Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2180
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2180, 417 aa
1>>>pF1KE2180 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2645+/-0.000703; mu= 16.0932+/- 0.043
mean_var=133.9829+/-26.376, 0's: 0 Z-trim(115.0): 31 B-trim: 7 in 1/52
Lambda= 0.110802
statistics sampled from 15540 (15571) to 15540 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.794), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 3013 492.3 3.5e-139
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 1282 215.6 6.6e-56
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 741 129.1 6.9e-30
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 726 126.7 3.6e-29
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 710 124.1 2.1e-28
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 693 121.4 1.4e-27
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 683 119.8 4.1e-27
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 570 101.7 1.1e-21
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 568 101.4 1.4e-21
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 568 101.4 1.5e-21
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 564 100.8 2.3e-21
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 471 85.9 6.8e-17
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 471 85.9 6.9e-17
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 461 84.3 2e-16
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 427 78.9 8.7e-15
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 410 76.2 5.7e-14
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 393 73.4 3.7e-13
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 391 73.0 4.2e-13
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 391 73.1 4.8e-13
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 390 72.9 5e-13
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 391 73.2 5e-13
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 378 71.0 2e-12
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 378 71.1 2e-12
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 348 66.3 5.6e-11
>>CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 (417 aa)
initn: 3013 init1: 3013 opt: 3013 Z-score: 2612.2 bits: 492.3 E(32554): 3.5e-139
Smith-Waterman score: 3013; 100.0% identity (100.0% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGSAHPRPWLRLRPQPQPRPALWVLLFFLLLLAAAMPRSAPNDILDLRLPPEPVLNANTV
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CCDS24 MGSAHPRPWLRLRPQPQPRPALWVLLFFLLLLAAAMPRSAPNDILDLRLPPEPVLNANTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CLTLPGLSRRQMEVCVRHPDVAASAIQGIQIAIHECQHQFRDQRWNCSSLETRNKIPYES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 CLTLPGLSRRQMEVCVRHPDVAASAIQGIQIAIHECQHQFRDQRWNCSSLETRNKIPYES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PIFSRGFRESAFAYAIAAAGVVHAVSNACALGKLKACGCDASRRGDEEAFRRKLHRLQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PIFSRGFRESAFAYAIAAAGVVHAVSNACALGKLKACGCDASRRGDEEAFRRKLHRLQLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ALQRGKGLSHGVPEHPALPTASPGLQDSWEWGGCSPDMGFGERFSKDFLDSREPHRDIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ALQRGKGLSHGVPEHPALPTASPGLQDSWEWGGCSPDMGFGERFSKDFLDSREPHRDIHA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RMRLHNNRVGRQAVMENMRRKCKCHGTSGSCQLKTCWQVTPEFRTVGALLRSRFHRATLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RMRLHNNRVGRQAVMENMRRKCKCHGTSGSCQLKTCWQVTPEFRTVGALLRSRFHRATLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RPHNRNGGQLEPGPAGAPSPAPGAPGPRRRASPADLVYFEKSPDFCEREPRLDSAGTVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RPHNRNGGQLEPGPAGAPSPAPGAPGPRRRASPADLVYFEKSPDFCEREPRLDSAGTVGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE2 LCNKSSAGSDGCGSMCCGRGHNILRQTRSERCHCRFHWCCFVVCEECRITEWVSVCK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LCNKSSAGSDGCGSMCCGRGHNILRQTRSERCHCRFHWCCFVVCEECRITEWVSVCK
370 380 390 400 410
>>CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 (389 aa)
initn: 1791 init1: 664 opt: 1282 Z-score: 1117.1 bits: 215.6 E(32554): 6.6e-56
Smith-Waterman score: 1776; 60.4% identity (80.9% similar) in 404 aa overlap (14-417:5-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGSAHPRPWLRLRPQPQPRPALWVLLFFLLLLAAAMPRSAPNDILDLRLPPEPVLNANTV
:.:.: :. . :.:: : . :. :.:: :.:: :: :.::::
CCDS87 MLEEPRPRPPPSGLAGLLFLALCS----RALSNEILGLKLPGEPPLTANTV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CLTLPGLSRRQMEVCVRHPDVAASAIQGIQIAIHECQHQFRDQRWNCSSLETRNKIPYES
:::: :::.::. .:.:.:::.:::.::..::.::::::.::::::::.:: ...:..:
CCDS87 CLTLSGLSKRQLGLCLRNPDVTASALQGLHIAVHECQHQLRDQRWNCSALEGGGRLPHHS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PIFSRGFRESAFAYAIAAAGVVHAVSNACALGKLKACGCDASRRGDEEAFRRKLHRLQLD
:..::::::::.... ::::.:::..::.:::: .::: . :... .: :: :::.
CCDS87 AILKRGFRESAFSFSMLAAGVMHAVATACSLGKLVSCGCGWKGSGEQDRLRAKL--LQLQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ALQRGKGLSHGVPEHPALPTASPGLQDSWEWGGCSPDMGFGERFSKDFLDSREPHRDIHA
::.:::.. :..: . ::: ::.::::::. :: :::.::.::::::: :::.:
CCDS87 ALSRGKSFPHSLPSPGPGSSPSPGPQDTWEWGGCNHDMDFGEKFSRDFLDSREAPRDIQA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RMRLHNNRVGRQAVMENMRRKCKCHGTSGSCQLKTCWQVTPEFRTVGALLRSRFHRATLI
:::.::::::::.: ::..:::::::::::::.::::...::::.::: :: :. :: .:
CCDS87 RMRIHNNRVGRQVVTENLKRKCKCHGTSGSCQFKTCWRAAPEFRAVGAALRERLGRAIFI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RPHNRNGGQLEPGPAGAPSPAPGAPGPRRRASPADLVYFEKSPDFCEREPRLDSAGTVGR
::::.: ..: ::: .. .:::::::::::::.: . : :: ::
CCDS87 DTHNRNSGAFQPRLR-----------PRRLSG--ELVYFEKSPDFCERDPTMGSPGTRGR
290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE2 LCNKSSAGSDGCGSMCCGRGHNILRQTRSERCHCRFHWCCFVVCEECRITEWVSVCK
:::.: :::::.:::::::.::::: :::::::::::.:.:.::..::::.:::
CCDS87 ACNKTSRLLDGCGSLCCGRGHNVLRQTRVERCHCRFHWCCYVLCDECKVTEWVNVCK
340 350 360 370 380
>>CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 (370 aa)
initn: 1036 init1: 373 opt: 741 Z-score: 650.0 bits: 129.1 E(32554): 6.9e-30
Smith-Waterman score: 948; 38.4% identity (60.1% similar) in 404 aa overlap (23-416:10-369)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGSAHPRPWLRLRPQPQPRPALWVLLFFLLLLAAAMPRSAPND------ILDLRLPPEPV
:: .:: ::: : :. :... . .
CCDS87 MGLWALLPGWVSATLLLALAALPAALAANSSGRWWGIVNVASSTNLL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LNANTVCLTL-PGL---SRRQMEVCVRHPDVAASAIQGIQIAIHECQHQFRDQRWNCSSL
..... :.: :.: ::.: .. ..: . :. :.: :..::. :::..:::: .
CCDS87 TDSKSLQLVLEPSLQLLSRKQRRLIRQNPGILHSVSGGLQSAVRECKWQFRNRRWNCPTA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ETRNKIPYESPIFSRGFRESAFAYAIAAAGVVHAVSNACALGKLKACGCDASRRGDEEAF
. . . : .:: ::.:: .::..:::.:.:. .:. :....: :: :::
CCDS87 PGPHLF---GKIVNRGCRETAFIFAITSAGVTHSVARSCSEGSIESCTCDYRRRG-----
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RRKLHRLQLDALQRGKGLSHGVPEHPALPTASPGLQDSWEWGGCSPDMGFGERFSKDFLD
:: : :.::::: .. ::. :...:.:
CCDS87 --------------------------------PGGPD-WHWGGCSDNIDFGRLFGREFVD
160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SREPHRDIHARMRLHNNRVGRQAVMENMRRKCKCHGTSGSCQLKTCWQVTPEFRTVGALL
: : ::.. : ::::..:: .:. .::..::::: :::: ..:::. : .:.:: .:
CCDS87 SGEKGRDLRFLMNLHNNEAGRTTVFSEMRQECKCHGMSGSCTVRTCWMRLPTLRAVGDVL
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RSRFHRATLIRPHNRNGGQLEPGPAGAPSPAPGAPGPRRRASPADLVYFEKSPDFCEREP
:.:: :. . ::.... . : : : :: :::::::::.::
CCDS87 RDRFDGASRVLYGNRGSNRASRAELLRLEPEDPAHKP---PSPHDLVYFEKSPNFCTYSG
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 RLDSAGTVGRLCNKSSAGSDGCGSMCCGRGHNILRQTRSERCHCRFHWCCFVVCEECRIT
:: .:::.:: ::.:: . ::: .:::::: : .:::.: ::::: : :..: :
CCDS87 RLGTAGTAGRACNSSSPALDGCELLCCGRGHRTRTQRVTERCNCTFHWCCHVSCRNCTHT
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EWVSVCK
. . :
CCDS87 RVLHECL
370
>>CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 (355 aa)
initn: 1037 init1: 374 opt: 726 Z-score: 637.3 bits: 126.7 E(32554): 3.6e-29
Smith-Waterman score: 985; 39.3% identity (64.0% similar) in 361 aa overlap (60-417:44-355)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 LLLAAAMPRSAPNDILDLRLPPEPVLNANTVCLTLPGLSRRQMEVCVRHPDVAASAIQGI
.: ..::: .:.. : . .. :. .:.
CCDS11 LGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIMPSVAEGV
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 QIAIHECQHQFRDQRWNCSSLETRNKIPYESPIFSRGFRESAFAYAIAAAGVVHAVSNAC
...:.::::::: .::::.... ... .:..... :::::..:::.:::. ::. .:
CCDS11 KLGIQECQHQFRGRRWNCTTID--DSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFAVTRSC
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 ALGKLKACGCDASRRGDEEAFRRKLHRLQLDALQRGKGLSHGVPEHPALPTASPGLQDSW
: : ::::. ..: : :: ..:
CCDS11 AEGTSTICGCDSHHKG---------------------------P---------PG--EGW
140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 EWGGCSPDMGFGERFSKDFLDSREPHRDIHARMRLHNNRVGRQAVMENMRRKCKCHGTSG
.::::: : :: :..: :.:: . : .. : :::..:: .....:. :::::: ::
CCDS11 KWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 SCQLKTCWQVTPEFRTVGALLRSRFHRAT--LIRPHNRNGGQLEPGPAGAPSPAPGAPGP
::..:::: . :.::..: .:.... :. ... : .. : .: : : :
CCDS11 SCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKP----P
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 RRRASPADLVYFEKSPDFCEREPRLDSAGTVGRLCNKSSAGSDGCGSMCCGRGHNILRQT
.: ::::.:.::.::: .:. : :: : :: .: : ::: .::::::: .
CCDS11 TER----DLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEK
270 280 290 300 310 320
390 400 410
pF1KE2 RSERCHCRFHWCCFVVCEEC-RITEWVSVCK
:.:.::: :::::.: :.:: :: . : .::
CCDS11 RKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYD-VHTCK
330 340 350
>>CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 (352 aa)
initn: 1014 init1: 369 opt: 710 Z-score: 623.5 bits: 124.1 E(32554): 2.1e-28
Smith-Waterman score: 969; 38.7% identity (61.6% similar) in 372 aa overlap (49-417:35-352)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 RPALWVLLFFLLLLAAAMPRSAPNDILDLRLPPEPVLNANTVCLTLPGLSRRQMEVCVRH
: .:.: : ..::: .:.. : .
CCDS15 GYFLLLCSLKQALGSYPIWWSLAVGPQYSSLGSQPIL-----CASIPGLVPKQLRFCRNY
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 PDVAASAIQGIQIAIHECQHQFRDQRWNCSSLETRNKIPYESPIFSRGFRESAFAYAIAA
.. :. .::.:.:.::::::: .::::.... ... .:..... :::::..:::.
CCDS15 VEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVH--DSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 AGVVHAVSNACALGKLKACGCDASRRGDEEAFRRKLHRLQLDALQRGKGLSHGVPEHPAL
:::. ::. .:: : :::.. ..:
CCDS15 AGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQG---------------------------------
120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 PTASPGLQDSWEWGGCSPDMGFGERFSKDFLDSREPHRDIHARMRLHNNRVGRQAVMENM
::: .:.::::: :. :: :..: :.:: . : .. : :::..::::. .:
CCDS15 ---SPG--KGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENRPDARSAMNRHNNEAGRQAIASHM
150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 RRKCKCHGTSGSCQLKTCWQVTPEFRTVGALLRSRFHRAT--LIRPHNRNGGQLEP-GPA
. :::::: ::::..:::: :.::..: .:.... :. ... : .. : .: :
CCDS15 HLKCKCHGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRPR
200 210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GAPSPAPGAPGPRRRASPADLVYFEKSPDFCEREPRLDSAGTVGRLCNKSSAGSDGCGSM
. .: . ::::.: ::.::: .:. : :: : :: :: : ::: .
CCDS15 YTYFKVP---------TERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVSSHGIDGCDLL
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410
pF1KE2 CCGRGHNILRQTRSERCHCRFHWCCFVVCEECRITEWVSVCK
::::::: . : :.:.: :::::.: :.:: . : .::
CCDS15 CCGRGHNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCK
320 330 340 350
>>CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 (349 aa)
initn: 861 init1: 355 opt: 693 Z-score: 608.9 bits: 121.4 E(32554): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 971; 38.8% identity (63.1% similar) in 363 aa overlap (55-417:32-349)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 LLFFLLLLAAAMPRSAPNDILDLRLPPEPVLNANTVCLTLPGLSRRQMEVCVRHPDVAAS
:.:. .: .:::. :: .: .::.
CCDS26 NRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 AIQGIQIAIHECQHQFRDQRWNCSSLETRNKIPYESPIFSRGFRESAFAYAIAAAGVVHA
.: :... ::: :::. :::::.: :. . : . : ::.::.::: ::::.::
CCDS26 IGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKV---GSREAAFTYAIIAAGVAHA
70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 VSNACALGKLKACGCDASRRGDEEAFRRKLHRLQLDALQRGKGLSHGVPEHPALPTASPG
.. ::. :.:. :::: ..: . ::
CCDS26 ITAACTQGNLSDCGCDKEKQG-------QYHR----------------------------
120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 LQDSWEWGGCSPDMGFGERFSKDFLDSREPHRDIHARMRLHNNRVGRQAVMENMRRKCKC
...:.::::: :. .: :.: :.:.:: ... .. : ::::..::. . :::. .:::
CCDS26 -DEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIKQNARTLMNLHNNEAGRKILEENMKLECKC
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 HGTSGSCQLKTCWQVTPEFRTVGALLRSRFHRATLIRPHNRNGGQLEPGPAGAPSPAPGA
::.:::: :::: . :.:: .: .:......:. ..: : . . .: .:
CCDS26 HGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVHVEP-VRASRNKRPTFLKIKKPL---
210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 PGPRRRASPADLVYFEKSPDFCEREPRLDSAGTVGRLCNKSSAGSDGCGSMCCGRGHNIL
:. .::::.::::..::..: :.:: :: :::.. ..:: ::::::.:
CCDS26 --SYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKTAPQASGCDLMCCGRGYNTH
260 270 280 290 300 310
390 400 410
pF1KE2 RQTRSERCHCRFHWCCFVVCEECRITEWVSVCK
. .: .:.:.:::::.: :. : . .::
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: .: .::::.::::..::.. :.:: :::::..: :.::: .::::::.:
CCDS33 --LRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPGADGCDTMCCGRGYN
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. :. .:.:.::::::: :. : : .::
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320 330 340
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.. .. . : . ::.::..::..:::..... :.:: . :::: :: :
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CCDS74 EKYHAALKV--------DLLQG-AGNSAAGRGAIADTFRSISTRELVHLEDSPDYCLENK
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: :: :: : . . . .: .: :: . . : :.:.::::: :
CCDS74 TLGLLGTEGRECLRRGRALGRWERRSCRRLCGDCGLAVEERRAETVSSCNCKFHWCCAVR
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410
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CCDS74 CEQCRRRVTKYFCSRAERPRGGAAHKPGRKP
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CCDS43 -------------NNGKTGGHG-----------------WIWGGCSDNVEFGERISKLFV
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:.... .: :. .: ::. : .. .:. : : .. :.:...:.:::.:
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CCDS75 ALGAQSGIEECKFQFAWERWNCP--ENALQLSTHNRLRS-ATRETSFIHAISSAGVMYII
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CCDS75 ---WIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKCH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]