Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2299
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2299, 429 aa
1>>>pF1KE2299 429 - 429 aa - 429 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4117+/-0.000794; mu= 17.0660+/- 0.048
mean_var=70.8090+/-13.881, 0's: 0 Z-trim(108.3): 46 B-trim: 133 in 1/48
Lambda= 0.152416
statistics sampled from 10058 (10105) to 10058 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 2890 644.5 5.7e-185
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 1052 240.4 2.6e-63
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 418 101.0 2.6e-21
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 400 97.0 4.3e-20
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 398 96.6 5.4e-20
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 394 95.7 8.8e-20
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 393 95.5 1.3e-19
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 392 95.3 1.3e-19
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 389 94.6 1.9e-19
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 378 92.2 1.1e-18
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 371 90.6 3e-18
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 368 89.9 4.7e-18
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 343 84.4 1.9e-16
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 332 82.0 1e-15
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 329 81.4 2e-15
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 323 80.1 5.2e-15
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 317 78.7 1e-14
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 296 74.1 2.7e-13
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 277 70.0 5.2e-12
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 259 66.0 7.1e-11
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 259 66.0 8.5e-11
>>CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 (429 aa)
initn: 2890 init1: 2890 opt: 2890 Z-score: 3434.3 bits: 644.5 E(32554): 5.7e-185
Smith-Waterman score: 2890; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MCPGALWVALPLLSLLAGSLQGKPLQSWGRGSAGGNAHSPLGVPGGGLPEHTFNLKMFLE
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CCDS73 MCPGALWVALPLLSLLAGSLQGKPLQSWGRGSAGGNAHSPLGVPGGGLPEHTFNLKMFLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPPQYMIDLYNRYTSDKSTTPASNIVRSFSMEDAISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPPQYMIDLYNRYTSDKSTTPASNIVRSFSMEDAISI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TATEDFPFQKHILLFNISIPRHEQITRAELRLYVSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TATEDFPFQKHILLFNISIPRHEQITRAELRLYVSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDGTD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AWDSATETKTFLVSQDIQDEGWETLEVSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVESHRKGCDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AWDSATETKTFLVSQDIQDEGWETLEVSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVESHRKGCDTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DISVPPGSRNLPFFVVFSNDHSSGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKDGSTEAGESSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DISVPPGSRNLPFFVVFSNDHSSGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKDGSTEAGESSH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGAGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGAGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDMGVPTLKYHYEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDMGVPTLKYHYEG
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 MSVAECGCR
:::::::::
CCDS73 MSVAECGCR
>>CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 (424 aa)
initn: 821 init1: 540 opt: 1052 Z-score: 1250.1 bits: 240.4 E(32554): 2.6e-63
Smith-Waterman score: 1052; 42.1% identity (71.6% similar) in 437 aa overlap (4-429:2-424)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MCPGALWVALPLLSLLAGSL-QGKPLQSWGRGSAGGNAHSPLGVPGGGLPEHT-FNLKMF
:.: ..: : ::. : .:.:... .. . ... : . :. ... .
CCDS18 MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPL----EEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LENVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPPQYMIDLYNRYTSDKSTTPASNIVRSFSMEDAI
:...: .::..:::: .:.::...:.::.::..:::....:... :..::.:::. :: .
CCDS18 LQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SITATEDFPFQKHILLFNISIPRHEQITRAELRLYVSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDG
: .. . ..:. ::::.:::.::.. ::::::. : . ...:..::..
CCDS18 SQPVSFN-GLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLES
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TDAWDSATETKTF-LVSQDIQDEG--WETLEVSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVES-HR
:. : . . ::: .: . :::..:..:..:: .: : : ..::: .:: :
CCDS18 KG--DNEGERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGS--STHQLEVHIESKHD
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KGCDT----LDISVPPGSRNLPFFVVFSNDHSSGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKD
.. :. :.:.. ... :...:::.:.:: :: . :: ::::::: : .:. :
CCDS18 EAEDASSGRLEIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSD-KERKEELNEMISHEQLPELDNLGLD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE2 G-STEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGAGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPK
. :. :: . . ... :: :: .:.: :..:..: : ..:..::::::::::
CCDS18 SFSSGPGEEALLQ-MRSNIIYDST-ARIRRNA-KGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPP
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDM
::::::.: : .:::. .:::::::.:.::::: :..::::::::: :::.:: :
CCDS18 GYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDK-
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KE2 GVPTLKYHYEGMSVAECGCR
:: : :..::::.:.:::::
CCDS18 GVVTYKFKYEGMAVSECGCR
410 420
>>CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 (455 aa)
initn: 427 init1: 327 opt: 418 Z-score: 496.2 bits: 101.0 E(32554): 2.6e-21
Smith-Waterman score: 479; 31.3% identity (55.3% similar) in 387 aa overlap (76-429:85-455)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GGLPEHTFNLKMFLENVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPPQYMIDLYNRYT-SDKSTTP
: :: : .::...: :. ..:
CCDS34 PRDSDAGREGQEPQPRPQDEPRAQQPRAQEPPGRGPRVVPHEYMLSIYRTYSIAEKLGIN
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE2 ASNIVRSFSMEDAISIT--ATEDF---PFQKHILLFNISI-PRHEQITRAELRLYVSCQN
:: . : : . :.. . .:. :.... ::..:. .:... :::::. . .
CCDS34 ASFFQSSKSANTITSFVDRGLDDLSHTPLRRQKYLFDVSMLSDKEELVGAELRLFRQAPS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE2 ----------HVDPSHDLKGSVVIYDVLDGTDAWDSATETKTFLVSQDIQDEGWETL--E
::. :. .. .:: : .. :. : : : .. . :. : :
CCDS34 APWGPPAGPLHVQLFPCLSPLLLDARTLDPQGAPPAGWEV--FDVWQGLRHQPWKQLCLE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 VSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVESHRKGCDTLDISV---PPGSRNLPFFVVFSNDHSS
. .: : . :. ... . . . .: .. :: : : .:::. :
CCDS34 LRAA---WGELDAGEAEARARGPQQPPPPDLRSLGFGRRVRPPQERAL--LVVFT---RS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 GTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKDGSTEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGA
:. :.::... :.. . .:: .. :.. : ::.:.: :
CCDS34 QRKNLFAEMREQLGSA-EAAGPGAGAEGSWPPPSGA----PDARPWLPSPGRRRRRTAFA
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KE2 GSH-----------CQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGCFFPLADDVTPTK
. : :.: :.:::...:::.::::: :::::.:.: : ::: . . ::.
CCDS34 SRHGKRHGKKSRLRCSKKPLHVNFKELGWDDWIIAPLEYEAYHCEGVCDFPLRSHLEPTN
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420
pF1KE2 HAIVQTLVHLKFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDMGVPTLKYHYEGMSVAECGCR
:::.:::.. : .. .:::::::.:::.:: : : .. .:: : : ::::
CCDS34 HAIIQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYID-AGNNVVYKQYEDMVVESCGCR
400 410 420 430 440 450
>>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 (501 aa)
initn: 375 init1: 326 opt: 400 Z-score: 474.2 bits: 97.0 E(32554): 4.3e-20
Smith-Waterman score: 444; 27.1% identity (55.7% similar) in 431 aa overlap (18-429:102-501)
10 20 30 40
pF1KE2 MCPGALWVALPLLSLLAGSLQGKPLQSWGRGSAGGNAHSPLG-VPGG
:. . :: . .: . . .: : .:::
CCDS13 ANARAKGGTGQTGGLTQPKKDEPKKLPPRPGGPEPKPGHPPQTRQATARTVTPKGQLPGG
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GLPEHTFNL-KMFLENVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPP-----QYMIDLYNRYTSDK
: .. .. . :: :.. : : . : .:: .::..:: : ::
CCDS13 KAPPKAGSVPSSFL-------LKKAREPGPPREPKEPFRPPPITPHEYMLSLY-RTLSDA
140 150 160 170 180
110 120 130 140 150
pF1KE2 STTPASNIVR-SFSMEDAIS--ITATED--FPF-QKHILLFNISIPRHEQITRAELR-LY
. ... :. .. ..:. : .: : .:. .:.:: ... . :::: :
CCDS13 DRKGGNSSVKLEAGLANTITSFIDKGQDDRGPVVRKQRYVFDISALEKDGLLGAELRILR
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDGTDAWDSATETKTFLVSQDIQDEGWETLEVSSAVKR
. .. . :. : .. . . .. . :. . : .. :::....
CCDS13 KKPSDTAKPAAPGGGRAAQLKLSSCPSGRQPAALLDVRSVP-GLDGSGWEVFDI------
250 260 270 280 290
220 230 240 250 260
pF1KE2 WVRSDSTKSKNKLEVTVESHRKG--CDTLDISVPPGSRNL---PFFVVFSNDHSSGTKET
: . :.. .: . .:. ..: : .. ..:.. .:.::.
CCDS13 WKLFRNFKNSAQLCLELEAWERGRAVDLRGLGFDRAARQVHEKALFLVFG----------
300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 RLELREMISHEQESVLKKLSKDGSTEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGAGSHCQ
: . :... .: .: : . . . : . .. .. ..: : . ..:.
CCDS13 RTKKRDLFFNE----IKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLATRQGKRP-SKNLKARCS
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 KTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFPTKV
. .:.:::.:.:::.::::: ::::..:.: : ::: . . ::.::..:::.. : ..
CCDS13 RKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPEST
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420
pF1KE2 GKACCVPTKLSPISVLYKDDMGVPTLKYHYEGMSVAECGCR
.:::::.:::::.:. :. . . : .:: : : ::::
CCDS13 PPTCCVPTRLSPISILFIDSANNVVYK-QYEDMVVESCGCR
470 480 490 500
>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa)
initn: 451 init1: 351 opt: 398 Z-score: 472.5 bits: 96.6 E(32554): 5.4e-20
Smith-Waterman score: 453; 31.0% identity (58.5% similar) in 316 aa overlap (124-428:168-453)
100 110 120 130 140
pF1KE2 NRYTSDKSTTPASNIVRSFSMEDAISITATEDFPFQK-HI--LLFNIS-IPRHEQITRAE
.:: :. : . :... ::. : .: ::
CCDS49 QSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LRLYVSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDGTDAWDSATETKTFLVSQDIQDEGWETLEVSS
.:.: . .:. .. .: . ::... :. .: . : :: .....
CCDS49 FRIYKDRSNNRFENETIK--ISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRKAQAL-DVGWLVFDITV
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 AVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVESHRKGCDTLDISVP-------PGSRNLPFFVVFSNDHS
. ..:: . .:.: . . .. ..... : :.. ::.:.:
CCDS49 TSNHWV----INPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQ-PFMVAF-----
260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 SGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKDGSTEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARRKRSAG
: ... :: . . .: . . ..:: ..:.. ..:. . ....:
CCDS49 --FKASEVLLRSV---------RAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQA-
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 AGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQTLVHL
:.: : :.:.:.::..:::::. : :. : : : ::: .. :.::::::::::
CCDS49 ----CKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHL
360 370 380 390 400
390 400 410 420
pF1KE2 KFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDMGVPTLKYHYEGMSVAECGCR
:: .: : ::.::::. ::::: :: . :: .:..: : :::
CCDS49 MFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILK-KYRNMVVRSCGCH
410 420 430 440 450
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 459 init1: 190 opt: 394 Z-score: 468.6 bits: 95.7 E(32554): 8.8e-20
Smith-Waterman score: 520; 31.7% identity (58.1% similar) in 382 aa overlap (67-429:55-396)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 AHSPLGVPGGGLPEHTFNLKMFLENVKVDFLRSLNLSGV---PSQDKTRVEPPQYMIDLY
:: :.. :. :. .. : :: ::.:::
CCDS13 VPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPP-YMLDLY
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140
pF1KE2 NRYTSDKSTTPA-----------SNIVRSFSMEDAISITATEDFPFQKHILLFNIS-IPR
:. : . .:: .: :::: :... . .. ..::.: ::
CCDS13 RRH-SGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRR-FFFNLSSIPT
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190
pF1KE2 HEQITRAELRLYV-SCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDGTDAWDSATETK---TFLVSQDI
.: :: :::... . :. . . ... . ::... . : .. :. : ::.:.
CCDS13 EEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNA
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 QDEGWETLEVSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVESHRKGCDTLDISVPPGSRNLPFFVVF
. ::...:. :: ::. . .. .::. ...: . . . ::.:
CCDS13 SR--WESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRI---SRSL-----H
210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 SNDHSSGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKDGSTEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARR
...:: . ..: . : ...::. :. :... . :..
CCDS13 QDEHSWS------QIRPL--------LVTFGHDGK---GHPLHKRE--------KRQAKH
260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KRSAGAGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQ
:. : :.. : :.: :.::..::.:: :.:. :.: : ::::: .. :.:::::
CCDS13 KQRKRLKSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQ
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420
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:::. . .:. :::::::.:: ::.:: :. .:: .:. : : ::::
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350 360 370 380 390
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: :.: . ::.: ::. : .: ::.:.:
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.: . .. . ::.::. . :: ::.. . ..::: ......
CCDS45 KDCV--MGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDS----DLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITAT
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. :: . . . .: :. :. : .. . . : .. ::.:.: :
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.....: ....:.. ..:....:... .: . : :. .
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:.: : :.:.:.::..:::::: : : : : : ::: .. :.:::::::::: :
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: : ::.::::. ::::: :: . :: .:..: : :::
CCDS45 YVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILK-KYRNMVVRACGCH
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:....: ..:: : ::: .:.
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: : :. .. . . : : ..:..:: : . .. . :. . : . :
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.:. ::.: . . .::..: . .... ::::. . . :. . .
CCDS17 TITGFTDQATQDESAAETGQSFLFDVSSLNDADEVVGAELRVLRRGSPESGPGSWTSPPL
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.. .. :. ... .. . . ::...:..:..: : : . .
CCDS17 LLLSTCPGAARAPRLLYSRA---AEPLVGQRWEAFDVADAMRRHRREPRPPRAFCLLLRA
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. : . : . : : : . . .:...: . . ....::..... .
CCDS17 VA---G----PVPSPLALRRLGFG--WPGGGGSAAEERAVLVVSSRTQRKESLFREIRAQ
240 250 260 270 280
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pF1KE2 GSTEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLA-----RRKRSA------------GAG--------S
. . .. . : : ....: : ::.:.: ::: :
CCDS17 ARALGAALASEPLPDPGTGTASPRAVIGGRRRRRTALAGTRTAQGSGGGAGRGHGRRGRS
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330 340 350 360 370 380
pF1KE2 HCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPKEYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFP
.:.. :.:.:...:::.::::: .::::.:.: : ::: . . ::.:::.:::.. :
CCDS17 RCSRKPLHVDFKELGWDDWIIAPLDYEAYHCEGLCDFPLRSHLEPTNHAIIQTLLNSMAP
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420
pF1KE2 TKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDMGVPTLKYHYEGMSVAECGCR
. .::::..:::::.:: : . . : .:: : : ::::
CCDS17 DAAPASCCVPARLSPISILYIDAANNVVYK-QYEDMVVEACGCR
410 420 430 440 450
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: :: : :.: ::.:. ... . :. ... : :: .. .:
CCDS97 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVA----EIQGHAGGRRSGQSHEL---
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:.. .. .:. ..: :. .:. : :.:: ::: .... :: :::
CCDS97 LRDFEATLLQMFGLRRRPQPSKSAV-IPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPAS
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: :::: :. . .: .: :. :. .:::.: ::..: :. :::::. ...::
CCDS97 RANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAFR---FLFNLSSIPENEVISSAELRLF---REQVD
120 130 140 150 160
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. : .: . ::.:. ... . :. : :: ... :::..:: :: ::
CCDS97 QGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTR--WETFDVSPAVLRW
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CCDS97 TREKQPNYGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRI---SRSLP--------QGSGNWA---QLRP
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. : ...:: .: . . . . : : ::.: ...:.. ::
CCDS97 L--------LVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKH---HSQRARKK-----NKNCRRHSLY
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CCDS97 VDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVN-SVNSSIPKACC
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CCDS97 VPTELSAISMLYLDEYDKVVLK-NYQEMVVEGCGCR
380 390 400
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CCDS13 TDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIY---KDYIRER
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CCDS13 FDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASE----EGWLVFDITATSNHWVVNPR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]