Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2205, 591 aa
1>>>pF1KE2205 591 - 591 aa - 591 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0701+/-0.00134; mu= -3.0098+/- 0.079
mean_var=285.0982+/-56.785, 0's: 0 Z-trim(107.2): 34 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.075959
statistics sampled from 9388 (9407) to 9388 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS719.1 GBP2 gene_id:2634|Hs108|chr1 ( 591) 3857 437.0 3.2e-122
CCDS718.1 GBP1 gene_id:2633|Hs108|chr1 ( 592) 3026 345.9 8.3e-95
CCDS717.2 GBP3 gene_id:2635|Hs108|chr1 ( 595) 2950 337.6 2.7e-92
CCDS722.1 GBP5 gene_id:115362|Hs108|chr1 ( 586) 2457 283.6 4.9e-76
CCDS720.1 GBP7 gene_id:388646|Hs108|chr1 ( 638) 2153 250.3 5.6e-66
CCDS721.1 GBP4 gene_id:115361|Hs108|chr1 ( 640) 2107 245.2 1.8e-64
CCDS723.1 GBP6 gene_id:163351|Hs108|chr1 ( 633) 2098 244.3 3.6e-64
>>CCDS719.1 GBP2 gene_id:2634|Hs108|chr1 (591 aa)
initn: 3857 init1: 3857 opt: 3857 Z-score: 2307.7 bits: 437.0 E(32554): 3.2e-122
Smith-Waterman score: 3857; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
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CCDS71 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
550 560 570 580 590
>>CCDS718.1 GBP1 gene_id:2633|Hs108|chr1 (592 aa)
initn: 3079 init1: 2123 opt: 3026 Z-score: 1815.5 bits: 345.9 E(32554): 8.3e-95
Smith-Waterman score: 3026; 76.0% identity (93.6% similar) in 592 aa overlap (1-590:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::.. ::: ::.::.:.:..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS71 MASEIHMTGPMCLIENTNGRLMANPEALKILSAITQPMVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
::.::::::::.::::::::::::::::: : :::::::::::.:::::.:::::::::.
CCDS71 KKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPKKPGHILVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSP--GNNSVDDSADFVSFFPAFVW
::::::::::.:::::::::::.:::::: ::...::: ..: :.:::::::::: :::
CCDS71 LLSSTFVYNSIGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEVEDSADFVSFFPDFVW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDW
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CCDS71 TLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLTYSLKLKKGTSQKDETFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PAPKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTY
:. .. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: :::::::::::::
CCDS71 PVHRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIQVNGPRLESLVLTY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDS
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CCDS71 VNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEE
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CCDS71 EREAIEVFIRSSFKDVDHLFQKELAAQLEKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLEE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQ
.:: : .:::::::::.::::.::.:::. :::::::.:.:. ::.:::...::.:::::
CCDS71 EVKAGIYSKPGGYRLFVQKLQDLKKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESMTDAILQTDQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRA
.:.:::: :::::.:::::.:. :::.:.:.:::.::::::.:::::.:::::::: ::.
CCDS71 TLTEKEKEIEVERVKAESAQASAKMLQEMQRKNEQMMEQKERSYQEHLKQLTEKMENDRV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 QLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
::. :::.::::::::::.::::::..::. ....: :.: . . . :.:
CCDS71 QLLKEQERTLALKLQEQEQLLKEGFQKESRIMKNEIQDLQTKMRR-RKACTIS
550 560 570 580 590
>>CCDS717.2 GBP3 gene_id:2635|Hs108|chr1 (595 aa)
initn: 3035 init1: 2950 opt: 2950 Z-score: 1770.5 bits: 337.6 E(32554): 2.7e-92
Smith-Waterman score: 2950; 76.5% identity (92.6% similar) in 578 aa overlap (1-578:1-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:::::.. ::: ::.::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MAPEIHMTGPMCLIENTNGELVANPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::.::.
CCDS71 KNKGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDNQNDSWIFTLAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
:::::.::::::::::::::::.:::::: ::...::: .: .:::::::::: :::::
CCDS71 LLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADFVSFFPDFVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
:::.:.::.::.:.: :.::: :::: .::..:.:.:: :::::::::::.:::::: :
CCDS71 RDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDLPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
.. ::.::.:..:::.:.:..:::.:::::.:.:..::::::: :::::::::::::.:
CCDS71 HRRKLAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGPRLESLVLTYIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
::: ::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::.::::::::::: :::
CCDS71 AISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQELLDLHRVSER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
:: ::.:::::::::..::.::.:::. .::::::::..:::: : :::: ::.::::.:
CCDS71 EATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLEEEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
: : .:::::: :: ::::.:..:::. :::::::.:.:. ::.:::.:.::.::::: :
CCDS71 KAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESVTDAILQTDQIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
.:::: :::: .:::::.:. ::.::.: : ..:::.::::::::::::::::::.::::
CCDS71 TEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQLTEKMERERAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
. ::::::. ::::: :.::: ..:: .::..: .:
CCDS71 LEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYMSHKLKI
550 560 570 580 590
>>CCDS722.1 GBP5 gene_id:115362|Hs108|chr1 (586 aa)
initn: 2396 init1: 2396 opt: 2457 Z-score: 1478.6 bits: 283.6 E(32554): 4.9e-76
Smith-Waterman score: 2457; 63.8% identity (83.4% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::.. :: ::.: . :: :: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MALEIHMSDPMCLIENFNEQLKVNQEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..:::..:::.:::::::.::::::. :.:::::::::::::.::.::.:: :::::.
CCDS72 KNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVEKADNKNDIQIFALAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
:::::::::... :.: :.: :: :::::: .:: .:: . :.: :: .:::: .::::
CCDS72 LLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVEDPADSASFFPDLVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
::: : ::.::. .: :.::: ::. ..:.:.. ..:: :::::.:::::.:::.:: ::
CCDS72 RDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQKFFPKKKCFIFDLPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN
.: ::.:: : ..::.:.:..::.::::::.::: .::: ::: ::: ::..:::::::
CCDS72 HQKKLAQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGIMVNGSRLKNLVLTYVN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSER
:::::::::.::::::::: ::::::.::::::.:::::::::: ::::::::::: :::
CCDS72 AISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPMETLQELLDLHRTSER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEEDV
:::::::::::::::: ::..: . :.:...:.::.: .:::: : :::.:::::::: :
CCDS72 EAIEVFMKNSFKDVDQSFQKELETLLDAKQNDICKRNLEASSDYCSALLKDIFGPLEEAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSL
::: .:::::. :: :: .::: :::. :::::::.:::.:::.:::.:. :.:::::.:
CCDS72 KQGIYSKPGGHNLFIQKTEELKAKYYREPRKGIQAEEVLQKYLKSKESVSHAILQTDQAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQL
.: :: . ..:::. .: . : ::..::.::...:. .::.:.: :: . .
CCDS72 TETEKKKKEAQVKAEAEKAEAQRLAAIQRQNEQMMQERERLHQEQVRQ----MEIAKQNW
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE2 MAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
.:::.: ..::: :. :. ... : ... : .. .: : .:
CCDS72 LAEQQKMQEQQMQEQAAQLSTTFQAQNRSLLSELQHAQRTVNNDDP-CVLL
540 550 560 570 580
>>CCDS720.1 GBP7 gene_id:388646|Hs108|chr1 (638 aa)
initn: 2260 init1: 1180 opt: 2153 Z-score: 1298.1 bits: 250.3 E(32554): 5.6e-66
Smith-Waterman score: 2153; 56.7% identity (81.6% similar) in 575 aa overlap (1-574:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
:: ::..:::. : .::::.:::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MASEIHMPGPVCLTENTKGHLVVNSEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
:..:: :: ::::.::::::::::::.::.:::.:::::::::.::.: ..::::::::.
CCDS72 KNKGFPLGCTVKSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLILLDTEGLGDMEKSDPKSDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
::::.::::::::::.::..:::::::::. :.:.: : . :.::..:::::: :.::.
CCDS72 LLSSSFVYNSMGTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSCPRPDEVEDSSEFVSFFPDFIWTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
:::::::..::.::: :.::: .::: .: . . .. : :: ::.::::.:::::: :
CCDS72 RDFTLELKLDGHPITEDEYLENALKLISGKNPQIQNSNKPREWIRHFFPKQKCFVFDRPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE2 -PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYV
:: : :.:...:..:. .: : .:::::..:...::: :: :.: :: :: ::.
CCDS72 NDKKLLLHVEEVREDQLDSNFQMQSENFCSYIFTHAKTKTLREGILVTGNRLGMLVETYL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 NAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSE
.::.:: ::.:::. .::: ::::::..: :: :::.:.:..::.:::::::.: :
CCDS72 DAINSGATPCLENAMAVLAQCENSAAVQRAANHYSQQMAQQVRFPTDTLQELLDVHAVCE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 REAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEED
:::: :::. :::: .: ::.:: .: ...:: :: .::. :.: :. . : :.
CCDS72 REAIAVFMEYSFKDKSQEFQKKLVDTMEKKKEDFVLQNEEASAKYCQAELKRLSELLTES
370 380 390 400 410 420
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]