Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2318
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2318, 1980 aa
1>>>pF1KE2318 1980 - 1980 aa - 1980 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1965+/-0.00123; mu= 16.2145+/- 0.074
mean_var=130.4180+/-26.975, 0's: 0 Z-trim(105.1): 117 B-trim: 462 in 1/50
Lambda= 0.112307
statistics sampled from 8129 (8246) to 8129 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 5.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 13129 2140.5 0
CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 13123 2139.5 0
CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1939) 8480 1387.2 0
CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 8391 1372.8 0
CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 8359 1367.6 0
CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8357 1367.3 0
CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8356 1367.1 0
CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000) 8190 1340.2 0
CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009) 7696 1260.2 0
CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977) 7652 1253.0 0
CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951) 6591 1081.1 0
CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836) 6012 987.3 0
CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 5804 953.6 0
CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015) 5798 952.7 0
CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 5798 952.7 0
CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962) 4224 697.6 1.2e-199
CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956) 3785 626.5 3.2e-178
CCDS46442.1 SCN7A gene_id:6332|Hs108|chr2 (1682) 2855 475.8 6.5e-133
CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3 (1791) 2726 454.9 1.3e-126
CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998) 2607 435.6 9.3e-121
CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983) 1687 286.6 6.9e-76
CCDS44801.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1213 209.8 9.7e-53
CCDS44795.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1207 208.8 1.9e-52
CCDS44796.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2144) 1202 208.0 3.3e-52
CCDS59166.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1912) 1169 202.6 1.2e-50
CCDS59167.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1966) 1169 202.6 1.3e-50
CCDS35253.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1977) 1169 202.6 1.3e-50
CCDS46849.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2137) 1155 200.4 6.5e-50
CCDS55665.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2251) 1142 198.3 2.9e-49
CCDS53443.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2270) 1142 198.3 2.9e-49
CCDS55664.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2313) 1142 198.3 3e-49
CCDS44798.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1087 189.4 1.3e-46
CCDS44791.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1081 188.4 2.6e-46
CCDS53734.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1081 188.4 2.6e-46
CCDS53735.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1081 188.4 2.7e-46
CCDS53733.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1081 188.4 2.7e-46
CCDS44800.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1074 187.3 5.8e-46
CCDS44787.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1074 187.3 5.8e-46
CCDS44799.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1074 187.3 5.9e-46
CCDS53736.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1074 187.3 5.9e-46
CCDS44794.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1068 186.3 1.1e-45
CCDS44793.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1068 186.3 1.1e-45
CCDS44789.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2158) 986 173.0 1.1e-41
CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2237) 940 165.6 2.1e-39
CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2339) 940 165.6 2.1e-39
CCDS44797.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2155) 844 150.0 9.7e-35
CCDS44790.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2166) 838 149.0 1.9e-34
CCDS1407.1 CACNA1S gene_id:779|Hs108|chr1 (1873) 829 147.5 4.7e-34
CCDS44792.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2179) 825 146.9 8.2e-34
CCDS46848.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2161) 795 142.1 2.4e-32
>>CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980 aa)
initn: 13129 init1: 13129 opt: 13129 Z-score: 11495.1 bits: 2140.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13129; 99.9% identity (99.9% similar) in 1980 aa overlap (1-1980:1-1980)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESEGRRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESEGRRDS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGPGSHIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGPGSHIG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 SVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 YKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 MVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 AHFKQCEADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIID
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AHFKQREADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIID
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 EDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 ETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 TNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 EGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYM
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 QKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 QFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSG
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
1930 1940 1950 1960 1970 1980
>>CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980 aa)
initn: 13123 init1: 13123 opt: 13123 Z-score: 11489.8 bits: 2139.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13123; 99.8% identity (99.9% similar) in 1980 aa overlap (1-1980:1-1980)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
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pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
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pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS81 PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
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CCDS81 TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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CCDS53 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMV
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pF1KE2 AHFKQCEADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIID
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AHFKQREADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIID
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWF
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pF1KE2 ETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFF
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pF1KE2 TNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNAL
:::::::::::::: :::::
CCDS53 TNAWCWLDFLIVAV-----------------------------------------VVNAL
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pF1KE2 VGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLM
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pF1KE2 EGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYM
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pF1KE2 YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV
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pF1KE2 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 QFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSG
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
1880 1890 1900 1910 1920 1930
>>CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981 aa)
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pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
: .:.:::::::. :: :::: ::::::: : :.: : : ..::... ::::::::
CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNP-KPD---KKDDDENGPKPNSDLE
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pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
:::.::::::::: .:. ::::.::::...:::.:::.::..:::::: :::::.:::
CCDS54 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNP
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pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
.:.::::::.::.:::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.:::::
CCDS54 LRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIAR
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
:::.. :::::::::::::.:: .::.::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS54 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 -INFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGR
.:.: . ... . :::. ::... : . :.:. ::::::::::::::::.:.::::
CCDS54 TVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGR
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pF1KE2 NPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVN
:::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS54 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIE
::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::: :: :: ::. :: .
CCDS54 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATA----SEHS--
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 EEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGM
.: .: :::: :::::::::::::::::::::: : :::: : .. ::::::..
CCDS54 REPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEK-DEDEFQKSESEDSI
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 RRKAFR--LPDNRIG--RKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSE
:::.:: . ::. ...: .:::::: :: : :.::..:.:::: :: .: :::
CCDS54 RRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFR--GRAKDVGSE
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 NEFADDEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRN
:.:::::::: :..:.::::::.: : :::.: . :: :::::.. . . : .
CCDS54 NDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNS-----NLSQTSRSSRMLAVFPANGKMH
590 600 610 620 630 640
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pF1KE2 STVDCNGVVSLIGGPGSHIGGRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSI
::::::::::: :. :::.:..:. .:. :::: : . ....: ::
CCDS54 STVDCNGVVSL----GT----------TTETEMRKRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQRAMSI
650 660 670 680
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pF1KE2 MSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAIT
:..::: :::::::..:::::::::.: ::::.: :::.:.:..:::.:::::::::::
CCDS54 ASILTNT-VEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVDLAIT
690 700 710 720 730 740
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pF1KE2 ICIVLNTLFMAMEHHPMTPQFEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIF
::::::::::::::.::: .:..::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 ICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIF
750 760 770 780 790 800
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pF1KE2 DGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTL
:::::.:::.::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTL
810 820 830 840 850 860
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pF1KE2 VLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIET
::::::::::::::::::::::.::::: .::.::::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 VLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIET
870 880 890 900 910 920
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 MWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQIS
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.
CCDS54 MWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDNEMNNLQIA
930 940 950 960 970 980
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 VIRIKKGVAWTKLKVHAFMQAHF--KQCEADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGD
: :..::::..: :.. :.: : :: ::.::::.: .:: .:..::: :.: .. :
CCDS54 VDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNHT-AEIGKDLD
990 1000 1010 1020 1030 1040
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 FQKNGNGTTSGIG--SSVEKYIIDE-DHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSS
. :. :::::::: :::::::::: :.:::::::.::: ::::::::::::::::: ::
CCDS54 YLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEDFSS
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KE2 ESDPEGSKDKLDDTSSS-EGSTIDIKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQV
::: : ::.::...::: ::::.:: ::: :: .::: :.:.:::::::::::::::.
CCDS54 ESDLEESKEKLNESSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQI
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KE2 NIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEY
:.::: ::.:: ::.::: :::::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:.:::
CCDS54 NVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEY
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KE2 ADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKS
:::::::::::::::::.:::. .::::::::::::: :::::: ::::::::::::::
CCDS54 ADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKS
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE2 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYH
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::..
CCDS54 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFY
1290 1300 1310 1320 1330 1340
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pF1KE2 YCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKG
.:.: :. ::.::::::.:.: ::.: :.: ::::::.:::::: :::.:::::::::
CCDS54 HCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETA-RWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKG
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KE2 WMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKF
::::::::::::. . :::::...:::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKF
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KE2 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICL
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::.:.::: ::.::::
CCDS54 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICL
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KE2 NMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVI
:::::::::: ::. . .:: :::::...:: :::::...:::::::::::::::::::
CCDS54 NMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVI
1530 1540 1550 1560 1570 1580
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pF1KE2 LSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNI
:::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNI
1590 1600 1610 1620 1630 1640
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pF1KE2 GLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPI
::::::::::..:::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS54 GLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPI
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pF1KE2 LN-RPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVAT
:: .::::. .: .:::. :::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS54 LNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVAT
1710 1720 1730 1740 1750 1760
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pF1KE2 EESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMD
::::.:::::::: :::.:::::::::::.:. ::..:: ::: :: .:.:: ..:::::
CCDS54 EESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMD
1770 1780 1790 1800 1810 1820
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pF1KE2 LPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRK
::::::::::::::::::::::::.:::.: :: ::::::.:::::::::.::::::.::
CCDS54 LPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRK
1830 1840 1850 1860 1870 1880
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pF1KE2 QEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLE-NGGTH-----------------REKK
:::::::..::::: :: .: . : :: . .::.. ::
CCDS54 QEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKT
1890 1900 1910 1920 1930 1940
1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 ESTPSTASLP-SYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
. : :::. : ::: :::: ::.. .::. :.::
CCDS54 DLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHE--QEGKDEKAKGK
1950 1960 1970 1980
>>CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
: .:.:::::::. :: :::: ::::::: : :.: : : ..::... ::::::::
CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNP-KPD---KKDDDENGPKPNSDLE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
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CCDS33 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNP
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pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
.:.::::::.::.:::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.:::::
CCDS33 LRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIAR
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pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
:::.. :::::::::::::.:: .::.::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS33 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 -INFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGR
.:.: . ... . :::. ::... : . :.:. ::::::::::::::::.:.::::
CCDS33 TVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGR
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pF1KE2 NPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVN
:::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIE
::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::: :: :: ::. :: .
CCDS33 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATA----SEHS--
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 EEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGM
.: .: :::: :::::::::::::::::::::: : :::: : .. ::::::..
CCDS33 REPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEK-DEDEFQKSESEDSI
480 490 500 510 520
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pF1KE2 RRKAFR--LPDNRIG--RKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSE
:::.:: . ::. ...: .:::::: :: : :.::..:.:::: :: .: :::
CCDS33 RRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFR--GRAKDVGSE
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 NEFADDEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRN
:.:::::::: :..:.::::::.: : :::.: . :: :::::.. . . : .
CCDS33 NDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNS-----NLSQTSRSSRMLAVFPANGKMH
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KE2 STVDCNGVVSLIGGPGSHIG--GRLLPEATT-EVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRI
:::::::::::.:::. . :.::::.:: :.:..:. .:. :::: : . ....:
CCDS33 STVDCNGVVSLVGGPSVPTSPVGQLLPEGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQRA
650 660 670 680 690 700
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pF1KE2 NSIMSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDL
:: :..::: :::::::..:::::::::.: ::::.: :::.:.:..:::.::::::::
CCDS33 MSIASILTNT-VEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVDL
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760 770 780 790 800 810
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:::::::::::::::::.::: .:..::.:::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS33 AITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGW
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::::::::.:::.::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::.::::: .::.::::::.:::::::::::::::::
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::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS33 IETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDNEMNNL
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::.: :..::::..: :.. :.: : :: ::.::::.: .:: .:..::: :.: .
CCDS33 QIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNHT-AEIGK
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. :. :. :::::::: :::::::::: :.:::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS33 DLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTED
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::::: : ::.::...::: ::::.:: ::: :: .::: :.:.:::::::::::::
CCDS33 FSSESDLEESKEKLNESSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKC
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::.:.::: ::.:: ::.::: :::::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:.
CCDS33 CQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTM
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::::::::::::::::::::.:::. .::::::::::::: :::::: :::::::::::
CCDS33 LEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGA
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:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
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:...:.: :. ::.::::::.:.: ::.: :.: ::::::.:::::: :::.::::::
CCDS33 KFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETA-RWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVAT
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::.:.::: ::.:
CCDS33 KKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMIL
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::::::::::::: ::. . .:: :::::...:: :::::...::::::::::::::::
CCDS33 ICLNMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFV
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::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPAL
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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:::::::::::::..:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLL
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:::: .::::. .: .:::. :::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::
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:::::::.:::::::: :::.:::::::::::.:. ::..:: ::: :: .:.:: ..::
CCDS33 VATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLI
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:::::::::::::::::::::::::::.:::.: :: ::::::.:::::::::.::::::
CCDS33 AMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTL
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.:::::::::..::::: :: .: . : :: . .::..
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CCDS33 SIRRKGFRFSLEGSRLTYEKRFSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRASLFSFRG--RAKDIG
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:::.:::::::: :....::::::.: : ::: .:. ::.::.::..: : . :
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.:.:::::::::.:::.. . :.::::.:: :.::.:. .: :::: : . ..:
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CCDS33 KSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGK
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CCDS33 VILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALF
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CCDS33 NIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLA
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CCDS33 PILNSGPPDCDPDKDHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSV
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pF1KE2 ATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIA
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CCDS33 ATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIA
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CCDS33 MDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLK
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::::::::...::::: .: . .: : . : .::....:
CCDS33 RKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENSTP-
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 EKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
:: . ::::.: ::::::::::::: :. . :. . :..::::
CCDS33 EKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEK---FEKDKSEKEDKGKDIRESKK
1970 1980 1990 2000
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::..:::::.::.:.:.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.::.::
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:::.:::::::: :....::::::.: : ::: .:. ::.::.::..: : . :
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:: :..:::. ::::::..::::::::::: :::.: :.:.:..:::.:::::::
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CCDS33 KDLNYLKDGNGTTSGIGSSVEKYVVDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEEF
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CCDS33 SSESDMEESKEKLNATSSSEGSTVDIGAPAEGEQPEVEPEESLEPEACFTEDCVRKFKCC
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:..:::: :: :: :::::. :::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.:
CCDS33 QISIEEGKGKLWWNLRKTCYKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTML
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:::::::::::::::::::.:::: .::::::::::::: :::::: ::::::::::::
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...:.: :. :.. ::: .::. :.:.:.: ::::::.:::::: :::.:::::::
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:::::::::::: ::..: ::::::::::...:: :::::...::.::::::::::::::
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CCDS33 VILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALF
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CCDS33 PILNSGPPDCDPDKDHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSV
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CCDS33 ATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIA
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CCDS33 MDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLK
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CCDS33 RKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENSTP-
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pF1KE2 EKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
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CCDS33 EKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEK---FEKDKSEKEDKGKDIRESKK
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CCDS33 MAQALLVPPGPESFRLFTRESLAAIEKRAAEEKAKKPKK----EQDNDDENKPKPNSDLE
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CCDS33 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVMNKGKAIFRFSATSALYILTPLNP
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CCDS33 VRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
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CCDS33 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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CCDS33 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFN
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CCDS33 --SGIGGLGELLESSSEASKLSSKSAKEWRNRRKKRRQREHLEGNNKGERDSFPKSESED
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CCDS33 SVKRSSFLFSMDGNRLTSDKKFCSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSKTSIFSFRG--RAKDVG
540 550 560 570 580
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CCDS33 SENDFADDEHSTFEDSESRRDSLFVPHRHGERRN-----SNVSQASMSSRMVPGLPANGK
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.:::::::::::.:::.. . :.: ::.:: :.:..:. .: .::..: . . ..
CCDS33 MHSTVDCNGVVSLVGGPSALTSPTGQLPPEGTTTETEVRKRRLSSYQISMEMLEDSSGRQ
650 660 670 680 690 700
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pF1KE2 RINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFV
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CCDS33 RAVSIASILTNTM-EELEESRQKCPPCWYRFANVFLIWDCCDAWLKVKHLVNLIVMDPFV
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pF1KE2 EWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMN
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CCDS33 EWIETMWDCMEVAGQTMCLIVFMLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMN
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CCDS33 NLQIAVGRMQKGIDYVKNKMRECFQKAFFRKPKVIEIHEGNKI----DSCMSNNTGIEIS
1010 1020 1030 1040 1050
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 RNGDFQKNGNGTTSGIG--SSVEKYIIDE-DHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTE
.. .. ..:::::::.: ::::::.::: :.:::::::.::: ::::::::::::::::
CCDS33 KELNYLRDGNGTTSGVGTGSSVEKYVIDENDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 DVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIK-PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFK
. ::::. : ::.::. ::::::::.:. :. : .::: : :.:::::::...:
CCDS33 EFSSESELEESKEKLNATSSSEGSTVDVVLPREGEQAETEPEEDLKPEACFTEGCIKKFP
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 CCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRT
:::. ::: :: :: :::::. :::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:
CCDS33 FCQVSTEEGKGKIWWNLRKTCYSIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKT
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE2 ILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELG
.::::::::::::::::::::.:::: .::::::::::::: ::::::.::::::::::
CCDS33 MLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGFQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANALGYSELG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KE2 AIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFA
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KE2 GKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVA
::...: : :. :.: :::: ..:. : . . ::::::.::::::::::::::::
CCDS33 GKFYHCVNMTTGNMFDISDVNNLSDCQAL----GKQARWKNVKVNFDNVGAGYLALLQVA
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KE2 TFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQ
:::::::::::::::: :: ::.:.:::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TFKGWMDIMYAAVDSRDVKLQPVYEENLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQ
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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pF1KE2 KKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::.:.::: ::.
CCDS33 KKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTRQVFDISIMI
1480 1490 1500 1510 1520 1530
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pF1KE2 LICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDF
:::::::::::::: :.: : .: :::::...:: : :::. .:::::::::::::::
CCDS33 LICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVSLRHYYFTIGWNIFDF
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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pF1KE2 VVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPA
:::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVVILSIVGMFLAEMIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPA
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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pF1KE2 LFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGL
::::::::::::::..:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGL
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1720 1730 1740 1750 1760
pF1KE2 LLPILNR-PPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENF
: :::: ::::. : ::::. :::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::
CCDS33 LAPILNSAPPDCDPDTIHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENF
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KE2 SVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIEL
::::::::.:::::::: :::.:::::::::::::. ::.::: ::. :: . ::: ..:
CCDS33 SVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQL
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KE2 IAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTT
::::::::::::::::::::::::::::.:::.: :: :::.::.:::::::::::::::
CCDS33 IAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEDRFMASNPSKVSYEPITTT
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1890 1900 1910 1920 1930
pF1KE2 LRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLE------------------NGGTH
:.::::::::...:: .: .: .. . ... :: ::..
CCDS33 LKRKQEEVSAAIIQRNFRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGRIDLPIKQDMIIDKLNGNST
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 REKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
:: ... ::.: :::::::::.::: :. . :. .. :::::..
CCDS33 PEKTDGSSSTTSPPSYDSVTKPDKEK---FEKDKPEKESKGKEVRENQK
1960 1970 1980 1990 2000
>>CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009 aa)
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pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
: .:.:::::::. :: :::: ::::::: : :.: : : ..::... ::::::::
CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNP-KPD---KKDDDENGPKPNSDLE
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pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
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CCDS54 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNP
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pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
.:.::::::.::.:::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.:::::
CCDS54 LRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIAR
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pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
:::.. :::::::::::::.:: .::.::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS54 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 -INFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGR
.:.: . ... . :::. ::... : . :.:. ::::::::::::::::.:.::::
CCDS54 TVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGR
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:::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS54 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN
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::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::: :: :: ::. :: .
CCDS54 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATA----SEHS--
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pF1KE2 EEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGM
.: .: :::: :::::::::::::::::::::: : :::: : .. ::::::..
CCDS54 REPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEK-DEDEFQKSESEDSI
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pF1KE2 RRKAFR--LPDNRIG--RKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSE
:::.:: . ::. ...: .:::::: :: : :.::..:.:::: :: .: :::
CCDS54 RRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFR--GRAKDVGSE
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pF1KE2 NEFADDEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRN
:.:::::::: :..:.::::::.: : :::.: . :: :::::.. . . : .
CCDS54 NDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNS-----NLSQTSRSSRMLAVFPANGKMH
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:::::::::::.:::. . :.::::. :::.:..:. .:. ::::
CCDS54 STVDCNGVVSLVGGPSVPTSPVGQLLPEVIIDKPATDDNGTTTETEMRKRRSSSFHVSMD
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pF1KE2 QLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIV
: . ....: :: :..::: :::::::..:::::::::.: ::::.: :::.:.:..:
CCDS54 FLEDPSQRQRAMSIASILTNT-VEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVV
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::.:::::::::::::::::::::::::.::: .:..::.:::::::::::::::::.::
CCDS54 NLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIA
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pF1KE2 MDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIK
:::::::::::::::::::.:::.::.::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MDPYYYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIK
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pF1KE2 IIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .::.::::::.::::::
CCDS54 IIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSF
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930 940 950 960 970 980
pF1KE2 LIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLA
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLA
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pF1KE2 ATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQAHF--KQCEADEVKPLDELYEKKANC
:::::.:::::::.: :..::::..: :.. :.: : :: ::.::::.: .:: .:
CCDS54 ATDDDNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSC
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pF1KE2 IANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIG--SSVEKYIIDE-DHMSFINNPNLTVRVPIAVG
..::: :.: .. :. :. :::::::: :::::::::: :.:::::::.::: ::::::
CCDS54 MSNHT-AEIGKDLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVG
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CCDS54 ESDFENLNTEDFSSESDLEESKEKLNESSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLEPEAC
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pF1KE2 FTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDI
:::::::::::::.:.::: ::.:: ::.::: :::::::::::.:::::::::::::::
CCDS54 FTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDI
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pF1KE2 YIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLI
::.:::::.:.::::::::::::::::::::.:::. .::::::::::::: ::::::
CCDS54 YIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLT
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pF1KE2 ANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 ANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLI
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pF1KE2 FSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVG
::::::::::::...:.: :. ::.::::::.:.: ::.: :.: ::::::.::::::
CCDS54 FSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETA-RWKNVKVNFDNVG
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CCDS54 FGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::
CCDS54 GVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVT
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pF1KE2 QQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYY
.:.::: ::.:::::::::::::: ::. . .:: :::::...:: :::::...:::::
CCDS54 RQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYY
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pF1KE2 FTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTL
:::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTL
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pF1KE2 LFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQ
::::::::::::::::::::::::..:::::::::::.:.::::::::::::::::::::
CCDS54 LFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQ
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pF1KE2 ITTSAGWDGLLLPILN-RPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVN
::::::::::: :::: .::::. .: .:::. :::::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 ITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVN
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KE2 MYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPL
::::.:::::::::::::.:::::::: :::.:::::::::::.:. ::..:: ::: ::
CCDS54 MYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPL
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KE2 RVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPS
.:.:: ..:::::::::::::::::::::::::::::.:::.: :: ::::::.:::::
CCDS54 NLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPS
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KE2 KVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLE-NGGTH-------
::::.::::::.:::::::::..::::: :: .: . : :: . .::..
CCDS54 KVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDM
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 ----------REKKESTPSTASLP-SYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
:: . : :::. : ::: :::: ::.. .::. :.::
CCDS54 IIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHE--QEGKDEKAKGK
1960 1970 1980 1990 2000
>>CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977 aa)
initn: 6555 init1: 2043 opt: 7652 Z-score: 6699.2 bits: 1253.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9181; 70.9% identity (85.9% similar) in 2005 aa overlap (5-1979:3-1976)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
.: ::::.:: :: .::: ::.:::: : :.: . ...::.. :::.::::
CCDS46 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKE----EKKDDDEEAPKPSSDLE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
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CCDS46 AGKQLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSP
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pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
.:::.::::.::.:::.:::::::::.:::..:::::.:::::::::::::::::::.::
CCDS46 LRRISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILAR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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CCDS46 GFCVGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
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CCDS46 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKCFRNSLENNET-LESIMNTL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF
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CCDS46 ESEE--DFRKYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSWAF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA
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CCDS46 LALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE2 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQA-AAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSE
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CCDS46 NIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIM-------GLSESSSE
420 430 440 450 460
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pF1KE2 ISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRL--PDNRIG
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CCDS46 TSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRA
470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 --RKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESE
...: ::: ::: :: : .:..:..:.:::.: :: : :::.:::::::: ..:
CCDS46 HEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGR--DIGSETEFADDEHSIFGDNE
530 540 550 560 570 580
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pF1KE2 GRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGP
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CCDS46 SRRGSLFVPHRPQERRSS-----NISQASRSPPMLPV---NGKMHSAVDCNGVVSLVDGR
590 600 610 620 630
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pF1KE2 GSHI--GGRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELE
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CCDS46 SALMLPNGQLLPEGTTNQIHKKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNT-VEELE
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pF1KE2 ESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAME
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CCDS46 ESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAME
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pF1KE2 HHPMTPQFEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELS
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CCDS46 HHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEMVLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELF
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pF1KE2 LADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVG
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CCDS46 LADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVG
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pF1KE2 MQLFGKSYKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMC
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CCDS46 MQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMC
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pF1KE2 LIVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKL
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CCDS46 LIVYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQ
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pF1KE2 KVHAFMQAHFKQCE--ADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIG
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CCDS46 TLREFILKAFSKKPKISREIRQAEDLNTKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKD-KISGFG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KE2 SSVEKYII-DEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTS
:::.:... : : .:::.::.::: :::: ::::.::.:.:..::.:: : :: .:. .:
CCDS46 SSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSS
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pF1KE2 SSEGSTID--IKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILR
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CCDS46 SSECSTVDNPLPGEGEEAEAE-PMNSDEPEACFTDGCVWRFSCCQVNIESGKGKIWWNIR
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pF1KE2 KTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEML
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CCDS46 KTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEML
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pF1KE2 LKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALS
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CCDS46 LKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALS
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CCDS46 RFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPAS
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pF1KE2 DVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKP
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CCDS46 QVPNRSECFALMNVSQN-VRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNV
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CCDS46 DKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKY
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CCDS46 YNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQ
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pF1KE2 QMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEK
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CCDS46 HMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIET
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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pF1KE2 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIF
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CCDS46 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIF
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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pF1KE2 GMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILN-RPPDCSLDKEH
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CCDS46 GMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVH
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pF1KE2 PGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFET
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CCDS46 PGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEM
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pF1KE2 FYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDI
:::.:::::::::::::. ::.::: ::. :: . ::: ..:::::::::::::::::::
CCDS46 FYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDI
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pF1KE2 LFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYR
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CCDS46 LFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYR
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 10:44:54 2016 done: Sun Nov 6 10:44:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]