Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2309
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2309, 1257 aa
1>>>pF1KE2309 1257 - 1257 aa - 1257 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3020+/-0.00106; mu= 3.7215+/- 0.064
mean_var=411.9786+/-84.255, 0's: 0 Z-trim(115.4): 94 B-trim: 167 in 1/53
Lambda= 0.063188
statistics sampled from 15865 (15955) to 15865 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16
Scan time: 5.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257) 8609 800.2 0
CCDS2463.1 IRS1 gene_id:3667|Hs108|chr2 (1242) 758 84.5 1.9e-15
CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338) 716 80.7 2.8e-14
>>CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257 aa)
initn: 8609 init1: 8609 opt: 8609 Z-score: 4259.0 bits: 800.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8609; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASCSFTRDQATRRLRGAAAAAAAALAAVVTTPLLSSGTPTALIGTGSSCPGAMWLSTAT
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CCDS14 MASCSFTRDQATRRLRGAAAAAAAALAAVVTTPLLSSGTPTALIGTGSSCPGAMWLSTAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLETADAPARLEYYENARKFRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLETADAPARLEYYENARKFRH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSVSQRADARYRHLIALFTQDEYFAMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSVSQRADARYRHLIALFTQDEYFAMV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGEPAALAAAAAAEPPFYKDVWQVIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGEPAALAAAAAAEPPFYKDVWQVIVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PRGLGHRKELSGVFRLCLTDEEVVFVRLNTEVASVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PRGLGHRKELSGVFRLCLTDEEVVFVRLNTEVASVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VIGPGELWMQVDDCVVAQNMHELFLEKMRALCADEYRARCRSYSISIGAHLLTLLSARRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VIGPGELWMQVDDCVVAQNMHELFLEKMRALCADEYRARCRSYSISIGAHLLTLLSARRH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LGLVPLEPGGWLRRSRFEQFCHLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LGLVPLEPGGWLRRSRFEQFCHLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RSRRAVSVPASFFRRLAPSPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGNPQGKEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RSRRAVSVPASFFRRLAPSPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGNPQGKEDQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 EGSGGDYMPMNNWGSGNGRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQCSGEGQGSRGGQGSNGQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EGSGGDYMPMNNWGSGNGRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQCSGEGQGSRGGQGSNGQGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GGNQCSRDGQGTAGGHGSGGGQRPGGGHGSGGGQGPGDGHGSGGGKNSGGGKGSGSGKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGNQCSRDGQGTAGGHGSGGGQRPGGGHGSGGGQGPGDGHGSGGGKNSGGGKGSGSGKGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DGDGERGKSLKKRSYFGKLTQSKQQQMPPPPPPPPPPPPAGGTGGKGKSGGRFRLYFCVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DGDGERGKSLKKRSYFGKLTQSKQQQMPPPPPPPPPPPPAGGTGGKGKSGGRFRLYFCVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RGATKECKEAKEVKDAEIPEGAARGPHRARAFDEDEDDPYVPMRPGVATPLVSSSDYMPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RGATKECKEAKEVKDAEIPEGAARGPHRARAFDEDEDDPYVPMRPGVATPLVSSSDYMPM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 APQNVSASKKRHSRSPFEDSRGYMMMFPRVSPPPAPSPPKAPDTNKEDDSKDNDSESDYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APQNVSASKKRHSRSPFEDSRGYMMMFPRVSPPPAPSPPKAPDTNKEDDSKDNDSESDYM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 FMAPGAGAIPKNPRNPQGGSSSKSWSSYFSLPNPFRSSPLGQNDNSEYVPMLPGKFLGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FMAPGAGAIPKNPRNPQGGSSSKSWSSYFSLPNPFRSSPLGQNDNSEYVPMLPGKFLGRG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LDKEVSYNWDPKDAASKPSGEGSFSKPGDGGSPSKPSDHEPPKNKAKRPNRLSFITKGYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDKEVSYNWDPKDAASKPSGEGSFSKPGDGGSPSKPSDHEPPKNKAKRPNRLSFITKGYK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 IKPKPQKPTHEQREADSSSDYVNMDFTKRESNTPAPSTQGLPDSWGIIAEPRQSAFSNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IKPKPQKPTHEQREADSSSDYVNMDFTKRESNTPAPSTQGLPDSWGIIAEPRQSAFSNYV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 NVEFGVPFPNPANDLSDLLRAIPRANPLSLDSARWPLPPLPLSATGSNAIEEEGDYIEVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NVEFGVPFPNPANDLSDLLRAIPRANPLSLDSARWPLPPLPLSATGSNAIEEEGDYIEVI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FNSAMTPAMALADSAIRYDAETGRIYVVDPFSECCMDISLSPSRCSEPPPVARLLQEEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FNSAMTPAMALADSAIRYDAETGRIYVVDPFSECCMDISLSPSRCSEPPPVARLLQEEEQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 ERRRPQSRSQSFFAAARAAVSAFPTDSLERDLSPSSAPAVASAAEPTLALSQVVAAASAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ERRRPQSRSQSFFAAARAAVSAFPTDSLERDLSPSSAPAVASAAEPTLALSQVVAAASAL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 AAAPGIGAAAAAAGFDSASARWFQPVANAADAEAVRGAQDVAGGSNPGAHNPSANLARGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAAPGIGAAAAAAGFDSASARWFQPVANAADAEAVRGAQDVAGGSNPGAHNPSANLARGD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 NQAGGAAAAAAAPEPPPRSRRVPRPPEREDSDNDDDTHVRMDFARRDNQFDSPKRGR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NQAGGAAAAAAAPEPPPRSRRVPRPPEREDSDNDDDTHVRMDFARRDNQFDSPKRGR
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS2463.1 IRS1 gene_id:3667|Hs108|chr2 (1242 aa)
initn: 911 init1: 510 opt: 758 Z-score: 391.0 bits: 84.5 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 1196; 29.3% identity (53.3% similar) in 1231 aa overlap (78-1218:12-1140)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 SSCPGAMWLSTATGSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLET-ADAP
.: : ::::: : :.:.:::. . : .:
CCDS24 MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRAASEAGGP
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ARLEYYENARKFRHSVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSVSQRADARYRH
:::::::: .:.::. : :.: : : .::....:::.. .:
CCDS24 ARLEYYENEKKWRHKSSA-------------------PKRSIPLESCFNINKRADSKNKH
50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 LIALFTQDEYFAMVAENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGT--LGAQPDGEPAALAAA-
:.::.:.::.::..:..:.::.::: : .: ..: .. :. ::: : . ...
CCDS24 LVALYTRDEHFAIAADSEAEQDSWYQALLQLHNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSGL
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270
pF1KE2 -AAAE-------PP--FYKDVWQVIVKPRGLGHRKELSGVFRLCLTDEEVVFVRLNTEVA
:.: :: .:.:::::.::.:::. :.: :..:::::.. . ::.::.:.:
CCDS24 GEAGEDLSYGDVPPGPAFKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAA
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 SVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRSTVIGPGELWMQVDDCVVAQNMHELFLEKMRALCA
.::.::..::::::::..::.:::::.: ::::.:::::: :::::::: .:: :::. .
CCDS24 AVVLQLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAM-S
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380
pF1KE2 DEYRARCRSYSISIGAHLLTLLSARRHLGLVPLEPGGWLRRSRFEQFC------------
::.: : .: : : .. ... :.::. : : :::: :..
CCDS24 DEFRPRSKSQSSSNCSNPISVPLRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430
pF1KE2 ---HLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGRRSRRAVSVPASFFRRLAP
..:: .::: : .: . . ::. : .: : : : : : . : . : . :
CCDS24 GSFRVRASSDGEGTM--SRPASVDGSPVSPST-NRTHAHRHRGSAR-LHPPLNHSRSI-P
330 340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGNPQGKEDQEGSGGDYM-PMNNWGSGN
:: :. .: :: :.:.. :. :: .: . : . .: .
CCDS24 MPASRCSPSA--------TSPVSLSSSSTSGH-----------GSTSDCLFPRRSSASVS
380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 GRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQCSGEGQGSRGGQGSNGQGSGGNQCSRDGQGTAGGHG
: : :: :. . .:: . .. . : : . . : .. : . ::.:
CCDS24 GSPSDGGFISSDEYGSSPCDFRSSFRSVTPDS---LGHTPPARGEEELS--NYICMGGKG
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 SGGGQRPGGGHG-SGGGQGPGDGHGSGGGKNSGGGKGSGSGKGSDGDGERGKSLKKRSYF
. :.: . : ::.: :.: : .: . :. .....: :.. ..::..
CCDS24 PSTLTAPNGHYILSRGGNGHRCTPGTGLG-TSPALAGDEAASAADLDNR----FRKRTHS
480 490 500 510 520
620 630 640 650 660
pF1KE2 GKLTQSKQQQMPPPPPPP----------PPPPPAGGTGGKGKSGGRFRLYFCVDRGATKE
. . . .: : : ::.::.:: . :. . : :. .:
CCDS24 AGTSPTITHQKTPSQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGG--RLPGHRHSAFVPTRSYPEE
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 CKEAKEVKDAEIPEGAARGPHRARAFDEDEDDPYVPMRPGVATPLVS----SSDYMPMAP
: . : : :: . :: :.:: :::: :. : :.:::::.:
CCDS24 GLEMH-------PLERRGGHHRPDSSTLHTDDGYMPMSPGVA-PVPSGRKGSGDYMPMSP
590 600 610 620 630
730 740 750 760 770
pF1KE2 QNVSASK------KRHSRSPFEDSRGYMMMFPRVSPPPAPSPPKAPDTNKEDDSKDNDSE
..::: . .:: . : ::::: : : .:. .:.... ... ..
CCDS24 KSVSAPQQIINPIRRHPQR--VDPNGYMMMSP--SGGCSPDIGGGPSSSSSSSNAVPSGT
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820
pF1KE2 SDYMFMAPGAGAI-------PKNPRNPQGGSSSKSWSSYFSL-P--NPFRSSP----LGQ
: . . :.:. :: : . .::. ..:... : . ::: :
CCDS24 SYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSDCYYGP
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870
pF1KE2 NDNSEYVPMLPGKFLGRGLDKEVSYNWDPKDAA-------SKPSGEGSFSKPGDGGSPSK
.: .. :.: : :.. :... .:...: : ::. .. .: .: :
CCDS24 ED-PQHKPVLSYYSLPRSF-KHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAATADDSSSST
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910 920
pF1KE2 PSDHEPPKNKAKRPNRLSFITKGYKIKPKPQKPTHE------QREADSSSDYVNMDFTKR
:: :. : ...:. .: :. :..:.... .
CCDS24 SSDS------------LGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPRKVDTAAQTNSRLARPT
820 830 840 850
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 ESNTPAPSTQGLP-------DSWGIIAEPRQSAFSNYVNVEFGVPFPNPANDLSDLLRAI
. . :... :: .. .. :. .. ..:::.::: .: : :
CCDS24 RLSLGDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIEFG-------SDQSGYL---
860 870 880 890 900
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 PRANPLSLDSARWPLPPLPLSATGSNAIEEEGDYIEVIFNSAMTPAMALADSAIRYDAET
..:... :. : . . . : .:: : .. . :. : . .:
CCDS24 --SGPVAFHSS----PSVRCPSQLQPAPREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQE-STGVEM
910 920 930 940 950 960
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 GRIYVVDPFSEC-CMDISLSPSRCSEPPPVARLLQEEEQERRRPQSRSQSFFAAARAAVS
::. . : . : :: :. .. .. .: . . .: :....
CCDS24 GRLGPAPPGAASICRPTRAVPS--SRGDYMTMQMSCPRQSYVDTSPAAPVSYADMRTGIA
970 980 990 1000 1010 1020
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE2 AFPTDSLERDLSPSSAPAVASAAEPTLALSQV-VAAASALAAAP-GIGAAAAAAGFDSAS
: . :: : ... . :..: :: . . .:: :.: ..: : :. .: . . .
CCDS24 AEEV-SLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSSLLGGPQGPGGMSAFTRVNLSP
1030 1040 1050 1060 1070
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 ARWFQPVANAADAEAVRGAQDVAG-GSNPGAHNPSANLARGDNQA-GGAAAAAAAPEPPP
: . . :: .. : .. .:.:.: . .. : . : ::....... :
CCDS24 NRNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVPFGAGAAVGGGGGSSSSSEDVK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1220 1230 1240 1250
pF1KE2 RSRRVPRPPEREDSDNDDDTHVRMDFARRDNQFDSPKRGR
:
CCDS24 RHSSASFENVWLRPGELGGAPKEPAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEP
1140 1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338 aa)
initn: 1124 init1: 469 opt: 716 Z-score: 369.9 bits: 80.7 E(32554): 2.8e-14
Smith-Waterman score: 1136; 29.9% identity (52.1% similar) in 1308 aa overlap (79-1226:31-1212)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 SCPGAMWLSTATGSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLE-------
: : ::::::::::.:.:::.
CCDS95 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150
pF1KE2 -----TADAPARLEYYENARKFRHSVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSV
.: : ::::::. .:.: . .:: :.:::.: :...
CCDS95 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWR------------SKAGA-------PKRVIALDCCLNI
70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 SQRADARYRHLIALFTQDEYFAMVAENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGE
..::::....::::.:.:::::..::::.:::.:: :. :. :. : .. : : .
CCDS95 NKRADAKHKYLIALYTKDEYFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEG---RAAAGDAPPAAA
110 120 130 140 150
220 230 240 250
pF1KE2 PAAL------------AAAAAAEPPF---------YKDVWQVIVKPRGLGHRKELSGVFR
::: :.::.:: . :..:::: .::.:::. :.:.::.:
CCDS95 PAASCSASLPGALGGSAGAAGAEDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYR
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 LCLTDEEVVFVRLNTEVASVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRSTVIGPGELWMQVDDCV
:::. . . ::.:: : ::..::..:::::::...::.:::::.: ::::::::.:: :
CCDS95 LCLSARTIGFVKLNCEQPSVTLQLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSV
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 VAQNMHELFLEKMRALCAD-EYRARCRSYSISIGA-HLLTLLSARRHLGLVPLEPG--GW
::::.:: .:: :.:: :.: : .: : . .: : ... .:::: :: : :. :
CCDS95 VAQNIHETILEAMKALKELFEFRPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 LRRSRFEQFCHLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGRRSRRAVSVPAS
.:::: ... .:: :.:. :.. . :... :.
CCDS95 VRRSRTDSLA------------------ATP--PAAKCSSCRVRTASEGDGGAAAGAAAA
340 350 360 370
440 450 460 470 480
pF1KE2 FFR--RLAPSPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGN--PQGKEDQEGSGGDY
: .: :: : :..:: : .:: : :. : . : : :. : .
CCDS95 GARPVSVAGSPLSP-GPVRAP---LSRSHTLSG-GCGGRGSKVALLPAGGALQH-SRSMS
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530
pF1KE2 MPM-NNWGSGNGRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQ------CSGEGQ-GSRGGQGSNGQG
::. .. .... :: ......:.:: : . : :: : :. ...:.
CCDS95 MPVAHSPPAATSPGSLSSSSGHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLHHGPGQRPSSGSASASGSP
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580
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