Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2238
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2238, 332 aa
1>>>pF1KE2238 332 - 332 aa - 332 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0392+/-0.00112; mu= 12.1781+/- 0.067
mean_var=82.0470+/-16.883, 0's: 0 Z-trim(103.6): 64 B-trim: 425 in 1/48
Lambda= 0.141593
statistics sampled from 7420 (7481) to 7420 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 1.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53394.1 SLAMF6 gene_id:114836|Hs108|chr1 ( 332) 2141 447.4 7.4e-126
CCDS1205.1 SLAMF6 gene_id:114836|Hs108|chr1 ( 331) 2124 443.9 8.2e-125
CCDS53393.1 SLAMF6 gene_id:114836|Hs108|chr1 ( 221) 1314 278.4 3.8e-75
CCDS81388.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 ( 339) 465 105.0 8.7e-23
CCDS1206.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 ( 328) 454 102.8 4e-22
CCDS53397.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 ( 272) 435 98.9 5.1e-21
CCDS53396.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 ( 345) 435 98.9 6.2e-21
CCDS1209.1 SLAMF7 gene_id:57823|Hs108|chr1 ( 335) 399 91.6 9.9e-19
CCDS1191.1 SLAMF9 gene_id:89886|Hs108|chr1 ( 289) 377 87.0 2e-17
CCDS60321.1 SLAMF7 gene_id:57823|Hs108|chr1 ( 296) 345 80.5 1.9e-15
CCDS65696.1 LY9 gene_id:4063|Hs108|chr1 ( 565) 338 79.2 8.7e-15
CCDS65695.1 LY9 gene_id:4063|Hs108|chr1 ( 641) 338 79.2 9.7e-15
CCDS30916.1 LY9 gene_id:4063|Hs108|chr1 ( 655) 338 79.2 9.9e-15
>>CCDS53394.1 SLAMF6 gene_id:114836|Hs108|chr1 (332 aa)
initn: 2141 init1: 2141 opt: 2141 Z-score: 2373.0 bits: 447.4 E(32554): 7.4e-126
Smith-Waterman score: 2141; 100.0% identity (100.0% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SLAFIVPHETKSPEIHVTNPKQGKRLNFTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTSAKLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLAFIVPHETKSPEIHVTNPKQGKRLNFTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTSAKLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SYTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNTLSSQPNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SYTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNTLSSQPNLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVSGICIVFGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVSGICIVFGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHSNRETEIWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHSNRETEIWTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE2 RENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
310 320 330
>>CCDS1205.1 SLAMF6 gene_id:114836|Hs108|chr1 (331 aa)
initn: 1723 init1: 1723 opt: 2124 Z-score: 2354.2 bits: 443.9 E(32554): 8.2e-125
Smith-Waterman score: 2124; 99.7% identity (99.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SLAFIVPHETKSPEIHVTNPKQGKRLNFTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTSAKLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLAFIVPHETKSPEIHVTNPKQGKRLNFTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTSAKLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SYTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNTLSSQPNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SYTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNTLSSQPNLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVSGICIVFGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVSGICIVFGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHSNRETEIWTP
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGP-ESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHSNRETEIWTP
250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE2 RENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
300 310 320 330
>>CCDS53393.1 SLAMF6 gene_id:114836|Hs108|chr1 (221 aa)
initn: 1314 init1: 1314 opt: 1314 Z-score: 1462.7 bits: 278.4 E(32554): 3.8e-75
Smith-Waterman score: 1314; 100.0% identity (100.0% similar) in 204 aa overlap (129-332:18-221)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LKMEDTGSYRAQISTKTSAKLSSYTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MLWLFQSLLFVFCFGPGQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDA
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DDNVSFRWEALGNTLSSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DDNVSFRWEALGNTLSSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVK
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 IQYTDTKMILFMVSGICIVFGFIILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IQYTDTKMILFMVSGICIVFGFIILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVS
110 120 130 140 150 160
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 PTNNTVYASVTHSNRETEIWTPRENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PTNNTVYASVTHSNRETEIWTPRENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
170 180 190 200 210 220
>>CCDS81388.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 (339 aa)
initn: 274 init1: 105 opt: 465 Z-score: 522.5 bits: 105.0 E(32554): 8.7e-23
Smith-Waterman score: 465; 30.7% identity (64.9% similar) in 319 aa overlap (2-312:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWL
::. ::. . : . ..: . . ::::::::::.:... ..:..:.:
CCDS81 MAQHHLWI---LLLCLQTWPEAAGKDSEI--FTVNGILGESVTFPVNIQEPRQVKIIAWT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FNETSLAFIVPHETKS-PEIHVTNPKQGKRLN-FTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTK
..::.:...: .... : . ::. . .:.. . .:.: .:.:.:::.:.:.:.:.:.
CCDS81 -SKTSVAYVTPGDSETAPVVTVTHRNYYERIHALGPNYNLVISDLRMEDAGDYKADINTQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TSAKLSS--YTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNT
.. .. :.:.: :.: . ..:. . : ::.. :::::: . ::.. : ::.
CCDS81 ADPYTTTKRYNLQIYRRLGKPKITQSLMASVNSTCNVTLTCSVEKEEKNVTYNWSPLGEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LSSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVS
. : . :. ..: ::: :.: ::: : :.::..:: :. . . . :. :
CCDS81 GNV---LQIFQTPE-DQELTYTCTAQNPVSNNSDSISARQLCADIAMGFRTHHTGLLSVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 GICIVFGFII--LLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYAS--V
.. ... .:. ..:. : :::.. :.: :..: .... :. . . :: : .
CCDS81 AMFFLLVLILSSVFLFRLFKRRQGSCLNT-FTKNPYAASKKTIYTYIMASRNTQPAESRI
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE2 THSNRETEIWTPRENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
.... .:. . :.:: .
CCDS81 YDEILQSKVLPSKEEPVNTVYSEVQFADKMGKASTQDSKPPGTSSYEIVI
290 300 310 320 330
>>CCDS1206.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 (328 aa)
initn: 288 init1: 119 opt: 454 Z-score: 510.6 bits: 102.8 E(32554): 4e-22
Smith-Waterman score: 454; 30.2% identity (64.5% similar) in 318 aa overlap (2-312:6-302)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWL
::. ::. . : . ..: . . ::::::::::.:... ..:..:.:
CCDS12 MAQHHLWI---LLLCLQTWPEAAGKDSEI--FTVNGILGESVTFPVNIQEPRQVKIIAWT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FNETSLAFIVPHETKS-PEIHVTNPKQGKRLN-FTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTK
..::.:...: .... : . ::. . .:.. . .:.: .:.:.:::.:.:.:.:.:.
CCDS12 -SKTSVAYVTPGDSETAPVVTVTHRNYYERIHALGPNYNLVISDLRMEDAGDYKADINTQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TSAKLSS--YTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNT
.. .. :.:.: :.: . ..:. . : ::.. :::::: . ::.. : ::.
CCDS12 ADPYTTTKRYNLQIYRRLGKPKITQSLMASVNSTCNVTLTCSVEKEEKNVTYNWSPLGEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LSSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVS
. : . :. ..: ::: :.: ::: : :.::..:: :. . . . :. :
CCDS12 GNV---LQIFQTPE-DQELTYTCTAQNPVSNNSDSISARQLCADIAMGFRTHHTGLLSVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 GICIVFGFI---ILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVT
.. ... .: ..:. ....:.:. : .: : ..:: . :... .: .
CCDS12 AMFFLLVLILSSVFLFRLFKRRQDAASKKTIYTY--IMASRNTQ-----PAESRIYDEIL
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE2 HSNRETEIWTPRENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
.: .. .:. . :.:: .
CCDS12 QS----KVLPSKEEPVNTVYSEVQFADKMGKASTQDSKPPGTSSYEIVI
290 300 310 320
>>CCDS53397.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 (272 aa)
initn: 195 init1: 115 opt: 435 Z-score: 490.9 bits: 98.9 E(32554): 5.1e-21
Smith-Waterman score: 435; 32.8% identity (67.5% similar) in 268 aa overlap (2-263:6-263)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWL
::. ::. . : . ..: . . ::::::::::.:... ..:..:.:
CCDS53 MAQHHLWI---LLLCLQTWPEAAGKDSEI--FTVNGILGESVTFPVNIQEPRQVKIIAWT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FNETSLAFIVPHETKS-PEIHVTNPKQGKRLN-FTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTK
..::.:...: .... : . ::. . .:.. . .:.: .:.:.:::.:.:.:.:.:.
CCDS53 -SKTSVAYVTPGDSETAPVVTVTHRNYYERIHALGPNYNLVISDLRMEDAGDYKADINTQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TSAKLSS--YTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNT
.. .. :.:.: :.: . ..:. . : ::.. :::::: . ::.. : ::.
CCDS53 ADPYTTTKRYNLQIYRRLGKPKITQSLMASVNSTCNVTLTCSVEKEEKNVTYNWSPLGEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LSSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVS
. : . :. ..: ::: :.: ::: : :.::..:: :. . . . :. :
CCDS53 GNV---LQIFQTPE-DQELTYTCTAQNPVSNNSDSISARQLCADIAMGFRTHHTGLLSVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GICIVFGFII--LLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTH
.. ... .:. ..:. : :::.. ::. . ..
CCDS53 AMFFLLVLILSSVFLFRLFKRRQGASLQGRASEHSLFRSAVC
240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE2 SNRETEIWTPRENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
>>CCDS53396.1 CD84 gene_id:8832|Hs108|chr1 (345 aa)
initn: 196 init1: 116 opt: 435 Z-score: 489.3 bits: 98.9 E(32554): 6.2e-21
Smith-Waterman score: 446; 29.9% identity (63.6% similar) in 324 aa overlap (2-312:6-319)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWL
::. ::. . : . ..: . . ::::::::::.:... ..:..:.:
CCDS53 MAQHHLWI---LLLCLQTWPEAAGKDSEI--FTVNGILGESVTFPVNIQEPRQVKIIAWT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FNETSLAFIVPHETKS-PEIHVTNPKQGKRLN-FTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTK
..::.:...: .... : . ::. . .:.. . .:.: .:.:.:::.:.:.:.:.:.
CCDS53 -SKTSVAYVTPGDSETAPVVTVTHRNYYERIHALGPNYNLVISDLRMEDAGDYKADINTQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TSAKLSS--YTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNT
.. .. :.:.: :.: . ..:. . : ::.. :::::: . ::.. : ::.
CCDS53 ADPYTTTKRYNLQIYRRLGKPKITQSLMASVNSTCNVTLTCSVEKEEKNVTYNWSPLGEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LSSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVS
. : . :. ..: ::: :.: ::: : :.::..:: :. . . . :. :
CCDS53 GNV---LQIFQTPE-DQELTYTCTAQNPVSNNSDSISARQLCADIAMGFRTHHTGLLSVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 GICIVFGFII--LLLLVLRKRRDSL-----SLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVY
.. ... .:. ..:. : :::.. : . :..: .... :. . . ::
CCDS53 AMFFLLVLILSSVFLFRLFKRRQGRIFPEGSCLNTFTKNPYAASKKTIYTYIMASRNTQP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE2 AS--VTHSNRETEIWTPRENDTITIYSTINHSKESKPTFSRATALDNVV
: . .... .:. . :.:: .
CCDS53 AESRIYDEILQSKVLPSKEEPVNTVYSEVQFADKMGKASTQDSKPPGTSSYEIVI
300 310 320 330 340
>>CCDS1209.1 SLAMF7 gene_id:57823|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 199 init1: 102 opt: 399 Z-score: 449.8 bits: 91.6 E(32554): 9.9e-19
Smith-Waterman score: 399; 29.5% identity (61.1% similar) in 319 aa overlap (32-332:31-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNETS
: .: .::.::. . ..:. :.: :: :
CCDS12 MAGSPTCLTLIYILWQLTGSAASGPVKELVGSVGGAVTFPLKSKV-KQVDSIVWTFNTTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAFIVPHETKSPEIHVTNPKQGKRLNFTQS-YSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTSAKLS
:. : : .. : ::. .. .:..: .. :::.::.:: .:.: : . : ... . :
CCDS12 LVTIQP---EGGTIIVTQNRNRERVDFPDGGYSLKLSKLKKNDSGIYYVGIYSSSLQQPS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 S--YTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNTLSSQPN
. :.:.. ..: . .:: : .: :: .::: .: ....: . :.:::.. . . :
CCDS12 TQEYVLHVYEHLSKPKVTMGLQSNKNGTCVTNLTCCMEHGEEDVIYTWKALGQAANESHN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ---LTVSWDPRIS-SEQDYTCIAENAVS-NLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVSG
: .:: : . :.. . :.:.: :: :.: . :.:::: . . :..:.:. .
CCDS12 GSILPISW--RWGESDMTFICVARNPVSRNFSSPILARKLCEGAA-DDPDSSMVLLCLLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ICIVFGFIILLLLV--LRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHS
. .......: :.. :...:. . .. .. :. . .:: : .. :.
CCDS12 VPLLLSLFVLGLFLWFLKRERQEEYIEEKKR---VDICRETPNICPHSGENTEYDTIPHT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE2 NRETEIWTPRENDTITIYSTIN--------HSKESKPTFSRATALDNVV
:: .:. . :.:::.. :: . : : : .::.
CCDS12 NRTIL----KEDPANTVYSTVEIPKKMENPHSLLTMPDTPRLFAYENVI
300 310 320 330
>>CCDS1191.1 SLAMF9 gene_id:89886|Hs108|chr1 (289 aa)
initn: 263 init1: 110 opt: 377 Z-score: 426.4 bits: 87.0 E(32554): 2e-17
Smith-Waterman score: 377; 35.1% identity (63.6% similar) in 228 aa overlap (30-248:30-249)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNET
: ..: ::..::::.: :.:. : : ..
CCDS11 MCAFPWLLLLLLLQEGSQRRLWRWCGSEEVVAVLQESISLPLEIPPDEEVENIIWS-SHK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 SLAFIVPHETKSPE-IHVTNPK-QGKRLNFTQSYSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTS--
::: .:: . : : ::::. ::. . ::::..:::. ::.: :.::.. .::
CCDS11 SLATVVPGKEGHPATIMVTNPHYQGQVSFLDPSYSLHISNLSWEDSGLYQAQVNLRTSQI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AKLSSYTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGN---TL
. ...:.. . : : . :.: . . . .: . :.:::: : .... : . :. :.
CCDS11 STMQQYNICVYRWLSEPQITVNFESSGEGACSMSLVCSVEKAGMDMTYSWLSRGDSTYTF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SSQPNLTVSWDPRISSEQDYTCIAENAVSNLS-FSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVS
: :..:: : .: .::: :.: .::.: . . : . :.. : .
CCDS11 HEGPVLSTSWRPG-DSALSYTCRANNPISNVSSCPIPDGPFYADPN--YASEKP----ST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GICIVF-GFIILLLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHS
..:.. :..:.::::.
CCDS11 AFCLLAKGLLIFLLLVILAMGLWVIRVQKRHKMPRMKKLMRNRMKLRKEAKPGSSPA
240 250 260 270 280
>>CCDS60321.1 SLAMF7 gene_id:57823|Hs108|chr1 (296 aa)
initn: 199 init1: 102 opt: 345 Z-score: 391.0 bits: 80.5 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 345; 33.2% identity (66.8% similar) in 229 aa overlap (32-251:31-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LWLFQSLLFVFCFGPGNVVSQSSLTPLMVNGILGESVTLPLEFPAGEKVNFITWLFNETS
: .: .::.::. . ..:. :.: :: :
CCDS60 MAGSPTCLTLIYILWQLTGSAASGPVKELVGSVGGAVTFPLKSKV-KQVDSIVWTFNTTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAFIVPHETKSPEIHVTNPKQGKRLNFTQS-YSLQLSNLKMEDTGSYRAQISTKTSAKLS
:. : : .. : ::. .. .:..: .. :::.::.:: .:.: : . : ... . :
CCDS60 LVTIQP---EGGTIIVTQNRNRERVDFPDGGYSLKLSKLKKNDSGIYYVGIYSSSLQQPS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 S--YTLRILRQLRNIQVTNHSQLFQNMTCELHLTCSVEDADDNVSFRWEALGNTLSSQPN
. :.:.. ..: . .:: : .: :: .::: .: ....: . :.:::.. . . :
CCDS60 TQEYVLHVYEHLSKPKVTMGLQSNKNGTCVTNLTCCMEHGEEDVIYTWKALGQAANESHN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ---LTVSWDPRIS-SEQDYTCIAENAVS-NLSFSVSAQKLCEDVKIQYTDTKMILFMVSG
: .:: : . :.. . :.:.: :: :.: . :.:::: . . :..:.:. .
CCDS60 GSILPISW--RWGESDMTFICVARNPVSRNFSSPILARKLCEGAA-DDPDSSMVLLCLLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ICIVFGFIIL-LLLVLRKRRDSLSLSTQRTQGPAESARNLEYVSVSPTNNTVYASVTHSN
. .......: :.: . ::
CCDS60 VPLLLSLFVLGLFLWFLKRERQEENNPKGRSSKYGLLHCGNTEKDGKSPLTAHDARHTKA
240 250 260 270 280 290
332 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:49:03 2016 done: Sun Nov 6 21:49:03 2016
Total Scan time: 1.880 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]