Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2194
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2194, 255 aa
1>>>pF1KE2194 255 - 255 aa - 255 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6889+/-0.000867; mu= 11.8840+/- 0.052
mean_var=59.2132+/-11.535, 0's: 0 Z-trim(105.3): 16 B-trim: 48 in 1/47
Lambda= 0.166673
statistics sampled from 8323 (8330) to 8323 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 2.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11001.1 YWHAE gene_id:7531|Hs108|chr17 ( 255) 1641 402.9 1.1e-112
CCDS6290.1 YWHAZ gene_id:7534|Hs108|chr8 ( 245) 1060 263.2 1.2e-70
CCDS13339.1 YWHAB gene_id:7529|Hs108|chr20 ( 246) 1024 254.6 4.7e-68
CCDS5584.1 YWHAG gene_id:7532|Hs108|chr7 ( 247) 1003 249.5 1.6e-66
CCDS1666.1 YWHAQ gene_id:10971|Hs108|chr2 ( 245) 999 248.6 3e-66
CCDS13901.1 YWHAH gene_id:7533|Hs108|chr22 ( 246) 986 245.4 2.7e-65
CCDS288.1 SFN gene_id:2810|Hs108|chr1 ( 248) 949 236.5 1.3e-62
>>CCDS11001.1 YWHAE gene_id:7531|Hs108|chr17 (255 aa)
initn: 1641 init1: 1641 opt: 1641 Z-score: 2136.8 bits: 402.9 E(32554): 1.1e-112
Smith-Waterman score: 1641; 100.0% identity (100.0% similar) in 255 aa overlap (1-255:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
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CCDS11 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGE
190 200 210 220 230 240
250
pF1KE2 EQNKEALQDVEDENQ
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CCDS11 EQNKEALQDVEDENQ
250
>>CCDS6290.1 YWHAZ gene_id:7534|Hs108|chr8 (245 aa)
initn: 1040 init1: 743 opt: 1060 Z-score: 1382.0 bits: 263.2 E(32554): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 1060; 69.0% identity (86.2% similar) in 239 aa overlap (3-241:2-238)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
:...:: .:::::::::::.:. ::.:. . .::. :::::::::::::.::::.::
CCDS62 MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVF
:..:::::: : :.: : .: ::::. .::::. :: :.:..:.: ::: :. .:::::
CCDS62 RVVSSIEQKTE--GAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVF
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CCDS62 YLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGE
::::::::..:: :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS62 YYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEA
180 190 200 210 220 230
250
pF1KE2 EQNKEALQDVEDENQ
:
CCDS62 EAGEGGEN
240
>>CCDS13339.1 YWHAB gene_id:7529|Hs108|chr20 (246 aa)
initn: 736 init1: 736 opt: 1024 Z-score: 1335.2 bits: 254.6 E(32554): 4.7e-68
Smith-Waterman score: 1024; 66.1% identity (83.7% similar) in 245 aa overlap (3-243:4-246)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRAS
:. .:: .:::::::::::.:. .:: :. . ::. :::::::::::::.::::.:
CCDS13 MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 WRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKV
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CCDS13 WRVISSIEQKTERN--EKKQQMGKEYREKIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 FYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSV
:: :::::: :::.: :.:.... .. :: ::. : .:. :. :::::::::::::::
CCDS13 FYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGD-
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CCDS13 FYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDE
180 190 200 210 220 230
240 250
pF1KE2 ---GEEQNKEALQDVEDENQ
:: .:
CCDS13 GDAGEGEN
240
>>CCDS5584.1 YWHAG gene_id:7532|Hs108|chr7 (247 aa)
initn: 1024 init1: 584 opt: 1003 Z-score: 1307.9 bits: 249.5 E(32554): 1.6e-66
Smith-Waterman score: 1003; 64.2% identity (83.3% similar) in 246 aa overlap (1-243:1-246)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
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CCDS55 MVDREQLVQKARLAEQAERYDDMAAAMKNVTELNEPLSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTG--ESK
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CCDS55 RVISSIEQKTSADGNEKKIEMVRAYREKIEKELEAVCQDVLSLLDNYLIKNCSETQYESK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFS
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CCDS55 VFYLKMKGDYYRYLAEVATGEKRATVVESSEKAYSEAHEISKEHMQPTHPIRLGLALNYS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGD
:::::: :.:..::.:::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.: :
CCDS55 VFYYEIQNAPEQACHLAKTAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDQQDD
190 200 210 220 230 240
240 250
pF1KE2 -GEEQNKEALQDVEDENQ
: : :
CCDS55 DGGEGNN
>>CCDS1666.1 YWHAQ gene_id:10971|Hs108|chr2 (245 aa)
initn: 1000 init1: 727 opt: 999 Z-score: 1302.8 bits: 248.6 E(32554): 3e-66
Smith-Waterman score: 999; 65.3% identity (85.2% similar) in 236 aa overlap (3-238:2-235)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
.. .:. .:::::::::::.:. :: :. . .::. :::::::::::::.:.::..:
CCDS16 MEKTELIQKAKLAEQAERYDDMATCMKAVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGGRRSAW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVF
:.::::::: ... . ::..:..::. ::.::. :: .:..:::.:: :.. :::::
CCDS16 RVISSIEQKTDTS--DKKLQLIKDYREKVESELRSICTTVLELLDKYLIANATNPESKVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVF
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CCDS16 YLKMKGDYFRYLAEVACGDDRKQTIDNSQGAYQEAFDISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGE
::::::.:. :: :::.:::.::::::::.:.:::::::::::::::::::::: :.
CCDS16 YYEILNNPELACTLAKTAFDEAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDSAGEEC
180 190 200 210 220 230
250
pF1KE2 EQNKEALQDVEDENQ
CCDS16 DAAEGAEN
240
>>CCDS13901.1 YWHAH gene_id:7533|Hs108|chr22 (246 aa)
initn: 1010 init1: 579 opt: 986 Z-score: 1285.8 bits: 245.4 E(32554): 2.7e-65
Smith-Waterman score: 986; 63.8% identity (82.5% similar) in 240 aa overlap (1-238:1-240)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
: :::.:. .:.:::::::::.:. .:: :. .. :. :.:::::::::::.::::.::
CCDS13 MGDREQLLQRARLAEQAERYDDMASAMKAVTELNEPLSNEDRNLLSVAYKNVVGARRSSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANT--GESK
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CCDS13 RVISSIEQKTMADGNEKKLEKVKAYREKIEKELETVCNDVLSLLDKFLIKNCNDFQYESK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFS
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CCDS13 VFYLKMKGDYYRYLAEVASGEKKNSVVEASEAAYKEAFEISKEQMQPTHPIRLGLALNFS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGD
:::::: :.:..:: ::: ::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.: .
CCDS13 VFYYEIQNAPEQACLLAKQAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDQQDE
190 200 210 220 230 240
240 250
pF1KE2 GEEQNKEALQDVEDENQ
CCDS13 EAGEGN
>>CCDS288.1 SFN gene_id:2810|Hs108|chr1 (248 aa)
initn: 927 init1: 927 opt: 949 Z-score: 1237.7 bits: 236.5 E(32554): 1.3e-62
Smith-Waterman score: 949; 60.7% identity (82.8% similar) in 244 aa overlap (3-245:2-245)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW
.: .:. .::::::::::..:. :: .. ::. :::::::::::::.:..::.:
CCDS28 MERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVF
:..:::::: ...:.:.: .::::. :::::. .: .: .::.::: :. .::.::
CCDS28 RVLSSIEQKSNEEGSEEKGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVF
: ::::::.::::: :::.:.:. ... ::. : ::. :.:::.:::::::::::::
CCDS28 YLKMKGDYYRYLAEVATGDDKKRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 YYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGD-G
.::: :::..: :::..::.:.:.: ::::.::::::::::::::::::::.: :. :
CCDS28 HYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEG
180 190 200 210 220 230
240 250
pF1KE2 EEQNKEALQDVEDENQ
: .:
CCDS28 GEAPQEPQS
240
255 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:38:55 2016 done: Sun Nov 6 23:38:55 2016
Total Scan time: 2.300 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]