Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2157
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2157, 330 aa
1>>>pF1KE2157 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6770+/-0.000747; mu= 15.5066+/- 0.045
mean_var=87.3783+/-16.936, 0's: 0 Z-trim(110.9): 71 B-trim: 16 in 2/51
Lambda= 0.137206
statistics sampled from 11859 (11932) to 11859 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 ( 330) 2371 478.8 2.7e-135
CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231) 1468 300.4 4.8e-81
CCDS30959.1 CFHR2 gene_id:3080|Hs108|chr1 ( 270) 1201 247.1 1.2e-65
CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 ( 569) 1133 233.9 2.4e-61
CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 330) 1058 218.9 4.7e-57
CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 331) 949 197.3 1.5e-50
CCDS55671.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 577) 934 194.5 1.8e-49
CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 ( 661) 634 135.1 1.5e-31
CCDS53453.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 269) 598 127.7 1e-29
CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 ( 449) 440 96.6 4e-20
CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 389 86.4 3.5e-17
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 320 73.2 1.1e-12
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 316 72.7 4.8e-12
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 316 72.7 5e-12
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 316 72.7 5e-12
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 292 67.6 5e-11
>>CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 (330 aa)
initn: 2371 init1: 2371 opt: 2371 Z-score: 2542.5 bits: 478.8 E(32554): 2.7e-135
Smith-Waterman score: 2371; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
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CCDS13 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE2 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
310 320 330
>>CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231 aa)
initn: 1323 init1: 1323 opt: 1468 Z-score: 1568.5 bits: 300.4 E(32554): 4.8e-81
Smith-Waterman score: 1469; 68.8% identity (80.1% similar) in 311 aa overlap (26-330:935-1231)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGI---LYDEEKYKPFSQVPTGEVFY
:.:.::. . : .: ::
CCDS13 FRISEENETTCYMGKWSSPPQCEGLPCKSPPEISHGVVAHMSDSYQY--------GEEVT
910 920 930 940 950
60 70 80 90 100
pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRL-CF-FPFVENGHSESSGQ-THLEGDT
:.: .: . .. : : :: :.:.. :. .: ::. . . .. :.
CCDS13 YKCFEGFGIDGPAI---AKCLGEKWSHPPSCIKTDCLSLPSFENAIPMGEKKDVYKAGEQ
960 970 980 990 1000 1010
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 VQIICNTGYRLQNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSG
: : : :.. .. .:..:.. :. : :: :::::::::::::.:.::::::::::
CCDS13 VTYTCATYYKM-DGASNVTCINSRWTGRPTCR--DTSCVNPPTVQNAYIVSRQMSKYPSG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 ERVRYECRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ERVRYQCRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAP
1080 1090 1100 1110 1120 1130
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLY
1140 1150 1160 1170 1180 1190
290 300 310 320 330
pF1KE2 LRTGESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRTGESVEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
1200 1210 1220 1230
>--
initn: 828 init1: 451 opt: 590 Z-score: 629.2 bits: 126.6 E(32554): 1e-28
Smith-Waterman score: 590; 29.3% identity (58.9% similar) in 321 aa overlap (23-330:325-626)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFY
::.: :.:: :: :. .:. : .:. .
CCDS13 RNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPYFPVAVGKYYS
300 310 320 330 340 350
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQI
: :. .: .:: :.: .: ::..::::. ::: :.::..:::.... :. ..: ....
CCDS13 YYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGKSIDV
360 370 380 390 400 410
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ICNTGYRLQNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERV
:. :: : . .....:.: ::: :.: . : . ..:. : :.. : :..
CCDS13 ACHPGYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCIRVKTCSKSSIDIENGFISESQYT-YALKEKA
420 430 440 450 460 470
180 190 200 210 220
pF1KE2 RYECRSPYEMFGDEE----VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPID---NGDITSFPLS
.:.:. : . .: : . : . .:. : : : : : .. ..:.: : :.
CCDS13 KYQCKLGY-VTADGETSGSITCGKDGWSAQPTCIKS---CDIPVFMNARTKNDFTWFKLN
480 490 500 510 520
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 VYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKR---ITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREI-MENYNIALR
....:.:.. :. . .. :.: . ::. : : . :: . . .. :
CCDS13 -----DTLDYECHDGYESNTGSTTGSIVCGYNGWSDLPICYE-----RECELPKIDVHLV
530 540 550 560 570
290 300 310 320 330
pF1KE2 WTAKQKLYLRTGESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKL--EYPTCAKR
:. : ..:: .: :: :. . . . . :. : . : : ..
CCDS13 PDRKKDQY-KVGEVLKFSCKPGFTIVGPNSV---QCYHFGLSPDLPICKEQVQSCGPPPE
580 590 600 610 620 630
CCDS13 LLNGNVKEKTKEEYGHSEVVEYYCNPRFLMKGPNKIQCVDGEWTTLPVCIVEESTCGDIP
640 650 660 670 680 690
>>CCDS30959.1 CFHR2 gene_id:3080|Hs108|chr1 (270 aa)
initn: 1669 init1: 1008 opt: 1201 Z-score: 1292.1 bits: 247.1 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1557; 70.9% identity (77.3% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-270)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MWLLVSVILISRISSVGGEAMFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SPSKSFWTRITCAEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY
:::::::::::::::::::::::
CCDS30 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTI------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL
:. :::::::::::::::: ::::::.::::::::::
CCDS30 -----------------------SAEKCGPPPPIDNGDITSFLLSVYAPGSSVEYQCQNL
150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC
::::::..::::::::::::::: :::::.::::.::: :.:: .:::: :::. .::::
CCDS30 YQLEGNNQITCRNGQWSEPPKCLDPCVISQEIMEKYNIKLKWTNQQKLYSRTGDIVEFVC
190 200 210 220 230 240
310 320 330
pF1KE2 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
: ::. ..::..:. : .::: ::.: ..
CCDS30 KSGYH-PTKSHSFRAMCQNGKLVYPSCEEK
250 260 270
>>CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 (569 aa)
initn: 1639 init1: 1031 opt: 1133 Z-score: 1214.8 bits: 233.9 E(32554): 2.4e-61
Smith-Waterman score: 1133; 51.7% identity (68.4% similar) in 329 aa overlap (1-327:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
: :: :::::: .:.::::.:.::::::.::.::::: :.::::::::::::::::::::
CCDS13 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
:::::::::::::::::::::::::.: ::::.:::::::: ::::::::::::::: :
CCDS13 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGYSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY
::::.::::::::::::: : : : : :. .. : : :. ... ::.
CCDS13 QNNEKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKES-YKVGDVLKFSCRKNL
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEP-PQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQN
:.. :.: . .:. : :: .. .::::: ..::.. . :. :::.:.
CCDS13 IRVGSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEVVEYDCNP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFV
. ..: :.: : .:.:. : :.. : : . .. . . : :.:
CCDS13 NFIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPE---LEYGYVQPSVPPYQHGVSVEVN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE2 CKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGK-LEYPTCAKR
:. : . . . :: .: : : :
CCDS13 CRNEYAMIGNNMI---TCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNS
300 310 320 330 340 350
>--
initn: 810 init1: 622 opt: 685 Z-score: 735.5 bits: 145.2 E(32554): 1.2e-34
Smith-Waterman score: 685; 40.2% identity (66.4% similar) in 229 aa overlap (100-327:345-568)
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRLQNNENNISC
::. ... .. :. .: ... :
CCDS13 IWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHS----VC
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VERGWSTPPKC-RSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPYEMFGDEEV
.. :. : .. . : :: . ::. .. .. : .::.: :. : . .:.
CCDS13 INGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQNMTTTVN-YQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEI
380 390 400 410 420
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKR
.: .: : :.: .::. ::::: :.::: :::::::: :.:.: :.::..:.:.:.
CCDS13 VCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVT
430 440 450 460 470 480
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVCKRGYRLSS
.:::: ::::::.:: :::.:.: :.. :: :.: ::: .::...:: :: ..
CCDS13 VTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMI
490 500 510 520 530 540
310 320 330
pF1KE2 RSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
: .:. : .::.::: :
CCDS13 SSPPFRAICQEGKFEYPICE
550 560
>>CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 (330 aa)
initn: 1236 init1: 561 opt: 1058 Z-score: 1137.9 bits: 218.9 E(32554): 4.7e-57
Smith-Waterman score: 1058; 40.9% identity (71.5% similar) in 330 aa overlap (1-327:1-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
: ::..::: .: ..:.. :::: :.:: :. :. .:. : .:. . : :. .:
CCDS30 MLLLINVILTLWVSCANGQVKPCDFPDIKHGGLFHENMRRPYFPVAVGKYYSYYCDEHFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
.:: :.: : ::..::::. ::: :.::..:::.... :. ..:..... :. :: :
CCDS30 TPSGSYWDYIHCTQNGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNYGRKFVQGNSTEVACHPGYGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY
. .....:.:.::: :.: . : . ..:. : :.. : : .....:.:. :
CCDS30 PKAQTTVTCTEKGWSPTPRCIRVRTCSKSDIEIENGFI-SESSSIYILNKEIQYKCKPGY
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 EMF-GDEE--VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQC
:. . ::...:. : : .:. ::::::::.::: ::: :.::.: : :::::
CCDS30 ATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICINSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAE
: :.:.:.. .:: ::.:::::.:.:::.:..: :.. :: :. . .: : .::.. :
CCDS30 QPYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIKLKGRSDRKYYAKTGDTIE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE2 FVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
:.:: :: .. .....: .: .::: :
CCDS30 FMCKLGYNANTSILSFQAVCREGIVEYPRCE
300 310 320 330
>>CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 (331 aa)
initn: 1085 init1: 505 opt: 949 Z-score: 1021.2 bits: 197.3 E(32554): 1.5e-50
Smith-Waterman score: 949; 40.3% identity (66.9% similar) in 335 aa overlap (1-327:1-330)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGG-EATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNF
: ::..::: .: ..: :. ::::.:.:: :: . . . . .:. . : :. ::
CCDS41 MLLLINVILTLWVSCANGQEVKPCDFPEIQHGGLYYKSLRRLYFPAAAGQSYSYYCDQNF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 VSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFP--FVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTG
:.:: :.: : ::..::::: ::: : .::: :.. .. . .: :. :
CCDS41 VTPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDIEIENGFISESSSIYILNKEIQYKCKPG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 YRLQ--NNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYE
: :. ..:.:.. :::. : : . : . :. .:.. : : .. . . ::
CCDS41 YATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICIKF---C-DMPVFENSRAKSNGM-RFKLHDTLDYE
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180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CRSPYEM-FGDEE--VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASS
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CCDS41 CYDGYEISYGNTTGSIVCGEDGWSHFPTCYNSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSR
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 VEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRT
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CCDS41 VEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIQLKGKSDIKYYAKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE2 GESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
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CCDS41 GDTIEFMCKLGYNANTSVLSFQAVCREGIVEYPRCE
300 310 320 330
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10 20 30 40 50
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pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFP--FVENGHSESSGQTHLEGDTV
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CCDS55 QYKCKPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICIKF---C-DMPVFENSRAKSNGM-RFKL
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>--
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10 20 30 40 50 60
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CCDS55 TPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDVEIENGFISESSSIYILNEETQYNCKPGY
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CCDS55 ATAEGNSSGSITCLQNGWSTQPICIKF---C-DMPVFENSRAKSNGM-WFKLHDTLDYEC
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CCDS55 YDGYESSYGNTTDSIVCGEDGWSHLPTCYNSSENCGPPPPISNGDTTSFPQKVYLPWSRV
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CCDS55 EYQCQSYYELQGSKYVTCSNGDWSEPPRCISMKPCEFPEIQHGHLYYENTRRPYFPVATG
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CCDS13 GGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEGDVVQFFCHENYYL
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.... : : . :: : .: : : : . :.. .. . :. .:. :.: :.
CCDS13 SGSDL---IQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHIECEL
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....... . : : . :. :::: . ..: .:: ..: : : .. : .:..:
CCDS13 NFEIHGSAE-IRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSKI--YYNGDKVT
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: :.: : . :..:. : :.:: ::.: ... .: :: . :: ... :. :: .:::
CCDS13 YACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVMNGAVADGILASYATGSSV
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::.:.. : :.:.: :..:.:: :: ::.::... . :. :: ..: . :. :
CCDS13 EYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVL--HG
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CCDS13 VDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWD
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CCDS13 CLAGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQENMRYGC
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CCDS13 QYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKC--TKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEG
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CCDS13 GYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISSTVDTYENGSS
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CCDS13 VEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWDFDNRPHILH
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:: ::.: :: : .: . :: : :.:.:: : :
CCDS13 GEYIEFIC-RGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYPRCIPRQSTLSYQEPLRT
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CCDS53 TPSGSYWDYIHCTQNGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNYGRKFVQGNSTEVACHPGYGL
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CCDS53 PKAQTTVTCTEKGWSPTPRC-------------------------------IRV------
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CCDS53 ----------------------NSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQCQPY
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CCDS53 YELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIKLKGRSDRKYYAKTGDTIEFMC
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CCDS53 KLGYNANTSILSFQAVCREGIVEYPRCE
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CCDS53 RNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPYFPVAVGKYYS
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CCDS53 YYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGKSIDV
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pF1KE2 ICNTGYRLQNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERV
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CCDS53 ACHPGYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCIRVSFTL
420 430 440
330 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]