FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2308, 1338 aa
1>>>pF1KE2308 1338 - 1338 aa - 1338 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7771+/-0.000453; mu= -19.5808+/- 0.028
mean_var=647.8269+/-135.545, 0's: 0 Z-trim(125.4): 101 B-trim: 1676 in 1/60
Lambda= 0.050390
statistics sampled from 49046 (49198) to 49046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.577), width: 16
Scan time: 20.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003740 (OMIM: 125853,600797) insulin receptor s (1338) 9245 688.2 1.1e-196
NP_005535 (OMIM: 125853,147545) insulin receptor s (1242) 1545 128.4 3.2e-28
XP_006724776 (OMIM: 300904) PREDICTED: insulin rec (1256) 716 68.1 4.5e-10
XP_005262277 (OMIM: 300904) PREDICTED: insulin rec (1256) 716 68.1 4.5e-10
NP_003595 (OMIM: 300904) insulin receptor substrat (1257) 716 68.1 4.5e-10
XP_011529363 (OMIM: 300904) PREDICTED: insulin rec (1300) 716 68.1 4.6e-10
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 443 48.5 0.00061
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 443 48.5 0.00062
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 443 48.5 0.00062
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 443 48.5 0.00062
NP_000079 (OMIM: 114000,120150,130000,130060,16620 (1464) 416 46.4 0.0018
XP_005257115 (OMIM: 114000,120150,130000,130060,16 (1374) 398 45.0 0.0044
XP_005257116 (OMIM: 114000,120150,130000,130060,16 (1158) 385 44.0 0.0074
>>NP_003740 (OMIM: 125853,600797) insulin receptor subst (1338 aa)
initn: 9245 init1: 9245 opt: 9245 Z-score: 3652.5 bits: 688.2 E(85289): 1.1e-196
Smith-Waterman score: 9245; 100.0% identity (100.0% similar) in 1338 aa overlap (1-1338:1-1338)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSVVAQNIHETILEAMKALKELFEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSVVAQNIHETILEAMKALKELFEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGLVRRSRTDSLAATPPAAKCSSCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGLVRRSRTDSLAATPPAAKCSSCR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VRTASEGDGGAAAGAAAAGARPVSVAGSPLSPGPVRAPLSRSHTLSGGCGGRGSKVALLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VRTASEGDGGAAAGAAAAGARPVSVAGSPLSPGPVRAPLSRSHTLSGGCGGRGSKVALLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AGGALQHSRSMSMPVAHSPPAATSPGSLSSSSGHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLHHGPGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AGGALQHSRSMSMPVAHSPPAATSPGSLSSSSGHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLHHGPGQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PSSGSASASGSPSDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGGGGGEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PSSGSASASGSPSDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGGGGGEFY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GYMTMDRPLSHCGRSYRRVSGDAAQDLDRGLRKRTYSLTTPARQRPVPQPSSASLDEYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GYMTMDRPLSHCGRSYRRVSGDAAQDLDRGLRKRTYSLTTPARQRPVPQPSSASLDEYTL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 MRATFSGSAGRLCPSCPASSPKVAYHPYPEDYGDIEIGSHRSSSSNLGADDGYMPMTPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MRATFSGSAGRLCPSCPASSPKVAYHPYPEDYGDIEIGSHRSSSSNLGADDGYMPMTPGA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ALAGSGSGSCRSDDYMPMSPASVSAPKQILQPRAAAAAAAAVPSAGPAGPAPTSAAGRTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ALAGSGSGSCRSDDYMPMSPASVSAPKQILQPRAAAAAAAAVPSAGPAGPAPTSAAGRTF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PASGGGYKASSPAESSPEDSGYMRMWCGSKLSMEHADGKLLPNGDYLNVSPSDAVTTGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PASGGGYKASSPAESSPEDSGYMRMWCGSKLSMEHADGKLLPNGDYLNVSPSDAVTTGTP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PDFFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCGGDSDQYVLMSSPVGRILEEERLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PDFFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCGGDSDQYVLMSSPVGRILEEERLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PQATPGPSQAASAFGAGPTQPPHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRPTRLSLEGLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PQATPGPSQAASAFGAGPTQPPHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRPTRLSLEGLPS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 LPSMHEYPLPPEPKSPGEYINIDFGEPGARLSPPAPPLLASAASSSSLLSASSPASSLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LPSMHEYPLPPEPKSPGEYINIDFGEPGARLSPPAPPLLASAASSSSLLSASSPASSLGS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 GTPGTSSDSRQRSPLSDYMNLDFSSPKSPKPGAPSGHPVGSLDGLLSPEASSPYPPLPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GTPGTSSDSRQRSPLSDYMNLDFSSPKSPKPGAPSGHPVGSLDGLLSPEASSPYPPLPPR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PSASPSSSLQPPPPPPAPGELYRLPPASAVATAQGPGAASSLSSDTGDNGDYTEMAFGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PSASPSSSLQPPPPPPAPGELYRLPPASAVATAQGPGAASSLSSDTGDNGDYTEMAFGVA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 ATPPQPIAAPPKPEAARVASPTSGVKRLSLMEQVSGVEAFLQASQPPDPHRGAKVIRADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ATPPQPIAAPPKPEAARVASPTSGVKRLSLMEQVSGVEAFLQASQPPDPHRGAKVIRADP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 QGGRRRHSSETFSSTTTVTPVSPSFAHNPKRHNSASVENVSLRKSSEGGVGVGPGGGDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QGGRRRHSSETFSSTTTVTPVSPSFAHNPKRHNSASVENVSLRKSSEGGVGVGPGGGDEP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 PTSPRQLQPAPPLAPQGRPWTPGQPGGLVGCPGSGGSPMRRETSAGFQNGLNYIAIDVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PTSPRQLQPAPPLAPQGRPWTPGQPGGLVGCPGSGGSPMRRETSAGFQNGLNYIAIDVRE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 EPGLPPQPQPPPPPLPQPGDKSSWGRTRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EPGLPPQPQPPPPPLPQPGDKSSWGRTRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KE2 ASIDFLSHHLKEATIVKE
::::::::::::::::::
NP_003 ASIDFLSHHLKEATIVKE
1330
>>NP_005535 (OMIM: 125853,147545) insulin receptor subst (1242 aa)
initn: 1792 init1: 604 opt: 1545 Z-score: 627.6 bits: 128.4 E(85289): 3.2e-28
Smith-Waterman score: 2446; 41.0% identity (59.2% similar) in 1361 aa overlap (31-1287:13-1222)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA
::: ::::: : ::::::::. :
NP_005 MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRA-------A
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE
. .:: : ::::::.::::: :..:::: : :. :.:::::::.:.:.:.::::.::
NP_005 SEAGG----PARLEYYENEKKWRHKSSAPKRSIPLESCFNINKRADSKNKHLVALYTRDE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA
.::.::..: ::..::.:: .: ..:: . :: :.. ..: :. : : ::
NP_005 HFAIAADSEAEQDSWYQALLQL--HNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSG--LGEAGE
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL
. ::: : :. : ..::::: ::::::::.::: :.:::::...::.::::: : .:.:
NP_005 DLSYGDVPPGPA-FKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAAAVVL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSVVAQNIHETILEAMKALKELFEF
:::::::::::..::::::::::::::::.:::.::::::::.::::::::.:... ::
NP_005 QLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAMSD--EF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE2 RPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGLVRRSRTDSLAATPPAA----KC
::::::::: :. ..::::: :.::: : ::::.::.:::::.:..:: ::. :
NP_005 RPRSKSQSS-SNCSNPISVP--LRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SSCRVRTASEGDGGAAAGAAAAGARPVSVAGSPLSPGPVRAPLSRSHTLSGGCGGRGSKV
.: :::..:.:.: . ::.:: :::.::. :. : : ::: .
NP_005 GSFRVRASSDGEGTMS--------RPASVDGSPVSPSTNRTHAHR-H--------RGS-A
330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 ALLPAGGALQHSRSMSMPVAHSPPAATSPGSLSSSS--GHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLH
: : :.::::. ::... :.:::: :::::: :::: :
NP_005 RLHPP---LNHSRSIPMPASRCSPSATSPVSLSSSSTSGHGSTS----------------
370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 HGPGQRPSSGSASASGSPSDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGG
: .:::.:::::: ::.: ::::::: :.:. : :: ::.:...:::::
NP_005 --DCLFPRRSSASVSGSPSDGGFISSDEYGSSPCDFRS--SFRSVTPDSLGHTPPAR---
410 420 430 440 450
540 550 560
pF1KE2 GGGEFYGYM--------TMDRP-----LSHCGRSYR-----------RVSGD---AAQDL
: :. .:. :. : ::. : ..: ..:: .: ::
NP_005 GEEELSNYICMGGKGPSTLTAPNGHYILSRGGNGHRCTPGTGLGTSPALAGDEAASAADL
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 DRGLRKRTYSL-TTPA--RQRPVPQPSSASLDEYTLMRATF---SGSAGRLCPSCPASSP
: .::::.: :.:. .:. : : ::..::: : .. .::.::: :. :
NP_005 DNRFRKRTHSAGTSPTITHQKTPSQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGGRL-PG-HRHSA
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670
pF1KE2 KVAYHPYPEDYGDIEI-----GSHRSSSSNLGADDGYMPMTPGAALAGSGSGSCRSDDYM
: . :::. ... : :: .::.: .:::::::.::.: . :: . : :::
NP_005 FVPTRSYPEEGLEMHPLERRGGHHRPDSSTLHTDDGYMPMSPGVAPVPSGRKG--SGDYM
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 PMSPASVSAPKQILQPRAAAAAAAAVPSAGPAGPAPTSAAGRTFPASGGGYKASSPAESS
:::: :::::.::..: . : : : .: : ::: ..:: . ..
NP_005 PMSPKSVSAPQQIINP-----IRRHPQRVDPNGYMMMSPSGGCSPDIGGGPSSSSSSSNA
640 650 660 670 680
740 750 760 770 780
pF1KE2 -PEDSGYMRMWCGS------------KLSMEHADGKLLP-NGDYLNVSPSDAVTTGTPPD
: ..: ..: .. : .: . ::::: .:::.:.:: .:..: :
NP_005 VPSGTSYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSD
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830
pF1KE2 FFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCG----GDSDQYVLMSSPVGRILEEER
. . : .:. : :::::.: : : :.. .:. ::.:
NP_005 CYYGPEDPQHKPV-----LSYYSLPRSFKHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAAT
750 760 770 780 790 800
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 LEPQATPGPSQAASAFGAG-------PTQP-PHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRP
. ... : .....:.: :. : :: : .: : . . .: .::
NP_005 ADDSSS---STSSDSLGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPR--KVDTAAQTNSRLARP
810 820 830 840 850
900 910 920 930
pF1KE2 TRLSLEGLP---SLPSMHEY-----PL--PPEPKSPGEYINIDFG-EPGARLSPPAPPLL
::::: : : .:: .: :: ::::::::::.::.:: . .. :: :.
NP_005 TRLSL-GDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIEFGSDQSGYLSGPV----
860 870 880 890 900 910
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 ASAASSSSLLSASSPASSLGSGTPGTSSDSRQRSPLSDYMNLDFSSPKSPKPGAPSGHPV
: :: :. : :.: : . .... .::..:.. . .: .
NP_005 --AFHSSP--SVRCP-SQL---QP---APREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQESTGVEM
920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 GSLDGLLSPEASSPYPPLPPRPSASPSS-SLQPPPPPPAPGELYRLPPASAVATAQGPGA
: : : : :.: : ::. . ..: . : : : :. :.:
NP_005 GRL-GPAPPGAASICRPTRAVPSSRGDYMTMQ-----------MSCPRQSYVDTS--PAA
970 980 990 1000
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 ASSLSSDTGDNGDYTEMAFGVAATP---PQPIAAPPKPEAARVASPTS--GVKRL----S
: :..: :.:: :. : . .: ::::. :. .: :
NP_005 PVS----------YADMRTGIAAEEVSLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSS
1010 1020 1030 1040 1050
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 LM---EQVSGVEAFLQASQPPDPHRGAKVIRADPQGGRRRHSSETFSSTTTVTPVSPSFA
:. . .:. :: ... :. ...:::::::::: :::::::::::: ..: :. .
NP_005 LLGGPQGPGGMSAFTRVNLSPNRNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 HNPKRHNSASVENVSLRKSSEGGVGVGPGGGDEPPTSPRQLQPAPPLAPQGRPWTPGQPG
. .:..:: :::. . . . . . : .::
NP_005 FG-------------------AGAAVGGGGGSSSSSEDVKRHSSASFE---NVWL--RPG
1120 1130 1140 1150
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE2 GLVGCPGSGGSPMRRETSAG-FQNGLNYIAID-VREEPGLP----PQPQPPPPPLP-QP-
: : : : . .:: ..:::::: .: :.. : :.::::::: : ::
NP_005 ELGGAPKE---PAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEPQPPPPPPPHQPL
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE2 --GDKSSWGRTRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTYASIDFLSHHLKEATIV
:..:: :.
NP_005 GSGESSSTRRSSEDLSAYASISFQKQPEDRQ
1220 1230 1240
>>XP_006724776 (OMIM: 300904) PREDICTED: insulin recepto (1256 aa)
initn: 1075 init1: 469 opt: 716 Z-score: 301.9 bits: 68.1 E(85289): 4.5e-10
Smith-Waterman score: 1150; 29.2% identity (52.4% similar) in 1337 aa overlap (31-1280:79-1232)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA
: : ::::::::::.:.:::.
XP_006 SCPGAMWLSTATGSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLE-------
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100
pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWR------------SKAGA-------PKRVIALDCCLNI
.: : ::::::. .:.: . .:: :.:::.: :...
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