Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2266
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2266, 852 aa
1>>>pF1KE2266 852 - 852 aa - 852 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0463+/-0.000515; mu= 22.5282+/- 0.032
mean_var=70.0738+/-14.426, 0's: 0 Z-trim(106.8): 51 B-trim: 166 in 1/48
Lambda= 0.153213
statistics sampled from 14871 (14918) to 14871 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 12.130
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689644 (OMIM: 610315) piwi-like protein 4 [Homo ( 852) 5645 1258.1 0
XP_011537305 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2818 633.2 1.5e-180
NP_004755 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 isofo ( 861) 2818 633.2 1.5e-180
XP_011537306 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2818 633.2 1.5e-180
XP_011537304 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2818 633.2 1.5e-180
NP_001177900 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 is ( 829) 2615 588.3 4.8e-167
XP_016875718 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 832) 2615 588.3 4.8e-167
XP_011537307 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 819) 2219 500.8 1.1e-140
NP_001242904 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 873) 2208 498.4 6e-140
NP_001129193 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 973) 1952 441.8 7e-123
NP_060538 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 isofo ( 973) 1952 441.8 7e-123
XP_011537308 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 481) 1730 392.5 2.4e-108
NP_001317409 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 937) 1603 364.7 1.1e-99
NP_001008496 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 882) 1454 331.7 8.9e-90
XP_005273608 (OMIM: 610312) PREDICTED: piwi-like p ( 804) 1376 314.4 1.3e-84
XP_016856017 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 383 94.8 1.2e-18
XP_005270633 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 383 94.8 1.2e-18
XP_016856013 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18
XP_016856014 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18
XP_016856015 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18
XP_011539184 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18
NP_803171 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 626) 383 94.9 1.3e-18
XP_016856016 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18
XP_011539181 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 845) 383 95.0 1.6e-18
XP_016856012 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 383 95.0 1.6e-18
NP_079128 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 860) 383 95.0 1.6e-18
XP_005270632 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 383 95.0 1.6e-18
XP_016868806 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 782) 379 94.1 2.8e-18
XP_011515268 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 813) 379 94.1 2.8e-18
NP_036286 (OMIM: 606229) protein argonaute-2 isofo ( 859) 379 94.1 3e-18
XP_011515267 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 873) 379 94.1 3e-18
XP_011515270 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 918) 379 94.1 3.1e-18
XP_016856508 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 706) 374 92.9 5.5e-18
NP_001304052 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 782) 374 93.0 5.9e-18
NP_036331 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 isofo ( 857) 374 93.0 6.4e-18
XP_011539538 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 860) 374 93.0 6.4e-18
NP_001304051 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 891) 374 93.0 6.6e-18
XP_011539186 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 660) 337 84.7 1.5e-15
XP_011539185 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 711) 337 84.7 1.6e-15
XP_005270635 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 337 84.8 1.7e-15
XP_005270636 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 337 84.8 1.7e-15
NP_060099 (OMIM: 607356) protein argonaute-4 [Homo ( 861) 337 84.8 1.9e-15
NP_001158095 (OMIM: 606229) protein argonaute-2 is ( 825) 186 51.4 2e-05
XP_016856507 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 725) 167 47.2 0.00033
XP_016856506 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 873) 167 47.2 0.00038
XP_016856505 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 876) 167 47.2 0.00038
>>NP_689644 (OMIM: 610315) piwi-like protein 4 [Homo sap (852 aa)
initn: 5645 init1: 5645 opt: 5645 Z-score: 6739.5 bits: 1258.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5645; 100.0% identity (100.0% similar) in 852 aa overlap (1-852:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSGRARVKARGIARSPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSRISTNDKYGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MSGRARVKARGIARSPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSRISTNDKYGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 WQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEKVTELSSETQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 WQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEKVTELSSETQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 RGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 IVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 IQRNTNARFELETWGLHFGSQISLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAADWSKDIRTCKILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 IQRNTNARFELETWGLHFGSQISLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAADWSKDIRTCKILN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 AQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQENPAAFVRAIQQYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 AQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQENPAAFVRAIQQYV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 DPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 CKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 CKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 DVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKE
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE2 PSLELANHLFYL
::::::::::::
NP_689 PSLELANHLFYL
850
>>XP_011537305 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like prote (861 aa)
initn: 2843 init1: 1472 opt: 2818 Z-score: 3362.3 bits: 633.2 E(85289): 1.5e-180
Smith-Waterman score: 2840; 49.1% identity (76.3% similar) in 865 aa overlap (1-852:1-861)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSGRARVKARGIAR---------SPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSR
:.::::..::: :: : .. . : :: : : .. . . : : .
XP_011 MTGRARARARGRARGQETAQLVGSTASQQPGYIQPRPQPPPAEGELFGRGRQRGTAGGTA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTN
: . . ::.: .. ::: . ..:: ::.. ::..: ::.. ::::::: :.: ::
XP_011 KSQGLQ--ISAGFQELSLAERGGR-RRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LFNLDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEK
: : .: :::::. : : . .:::: :::..: .: .: .::::.:::: ..:..:
XP_011 HFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSALLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSE
:::. :.:. :: ...:::: ::: .::.:.: .:::::..:: ... :::::.:::..
XP_011 VTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQQIGRNYYNPND
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ
:..::.:.: .::::. :. .: .... .:::.::::.::::.:: . ..: : .
XP_011 PIDIPSHRLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVLRSETVLDFMFNFYHQTEEHKFQE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDL
:.::::.:::.:::.:: .:::::. .: ::.: ::.:.....::..::. ..::
XP_011 QVSKELIGLVVLTKYNNKTYRVDDIDWDQNPKSTFKKADGSEVSFLEYYRKQYNQEITDL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NQPMLVSLLKKKRNDNSEAQL-AHLIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGR
.::.::: :..:. .. : ::::::.::::::. .::..:: .: .:::.: :
XP_011 KQPVLVSQPKRRRGPGGTLPGPAMLIPELCYLTGLTDKMRNDFNVMKDLAVHTRLTPEQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE2 QQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQI-SLTGRIVPSEKILMQDHICQ--PVSAA
:....::.: :..: :.. ::. ::: : :.. :..:::. .::: . . . : . :
XP_011 QREVGRLIDYIHKNDNVQRELRDWGLSFDSNLLSFSGRILQTEKIHQGGKTFDYNP-QFA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 DWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQE
::::. : ..... :..::.. . :. .:.:... : .:. .::... .:.:..
XP_011 DWSKETRGAPLISVKPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKVTPAMGMQMRKAIMIEVDD
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 NPAAFVRAIQQYVDPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGM
:..:..:: : :.:.:.:.: ::.: ::.::::: .:::.:::::.::::.::
XP_011 RTEAYLRVLQQKVTADTQIVVCLLSSNRKDKYDAIKKYLCTDCPTPSQCVVARTLGKQQT
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 MMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRIT
.:.::::::.::.::.::::: :.:::: .:.:::: .: . ..: :::.: .:
XP_011 VMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGIDCYHDMTAGRRSIAGFVASINEGMT
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 RWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYE
:::::::.: ...: ::: . .:: : . :. .:.:::::: ::::::::::..::
XP_011 RWFSRCIFQDRGQELVDGLKVCLQAALRAWNSCNEYMPSRIIVYRDGVGDGQLKTLVNYE
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 VPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYD
:::.:. . . . . ::.::::.:. :::.. . .::: :::.: :.:: ::::
XP_011 VPQFLDCLKSIGRGYNPRLTVIVVKKRVNTRFFAQSGGRLQNPLPGTVIDVEVTRPEWYD
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 FYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAH
:...::.. :.::::.::::::..::::::.::::.::::.::::::.. :::::::::
XP_011 FFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLTYKLCHIYYNWPGVIRVPAPCQYAH
780 790 800 810 820 830
830 840 850
pF1KE2 KLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL
::.:::.::::.::.: :.:.:.::
XP_011 KLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL
840 850 860
>>NP_004755 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 isoform 1 (861 aa)
initn: 2843 init1: 1472 opt: 2818 Z-score: 3362.3 bits: 633.2 E(85289): 1.5e-180
Smith-Waterman score: 2840; 49.1% identity (76.3% similar) in 865 aa overlap (1-852:1-861)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSGRARVKARGIAR---------SPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSR
:.::::..::: :: : .. . : :: : : .. . . : : .
NP_004 MTGRARARARGRARGQETAQLVGSTASQQPGYIQPRPQPPPAEGELFGRGRQRGTAGGTA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTN
: . . ::.: .. ::: . ..:: ::.. ::..: ::.. ::::::: :.: ::
NP_004 KSQGLQ--ISAGFQELSLAERGGR-RRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LFNLDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEK
: : .: :::::. : : . .:::: :::..: .: .: .::::.:::: ..:..:
NP_004 HFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSALLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSE
:::. :.:. :: ...:::: ::: .::.:.: .:::::..:: ... :::::.:::..
NP_004 VTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQQIGRNYYNPND
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ
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