FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2297, 1660 aa
1>>>pF1KE2297 1660 - 1660 aa - 1660 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7646+/-0.00117; mu= -15.0907+/- 0.070
mean_var=497.5079+/-101.749, 0's: 0 Z-trim(114.9): 44 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.057501
statistics sampled from 15445 (15474) to 15445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16
Scan time: 7.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2 (1795) 11461 966.9 0
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CCDS7281.1 TET1 gene_id:80312|Hs108|chr10 (2136) 1727 159.4 1.2e-37
>>CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2 (1795 aa)
initn: 11461 init1: 11461 opt: 11461 Z-score: 5154.7 bits: 966.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11461; 100.0% identity (100.0% similar) in 1660 aa overlap (1-1660:136-1795)
10 20 30
pF1KE2 MDSGPVYHGDSRQLSASGVPVNGAREPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AGEGAGPWGQGAAVKTGSELSPVDGPVPGQMDSGPVYHGDSRQLSASGVPVNGAREPAGP
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SLLGTGGPWRVDQKPDWEAAPGPAHTARLEDAHDLVAFSAVAEAVSSYGALSTRLYETFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLLGTGGPWRVDQKPDWEAAPGPAHTARLEDAHDLVAFSAVAEAVSSYGALSTRLYETFN
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 REMSREAGNNSRGPRPGPEGCSAGSEDLDTLQTALALARHGMKPPNCNCDGPECPDYLEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 REMSREAGNNSRGPRPGPEGCSAGSEDLDTLQTALALARHGMKPPNCNCDGPECPDYLEW
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LEGKIKSVVMEGGEERPRLPGPLPPGEAGLPAPSTRPLLSSEVPQISPQEGLPLSQSALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEGKIKSVVMEGGEERPRLPGPLPPGEAGLPAPSTRPLLSSEVPQISPQEGLPLSQSALS
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 IAKEKNISLQTAIAIEALTQLSSALPQPSHSTPQASCPLPEALSPPAPFRSPQSYLRAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IAKEKNISLQTAIAIEALTQLSSALPQPSHSTPQASCPLPEALSPPAPFRSPQSYLRAPS
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 WPVVPPEEHSSFAPDSSAFPPATPRTEFPEAWGTDTPPATPRSSWPMPRPSPDPMAELEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WPVVPPEEHSSFAPDSSAFPPATPRTEFPEAWGTDTPPATPRSSWPMPRPSPDPMAELEQ
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LLGSASDYIQSVFKRPEALPTKPKVKVEAPSSSPAPAPSPVLQREAPTPSSEPDTHQKAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLGSASDYIQSVFKRPEALPTKPKVKVEAPSSSPAPAPSPVLQREAPTPSSEPDTHQKAQ
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 TALQQHLHHKRSLFLEQVHDTSFPAPSEPSAPGWWPPPSSPVPRLPDRPPKEKKKKLPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TALQQHLHHKRSLFLEQVHDTSFPAPSEPSAPGWWPPPSSPVPRLPDRPPKEKKKKLPTP
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 AGGPVGTEKAAPGIKPSVRKPIQIKKSRPREAQPLFPPVRQIVLEGLRSPASQEVQAHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AGGPVGTEKAAPGIKPSVRKPIQIKKSRPREAQPLFPPVRQIVLEGLRSPASQEVQAHPP
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 APLPASQGSAVPLPPEPSLALFAPSPSRDSLLPPTQEMRSPSPMTALQPGSTGPLPPADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APLPASQGSAVPLPPEPSLALFAPSPSRDSLLPPTQEMRSPSPMTALQPGSTGPLPPADD
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 KLEELIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQQTCLPAPESPFATRSPKQIKIESSGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLEELIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQQTCLPAPESPFATRSPKQIKIESSGAV
710 720 730 740 750 760
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 TVLSTTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDTPAKRAQAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVLSTTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDTPAKRAQAEF
770 780 790 800 810 820
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 PTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKVIYTGKEGKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKVIYTGKEGKSS
830 840 850 860 870 880
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 RGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSLGDTLYQELTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSLGDTLYQELTD
890 900 910 920 930 940
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 TLRKYGNPTSRRCGLNDDRTCACQGKDPNTCGASFSFGCSWSMYFNGCKYARSKTPRKFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLRKYGNPTSRRCGLNDDRTCACQGKDPNTCGASFSFGCSWSMYFNGCKYARSKTPRKFR
950 960 970 980 990 1000
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 LAGDNPKEEEVLRKSFQDLATEVAPLYKRLAPQAYQNQVTNEEIAIDCRLGLKEGRPFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LAGDNPKEEEVLRKSFQDLATEVAPLYKRLAPQAYQNQVTNEEIAIDCRLGLKEGRPFAG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 VTACMDFCAHAHKDQHNLYNGCTVVCTLTKEDNRCVGKIPEDEQLHVLPLYKMANTDEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VTACMDFCAHAHKDQHNLYNGCTVVCTLTKEDNRCVGKIPEDEQLHVLPLYKMANTDEFG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 SEENQNAKVGSGAIQVLTAFPREVRRLPEPAKSCRQRQLEARKAAAEKKKIQKEKLSTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SEENQNAKVGSGAIQVLTAFPREVRRLPEPAKSCRQRQLEARKAAAEKKKIQKEKLSTPE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 KIKQEALELAGITSDPGLSLKGGLSQQGLKPSLKVEPQNHFSSFKYSGNAVVESYSVLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KIKQEALELAGITSDPGLSLKGGLSQQGLKPSLKVEPQNHFSSFKYSGNAVVESYSVLGN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 CRPSDPYSMNSVYSYHSYYAQPSLTSVNGFHSKYALPSFSYYGFPSSNPVFPSQFLGPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CRPSDPYSMNSVYSYHSYYAQPSLTSVNGFHSKYALPSFSYYGFPSSNPVFPSQFLGPGA
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 WGHSGSSGSFEKKPDLHALHNSLSPAYGGAEFAELPSQAVPTDAHHPTPHHQQPAYPGPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WGHSGSSGSFEKKPDLHALHNSLSPAYGGAEFAELPSQAVPTDAHHPTPHHQQPAYPGPK
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE2 EYLLPKAPLLHSVSRDPSPFAQSSNCYNRSIKQEPVDPLTQAEPVPRDAGKMGKTPLSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EYLLPKAPLLHSVSRDPSPFAQSSNCYNRSIKQEPVDPLTQAEPVPRDAGKMGKTPLSEV
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE2 SQNGGPSHLWGQYSGGPSMSPKRTNGVGGSWGVFSSGESPAIVPDKLSSFGASCLAPSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SQNGGPSHLWGQYSGGPSMSPKRTNGVGGSWGVFSSGESPAIVPDKLSSFGASCLAPSHF
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE2 TDGQWGLFPGEGQQAASHSGGRLRGKPWSPCKFGNSTSALAGPSLTEKPWALGAGDFNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TDGQWGLFPGEGQQAASHSGGRLRGKPWSPCKFGNSTSALAGPSLTEKPWALGAGDFNSA
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 LKGSPGFQDKLWNPMKGEEGRIPAAGASQLDRAWQSFGLPLGSSEKLFGALKSEEKLWDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKGSPGFQDKLWNPMKGEEGRIPAAGASQLDRAWQSFGLPLGSSEKLFGALKSEEKLWDP
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE2 FSLEEGPAEEPPSKGAVKEEKGGGGAEEEEEELWSDSEHNFLDENIGGVAVAPAHGSILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSLEEGPAEEPPSKGAVKEEKGGGGAEEEEEELWSDSEHNFLDENIGGVAVAPAHGSILI
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE2 ECARRELHATTPLKKPNRCHPTRISLVFYQHKNLNQPNHGLALWEAKMKQLAERARARQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ECARRELHATTPLKKPNRCHPTRISLVFYQHKNLNQPNHGLALWEAKMKQLAERARARQE
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KE2 EAARLGLGQQEAKLYGKKRKWGGTVVAEPQQKEKKGVVPTRQALAVPTDSAVTVSSYAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EAARLGLGQQEAKLYGKKRKWGGTVVAEPQQKEKKGVVPTRQALAVPTDSAVTVSSYAYT
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1660
pF1KE2 KVTGPYSRWI
::::::::::
CCDS46 KVTGPYSRWI
1790
>>CCDS47120.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4 (2002 aa)
initn: 2613 init1: 1834 opt: 2045 Z-score: 932.5 bits: 185.8 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 2598; 42.4% identity (63.3% similar) in 1206 aa overlap (501-1660:915-2002)
480 490 500 510 520
pF1KE2 PIQIKKSRPREAQPLFPPVRQIVLEGLRSPASQEVQAHPPA---PLPASQGSAVPLPPEP
:.:. : : :.: . :: . ::.
CCDS47 EQEQKSQQASVLQGYKNRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQK
890 900 910 920 930 940
530 540 550 560 570
pF1KE2 SLA--------LFAPSPSRDSLLPPTQ----EMRSPSPMT-ALQPGSTGPLPPADDKLEE
. :. . .... : :. .:. : . . .: . : ..: .
CCDS47 DTQKHAALRWHLLQKQEQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPENKTWK
950 960 970 980 990 1000
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 LIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQQTCLPA--PESPFATRSPKQIKIESSGAVTV
. . : .. .. . .. . .: . .. .. .: ::.:.: :: :::
CCDS47 KVTKQENPPASCDNVQQKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKSQKQVKVEMSGPVTV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
640 650 660 670 680
pF1KE2 LS-----------TTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDT
:. : .... ..: :::: . .:..:.::: : :::: :.::::
CCDS47 LTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTA--ASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 PAKRAQAEFPTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKVI
:.: .: .::.: :::::.::::::.:::::.::.::.:::.::::.:.::::::::.::
CCDS47 PVK-TQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVI
1130 1140 1150 1160 1170 1180
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 YTGKEGKSSRGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSLG
:::::::::.::::::::.:: . :::::::::.:::: :. ::::::::.::::: ::.
CCDS47 YTGKEGKSSQGCPIAKWVVRRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLA
1190 1200 1210 1220 1230 1240
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 DTLYQELTDTLRKYGNPTSRRCGLNDDRTCACQGKDPNTCGASFSFGCSWSMYFNGCKYA
: ::.:::.::::::. :.:::.::..::::::: ::.:::::::::::::::.::::.:
CCDS47 DKLYSELTETLRKYGTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKFA
1250 1260 1270 1280 1290 1300
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 RSKTPRKFRLAGDNPKEEEVLRKSFQDLATEVAPLYKRLAPQAYQNQVTNEEIAIDCRLG
::: ::::.: ::.::::: :.. .:.:.: .:: ::.:::.::.::. :. : .::::
CCDS47 RSKIPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIEYEHRAPECRLG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 LKEGRPFAGVTACMDFCAHAHKDQHNLYNGCTVVCTLTKEDNRCVGKIPEDEQLHVLPLY
:::::::.:::::.:::::::.: ::. :: :.:::::.:::: : ::::::::::::
CCDS47 LKEGRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTREDNREFGGKPEDEQLHVLPLY
1370 1380 1390 1400 1410 1420
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE2 KMANTDEFGSEENQNAKVGSGAIQVLTAFPREVRRLPEPAKSCRQRQLEARKAAAEK---
:....::::: : :. : :::::::..: :.:: : ::.:.::::.:::.::::::
CCDS47 KVSDVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSFRRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSS
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE2 -----KKIQKEKLSTPEKIKQEALELAGITSDPGLSLKGGLSQQGLKPSLKVEPQNHFSS
.: .::: :.: . :: . : :.: . ::. .: .: ..
CCDS47 LENSSNKNEKEK-SAPSRTKQTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQP----QPLQK---
1490 1500 1510 1520 1530
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE2 FKYSGNAVVESYSVLGNCRPSDPYSMNSVYSYHSYYAQPSLTSVNGFHSKYALPSFSYYG
.: .: ... . . .. :. :::.. .. . . :.
CCDS47 ------------------QPPQPQQQQRPQQQQPHH--PQTESVNSYSASGS--TNPYMR
1540 1550 1560 1570
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 FPSSNPVFPSQFLGPGAWGHSGSSGSFEKKPDLHALHNSLSPAYGGAEFAELPSQAVPTD
: ::: : :.. .:... ...: :: .: :::. .
CCDS47 RP--NPVSPY----PNS-SHTSD------------IYGSTSPM----NFYSTSSQAAGSY
1580 1590 1600
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE2 AHHPTPHHQQPAYPGPKEYLLPKAPLLHSVSRDPSPFAQSSNCYNRSIKQEPVDP-LTQA
. .: . : ::: ::.. .. : : .: : ... . .: : .
CCDS47 LNSSNPMN--P-YPG----------LLNQNTQYP-----SYQC-NGNLSVDNCSPYLGSY
1610 1620 1630 1640
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 EPV--PRDAGKM-GKTPLSEVSQNGGPSHLWGQYSGGPSMSPKRTNGVGGSWGVFSSGES
: : : .. .. :::..: : : : : :.: :. .. ..: :
CCDS47 SPQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSL--PPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQNMQGDGFS
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 PAIVPDKLSSFGASCLAPSHFTDGQWGLFPGEGQQAASHSGGRLRGKPWSPCKFGNSTSA
. .. : :.: ::. : : :.:. : ..: : :. :
CCDS47 SCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGH---FMG----ATSRLPPNL-SNPNMDYKNGEHHS-
1710 1720 1730 1740 1750
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 LAGPSLTEKPWALGAGDFNSALKGSPGFQDKLWNPMKGEEGRIPAAGASQLDRAWQSFGL
:: . .. . : :::.:.. .:.: : : .. : : :.. :
CCDS47 ---PSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALH-LQNKE-NDMLSH----TANGLSKM--------L
1760 1770 1780 1790 1800
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 PLGSSEKLFGALKSEEKLWDPFSLEEGPAEEPPSKGAVKEEKGGGGAEEEEEELWSDSEH
: . .. . . .:: : .: ..: . .: ... :...:.:::::.
CCDS47 PALNHDRTACVQGGLHKLSDA----NGQEKQP-----LALVQGVASGAEDNDEVWSDSEQ
1810 1820 1830 1840 1850
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 NFLDENIGGVAVAPAHGSILIECARRELHATTPLKKPNRCHPTRISLVFYQHKNLNQPNH
.::: .::::::::.:::::::::.::::::::::.::: :::::::::::::..:.:.:
CCDS47 SFLDPDIGGVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSMNEPKH
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 GLALWEAKMKQLAERARARQEEAARLGLGQQEAKLYGKKRKWGGTVVAEPQQKEKKGVVP
::::::::: ::.:: ..:: . : : .::: : :::.. . .
CCDS47 GLALWEAKM---AEKAREKEEECEKYGPDYVPQKSHGKKVK---REPAEPHETSEPTYLR
1920 1930 1940 1950 1960
1630 1640 1650 1660
pF1KE2 TRQALA-----VPTDSAVTVSSYAYTKVTGPYSRWI
..:: : :::.::.: ::.:.:::::.:.:
CCDS47 FIKSLAERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNRYI
1970 1980 1990 2000
>>CCDS7281.1 TET1 gene_id:80312|Hs108|chr10 (2136 aa)
initn: 1591 init1: 958 opt: 1727 Z-score: 789.5 bits: 159.4 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 2003; 31.9% identity (54.0% similar) in 1579 aa overlap (178-1660:847-2136)
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LEWLEGKIKSVVMEGGEERPRLPGPLPPGEAGLPAPSTRPLLSSEVPQISPQEGLPLSQS
:.. . .: ..:. :..: :.. :
CCDS72 KGRSNVLVFQQPGFNCSSIPHSSHSIINHHASIHNEGDQPKTPENIPSKEPKDGSPVQPS
820 830 840 850 860 870
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CCDS72 LLSLMKDRRLTLEQVVAIEALTQLSEA---PSENSSPSKSEKDEESEQRTASLLNSCKAI
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CCDS72 LYTVRKDLQDPNLQGEPPKLNHCPSLEKQSSCNTVVFNGQTTTLSNSHINSATNQASTKS
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pF1KE2 -EHSSFAPDSSAFPPATPRTEFPE----AWGTDTPPATPRSSWPMPRPSPDPMAELEQLL
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CCDS72 HEYSKVTNSLSLFIPKSNSSKIDTNKSIAQGIITLDNCSNDLHQLP-PRNNEVEYCNQLL
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CCDS72 DSSKKLDSDDLSCQDATHTQIEEDVATQLTQLASIIKINYIKPEDKKVESTPTSLVTCNV
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CCDS72 QQKYNQEKGTIQQKPPSSVHNNHGSSL-TKQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQEN
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CCDS72 DRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKFQNFGQFCPHDFPTVFGKISSSTK--IWKPLAQTRS-
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CCDS72 IMQPKTVFPPLTQIKLQ--RYPESAEEKVKVE---PLDSLSLFHLKTESNGKAFTDKAYN
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... .. .. :.: . :.. . . .::.. .:. ... :..:
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CCDS72 GISHET-----PLPESALTLRN---VNVVCSGGITVVSTKS--EEEVCSSSFGTSEFSTV
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CCDS72 DSAQKNFNDYAMNFFTNPTKNLVSIT---KDSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHLGAGPS
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CCDS72 IDPETCGASFSFGCSWSMYFNGCKFGRSPSPRRFRIDPSSPLHEKNLEDNLQSLATRLAP
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.::. :: :::::: :..: .:::: ::::::.:::::.::::: :.: ::. :: :::
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CCDS72 CTLTREDNRSLGVIPQDEQLHVLPLYKLSDTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLA--PRRKK
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: . .:. .: ..: .. :.: . :: : .::.. . .: :.
CCDS72 RTCFTQPVPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAV-EKKPIP-RIKRKNNSTTTNNSKPSSLPTL
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: . . ..: .: : . :: .: : :. ..::.. :: :. .
CCDS72 GSNTETVQPEVKSETEPHFI-LKSSDNT--KTYSLM----PSAPHPV-------------
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pF1KE2 SLTSVNGFHSKYALPSFSYYGFPSSNPVFPSQFLGPGAWGHSGSSGSFEKKPDLHALHNS
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CCDS72 ----------KEASPGFSWS--PKTASATPA----P--------------------LKND
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. . : :.: : ::: .:.
CCDS72 ATASCG---FSERSS----------TPHCTMPS---------------------------
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:. .... ::
CCDS72 ------------------------------GRLSGANAAAADGP----------------
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CCDS72 -------HIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLIECARRELHATTPVEHPNRNHP
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pF1KE2 TRISLVFYQHKNLNQPNHGLALWEAKMKQLAERARARQEEAARLGLGQQEAKLYGKKRKW
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CCDS72 TRLSLVFYQHKNLNKPQHGFEL--NKIKFEAKEAKNKKMKASEQ---KDQAANEGPEQS-
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]