Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2286
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2286, 444 aa
1>>>pF1KE2286 444 - 444 aa - 444 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2831+/-0.000756; mu= 13.9269+/- 0.045
mean_var=98.7418+/-20.585, 0's: 0 Z-trim(111.4): 76 B-trim: 832 in 2/49
Lambda= 0.129070
statistics sampled from 12308 (12389) to 12308 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.381), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 3086 584.7 6.1e-167
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 2629 499.6 2.6e-141
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 1886 361.2 9.1e-100
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1880 360.1 2e-99
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1873 358.9 6e-99
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1625 312.7 4.5e-85
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 995 195.2 6.7e-50
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 937 184.7 2.3e-46
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 937 184.7 2.4e-46
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 846 167.6 1.8e-41
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 846 167.7 3e-41
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 826 163.9 3.1e-40
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 814 161.7 1.5e-39
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 793 157.8 2.2e-38
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 793 157.8 2.3e-38
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 793 157.8 2.7e-38
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 791 157.5 3.4e-38
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 789 157.1 4.8e-38
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 789 157.1 4.8e-38
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 787 156.7 6.2e-38
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 787 156.7 6.2e-38
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 757 151.1 2.3e-36
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 751 150.0 5e-36
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 739 147.7 2.3e-35
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 739 147.7 2.3e-35
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 730 146.0 7.7e-35
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 695 139.6 8.2e-33
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 695 139.6 8.2e-33
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 464 96.4 4.1e-20
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 429 89.9 3.8e-18
CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 447) 421 88.5 1.5e-17
CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 448) 421 88.5 1.5e-17
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 405 85.4 8.2e-17
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 405 85.4 8.6e-17
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 405 85.4 8.6e-17
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 401 84.6 1.4e-16
CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 334 72.1 7.5e-13
CCDS82395.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 279) 326 70.7 2.2e-12
CCDS12907.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 287) 322 69.9 3.7e-12
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 315 68.6 9.1e-12
CCDS55490.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1327) 319 69.8 1.9e-11
CCDS14629.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1336) 319 69.8 1.9e-11
CCDS55491.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1341) 319 69.8 1.9e-11
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 302 66.2 4.7e-11
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 302 66.2 4.8e-11
CCDS12909.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 275) 299 65.6 6.9e-11
>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 3086 init1: 3086 opt: 3086 Z-score: 3110.6 bits: 584.7 E(32554): 6.1e-167
Smith-Waterman score: 3086; 99.3% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGN
:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS42 YKEDRIHIPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE2 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
430 440
>>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (455 aa)
initn: 2629 init1: 2629 opt: 2629 Z-score: 2650.5 bits: 499.6 E(32554): 2.6e-141
Smith-Waterman score: 2629; 85.6% identity (92.8% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
::: ::::::::.::.: : : ::::::::::: ::.::::::::.:.::::. ::::::
CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGN
::::: ::::::::::::.: :.::: ::::.: ::::.::: :::::::::.:::::::
CCDS12 YKEDRSHVPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF
:::::::::::::.:::: ::::::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS12 HRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV
::::.: .::::::::::: :.::::::::::::::.:: :::::::::::: :::::.:
CCDS12 SIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS
:::::: ::::.::::::: :::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRAVPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL
: ::. ::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::::.::::::::::
CCDS12 PCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT
. :::::::::::::::::.::.: .:::::::.:::::::::::: ::::.::::::::
CCDS12 YRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKT
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE2 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
: ::: .:::::::.:::::::::
CCDS12 PLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF
430 440 450
>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa)
initn: 2441 init1: 1881 opt: 1886 Z-score: 1904.6 bits: 361.2 E(32554): 9.1e-100
Smith-Waterman score: 1886; 85.5% identity (92.1% similar) in 318 aa overlap (119-436:24-341)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
: :::::::::::::::: : ::::::::.
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
:.::.::.:: :: .:.:. ::::::::::::::: :::::::::::::.::::::
CCDS33 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
::::::::.:: :::::::::::: : :::::::::::::::::::::::: :::::. :
CCDS33 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
::: :::::::::::::::::::::::: ::::::. :::::::::::::.:::::::
CCDS33 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS
:::..:::::::.:::::::::::::::::::: :: :::::.:::::::::::.: :::
CCDS33 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
:::::.:::::::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::.:
CCDS33 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
300 310 320 330 340
>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa)
initn: 1879 init1: 1353 opt: 1880 Z-score: 1898.5 bits: 360.1 E(32554): 2e-99
Smith-Waterman score: 1880; 85.0% identity (91.1% similar) in 326 aa overlap (119-444:24-348)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
: ::::::::::: :::: : ::::::::.
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
:::::.::.::. .: ::.:. :::::::::::. : :::::::::::::.:::.::
CCDS12 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
::::::::. : ::::::::: :: : :::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS12 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
::: :::::::::::::::::::::::. :::::: :::::::::::::.:::::::
CCDS12 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS
::::.:::::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::::: :::::::::::
CCDS12 PSSKTGNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDS
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
:::::.::::.::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::. ::::::::
CCDS12 DEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
300 310 320 330 340
>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 2500 init1: 1873 opt: 1873 Z-score: 1890.0 bits: 358.9 E(32554): 6e-99
Smith-Waterman score: 2463; 81.8% identity (89.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
::: ::::::::.::.: : : ::::::::::: ::.::::::::.:.::::. ::::::
CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGN
::::: ::::::::::::.: :.::: ::::.: ::::.::: :::::::::.:::::::
CCDS58 YKEDRSHVPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF
:::::::::::::.:::: ::::::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS58 HRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV
::::.: .::::::::::: :.::::::::::::::.:: :::::::::::: :::::.:
CCDS58 SIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS
:::::: ::::.::::::: :::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRAVPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL
: ::. ::::::::: : ::::.::::::::.::::::::::
CCDS58 PCVWSNSSDPLLVSVT-----------------GICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLL
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT
. :::::::::::::::::.::.: .:::::::.:::::::::::: ::::.::::::::
CCDS58 YRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKT
350 360 370 380 390 400
430 440
pF1KE2 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
: ::: .:::::::.:::::::::
CCDS58 PLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF
410 420 430
>>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
::::::::::::.::.. ::.::::::::::::..:: .: ::::.:. : ::.: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGN
::: . :: ...:::...: :.::: ::::.: : .:::::::::::::::.::::::
CCDS12 SKEDGMPVPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF
:::::::::::::::::: ::::::::. ::.:.::.:::..:: :::::.::. :..:.
CCDS12 HRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV
:.::: ::::::::.::::: ::.::::::::::::.: : :::::::::: :::::.:
CCDS12 SMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSAPSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS
:::::::: .:.::::::. : : :: :: .:: ::::.:::::.::::.::::::::
CCDS12 TLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTAVLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL
:. :::::::: :::::: :.::.::::::::: : .::::::
CCDS12 PHAWSDPSDPLPVSVTGNS-----------------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLL
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT
: ::.:::::.:::::::::::.: ::::::::.:::::::.::::::::::::::::::
CCDS12 HRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKT
350 360 370 380 390 400
430 440
pF1KE2 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
:::::
CCDS12 PPTDTSV
410
>>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa)
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Smith-Waterman score: 1165; 53.5% identity (62.5% similar) in 368 aa overlap (1-368:3-270)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNF
:: :. .::.:.:: : . :.::::::: :::::::::.:::::::::::. :: :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MLYKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVT
:::.: . :: ...::: ..: .:::: ::::.: ::: :::::: :::::::.:::::
CCDS42 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKA
:
CCDS42 GL----------------------------------------------------------
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGE
::::::.:.::: :.:::
CCDS42 ------------------------------------------YEKPSLTARPGPTVRAGE
130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFR
.:::::::.::.:.::::::: ::: ::::: ..: :::::::::::::: ::::::::.
CCDS42 NVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFH
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 HSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFF
:::::::::::: :::::::::::::::::: :.: :::: .: ::.:::: .: ::
CCDS42 GSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFF
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRP
::: :::.::
CCDS42 LLHRWCSKKKMLL
270
>>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (631 aa)
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Smith-Waterman score: 969; 38.9% identity (65.6% similar) in 445 aa overlap (24-444:119-559)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRH
: .:: ::: :: :: ::..:::: ..
CCDS33 TQHHAGRYRCHYYSSAGWSEPSDPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQK
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100
pF1KE2 RFNNFMLYKEDRIHVP------IFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWS
...:.:.:: . ..: .:. :: : ..::: .: .:: . ..: ::
CCDS33 GYHHFVLMKEGEHQLPRTLDSQQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWS
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 APSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRL
::.:. :. .: ::::::. ::.. :. . ::: ::. ...: :.::: .: .
CCDS33 HPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEG-ERDFLQR
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VGQI-HDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGP-YEKPS
:: . :.:.:::..::. . .: :::::. . . :::::::::..:: :. :
CCDS33 PGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA-HNLSSEWSAPSDPLDILITGQIYDTVS
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHER-RLPAVRKVNRTFQADFPLGP
::::::: : .::..:: :.::. .: . :..::.:: :: .. ... .::.::..:
CCDS33 LSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLRLRSMYGAHK-YQAEFPMSP
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 AT--HGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHIL
.: :.:::::.:: .:. : ::.:: . :.:. ..: :: : : : :.:..:
CCDS33 VTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSLPPTGPPSTPGLGRYLEVL
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390
pF1KE2 IGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAV----MD-QEPAGNRTANSED-------SDE
::.::...:...::.::: : ..:. . : :.::: .. .: :
CCDS33 IGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDFQRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPA
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440
pF1KE2 QD-PEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
: :: :: . . .. .. :: :. ... :. . ...:: ...: :
CCDS33 ADVQEENLYAAVKD-TQSEDRVELDSQSPHDEDPQAVTYAPVKHSSPRREMASPPSSLSG
510 520 530 540 550 560
CCDS33 EFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEGEPPAEPSI
570 580 590 600 610 620
>>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa)
initn: 743 init1: 509 opt: 937 Z-score: 945.7 bits: 184.7 E(32554): 2.4e-46
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRH
: .:: ::: :: :: ::..:::: ..
CCDS46 TQHHAGRYRCHYYSSAGWSEPSDPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQK
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100
pF1KE2 RFNNFMLYKEDRIHVP------IFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWS
...:.:.:: . ..: .:. :: : ..::: .: .:: . ..: ::
CCDS46 GYHHFVLMKEGEHQLPRTLDSQQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWS
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 APSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRL
::.:. :. .: ::::::. ::.. :. . ::: ::. ...: :.::: .: .
CCDS46 HPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEG-ERDFLQR
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VGQI-HDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGP-YEKPS
:: . :.:.:::..::. . .: :::::. . . :::::::::..:: :. :
CCDS46 PGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA-HNLSSEWSAPSDPLDILITGQIYDTVS
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHER-RLPAVRKVNRTFQADFPLGP
::::::: : .::..:: :.::. .: . :..::.:: :: .. ... .::.::..:
CCDS46 LSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLRLRSMYGAHK-YQAEFPMSP
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 AT--HGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHIL
.: :.:::::.:: .:. : ::.:: . :.:. ..: :: : : : :.:..:
CCDS46 VTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSLPPTGPPSTPGLGRYLEVL
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390
pF1KE2 IGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAV----MD-QEPAGNRTANSED-------SDE
::.::...:...::.::: : ..:. . : :.::: .. .: :
CCDS46 IGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDFQRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPA
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440
pF1KE2 QD-PEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
: :: :: . .: .: :. ... :. . ...:: ...: :
CCDS46 ADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQAVTYAPVKHSSPRREMASPPSSLSG
510 520 530 540 550 560
CCDS46 EFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEGEPPAEPSI
570 580 590 600 610 620
>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa)
initn: 1940 init1: 774 opt: 846 Z-score: 858.0 bits: 167.6 E(32554): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 1299; 51.8% identity (60.5% similar) in 438 aa overlap (1-438:3-305)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNF
:: :. .::.:.:: : . :.::::::: :::::::::.:::::::::::. :: :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MLYKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVT
:::.: . :: ...::: ..: .:::: ::::.: ::: :::::: :::::::.:::::
CCDS42 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKA
:
CCDS42 G-----------------------------------------------------------
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGE
::::::.:.::: :.:::
CCDS42 -----------------------------------------LYEKPSLTARPGPTVRAGE
130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFR
.:::::::.::.:.::::::: ::: ::::: ..: :::::::::::::: ::::::::.
CCDS42 NVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFH
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 HSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFF
:::::::::::: :::::::::::::::::: :.
CCDS42 GSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT-------------------------
210 220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRP
.::::.:::::.::.: ::::::::.::::::::::.::::::: ::::
CCDS42 ----------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRS
240 250 260 270 280
420 430 440
pF1KE2 KTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
: : ::: . :::::.::.
CCDS42 KRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI
290 300 310 320 330 340
444 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:33:43 2016 done: Sun Nov 6 22:33:43 2016
Total Scan time: 3.290 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]