Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2203, 875 aa
1>>>pF1KE2203 875 - 875 aa - 875 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0830+/-0.00129; mu= -0.2852+/- 0.078
mean_var=276.6923+/-55.625, 0's: 0 Z-trim(108.9): 74 B-trim: 81 in 1/51
Lambda= 0.077104
statistics sampled from 10430 (10491) to 10430 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 5688 647.2 3.8e-185
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 1277 156.4 1.6e-37
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 774 100.3 8.1e-21
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 774 100.4 1e-20
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 745 97.3 1.2e-19
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 701 92.2 2.4e-18
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 667 88.5 3.3e-17
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 642 85.9 3.6e-16
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 642 85.9 3.6e-16
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 632 84.6 5.9e-16
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 636 85.2 5.9e-16
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 632 84.7 6.6e-16
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 632 84.7 7e-16
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 631 84.6 7.2e-16
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 631 84.6 7.2e-16
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 619 83.2 1.7e-15
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 616 82.9 2.3e-15
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 612 82.4 2.7e-15
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 612 82.4 2.7e-15
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 617 83.1 2.8e-15
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 617 83.1 2.8e-15
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 596 80.6 8.9e-15
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 596 80.7 1e-14
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 596 80.7 1e-14
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 596 80.7 1.1e-14
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 567 77.4 8.8e-14
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 565 77.2 1e-13
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 552 75.6 2e-13
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 548 75.2 2.7e-13
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 551 75.6 2.9e-13
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 537 74.0 6.7e-13
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 531 73.3 1e-12
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 526 72.7 1.6e-12
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 517 71.7 3e-12
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 487 68.6 5.2e-11
>>CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 (875 aa)
initn: 5688 init1: 5688 opt: 5688 Z-score: 3437.4 bits: 647.2 E(32554): 3.8e-185
Smith-Waterman score: 5688; 100.0% identity (100.0% similar) in 875 aa overlap (1-875:1-875)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGKTANSPGSGARPDPVRSFNRWKKKHSHRQNKKKQLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MGKTANSPGSGARPDPVRSFNRWKKKHSHRQNKKKQLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYRVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYRVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PSEKAMVQQLLQKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PSEKAMVQQLLQKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAPRVRFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAPRVRFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GSQAPSLPNTSEAQKIKEVPTQFLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTLQKKEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GSQAPSLPNTSEAQKIKEVPTQFLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTLQKKEPS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KSSIKKKMTKVAEAKKVMKRNFKVNKKITFTDEGELVQQWPQMQKSAIKDAEEDDDTGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KSSIKKKMTKVAEAKKVMKRNFKVNKKITFTDEGELVQQWPQMQKSAIKDAEEDDDTGGI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NLHKAKERLQEEDKFDKEEYRKKIKAKHREKRLKEREARREANKRQAKAKDEEEAFLDWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NLHKAKERLQEEDKFDKEEYRKKIKAKHREKRLKEREARREANKRQAKAKDEEEAFLDWS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DDDDDDDDGFDPSTLPDPDKYRSSEDSDSEDMENKISDTKKKQGMKKRSNSEVEDVGPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DDDDDDDDGFDPSTLPDPDKYRSSEDSDSEDMENKISDTKKKQGMKKRSNSEVEDVGPTS
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE2 HNRKKARWDTLEPLDTGLSLAEDEELVLHLLRSQS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HNRKKARWDTLEPLDTGLSLAEDEELVLHLLRSQS
850 860 870
>>CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 (670 aa)
initn: 902 init1: 476 opt: 1277 Z-score: 787.3 bits: 156.4 E(32554): 1.6e-37
Smith-Waterman score: 1277; 42.0% identity (74.5% similar) in 505 aa overlap (12-510:121-621)
10 20 30 40
pF1KE2 MGKTANSPGSGARPDPVRSFNRWKKKHSHRQNKK-KQLRKQ
:.:: .. .. : : ... . :. ...
CCDS21 TVLTNGEAAMQSSNSESKKKKKKKRKMVNDAEPDTKKAKTENKGKSEEESAETTKETENN
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90
pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFP--LSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQ
..::. . .. . : . .. : : :... ....:::...: . .::::..
CCDS21 VEKPDNDEDESEVPSLPLGLT--GAFEDTSFASLCNLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQHK
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRELAYQTF
.: :.:.:.:.:::::::::::::.:..: . .:.. .: ::::.:::::::.:::
CCDS21 SIRPLLEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLRFMPRNGTGVLILSPTRELAMQTF
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 EVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERINN-INILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQ
::... .: . :::.::.. . ::....: :::.: ::::::.::..: .: .::
CCDS21 GVLKELMTHHVHTYGLIMGGSNRSAEAQKLGNGINIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQ
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 MLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKN-PEYVWV
::.::::::::.:: . .. .:. :: .:::.:::::::..:.::::.:::. : :: :
CCDS21 CLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTMLFSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGV
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 HEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYRVFCRL
. .: :::.:.:: .... .:..::... ::: .:::::: :.: :... .
CCDS21 DDDKANATVDGLEQGYVVCPSEKRFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFSSCMSVKYHYELLNYI
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDA
. .::.::.:.: .: .. .: ...:. ::.::::::.: :.:..:.: :.:
CCDS21 --DLPVLAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCTDVAARGLDIPEVDWIVQYDPPDDP
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 NTYIHRAGRTAR-YKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKLE
. ::::.::::: . :.::::: : : .... : :.:::..:. .. :. :.:..::
CCDS21 KEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEELGFLRYLKQSKVPLSEFDFSWSKISDIQSQLE
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAPRVRFLQK
... .. :.. ::. . ::.:. . :..:.:..: .:. :::.:. : : :
CCDS21 KLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHSLKQIFNVNNLNLPQVALSFGFKVPPFVDLNVN
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 MQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDN
CCDS21 SNEGKQKKRGGGGGFGYQKTKKVEKSKIFKHISKKSSDSRQFSH
630 640 650 660 670
>>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa)
initn: 715 init1: 264 opt: 774 Z-score: 487.2 bits: 100.3 E(32554): 8.1e-21
Smith-Waterman score: 774; 34.1% identity (66.1% similar) in 416 aa overlap (63-469:18-425)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 KKKQLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLV
.. .: :.:. .. .. .. .
CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKP
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRE
:.:: ..: :::::.:..: :.:::::: :: .:.:.:: . . . : .:...::::
CCDS86 TKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLE----TPQRLFALVLTPTRE
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKD-LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSF
::.: : .. .:.. ....:.:: : ... .. .:.. :::::..:...: .:
CCDS86 LAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGF
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 HATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNP
. :..::.:::::::.: : .. ... .:. :.:.:::::.::.:. : : .::::
CCDS86 NLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNP
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 EYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYR
: ..::.: :.: :: . : . : .: .. ..: :.:...:
CCDS86 --VKCAVSSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTAL
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 VFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFD
.. : : . . :::...: .:. :.: : ..:.:::.:.::::.: :. :..::
CCDS86 LLRNL--GFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFD
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440
pF1KE2 CPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQ---LLQKKVPV-----KEIKIN
: .. ::::.::::: ..:.:. .. . . :. :. ::.: :. .
CCDS86 IPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMML
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 PEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLG
:.. ..:. . : . . :.:..
CCDS86 TERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
400 410 420 430 440 450
>>CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 (600 aa)
initn: 877 init1: 321 opt: 774 Z-score: 485.5 bits: 100.4 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 1054; 36.3% identity (67.8% similar) in 559 aa overlap (75-600:15-568)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 EWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLAL
:: ..: .:.: . .: .:. :: : .
CCDS92 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFM
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 QGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWT-STDGLGVLIISPTRELAYQTFEVLRK
..::: . : :::::::::..:.:: : : . . . .:..::.:::::: : ::: .
CCDS92 RNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSH
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210
pF1KE2 VGKNH-DFSAGLIIGGKDLKHEAERINNI--NILVCTPGRL---LQHMDETVSFHAT--D
:. .:: : :::.. ...::... ::.: ::::: ... : ... . .
CCDS92 FTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRS
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVW
:..::::::::.::::: ..:...: :::.:.: :::::::. :..:.: .:.:: :
CCDS92 LDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVS
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VHEK-----AKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY
:.:: . .::. ::. :.::. ..:.. : :::.: ..: .::::.: :.:
CCDS92 VKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYG
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQF
... : ::.:. .::... ..: ... :: . ....: ::. :::.:.: ::::::.
CCDS92 KALEVLVKGVKIMCIHGKMK-YKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQY
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440
pF1KE2 DCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL-LQKKVPVKEIKINPEK-LI
: : .:....:: ::::: . : ::..::: :..... : ...: :..:.: :..
CCDS92 DPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMK--PQRNTA
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP
:. ::.:. :. . :.... :::::.. . . .: .. : . : ...: :
CCDS92 DLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLRMP
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550
pF1KE2 RVRFLQKMQ------------KQPTKELVR-SQADKVIEP-RAPSLTNDEVEEF---RAY
.. :. : : :. .: .: .:..: : . :. ..: .:.
CCDS92 KMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGRRKFIKNKAW
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 FNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTS
..: . .: :... ..:.... ..:. :: .. .. .:: :.:
CCDS92 SKQKAKKEKK--KKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEEEFEKGLL
530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 EAQKIKEVPTQFLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKV
CCDS92 TTGKRTIKTVDLGISDLEDDC
580 590 600
>>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa)
initn: 592 init1: 382 opt: 745 Z-score: 466.4 bits: 97.3 E(32554): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 754; 29.7% identity (59.2% similar) in 622 aa overlap (66-667:215-795)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 QLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEI
.: :.:. ::. ::.. .. : :
CCDS13 KADTLKVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPI
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 QKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEAL-YRLQWTSTDGLGVLIISPTRELA
:: : ..: :::. . : ::.::: :: .:::: : :. . . . ::.. :::::.
CCDS13 QKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVT--RVLVLVPTRELG
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 YQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLK-HEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSFHA
:. : :.... .... : .:: :.: .:: .::. :::::..:. . :::
CCDS13 IQVHSVTRQLAQFCNITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHL
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 TDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEY
.....:.::::::.:: : . :. .:. ..:::.:::::.: ::::: .:::::
CCDS13 SSIEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVR
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQ---KISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY
..:. .. . : :.:..: . .. . ... ..: . . ..: .. :... ..
CCDS13 IFVNSNTDVA-P-FLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMH
430 440 450 460 470 480
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQF
.. . :... ::: .: .:.:. .: .. .: :::.::::::. .:. :..:
CCDS13 ILLGLM--GLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINF
490 500 510 520 530
400 410 420 430 440
pF1KE2 DCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQK-KVPVKEIKINPEKLID
:. . :.::.::::: . :... .. .:. :...... :.:::
CCDS13 TMPNTIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKA----------
540 550 560 570 580
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 VQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLA-VAP
:: :: :: : . . : .:.:. : .: : .. . : .
CCDS13 ------RILPQDVILKFRDK---------IEKM-EKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINT
590 600 610 620 630
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RVRFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRLEG
:.:.: .. ..: :: .. : : ..:: . : : :..
CCDS13 AKRLLEKGKEAVVQEPERSWF-QTKEERKKEKIAKALQEFDLALRGK-----KKRKKFMK
640 650 660 670 680
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 TEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKA--KGSQAPSLPNT----SEAQKIKEVPTQ
... . :..:... : . . :.::: ....: ..:. . :.: :. .
CCDS13 DAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFAERLAKRNRRAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKS
690 700 710 720 730 740
630 640 650 660 670
pF1KE2 FLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTL----QKKE---PSKSSIKKKMTKVAEAK
.:.. . . :: : : .....: : :.. ::: :..
CCDS13 VFDEELTNTSKKALKQYRA---GPSFEERKQLGLPHQRRGGNFKSKSRYKRRK
750 760 770 780 790
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 KVMKRNFKVNKKITFTDEGELVQQWPQMQKSAIKDAEEDDDTGGINLHKAKERLQEEDKF
>>CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 (483 aa)
initn: 447 init1: 223 opt: 701 Z-score: 443.0 bits: 92.2 E(32554): 2.4e-18
Smith-Waterman score: 701; 30.0% identity (61.5% similar) in 483 aa overlap (71-539:4-470)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI
:... ::. .. .. . : .: :
CCDS12 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCI
10 20 30
110 120 130 140 150
pF1KE2 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGV--LIISPTRELAYQTF
:.:.: :: :::::::: ::..:.:. : : : :. :...::::::::
CCDS12 PAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKL------SEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIA
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 EVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQ
: .: .:: .. .:.:: :. .: ... . .... ::::: .:. . .: ..
CCDS12 EQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIR
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 MLVLDEADRILDMGFAD---TMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYV
.::.:::::.:..: .: ..:.. .: .::::::::: : ....: :. ..: .
CCDS12 FLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQP-FF
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 WVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQK----ISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY
: . .: :: :.: :.. . : . .. : : . :.: ..:: : :
CCDS12 W-EAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILC
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380
pF1KE2 RVFCRLR-PGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQ
.. .. : : :::. ..: .:. . .: . .:.:::.:.::::.:.:. :..
CCDS12 MMLRKFSFPTV---ALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVIN
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 FDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQK-KVPVKEIKINPEKLI
. : . ::::.::::: ..:.:. .. . .:. . .. : ..:.... ...
CCDS12 HNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVL
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP
.. .. ... .. ..: .: . . .. . : :... .: : : . ::
CCDS12 QILTQV-NVVRRECEIKLEA----AHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIK
390 400 410 420 430
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RV--RFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRL
. :: .:... .. . . : ::.::
CCDS12 QKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV
440 450 460 470 480
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 EGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTSEAQKIKEVPTQFLDR
>>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 (483 aa)
initn: 469 init1: 162 opt: 667 Z-score: 422.5 bits: 88.5 E(32554): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 667; 29.7% identity (64.9% similar) in 461 aa overlap (3-450:26-470)
10 20 30
pF1KE2 MGKTANSPGSGARPDPVRSFNRWKKKHSHRQNKKKQL
: ...::.:. ...:. :. .. .. ..:
CCDS44 MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPTGGPGGGGTQTQ-QQMNQLKNTNTINNGTQQQA
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
pF1KE2 RKQLK--KP--EWQVERESISRLMQNYEKINVNEIT-----RFSDFPLSKKTLKGLQEAQ
... :: .:. . .: . .:.....: .: :. :... : :. :
CCDS44 QSMTTTIKPGDDWK----KTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMG
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 YRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIIS
.. . ::...: .::.:.:.:. ::.:.::. :.:.:.:: ::. . :.. ...:
CCDS44 WEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLE---RLD-LKKDNIQAMVIV
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 PTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLII--GGKDLKHEAERINN-INILVCTPGRLLQHM
:::::: :. .. .:.: : .: .. :: .:. . :... ..... ::::.:. .
CCDS44 PTRELALQVSQICIQVSK-HMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLI
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 DETVSFHATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLAR
. :. .. .::.::::::..:.. :.. :. .: .:::.:: ::.::: ::. .
CCDS44 KKGVA-KVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMN
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 LSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKE
:..: . . :. : . : : .::. : ... ..::.: .: ..
CCDS44 SHLQKPYEINLMEEL---TLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQR
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 VQYLYRVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVN
:. : . . .: : : . .:....: .: .:...: : ::. .::.:. :::
CCDS44 VELLAKKISQL--GYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVN
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 WVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQK-KVPVKEIKINP
:..:: :. :.::.:: ::..:. . : :. .. ... .... .. . .: : :
CCDS44 VVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNI
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 EKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGL
.: . :
CCDS44 DKSLYVAEYHSEPVEDEKP
470 480
>>CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (881 aa)
initn: 586 init1: 267 opt: 642 Z-score: 403.9 bits: 85.9 E(32554): 3.6e-16
Smith-Waterman score: 716; 27.2% identity (59.6% similar) in 718 aa overlap (71-728:98-795)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI
:... :: ..::... :.. : ::..::
CCDS31 FPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE2 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTD-GLGVLIISPTRELAYQTFE
. :.::::.. :.:::::: ::.:..: ::. :.. : .::.::::::: ::..
CCDS31 PVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFE---RLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQM
...:: ....::.:: .. . .. : .:.. :::::. :. .:.. ....
CCDS31 FTKELGKFTGLKTALILGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLV-HVAVEMSLKLQSVEY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHE
.:.:::::...::::. .. .: :: .::.::::: : . ..:: .: .: . .
CCDS31 VVFDEADRLFEMGFAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLDV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 KAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKK--SIVFFSSCKEVQYLYRVFCRL
.: . :. .... . . : .:: .:.. .. . ..:: .. ....:: ...
CCDS31 DTKLNEQ--LKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQ
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDA
: :: ... . : .:. . ..:..::.::::::.: .. :.... : .
CCDS31 R--VSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKG
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE2 NTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL---LQKKV----PVKEIK----IN--
. ..::.::.:: ..: : .. :.: .. .: : ... :.:: . ..
CCDS31 KLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVDGM
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE2 ----PEKLIDVQKK-LESILAQDQDLK---ERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPI
:....: . . :.: : . .:. . :. .:::: . . . .... .
CCDS31 LGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEMDL
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE2 PEYALSLGLAVAPRVRF----LQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPS--LTNDEVEEFR
..::: :: ::... . . ::.: ..: : : : .. .. :
CCDS31 ----VGLGLHPLFSSRFEEEELQRLRLVDSIKNYRSRAT-IFEINASSRDLCSQVMRAKR
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590
pF1KE2 AYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTG-----------NEEQEEEEDDEEEMEEKLAK
. .. .:.: . : ...:.. .: . :.::::. : .:. ...
CCDS31 QKDRKAIARFQQGQQ---GRQEQQEGPVGPAPSRPALQEKQPEKEEEEEAGESVEDIFSE
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640
pF1KE2 AKGSQAP-SLPNTSEAQKIKE---------VPTQFLDRDEEE------EDADFLKVKRHN
. : . : :: . .. .: .: . : : :. : . : .
CCDS31 VVGRKRQRSGPNRGAKRRREEARQRDQEFYIPYRPKDFDSERGLSISGEGGAFEQQAAGA
660 670 680 690 700 710
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 VFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKVAEAKKVMKRNFKVN--KKITFTDEGELVQQW
:. : . ..: . . . . .:: :... . :...:.. . :. . . .: :.:
CCDS31 VLDLMGDEAQNLTRGRQQLKWDRKKKRFVGQSGQEDKKKIKTESGRYISSSYKRDLYQKW
720 730 740 750 760 770
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 PQMQKSAIKDAEEDDDTGGINLHKAKERLQEEDKFDKEEYRKKIKAKHREKRLKEREARR
: :: : : .:.: : . ... ::
CCDS31 KQKQK--IDD--RDSDEEGASDRRGPERRGGKRDRGQGASRPHAPGTPAGRVRPELKTKQ
780 790 800 810 820
>>CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (882 aa)
initn: 586 init1: 267 opt: 642 Z-score: 403.8 bits: 85.9 E(32554): 3.6e-16
Smith-Waterman score: 716; 27.2% identity (59.6% similar) in 718 aa overlap (71-728:98-795)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI
:... :: ..::... :.. : ::..::
CCDS44 FPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE2 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTD-GLGVLIISPTRELAYQTFE
. :.::::.. :.:::::: ::.:..: ::. :.. : .::.::::::: ::..
CCDS44 PVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFE---RLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQM
...:: ....::.:: .. . .. : .:.. :::::. :. .:.. ....
CCDS44 FTKELGKFTGLKTALILGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLV-HVAVEMSLKLQSVEY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHE
.:.:::::...::::. .. .: :: .::.::::: : . ..:: .: .: . .
CCDS44 VVFDEADRLFEMGFAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLDV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 KAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKK--SIVFFSSCKEVQYLYRVFCRL
.: . :. .... . . : .:: .:.. .. . ..:: .. ....:: ...
CCDS44 DTKLNEQ--LKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQ
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDA
: :: ... . : .:. . ..:..::.::::::.: .. :.... : .
CCDS44 R--VSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKG
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE2 NTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL---LQKKV----PVKEIK----IN--
. ..::.::.:: ..: : .. :.: .. .: : ... :.:: . ..
CCDS44 KLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVDGM
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE2 ----PEKLIDVQKK-LESILAQDQDLK---ERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPI
:....: . . :.: : . .:. . :. .:::: . . . .... .
CCDS44 LGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEMDL
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE2 PEYALSLGLAVAPRVRF----LQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPS--LTNDEVEEFR
..::: :: ::... . . ::.: ..: : : : .. .. :
CCDS44 ----VGLGLHPLFSSRFEEEELQRLRLVDSIKNYRSRAT-IFEINASSRDLCSQVMRAKR
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590
pF1KE2 AYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTG-----------NEEQEEEEDDEEEMEEKLAK
. .. .:.: . : ...:.. .: . :.::::. : .:. ...
CCDS44 QKDRKAIARFQQGQQ---GRQEQQEGPVGPAPSRPALQEKQPEKEEEEEAGESVEDIFSE
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640
pF1KE2 AKGSQAP-SLPNTSEAQKIKE---------VPTQFLDRDEEE------EDADFLKVKRHN
. : . : :: . .. .: .: . : : :. : . : .
CCDS44 VVGRKRQRSGPNRGAKRRREEARQRDQEFYIPYRPKDFDSERGLSISGEGGAFEQQAAGA
660 670 680 690 700 710
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 VFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKVAEAKKVMKRNFKVN--KKITFTDEGELVQQW
:. : . ..: . . . . .:: :... . :...:.. . :. . . .: :.:
CCDS44 VLDLMGDEAQNLTRGRQQLKWDRKKKRFVGQSGQEDKKKIKTESGRYISSSYKRDLYQKW
720 730 740 750 760 770
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 PQMQKSAIKDAEEDDDTGGINLHKAKERLQEEDKFDKEEYRKKIKAKHREKRLKEREARR
: :: : : .:.: : . ... ::
CCDS44 KQKQK--IDD--RDSDEEGASDRRGPERRGGKRDRGQAGASRPHAPGTPAGRVRPELKTK
780 790 800 810 820
>>CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 (622 aa)
initn: 596 init1: 223 opt: 632 Z-score: 399.9 bits: 84.6 E(32554): 5.9e-16
Smith-Waterman score: 640; 33.2% identity (62.6% similar) in 404 aa overlap (68-450:180-576)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 RKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQK
: :... . :.::.. . : ::
CCDS44 RYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQI
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 QTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPV----LEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTREL
: : :.:.:..: : :::::::.: .:: :: :: ... .: ::: :.:::
CCDS44 QGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSREL
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200
pF1KE2 AYQTFEVLRKVGK--NHDFSA----GLIIGGKDLKHEAERI-NNINILVCTPGRLLQHMD
: :: .:. . ..: : .: ::: ..:.. : : ......: :::::.. ..
CCDS44 ARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQ
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 ETVSFHATDL-QMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLAR
. . . :. ..:.::::::..:::: . ... . .:::::::::. :.....:.
CCDS44 KKMV--SLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAK
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 LSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKE
.: .: . : . . : . : .:. : :. : :.. ..: . .
CCDS44 SALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEE--AKMVYLLECLQK-TPPPVLIFAEKKAD
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 VQYLYRVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVN
:. ... . : :: .:.:: ..: .: .. . : . . :: :::.:..::::::..
CCDS44 VDAIHEYL--LLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQ
450 460 470 480 490 500
390 400 410 420 430
pF1KE2 WVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLIL--------LPSEKAMVQQLLQKKVPV
:...: ::. ..:.:: :::.: . : : .. : . ::.. . :: ::
CCDS44 HVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPV
510 520 530 540 550 560
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 KEI-KINPEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIP
.. . . :...:.
CCDS44 LQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF
570 580 590 600 610 620
875 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 15:45:01 2016 done: Mon Nov 7 15:45:02 2016
Total Scan time: 2.850 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]