Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2205, 591 aa
1>>>pF1KE2205 591 - 591 aa - 591 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0759+/-0.0006; mu= -8.8019+/- 0.037
mean_var=346.4004+/-70.030, 0's: 0 Z-trim(114.7): 27 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.068910
statistics sampled from 24645 (24667) to 24645 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 11.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein ( 591) 3857 398.3 3.7e-110
NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein ( 592) 3026 315.7 2.7e-85
NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein ( 595) 2950 308.2 5.1e-83
XP_005270800 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 2507 264.1 8.3e-70
XP_011539535 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 2507 264.1 8.3e-70
NP_001306108 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 516) 2507 264.1 8.3e-70
NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein ( 586) 2457 259.1 2.9e-68
NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding prot ( 586) 2457 259.1 2.9e-68
NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein ( 638) 2153 229.0 3.8e-59
NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein ( 640) 2107 224.4 9.2e-58
NP_001306109 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 461) 2097 223.3 1.4e-57
XP_016856502 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 461) 2097 223.3 1.4e-57
XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-b ( 633) 2098 223.5 1.7e-57
NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein ( 633) 2098 223.5 1.7e-57
XP_006710637 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 568) 2023 216.0 2.7e-55
NP_001306110 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 544) 1997 213.4 1.6e-54
NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding prot ( 503) 1463 160.3 1.4e-38
XP_016856503 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 380) 1381 152.0 3.3e-36
XP_011539536 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 514) 1381 152.1 4.1e-36
>>NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein 2 [ (591 aa)
initn: 3857 init1: 3857 opt: 3857 Z-score: 2098.8 bits: 398.3 E(85289): 3.7e-110
Smith-Waterman score: 3857; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
550 560 570 580 590
>>NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein 1 [ (592 aa)
initn: 3079 init1: 2123 opt: 3026 Z-score: 1652.3 bits: 315.7 E(85289): 2.7e-85
Smith-Waterman score: 3026; 76.0% identity (93.6% similar) in 592 aa overlap (1-590:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::.. ::: ::.::.:.:..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_002 MASEIHMTGPMCLIENTNGRLMANPEALKILSAITQPMVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
::.::::::::.::::::::::::::::: : :::::::::::.:::::.:::::::::.
NP_002 KKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPKKPGHILVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSP--GNNSVDDSADFVSFFPAFVW
::::::::::.:::::::::::.:::::: ::...::: ..: :.:::::::::: :::
NP_002 LLSSTFVYNSIGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEVEDSADFVSFFPDFVW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDW
:::::.:.::.::.:.: :.:: ::::.:::..:...:: :::::::::::.::::::
NP_002 TLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLTYSLKLKKGTSQKDETFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PAPKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTY
:. .. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: :::::::::::::
NP_002 PVHRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIQVNGPRLESLVLTY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDS
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEE
::::::::...::::::..::..:.:::: .::::::::..:::: : :::: ::.::::
NP_002 EREAIEVFIRSSFKDVDHLFQKELAAQLEKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLEE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQ
.:: : .:::::::::.::::.::.:::. :::::::.:.:. ::.:::...::.:::::
NP_002 EVKAGIYSKPGGYRLFVQKLQDLKKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESMTDAILQTDQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRA
.:.:::: :::::.:::::.:. :::.:.:.:::.::::::.:::::.:::::::: ::.
NP_002 TLTEKEKEIEVERVKAESAQASAKMLQEMQRKNEQMMEQKERSYQEHLKQLTEKMENDRV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 QLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
::. :::.::::::::::.::::::..::. ....: :.: . . . :.:
NP_002 QLLKEQERTLALKLQEQEQLLKEGFQKESRIMKNEIQDLQTKMRR-RKACTIS
550 560 570 580 590
>>NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein 3 i (595 aa)
initn: 3035 init1: 2950 opt: 2950 Z-score: 1611.4 bits: 308.2 E(85289): 5.1e-83
Smith-Waterman score: 2950; 76.5% identity (92.6% similar) in 578 aa overlap (1-578:1-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:::::.. ::: ::.::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MAPEIHMTGPMCLIENTNGELVANPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::.::.
NP_060 KNKGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDNQNDSWIFTLAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
:::::.::::::::::::::::.:::::: ::...::: .: .:::::::::: :::::
NP_060 LLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADFVSFFPDFVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
:::.:.::.::.:.: :.::: :::: .::..:.:.:: :::::::::::.:::::: :
NP_060 RDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDLPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
.. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: :::::::::::::.:
NP_060 HRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGPRLESLVLTYIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
::: ::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::.::::::::::: :::
NP_060 AISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQELLDLHRVSER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
:: ::.:::::::::..::.::.:::. .::::::::..:::: : :::: ::.::::.:
NP_060 EATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLEEEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
: : .:::::: :: ::::.:..:::. :::::::.:.:. ::.:::.:.::.::::: :
NP_060 KAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESVTDAILQTDQIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
.:::: :::: .:::::.:. ::.::.: : ..:::.::::::::::::::::::.::::
NP_060 TEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQLTEKMERERAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
. ::::::. ::::: :.::: ..:: .::..: .:
NP_060 LEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYMSHKLKI
550 560 570 580 590
>>XP_005270800 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-bindi (516 aa)
initn: 2592 init1: 2507 opt: 2507 Z-score: 1374.2 bits: 264.1 E(85289): 8.3e-70
Smith-Waterman score: 2507; 74.7% identity (91.8% similar) in 499 aa overlap (80-578:1-499)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GKSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDN
::::::::::::::::::::::::..::::
XP_005 MWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDN
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADF
.::::::.::.:::::.::::::::::::::::.:::::: ::...::: .: .:::::
XP_005 QNDSWIFTLAVLLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADF
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFP
::::: ::::::::.:.::.::.:.: :.::: :::: .::..:.:.:: ::::::::::
XP_005 VSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 KRKCFVFDWPAPKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGP
:.:::::: : .. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: ::::
XP_005 KKKCFVFDLPIHRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RLESLVLTYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQ
:::::::::.:::: ::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::.::::
XP_005 RLESLVLTYINAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ELLDLHRDSEREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALL
::::::: ::::: ::.:::::::::..::.::.:::. .::::::::..:::: : :::
XP_005 ELLDLHRVSEREATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 QDIFGPLEEDVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDV
: ::.::::.:: : .:::::: :: ::::.:..:::. :::::::.:.:. ::.:::.:
XP_005 QVIFSPLEEEVKAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ADALLQTDQSLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQL
.::.::::: :.:::: :::: .:::::.:. ::.::.: : ..:::.::::::::::::
XP_005 TDAILQTDQILTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQL
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TEKMERDRAQLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICN
::::::.::::. ::::::. ::::: :.::: ..:: .::..: .:
XP_005 TEKMERERAQLLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYM
460 470 480 490 500 510
590
pF1KE2 IL
XP_005 SHKLKI
>>XP_011539535 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-bindi (516 aa)
initn: 2592 init1: 2507 opt: 2507 Z-score: 1374.2 bits: 264.1 E(85289): 8.3e-70
Smith-Waterman score: 2507; 74.7% identity (91.8% similar) in 499 aa overlap (80-578:1-499)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GKSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDN
::::::::::::::::::::::::..::::
XP_011 MWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDN
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADF
.::::::.::.:::::.::::::::::::::::.:::::: ::...::: .: .:::::
XP_011 QNDSWIFTLAVLLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADF
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFP
::::: ::::::::.:.::.::.:.: :.::: :::: .::..:.:.:: ::::::::::
XP_011 VSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 KRKCFVFDWPAPKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGP
:.:::::: : .. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: ::::
XP_011 KKKCFVFDLPIHRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RLESLVLTYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQ
:::::::::.:::: ::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::.::::
XP_011 RLESLVLTYINAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ELLDLHRDSEREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALL
::::::: ::::: ::.:::::::::..::.::.:::. .::::::::..:::: : :::
XP_011 ELLDLHRVSEREATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 QDIFGPLEEDVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDV
: ::.::::.:: : .:::::: :: ::::.:..:::. :::::::.:.:. ::.:::.:
XP_011 QVIFSPLEEEVKAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ADALLQTDQSLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQL
.::.::::: :.:::: :::: .:::::.:. ::.::.: : ..:::.::::::::::::
XP_011 TDAILQTDQILTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQL
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TEKMERDRAQLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICN
::::::.::::. ::::::. ::::: :.::: ..:: .::..: .:
XP_011 TEKMERERAQLLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYM
460 470 480 490 500 510
590
pF1KE2 IL
XP_011 SHKLKI
>>NP_001306108 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein (516 aa)
initn: 2592 init1: 2507 opt: 2507 Z-score: 1374.2 bits: 264.1 E(85289): 8.3e-70
Smith-Waterman score: 2507; 74.7% identity (91.8% similar) in 499 aa overlap (80-578:1-499)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GKSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDN
::::::::::::::::::::::::..::::
NP_001 MWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDN
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADF
.::::::.::.:::::.::::::::::::::::.:::::: ::...::: .: .:::::
NP_001 QNDSWIFTLAVLLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADF
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170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFP
::::: ::::::::.:.::.::.:.: :.::: :::: .::..:.:.:: ::::::::::
NP_001 VSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 KRKCFVFDWPAPKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGP
:.:::::: : .. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: ::::
NP_001 KKKCFVFDLPIHRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RLESLVLTYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQ
:::::::::.:::: ::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::.::::
NP_001 RLESLVLTYINAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ELLDLHRDSEREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALL
::::::: ::::: ::.:::::::::..::.::.:::. .::::::::..:::: : :::
NP_001 ELLDLHRVSEREATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 QDIFGPLEEDVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDV
: ::.::::.:: : .:::::: :: ::::.:..:::. :::::::.:.:. ::.:::.:
NP_001 QVIFSPLEEEVKAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ADALLQTDQSLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQL
.::.::::: :.:::: :::: .:::::.:. ::.::.: : ..:::.::::::::::::
NP_001 TDAILQTDQILTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQL
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530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TEKMERDRAQLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICN
::::::.::::. ::::::. ::::: :.::: ..:: .::..: .:
NP_001 TEKMERERAQLLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYM
460 470 480 490 500 510
590
pF1KE2 IL
NP_001 SHKLKI
>>NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein 5 [ (586 aa)
initn: 2396 init1: 2396 opt: 2457 Z-score: 1346.6 bits: 259.1 E(85289): 2.9e-68
Smith-Waterman score: 2457; 63.8% identity (83.4% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::.. :: ::.: . :: :: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 MALEIHMSDPMCLIENFNEQLKVNQEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..:::..:::.:::::::.::::::. :.:::::::::::::.::.::.:: :::::.
NP_443 KNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVEKADNKNDIQIFALAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
:::::::::... :.: :.: :: :::::: .:: .:: . :.: :: .:::: .::::
NP_443 LLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVEDPADSASFFPDLVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
::: : ::.::. .: :.::: ::. ..:.:.. ..:: :::::.:::::.:::.:: ::
NP_443 RDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQKFFPKKKCFIFDLPA
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
.: ::.:: : ..::.:.:..::.::::::.::: .::: ::: ::: ::..:::::::
NP_443 HQKKLAQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGIMVNGSRLKNLVLTYVN
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
:::::::::.::::::::: ::::::.::::::.:::::::::: ::::::::::: :::
NP_443 AISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPMETLQELLDLHRTSER
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
:::::::::::::::: ::..: . :.:...:.::.: .:::: : :::.:::::::: :
NP_443 EAIEVFMKNSFKDVDQSFQKELETLLDAKQNDICKRNLEASSDYCSALLKDIFGPLEEAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
::: .:::::. :: :: .::: :::. :::::::.:::.:::.:::.:. :.:::::.:
NP_443 KQGIYSKPGGHNLFIQKTEELKAKYYREPRKGIQAEEVLQKYLKSKESVSHAILQTDQAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
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NP_443 TETEKKKKEAQVKAEAEKAEAQRLAAIQRQNEQMMQERERLHQEQVRQ----MEIAKQNW
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
.:::.: ..::: :. :. ... : ... : .. .: : .:
NP_443 LAEQQKMQEQQMQEQAAQLSTTFQAQNRSLLSELQHAQRTVNNDDP-CVLL
540 550 560 570 580
>>NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein (586 aa)
initn: 2396 init1: 2396 opt: 2457 Z-score: 1346.6 bits: 259.1 E(85289): 2.9e-68
Smith-Waterman score: 2457; 63.8% identity (83.4% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::.. :: ::.: . :: :: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALEIHMSDPMCLIENFNEQLKVNQEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..:::..:::.:::::::.::::::. :.:::::::::::::.::.::.:: :::::.
NP_001 KNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVEKADNKNDIQIFALAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
:::::::::... :.: :.: :: :::::: .:: .:: . :.: :: .:::: .::::
NP_001 LLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVEDPADSASFFPDLVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
::: : ::.::. .: :.::: ::. ..:.:.. ..:: :::::.:::::.:::.:: ::
NP_001 RDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQKFFPKKKCFIFDLPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
.: ::.:: : ..::.:.:..::.::::::.::: .::: ::: ::: ::..:::::::
NP_001 HQKKLAQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGIMVNGSRLKNLVLTYVN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
:::::::::.::::::::: ::::::.::::::.:::::::::: ::::::::::: :::
NP_001 AISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPMETLQELLDLHRTSER
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
:::::::::::::::: ::..: . :.:...:.::.: .:::: : :::.:::::::: :
NP_001 EAIEVFMKNSFKDVDQSFQKELETLLDAKQNDICKRNLEASSDYCSALLKDIFGPLEEAV
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
::: .:::::. :: :: .::: :::. :::::::.:::.:::.:::.:. :.:::::.:
NP_001 KQGIYSKPGGHNLFIQKTEELKAKYYREPRKGIQAEEVLQKYLKSKESVSHAILQTDQAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
.: :: . ..:::. .: . : ::..::.::...:. .::.:.: :: . .
NP_001 TETEKKKKEAQVKAEAEKAEAQRLAAIQRQNEQMMQERERLHQEQVRQ----MEIAKQNW
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
.:::.: ..::: :. :. ... : ... : .. .: : .:
NP_001 LAEQQKMQEQQMQEQAAQLSTTFQAQNRSLLSELQHAQRTVNNDDP-CVLL
540 550 560 570 580
>>NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein 7 [ (638 aa)
initn: 2260 init1: 1180 opt: 2153 Z-score: 1182.8 bits: 229.0 E(85289): 3.8e-59
Smith-Waterman score: 2153; 56.7% identity (81.6% similar) in 575 aa overlap (1-574:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::..:::. : .::::.:::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MASEIHMPGPVCLTENTKGHLVVNSEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..:: :: ::::.::::::::::::.::.:::.:::::::::.::.: ..::::::::.
NP_997 KNKGFPLGCTVKSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLILLDTEGLGDMEKSDPKSDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
::::.::::::::::.::..:::::::::. :.:.: : . :.::..:::::: :.::.
NP_997 LLSSSFVYNSMGTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSCPRPDEVEDSSEFVSFFPDFIWTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
:::::::..::.::: :.::: .::: .: . . .. : :: ::.::::.:::::: :
NP_997 RDFTLELKLDGHPITEDEYLENALKLISGKNPQIQNSNKPREWIRHFFPKQKCFVFDRPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE2 -PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYV
:: : :.:...:..:. .: : .:::::..:...::: :: :.: :: :: ::.
NP_997 NDKKLLLHVEEVREDQLDSNFQMQSENFCSYIFTHAKTKTLREGILVTGNRLGMLVETYL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 NAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSE
.::.:: ::.:::. .::: ::::::..: :: :::.:.:..::.:::::::.: :
NP_997 DAINSGATPCLENAMAVLAQCENSAAVQRAANHYSQQMAQQVRFPTDTLQELLDVHAVCE
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 REAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEED
:::: :::. :::: .: ::.:: .: ...:: :: .::. :.: :. . : :.
NP_997 REAIAVFMEYSFKDKSQEFQKKLVDTMEKKKEDFVLQNEEASAKYCQAELKRLSELLTES
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQS
...::: :::. .. . ..... : :::::..: :::...:.:. . ...::.:..
NP_997 ISRGTFFVPGGHNIYLEAKKKIEQDYTLVPRKGVKADEVLQSFLQSQVVIEESILQSDKA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQ
:. :::: ... : :.:: ...:.. ::....::: .:.:.::.. :: .::::.: .
NP_997 LTAGEKAIAAKQAKKEAAEKEQELLRQKQKEQQQMMEAQERSFQENIAQLKKKMEREREN
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
: : .: :. :.. :.:: :::.. . :...:
NP_997 YMRELRKMLSHKMKVLEELLTEGFKEIFESLNEEINRLKEQIEAAENEEPSVFSQILDVA
550 560 570 580 590 600
NP_997 GSIFIAALPGAAKLVDLGMKILSSLCNRLRNPGKKIIS
610 620 630
>>NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein 4 [ (640 aa)
initn: 2168 init1: 1080 opt: 2107 Z-score: 1158.0 bits: 224.4 E(85289): 9.2e-58
Smith-Waterman score: 2107; 55.0% identity (82.1% similar) in 575 aa overlap (10-583:25-599)
10 20 30 40
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVG
:. :..: . ::.:: .::.::. :.::::::::::
NP_443 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LYRTGKSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIE
:::::::::::.::::.::: :::::.:.::::::::::: .::.:::::::::::::.:
NP_443 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KGDNENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDD
:.. .:::::::::.::::.:::::..:::.::..::::::::.. :.:.: : . ..:
NP_443 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SADFVSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIR
:..:.:::: :.::.:::::::..::.::: :.::: .::: : . : .. : :: :::
NP_443 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
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