAGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRR
.:::::::::: ::: ::::::::: .:::::::::::.: ::.::::::.:.::.:.:.
CCDS33 SLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPIRK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFC
..:::::::::.:::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS33 LAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA
. .:::::::::::::.::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE2 LIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKC-----------------FRNSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::..:: : :::
CCDS33 LIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNNSL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
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..: : ::.: : :: ...::.:::..:::::: :.:.::::::: ::: :::
CCDS33 DGNGTTFNRTVSIFNWDEYIED-KSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGRN
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 PDYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINL
:.::::::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::.::::::::::::
CCDS33 PNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINL
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:::::::::::::::..:::.::: ::::::..:::.::::.: :::: :: .. .
CCDS33 ILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAAAAAASAESRDFSGAGG
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.:. ::::: .::::::: :: .::::::.::. :. :::.: .. :::::::::::.:
CCDS33 IGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGEEEKND--RVRKSESEDSIRRKGF
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pF1KE2 HLGVEGHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDE
....:: : ..:::.:.:.:: ::::::::: ::.::.:::::.::..:::::..:::::
CCDS33 RFSLEGSRLTYEKRFSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRASLFSFRGRAKDIGSENDFADDE
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:: : ::.::: ::::::: ::: ::.:::::. :.::.:::::::::::::::::
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: :.: :::::::::.. . .::: ::: .: :.:.::. :::::: :::::::.:
CCDS33 GGPSTLT-SAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLEDPTSRQRAMSIASILTNTME
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::::::::::: ::.::. :::.: :.: :. . ..:::::::::::::::::::::
CCDS33 ELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFM
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::::.::::.:..::..:::::::::.::: ::.:::::: ::: ::::::..::.:::.
CCDS33 AMEHYPMTEQFSSVLSVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLM
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:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::..:: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVGMQLFGKSYKECVCKISNDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQ
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.::: :.::::::::::::::::::::::::::::.: ..: . ::::::: :..:::..
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::. .:::: ::: .: : ::. ::::.::.. ::::: :..: :.::. . :
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:.::::.:.....:: .:::.::::::::::: ::::.::.:.::.::.:: : :: .::
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.:::: :::: :.:::. :.:: .: :::::::. :::.:.:::..:: ::::.:::
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.::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::::..:::: .::::::.::::::::
CCDS33 LRKTCYKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILE
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CCDS33 MLLKWVAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRA
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::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::: : : :
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.: : : ::: ::.. .:..::::.::::::::::::::::::::::: :::::::: :
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:.::..:::::.:::.::::::::::::::.::::.:::::::::::.::::::::.:::
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::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI
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::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :
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::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
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:::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLD
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1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 MLLKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRA
:::::.:::...:::::::::::::::::::.:.::.::::.:: :::::::::::::::
CCDS33 MLLKWVAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRA
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1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE2 LSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFP
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::: : : :
CCDS33 LSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGEMFD
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.: : : ::: ::.. .:..::::.::::::::::::::::::::::: :::::::: :
CCDS33 VSVVNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRN
1380 1390 1400 1410 1420 1430
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pF1KE2 VDKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKK
:. ::::: .::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS33 VELQPKYEDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKK
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::::::::::::::::::::.::.:: .::.::.:.::::::.:::::::::::: . ::
CCDS33 YYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQS
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CCDS33 QEMTNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISLRYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIE
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1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KE2 TYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI
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::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :
CCDS33 FGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKD
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::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS33 HPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFE
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KE2 MFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLD
:::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLD
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KE2 ILFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAY
:::::::::::::::::.:: :::::::..:::::::::::::::::::.::: .:::::
CCDS33 ILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAY
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KE2 RRYRLRQNVKNISSIYIKD-GDRDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYD
::: :.:.::..:::: :: : . : :.: .:..::::.::::: : :::::::::
CCDS33 RRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENSTPEKTDMTPSTTSPPSYD
1920 1930 1940 1950 1960 1970
1950 1960 1970
pF1KE2 SVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK
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CCDS33 SVTKPEKEKFEKDKSEKEDKGKDIRESKK
1980 1990 2000
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:.: ::::.:: ::..::: ::.: ::.:.:.::.:. .:::. :::.:::::::.
CCDS33 MAQALLVPPGPESFRLFTRESLAAIEKRAAEEKAKKPKKEQDNDDENKPKPNSDLEAGKN
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CCDS33 LPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVMNKGKAIFRFSATSALYILTPLNPVRKI
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.:::::::::::::::::::::.:::..::::::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS33 AIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFCL
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.::::::::::::: :::.::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGAL
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CCDS33 IQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFNGTMD
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CCDS33 SNGTFVNVTMSTFNWKDYIGDDSHFYVLDGQKDPLLCGNGSDAGQCPEGYICVKAGRNPN
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::::::::::::::.::::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::.::::
CCDS33 YGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLVNLIL
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CCDS33 AVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAVAAASA--ASRDFSGIGGL
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CCDS33 GELLESSSEASKLSSKSAKEWRNRRKKRRQREHLEGNNKGERDSFPKSESEDSVKRSSFL
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....:.: . .:.. .:.:: ::::::::: ::.:.::.:::.::..:.:::..::::::
CCDS33 FSMDGNRLTSDKKFCSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSKTSIFSFRGRAKDVGSENDFADDEH
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CCDS33 STFEDSESRRDSLFVPHRHGERRNSNVSQASMSSRMVPGLPANGKMHSTVDCNGVVSLVG
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CCDS33 GPSALTSPTGQLPPEGTTTETEVRKRRLSSYQISMEMLEDSSGRQRAVSIASILTNTMEE
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:::::::::: :::::. ::::.: :.: :. . .:::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEESRQKCPPCWYRFANVFLIWDCCDAWLKVKHLVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMA
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CCDS33 MEHYPMTEQFSSVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGIIVSLSLME
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CCDS33 LGLSNVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAV
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CCDS33 VGMQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQT
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:. .:: . ::: .:::. ::.. ..: .. .::.: :.:: :.:.. . .
CCDS33 KNKMRECFQKAFFRKPKVI-EIHE----GNKIDSCMSNNTGIEISKELNYLRDGNGTTSG
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CCDS33 VGTGSSVEKYVIDENDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEEFSSESELEESKEKL
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: .:::: :::: :: :::.::.:: .. .::::::.::...: :::. : :::::::
CCDS33 NATSSSEGSTVDVVLPREGEQAETEPEEDLKPEACFTEGCIKKFPFCQVSTEEGKGKIWW
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pF1KE2 NIRKTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFIL
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CCDS33 NLRKTCYSIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFIL
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::::::.:::..::::::::::::::::::::.::::.::::.:: ::::::::::::::
CCDS33 EMLLKWVAYGFQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLR
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pF1KE2 ALSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRF
:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:.: : :. :
CCDS33 ALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTGNMF
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pF1KE2 PASQVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSV
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CCDS33 DISDVNNLSDCQAL---GKQARWKNVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSR
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CCDS33 DVKLQPVYEENLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQK
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CCDS33 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQ
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CCDS33 GKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVSLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEMI
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pF1KE2 ETYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYA
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CCDS33 EKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYA
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pF1KE2 IFGMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKK
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CCDS33 IFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDT
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pF1KE2 VHPGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDF
.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS33 IHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDF
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pF1KE2 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL
1800 1810 1820 1830 1840 1850
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pF1KE2 DILFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRA
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CCDS33 DILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEDRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRN
1860 1870 1880 1890 1900 1910
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pF1KE2 YRRYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDD-DLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSY
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CCDS33 FRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGRIDLPIKQDMIIDKLNGNSTPEKTDGSSSTTSPPSY
1920 1930 1940 1950 1960 1970
1950 1960 1970
pF1KE2 DSVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK
::::::::::.:.:. :::.:::. .:..:
CCDS33 DSVTKPDKEKFEKDKPEKESKGKEVRENQK
1980 1990 2000
>>CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998 aa)
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CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEAGKN
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pF1KE2 LPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRRI
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CCDS33 LPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPLRKI
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pF1KE2 SIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCV
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CCDS33 AIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGFCL
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pF1KE2 GEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGAL
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CCDS33 EDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGAL
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CCDS33 IQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNITVNY
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pF1KE2 --SIMNTLESEEDFR------KYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDY
...: : :.. .: :.::: :::::: :.:.::::::: ::: ::::.:
CCDS33 NGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNY
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 GYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILA
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CCDS33 GYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILA
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400 410 420 430 440 450
pF1KE2 VVAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLS
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CCDS33 VVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLS
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460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ESSSETSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVE
.::::.:::::::::::::::::..::. :.:::: : ....:::::::::::.:....:
CCDS33 DSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEK-DEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIE
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pF1KE2 GHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFG
:.: ..::: :.:.:: ::::::::: ::.::::::::.::..:.:::..::::::: :
CCDS33 GNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFE
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pF1KE2 DNESRRGSLFVPHRPQERRSSNISQASRSPPML---PVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSA
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CCDS33 DNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTVDCNGVVSLVGGPSV
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CCDS33 PTSPVGQLLPEGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQRAMSIASILTNTVEELEES
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:::::: ::.:.. ::::.:::::.: :. . ..:::::::::::::::::::::::::.
CCDS33 RQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHY
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:::..:.:::..:::::::::.::: ::.:::::: ::: ::::::..::::::::: ::
CCDS33 PMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLA
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:::::::.::::: .:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLT
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::: ..: .: :: ::. .:::.::.. .:::: ::..: ..::. . . : :
CCDS33 YEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNHT-AEIGKDLDYLKDVNGTTSGIGTG
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:::.:.....:: .:::.::::::::::: ::::.::.:.:..::.:: : :: .::.::
CCDS33 SSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEDFSSESDLEESKEKLNESS
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:: : :::: : : :. .:: .. :::::::.:::.::.:::.:.: :.:: :::.:
CCDS33 SSSEGSTVDIGAPVE-EQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLR
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.::..::::.:::.:::.::::::::::::::::...:::: .::::::.::::::::::
CCDS33 RTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEML
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CCDS33 RFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIE
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CCDS33 DVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVE
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CCDS33 NAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEY
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.: .: ::.:::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::: :
CCDS33 VTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKY
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CCDS33 FVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFG
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::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:
CCDS33 MSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNP
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::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS33 GSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMF
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::::::::::::::.:: :::.:::::.::: . .:::.:::::::::::::::::::::
CCDS33 YEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDIL
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CCDS33 FAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRR
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CCDS33 HLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDR
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CCDS33 VTKPIVEKHEQEGKDEKAKGK
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CCDS54 NAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEY
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE2 MTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIETY
.: .: ::.:::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::: :
CCDS54 VTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKY
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KE2 FVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFG
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFG
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KE2 MSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVHP
::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:
CCDS54 MSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNP
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE2 GSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMF
::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS54 GSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMF
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE2 YEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDIL
::::::::::::::.:: :::.:::::.::: . .:::.:::::::::::::::::::::
CCDS54 YEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDIL
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KE2 FAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYRR
:::::::::::::::.:: :::::::..:::::::.:::::::::::.:::..:::::::
CCDS54 FAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRR
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1900 1910 1920 1930 1940
pF1KE2 YRLRQNVKNISSIYIKDGDRDD-DLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTS-PPSYDS
. :...::. : : :. . .:: :.:: .: .:::: :::: : ::.. :::::
CCDS54 HLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDR
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1950 1960 1970
pF1KE2 VTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK
:::: ::.::. ... :::
CCDS54 VTKPIVEKHEQEGKDEKAKGK
1970 1980
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:::.::::::::: :.:. ::::.:::: .:::.:::.:::.:::.::::::.::::.
CCDS44 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:: .. ::. ::. . .
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::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::.:::::.:::::::::::::::::
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420 430 440 450 460
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..:::.::: ::. ::..:::.::::.: :: :. .. .. : : .::::
CCDS44 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQA-AAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSE
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:::::::::::::::::..::.:: :::::: ::. ::::::..:::.:.: .: .
CCDS44 ISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRL--PDNRIG
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pF1KE2 HEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGR--DIGSETEFADDEHSIFGDNE
...: ::: ::: :: : .:..:..:.:::.: :: : :::.:::::::: ..:
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.:: :::.: : .::::: . ::.::: ..: . : .:.:::::::::. :
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.. . .:.::::.::. ::. .: :.: :.: . . ..: : :..::: :::::
CCDS44 GSHI--GGRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELE
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::..:::: ::.::. ::::.: :::::.:. . .:::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAME
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CCDS44 LADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVG
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CCDS44 KVHAFMQAHFKQRE--ADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIG
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:::.:... : : .:::.::.::: :::: ::::.::.:.:..::.:: : :: .:. .:
CCDS44 SSVEKYII-DEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTS
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::: ::.: . : ::. .: : . .:.::::.:::.::.::::::: : :: :: .:
CCDS44 SSEGSTID--IKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILR
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::: :::. .::::::::::::: ::::.:.::.::::.:: :::::::::::::::::
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::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.. :.: :. ::
CCDS44 RFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIE
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CCDS44 DVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKP
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pF1KE2 YNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQ
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CCDS44 QMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEK
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::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::..::
CCDS44 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIF
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CCDS44 GMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILN-RPPDCSLDKEH
1670 1680 1690 1700 1710 1720
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pF1KE2 PGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEM
:::. .:::::::::::.::::::::::.:::::::.::::::::::::..::::::::
CCDS44 PGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFET
1730 1740 1750 1760 1770 1780
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pF1KE2 FYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDI
:::.:::::::::::::. ::.::: ::. :: . ::: ..:::::::::::::::::::
CCDS44 FYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDI
1790 1800 1810 1820 1830 1840
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pF1KE2 LFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYR
::::::::::.:::.: ::.::::::...::::::::::::::.::::.:::.:.:::::
CCDS44 LFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYR
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KE2 RYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSV
. :.. .. :: . : .. :: ..: ::.: ::::::
CCDS44 GHLARRG-----------------FICKKTTSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSV
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1960 1970
pF1KE2 TKPDKEKY---EQDRTEKEDKGKDSKESKK
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CCDS44 TKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
1960 1970 1980
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKE----EKKDDDEEAPKPSSDLE
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CCDS81 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
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CCDS81 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
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pF1KE2 LRRISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILAR
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CCDS81 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
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CCDS81 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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CCDS81 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
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CCDS81 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQA-AAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSE
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pF1KE2 TSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRA
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CCDS81 ISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRL--PDNRIG
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pF1KE2 HEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGR--DIGSETEFADDEHSIFGDNE
...: ::: ::: :: : .:..:..:.:::.: :: : :::.:::::::: ..:
CCDS81 --RKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESE
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CCDS46 RFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTGNMFDIS
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CCDS46 DVNNLSDCQAL---GKQARWKNVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRDVK
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CCDS46 YEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDIL
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1870 1880 1890 1900 1910 1920
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]